MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halopiger xanaduensis SH-6 chromosome

Total Repeats: 91388

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_015666	GAG	2	6	219139	219144	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252323
5502	NC_015666	GGA	2	6	219192	219197	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252323
5503	NC_015666	CGA	2	6	219207	219212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252323
5504	NC_015666	GAG	2	6	219247	219252	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252323
5505	NC_015666	CGC	2	6	219278	219283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252323
5506	NC_015666	CCG	2	6	219332	219337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252323
5507	NC_015666	CGA	2	6	219405	219410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252323
5508	NC_015666	GCC	2	6	219430	219435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252323
5509	NC_015666	GGCCGC	2	12	219461	219472	0 %	0 %	50 %	50 %	336252323
5510	NC_015666	GAG	2	6	219487	219492	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252323
5511	NC_015666	CGG	2	6	219494	219499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252323
5512	NC_015666	CCG	2	6	219557	219562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252323
5513	NC_015666	GCG	2	6	219579	219584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252323
5514	NC_015666	TCG	2	6	219599	219604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252323
5515	NC_015666	GAC	2	6	219631	219636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252324
5516	NC_015666	GACG	2	8	219657	219664	25 %	0 %	50 %	25 %	336252324
5517	NC_015666	ACG	2	6	219728	219733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252324
5518	NC_015666	CGT	2	6	219741	219746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252324
5519	NC_015666	CGA	2	6	219762	219767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252324
5520	NC_015666	GCGT	2	8	219794	219801	0 %	25 %	50 %	25 %	336252324
5521	NC_015666	GGTC	2	8	219852	219859	0 %	25 %	50 %	25 %	336252324
5522	NC_015666	TCG	2	6	219887	219892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252324
5523	NC_015666	CGT	2	6	219897	219902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252324
5524	NC_015666	CGA	2	6	219954	219959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252324
5525	NC_015666	CGGG	2	8	220004	220011	0 %	0 %	75 %	25 %	336252324
5526	NC_015666	GTC	2	6	220018	220023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252324
5527	NC_015666	CAGC	2	8	220148	220155	25 %	0 %	25 %	50 %	336252325
5528	NC_015666	GAC	2	6	220158	220163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252325
5529	NC_015666	CGA	2	6	220193	220198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252325
5530	NC_015666	CGA	3	9	220217	220225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252325
5531	NC_015666	GCG	2	6	220238	220243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252325
5532	NC_015666	CGA	3	9	220247	220255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252325
5533	NC_015666	GGA	2	6	220283	220288	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252325
5534	NC_015666	CGT	2	6	220296	220301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252325
5535	NC_015666	CGC	2	6	220308	220313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252325
5536	NC_015666	CAG	2	6	220350	220355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252325
5537	NC_015666	ACCAGC	2	12	220369	220380	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	336252325
5538	NC_015666	CCG	2	6	220402	220407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252325
5539	NC_015666	CCG	2	6	220537	220542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252325
5540	NC_015666	CGC	2	6	220548	220553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252325
5541	NC_015666	CCG	2	6	220558	220563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252325
5542	NC_015666	CGA	2	6	220613	220618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252325
5543	NC_015666	GC	3	6	220619	220624	0 %	0 %	50 %	50 %	336252325
5544	NC_015666	CGA	2	6	220625	220630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252325
5545	NC_015666	GAC	2	6	220647	220652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252325
5546	NC_015666	CGTC	2	8	220663	220670	0 %	25 %	25 %	50 %	336252325
5547	NC_015666	CGCTG	2	10	220701	220710	0 %	20 %	40 %	40 %	336252325
5548	NC_015666	CGA	2	6	220712	220717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252325
5549	NC_015666	CCG	2	6	220810	220815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252325
5550	NC_015666	TCG	2	6	220823	220828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252325
5551	NC_015666	GATGCC	2	12	220830	220841	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	336252325
5552	NC_015666	AAG	2	6	220846	220851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336252325
5553	NC_015666	GA	3	6	220879	220884	50 %	0 %	50 %	0 %	336252325
5554	NC_015666	TCG	2	6	221006	221011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252326
5555	NC_015666	GTCG	2	8	221029	221036	0 %	25 %	50 %	25 %	336252326
