MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halopiger xanaduensis SH-6 chromosome

Total Repeats: 91388

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_015666	TTG	2	6	239940	239945	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336252341
6002	NC_015666	CGA	2	6	239989	239994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252341
6003	NC_015666	CGGA	2	8	240002	240009	25 %	0 %	50 %	25 %	336252341
6004	NC_015666	GAA	2	6	240023	240028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336252341
6005	NC_015666	CGACG	2	10	240139	240148	20 %	0 %	40 %	40 %	336252341
6006	NC_015666	AGC	2	6	240182	240187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252341
6007	NC_015666	GA	3	6	240248	240253	50 %	0 %	50 %	0 %	336252341
6008	NC_015666	CAC	2	6	240254	240259	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336252341
6009	NC_015666	GTC	2	6	240274	240279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252341
6010	NC_015666	CGA	2	6	240349	240354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252341
6011	NC_015666	ATT	2	6	240397	240402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336252341
6012	NC_015666	ACGG	2	8	240443	240450	25 %	0 %	50 %	25 %	336252341
6013	NC_015666	CGC	2	6	240520	240525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252341
6014	NC_015666	GAC	2	6	240563	240568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252341
6015	NC_015666	ACT	2	6	240615	240620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336252341
6016	NC_015666	GAC	3	9	240632	240640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252341
6017	NC_015666	GAG	2	6	240647	240652	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252341
6018	NC_015666	CGA	2	6	240693	240698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252341
6019	NC_015666	CGTC	2	8	240711	240718	0 %	25 %	25 %	50 %	336252341
6020	NC_015666	GAG	2	6	241085	241090	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252342
6021	NC_015666	GTC	2	6	241160	241165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252342
6022	NC_015666	GCA	2	6	241167	241172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252342
6023	NC_015666	TCG	2	6	241182	241187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252342
6024	NC_015666	CGA	2	6	241189	241194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252342
6025	NC_015666	TCG	2	6	241248	241253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252342
6026	NC_015666	CGT	2	6	241278	241283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252342
6027	NC_015666	TGA	2	6	241341	241346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336252342
6028	NC_015666	GAC	2	6	241432	241437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252342
6029	NC_015666	ACG	2	6	241515	241520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252342
6030	NC_015666	CGA	2	6	241561	241566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252342
6031	NC_015666	CGT	3	9	241588	241596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252342
6032	NC_015666	CGG	2	6	241621	241626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252342
6033	NC_015666	CAG	2	6	241627	241632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252342
6034	NC_015666	TCG	2	6	241635	241640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252342
6035	NC_015666	AGTA	2	8	241670	241677	50 %	25 %	25 %	0 %	336252342
6036	NC_015666	CTT	2	6	241696	241701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336252342
6037	NC_015666	CGA	2	6	241719	241724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252342
6038	NC_015666	ACG	2	6	241746	241751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252342
6039	NC_015666	GGACGG	2	12	241755	241766	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	336252342
6040	NC_015666	GGGCG	2	10	241846	241855	0 %	0 %	80 %	20 %	336252342
6041	NC_015666	CGA	2	6	241861	241866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252342
6042	NC_015666	CA	3	6	241873	241878	50 %	0 %	0 %	50 %	336252342
6043	NC_015666	CCG	2	6	241892	241897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252342
6044	NC_015666	CGA	2	6	241903	241908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252342
6045	NC_015666	ACGCG	2	10	241926	241935	20 %	0 %	40 %	40 %	336252342
6046	NC_015666	CGA	2	6	241987	241992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252342
6047	NC_015666	AG	3	6	242041	242046	50 %	0 %	50 %	0 %	336252342
6048	NC_015666	TC	3	6	242065	242070	0 %	50 %	0 %	50 %	336252342
6049	NC_015666	TCG	3	9	242088	242096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252342
6050	NC_015666	ACG	2	6	242115	242120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252342
6051	NC_015666	ACG	2	6	242184	242189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252342
6052	NC_015666	CGG	2	6	242197	242202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252342
6053	NC_015666	ACGA	2	8	242234	242241	50 %	0 %	25 %	25 %	336252342
6054	NC_015666	CGA	2	6	242272	242277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252342
6055	NC_015666	CGG	2	6	242299	242304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252342
6056	NC_015666	CGG	2	6	242335	242340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252342