5556	NC_015666	GCG	2	6	221045	221050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252326
5557	NC_015666	GCG	2	6	221091	221096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252326
5558	NC_015666	GCG	2	6	221106	221111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252326
5559	NC_015666	C	6	6	221155	221160	0 %	0 %	0 %	100 %	336252326
5560	NC_015666	GAC	2	6	221164	221169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252326
5561	NC_015666	CGA	2	6	221202	221207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252326
5562	NC_015666	CCG	2	6	221210	221215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252326
5563	NC_015666	CGA	3	9	221223	221231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252326
5564	NC_015666	ACG	3	9	221315	221323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252326
5565	NC_015666	CGG	2	6	221331	221336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252326
5566	NC_015666	CGGC	2	8	221338	221345	0 %	0 %	50 %	50 %	336252326
5567	NC_015666	CGA	2	6	221352	221357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252326
5568	NC_015666	GCA	2	6	221403	221408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252326
5569	NC_015666	GAC	2	6	221440	221445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252326
5570	NC_015666	CCG	2	6	221496	221501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252326
5571	NC_015666	CCG	2	6	221549	221554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252326
5572	NC_015666	TCG	3	9	221573	221581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252326
5573	NC_015666	CGA	2	6	221607	221612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252326
5574	NC_015666	GCA	2	6	221628	221633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252326
5575	NC_015666	CGA	2	6	221691	221696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252326
5576	NC_015666	CGATC	2	10	221736	221745	20 %	20 %	20 %	40 %	336252326
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5578	NC_015666	CAG	2	6	221911	221916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252326
5579	NC_015666	CGA	3	9	221922	221930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252326
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5582	NC_015666	GCACGA	2	12	222036	222047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252326
5583	NC_015666	GAG	2	6	222055	222060	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252326
5584	NC_015666	CGA	2	6	222099	222104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252326
5585	NC_015666	GGTC	2	8	222112	222119	0 %	25 %	50 %	25 %	336252326
5586	NC_015666	GAC	2	6	222293	222298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252327
5587	NC_015666	GTA	2	6	222338	222343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336252327
5588	NC_015666	CAGCGC	2	12	222362	222373	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	336252327
5589	NC_015666	CGA	2	6	222388	222393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252327
5590	NC_015666	CAT	2	6	222410	222415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336252327
5591	NC_015666	GGATCG	2	12	222454	222465	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	336252327
5592	NC_015666	GCG	2	6	222503	222508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252327
5593	NC_015666	CGG	2	6	222565	222570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252327
5594	NC_015666	GCT	2	6	222590	222595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252327
5595	NC_015666	CGG	2	6	222667	222672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252327
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5598	NC_015666	CGC	2	6	222749	222754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252327
5599	NC_015666	CGG	2	6	222774	222779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252327
5600	NC_015666	GAC	2	6	222788	222793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252327
5601	NC_015666	GAA	2	6	222830	222835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336252327
5602	NC_015666	GTA	2	6	222842	222847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336252327
5603	NC_015666	GTC	2	6	222852	222857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252327
5604	NC_015666	CAG	2	6	222860	222865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252327
5605	NC_015666	GAT	2	6	222869	222874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336252327
5606	NC_015666	GAAC	2	8	222910	222917	50 %	0 %	25 %	25 %	336252327
5607	NC_015666	CGG	2	6	222938	222943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252327
5608	NC_015666	CGA	2	6	222955	222960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252327
5609	NC_015666	CGA	2	6	223036	223041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252327
5610	NC_015666	GAT	3	9	223064	223072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336252327
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5613	NC_015666	ATG	2	6	223155	223160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336252327
5614	NC_015666	GTTC	2	8	223231	223238	0 %	50 %	25 %	25 %	336252327
5615	NC_015666	CGC	2	6	223241	223246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252327
5616	NC_015666	AGG	2	6	223308	223313	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252327