6057	NC_015666	ACGA	2	8	242342	242349	50 %	0 %	25 %	25 %	336252342
6058	NC_015666	CTT	2	6	242407	242412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336252342
6059	NC_015666	TCG	2	6	242429	242434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252342
6060	NC_015666	CTG	2	6	242525	242530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252342
6061	NC_015666	AC	3	6	242563	242568	50 %	0 %	0 %	50 %	336252342
6062	NC_015666	TCG	2	6	242618	242623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252343
6063	NC_015666	TCC	2	6	242632	242637	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252343
6064	NC_015666	TCG	2	6	242644	242649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252343
6065	NC_015666	TCC	2	6	242686	242691	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252343
6066	NC_015666	GTC	2	6	242763	242768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252343
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6068	NC_015666	CGTC	2	8	242837	242844	0 %	25 %	25 %	50 %	336252343
6069	NC_015666	CGG	2	6	242857	242862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252343
6070	NC_015666	TCC	2	6	242884	242889	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252343
6071	NC_015666	TCG	2	6	243007	243012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252343
6072	NC_015666	GAC	2	6	243024	243029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252343
6073	NC_015666	TCG	2	6	243031	243036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252343
6074	NC_015666	GGT	2	6	243135	243140	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336252343
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6078	NC_015666	CGA	2	6	243460	243465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252344
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6080	NC_015666	CTG	2	6	243605	243610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252344
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6084	NC_015666	TCG	2	6	244278	244283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252345
6085	NC_015666	TCG	2	6	244287	244292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252345
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6088	NC_015666	CAT	2	6	244435	244440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336252345
6089	NC_015666	GTC	2	6	244454	244459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252345
6090	NC_015666	AAC	2	6	244500	244505	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336252345
6091	NC_015666	GGA	2	6	244507	244512	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252345
6092	NC_015666	GATCGA	2	12	244516	244527	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	336252345
6093	NC_015666	CTA	2	6	244558	244563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336252345
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6100	NC_015666	CCGA	2	8	245054	245061	25 %	0 %	25 %	50 %	336252345
6101	NC_015666	GAG	2	6	245081	245086	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252345
6102	NC_015666	CGAC	2	8	245106	245113	25 %	0 %	25 %	50 %	336252345
6103	NC_015666	CGAG	2	8	245142	245149	25 %	0 %	50 %	25 %	336252345
6104	NC_015666	GAC	2	6	245150	245155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252345
6105	NC_015666	CGA	2	6	245170	245175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252345
6106	NC_015666	CGG	2	6	245176	245181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252345
6107	NC_015666	CGA	2	6	245194	245199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252345
6108	NC_015666	CGG	2	6	245206	245211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252345
6109	NC_015666	CAA	2	6	245254	245259	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336252345
6110	NC_015666	TGAG	2	8	245288	245295	25 %	25 %	50 %	0 %	336252345
6111	NC_015666	ACG	2	6	245332	245337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252346
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6114	NC_015666	CTG	2	6	245386	245391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252346
6115	NC_015666	CGG	2	6	245394	245399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252346
6116	NC_015666	GCT	2	6	245409	245414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252346
6117	NC_015666	CGG	2	6	245439	245444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252346
6118	NC_015666	GCT	2	6	245451	245456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252346
6119	NC_015666	GAC	2	6	245484	245489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252346
6120	NC_015666	ACT	2	6	245546	245551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336252346
6121	NC_015666	CGG	2	6	245676	245681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252346
6122	NC_015666	CGC	2	6	245696	245701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252346
6123	NC_015666	ACG	2	6	245719	245724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252346
6124	NC_015666	CGG	2	6	245742	245747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252346
6125	NC_015666	CG	4	8	245831	245838	0 %	0 %	50 %	50 %	336252346
6126	NC_015666	GCT	2	6	245883	245888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252346
6127	NC_015666	GAT	2	6	245898	245903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336252346
6128	NC_015666	GCT	2	6	245922	245927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252346
6129	NC_015666	CTG	3	9	245938	245946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252346
6130	NC_015666	CTG	2	6	246001	246006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252346
6131	NC_015666	TTC	2	6	246025	246030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336252346
6132	NC_015666	TCT	2	6	246053	246058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336252346
6133	NC_015666	TCG	2	6	246113	246118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252346
6134	NC_015666	TCA	2	6	246131	246136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336252346
6135	NC_015666	TGG	2	6	246149	246154	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336252346
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6139	NC_015666	TCT	2	6	246272	246277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336252346
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6141	NC_015666	CGG	2	6	246363	246368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252346
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6143	NC_015666	CGG	2	6	246480	246485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252346
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6146	NC_015666	CTG	2	6	246577	246582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252346
6147	NC_015666	CGC	2	6	246616	246621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252346
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6150	NC_015666	TCCC	2	8	246795	246802	0 %	25 %	0 %	75 %	336252346
6151	NC_015666	C	7	7	246800	246806	0 %	0 %	0 %	100 %	336252346
6152	NC_015666	CGG	2	6	246809	246814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252346
6153	NC_015666	CGAC	2	8	246881	246888	25 %	0 %	25 %	50 %	336252346
6154	NC_015666	GGC	2	6	246889	246894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252346
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6157	NC_015666	ACGTTC	2	12	246994	247005	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	336252346
6158	NC_015666	CGT	2	6	247035	247040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252346
6159	NC_015666	GCCGA	2	10	247096	247105	20 %	0 %	40 %	40 %	336252346
6160	NC_015666	TGC	2	6	247127	247132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252346
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6182	NC_015666	TCG	2	6	248279	248284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252347
6183	NC_015666	GACT	2	8	248285	248292	25 %	25 %	25 %	25 %	336252347
6184	NC_015666	ACC	2	6	248302	248307	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336252347
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6203	NC_015666	CGTTC	2	10	248932	248941	0 %	40 %	20 %	40 %	336252347
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6220	NC_015666	AG	3	6	249757	249762	50 %	0 %	50 %	0 %	336252347
6221	NC_015666	AGC	2	6	249764	249769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252347
6222	NC_015666	AGAC	2	8	249770	249777	50 %	0 %	25 %	25 %	336252347
6223	NC_015666	CG	3	6	249811	249816	0 %	0 %	50 %	50 %	336252347
6224	NC_015666	TGG	2	6	250047	250052	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336252348
6225	NC_015666	TTC	2	6	250076	250081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336252348
6226	NC_015666	CTT	2	6	250090	250095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336252348
6227	NC_015666	GATGGC	2	12	250105	250116	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	336252348
6228	NC_015666	TCG	2	6	250134	250139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252348
6229	NC_015666	CTA	2	6	250162	250167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336252348
6230	NC_015666	TCG	2	6	250176	250181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252348
6231	NC_015666	CG	3	6	250188	250193	0 %	0 %	50 %	50 %	336252348
6232	NC_015666	ATG	2	6	250205	250210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336252348
6233	NC_015666	CCG	2	6	250215	250220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252348
6234	NC_015666	CTG	2	6	250235	250240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252348
6235	NC_015666	TCCA	2	8	250259	250266	25 %	25 %	0 %	50 %	336252348
6236	NC_015666	GAA	2	6	251128	251133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336252349
6237	NC_015666	AAG	2	6	251135	251140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336252349
6238	NC_015666	TCA	2	6	251225	251230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336252349
6239	NC_015666	CGC	2	6	251340	251345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252349
6240	NC_015666	TTCGCT	2	12	251523	251534	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	336252349
6241	NC_015666	GAA	2	6	251566	251571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336252349
6242	NC_015666	TCC	2	6	251573	251578	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252349
6243	NC_015666	ACG	2	6	251605	251610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252349
6244	NC_015666	TTC	2	6	251636	251641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336252349
6245	NC_015666	GTC	2	6	251704	251709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252349