5617	NC_015666	CCGAAC	2	12	223314	223325	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	336252327
5618	NC_015666	TCAG	2	8	223338	223345	25 %	25 %	25 %	25 %	336252327
5619	NC_015666	CGC	2	6	223376	223381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252327
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5623	NC_015666	CCG	2	6	223444	223449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252327
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5738	NC_015666	GCC	2	6	228271	228276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252329
5739	NC_015666	CGG	2	6	228337	228342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252329
5740	NC_015666	CGA	4	12	228353	228364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252329
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5742	NC_015666	CG	3	6	228406	228411	0 %	0 %	50 %	50 %	336252329
5743	NC_015666	CGA	2	6	228413	228418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252329
5744	NC_015666	CGTGAT	2	12	228449	228460	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	336252329
5745	NC_015666	CGA	2	6	228473	228478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252329
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5747	NC_015666	CGA	2	6	228539	228544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252329
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5751	NC_015666	GTC	2	6	228907	228912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252330
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5754	NC_015666	TCGA	2	8	228995	229002	25 %	25 %	25 %	25 %	336252330
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5766	NC_015666	TGA	2	6	229366	229371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336252330
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5801	NC_015666	CCTCGA	2	12	231078	231089	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	336252332
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5847	NC_015666	GC	3	6	232570	232575	0 %	0 %	50 %	50 %	336252333
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5851	NC_015666	CGT	2	6	232761	232766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252334
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5853	NC_015666	CGC	2	6	232800	232805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252334
5854	NC_015666	CG	3	6	232808	232813	0 %	0 %	50 %	50 %	336252334
5855	NC_015666	ATC	2	6	232861	232866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336252334
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5857	NC_015666	CCGGT	2	10	232891	232900	0 %	20 %	40 %	40 %	336252334
5858	NC_015666	CGT	2	6	232937	232942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252334
5859	NC_015666	CGA	2	6	232946	232951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252334
5860	NC_015666	AGA	2	6	232985	232990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336252334
5861	NC_015666	CGT	2	6	233021	233026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252334
5862	NC_015666	GAC	3	9	233100	233108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252334
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5864	NC_015666	CCG	2	6	233174	233179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252334
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5873	NC_015666	GTA	2	6	233505	233510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336252335
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5976	NC_015666	GAC	2	6	238598	238603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252341
5977	NC_015666	ACGA	2	8	238619	238626	50 %	0 %	25 %	25 %	336252341
5978	NC_015666	CCG	2	6	238644	238649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252341
5979	NC_015666	TCA	2	6	238729	238734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336252341
5980	NC_015666	GCGG	2	8	238736	238743	0 %	0 %	75 %	25 %	336252341
5981	NC_015666	GAGGG	2	10	238752	238761	20 %	0 %	80 %	0 %	336252341
5982	NC_015666	TAC	2	6	238799	238804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336252341
5983	NC_015666	GCG	2	6	238808	238813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252341
5984	NC_015666	GTCGA	2	10	238827	238836	20 %	20 %	40 %	20 %	336252341
5985	NC_015666	CGG	2	6	238855	238860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252341
5986	NC_015666	GAC	2	6	238868	238873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252341
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5989	NC_015666	GAT	2	6	239186	239191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336252341
5990	NC_015666	CGAT	2	8	239196	239203	25 %	25 %	25 %	25 %	336252341
5991	NC_015666	GGA	2	6	239263	239268	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252341
5992	NC_015666	TCG	2	6	239274	239279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252341
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5998	NC_015666	CG	3	6	239747	239752	0 %	0 %	50 %	50 %	336252341
5999	NC_015666	ACGG	2	8	239780	239787	25 %	0 %	50 %	25 %	336252341
6000	NC_015666	CGG	2	6	239922	239927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252341

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