6246	NC_015666	TGC	2	6	251764	251769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252349
6247	NC_015666	ATC	2	6	251857	251862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336252349
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6250	NC_015666	AGTCA	2	10	252082	252091	40 %	20 %	20 %	20 %	336252349
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6253	NC_015666	AGT	2	6	252195	252200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336252349
6254	NC_015666	TCG	2	6	252212	252217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252349
6255	NC_015666	TCT	2	6	252302	252307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336252349
6256	NC_015666	GTC	2	6	252316	252321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252349
6257	NC_015666	ATGTA	2	10	252331	252340	40 %	40 %	20 %	0 %	336252349
6258	NC_015666	GTC	2	6	252341	252346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252349
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6263	NC_015666	TTC	2	6	252830	252835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336252350
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6293	NC_015666	GCA	2	6	254376	254381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252351
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6303	NC_015666	CGA	2	6	254772	254777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252351
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6340	NC_015666	GAA	2	6	256291	256296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336252351
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6344	NC_015666	CAG	2	6	256396	256401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252351
6345	NC_015666	CGAGAC	2	12	256404	256415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252351
6346	NC_015666	CGA	2	6	256464	256469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252351
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6348	NC_015666	GAG	2	6	256546	256551	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252351
6349	NC_015666	CTG	2	6	256573	256578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252351
6350	NC_015666	CGA	2	6	256719	256724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252351
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6352	NC_015666	CCG	2	6	256876	256881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252351
6353	NC_015666	CGA	2	6	256890	256895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252351
6354	NC_015666	CGA	2	6	256898	256903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252351
6355	NC_015666	ACC	2	6	256904	256909	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336252351
6356	NC_015666	CGACC	2	10	256911	256920	20 %	0 %	20 %	60 %	336252351
6357	NC_015666	TCG	3	9	256982	256990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252351
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6475	NC_015666	ATC	2	6	261467	261472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336252354
6476	NC_015666	TTC	2	6	261514	261519	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336252354
6477	NC_015666	CATT	2	8	261527	261534	25 %	50 %	0 %	25 %	336252354
6478	NC_015666	CAA	2	6	261702	261707	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336252354
6479	NC_015666	TCCG	2	8	261721	261728	0 %	25 %	25 %	50 %	336252354
6480	NC_015666	GTC	2	6	261751	261756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252354
6481	NC_015666	GAC	3	9	262042	262050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252354
6482	NC_015666	CGGC	2	8	262094	262101	0 %	0 %	50 %	50 %	336252354
6483	NC_015666	ACT	2	6	262115	262120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336252354
6484	NC_015666	ACCA	2	8	262127	262134	50 %	0 %	0 %	50 %	336252354
6485	NC_015666	GGA	2	6	262137	262142	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252354
6486	NC_015666	GCG	2	6	262206	262211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252354
6487	NC_015666	TGCC	2	8	262282	262289	0 %	25 %	25 %	50 %	336252354
6488	NC_015666	ACG	2	6	262310	262315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252354
6489	NC_015666	GTC	2	6	262324	262329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252354
6490	NC_015666	GAA	2	6	262336	262341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336252354
6491	NC_015666	GA	3	6	262350	262355	50 %	0 %	50 %	0 %	336252354
6492	NC_015666	GAC	2	6	262377	262382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252354
6493	NC_015666	GCT	2	6	262389	262394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252354
6494	NC_015666	CGA	2	6	262474	262479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252355
6495	NC_015666	CGA	2	6	262483	262488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252355
6496	NC_015666	CCA	2	6	262501	262506	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336252355
6497	NC_015666	AGC	2	6	262614	262619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252355
6498	NC_015666	TC	3	6	262726	262731	0 %	50 %	0 %	50 %	336252355
6499	NC_015666	AGTC	2	8	262755	262762	25 %	25 %	25 %	25 %	336252355
6500	NC_015666	GGA	2	6	262807	262812	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252355

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