MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halopiger xanaduensis SH-6 plasmid pHALXA01

Total Repeats: 9046

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_015658	ACGCG	2	10	55682	55691	20 %	0 %	40 %	40 %	336251796
1003	NC_015658	CGG	2	6	55699	55704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336251796
1004	NC_015658	AGC	2	6	55783	55788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251796
1005	NC_015658	GAA	2	6	55827	55832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336251796
1006	NC_015658	CGA	2	6	55886	55891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251796
1007	NC_015658	CAG	2	6	55953	55958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251796
1008	NC_015658	CAG	2	6	55980	55985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251796
1009	NC_015658	CAT	2	6	56004	56009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336251796
1010	NC_015658	GCG	2	6	56031	56036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336251796
1011	NC_015658	CAG	2	6	56049	56054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251796
1012	NC_015658	TCG	2	6	56084	56089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251796
1013	NC_015658	CGT	2	6	56109	56114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251796
1014	NC_015658	GCG	2	6	56217	56222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336251797
1015	NC_015658	CCT	2	6	56227	56232	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336251797
1016	NC_015658	CGA	2	6	56383	56388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251797
1017	NC_015658	CGC	2	6	56400	56405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336251797
1018	NC_015658	CTC	2	6	56411	56416	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336251797
1019	NC_015658	AGT	2	6	56479	56484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336251797
1020	NC_015658	GCC	2	6	56489	56494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336251797
1021	NC_015658	GC	3	6	56497	56502	0 %	0 %	50 %	50 %	336251797
1022	NC_015658	GCC	2	6	56510	56515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336251797
1023	NC_015658	CTCGCC	2	12	56528	56539	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	336251797
1024	NC_015658	GGCATC	2	12	56556	56567	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	336251797
1025	NC_015658	CGT	2	6	56590	56595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251797
1026	NC_015658	GTTGAT	2	12	56603	56614	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	336251797
1027	NC_015658	CGGT	2	8	56649	56656	0 %	25 %	50 %	25 %	336251797
1028	NC_015658	CCG	2	6	56712	56717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336251797
1029	NC_015658	CGTC	2	8	56743	56750	0 %	25 %	25 %	50 %	336251797
1030	NC_015658	TCG	2	6	56799	56804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251797
1031	NC_015658	CGC	2	6	56866	56871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336251797
1032	NC_015658	ACG	2	6	56875	56880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251797
1033	NC_015658	GCA	2	6	56900	56905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251797
1034	NC_015658	TCG	2	6	57073	57078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251797
1035	NC_015658	AGT	2	6	57151	57156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336251797
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1037	NC_015658	CAG	2	6	57257	57262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251797
1038	NC_015658	TCG	2	6	57315	57320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251797
1039	NC_015658	CGC	2	6	57331	57336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336251797
1040	NC_015658	ATC	2	6	57339	57344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336251797
1041	NC_015658	CGT	2	6	57373	57378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251797
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1043	NC_015658	TCGT	2	8	57417	57424	0 %	50 %	25 %	25 %	336251797
1044	NC_015658	GTA	2	6	57436	57441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336251797
1045	NC_015658	CGT	2	6	57451	57456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251797
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1050	NC_015658	GCT	3	9	57725	57733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251798
1051	NC_015658	GATG	2	8	57782	57789	25 %	25 %	50 %	0 %	336251798
1052	NC_015658	TTC	2	6	57825	57830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336251798
1053	NC_015658	TCA	2	6	57854	57859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336251798
1054	NC_015658	GGT	2	6	57863	57868	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336251798
1055	NC_015658	ACAT	2	8	57928	57935	50 %	25 %	0 %	25 %	336251798
1056	NC_015658	GACC	2	8	57975	57982	25 %	0 %	25 %	50 %	336251798
1057	NC_015658	C	6	6	57990	57995	0 %	0 %	0 %	100 %	336251798
1058	NC_015658	TCC	2	6	58024	58029	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336251798
1059	NC_015658	GCATCC	2	12	58057	58068	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	336251798
1060	NC_015658	CCT	2	6	58076	58081	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336251798
1061	NC_015658	CGA	2	6	58181	58186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251798
1062	NC_015658	GCG	2	6	58217	58222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336251798
1063	NC_015658	CTG	2	6	58230	58235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251798
1064	NC_015658	CGC	2	6	58241	58246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336251798
1065	NC_015658	TGA	2	6	58250	58255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336251798
1066	NC_015658	CCT	3	9	58283	58291	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336251798
1067	NC_015658	TCCG	2	8	58348	58355	0 %	25 %	25 %	50 %	336251798
1068	NC_015658	CG	3	6	58431	58436	0 %	0 %	50 %	50 %	336251798
1069	NC_015658	CCG	2	6	58462	58467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336251798
1070	NC_015658	CGT	2	6	58523	58528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251798
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1080	NC_015658	GTC	2	6	58809	58814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251798
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1086	NC_015658	CGGG	2	8	59343	59350	0 %	0 %	75 %	25 %	336251799
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1089	NC_015658	CGA	2	6	59466	59471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251799
1090	NC_015658	CG	3	6	59499	59504	0 %	0 %	50 %	50 %	336251799
1091	NC_015658	CGAC	2	8	59515	59522	25 %	0 %	25 %	50 %	336251799
1092	NC_015658	GGC	2	6	59523	59528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336251799
1093	NC_015658	ACGG	2	8	59646	59653	25 %	0 %	50 %	25 %	336251799
1094	NC_015658	ACA	2	6	59716	59721	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336251799
1095	NC_015658	GAC	3	9	59735	59743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251799
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1099	NC_015658	CGT	2	6	59846	59851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251799
1100	NC_015658	CGGC	2	8	59855	59862	0 %	0 %	50 %	50 %	336251799
1101	NC_015658	CGC	2	6	59875	59880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336251799
1102	NC_015658	CGATC	2	10	59888	59897	20 %	20 %	20 %	40 %	336251799
1103	NC_015658	CCCGA	2	10	59910	59919	20 %	0 %	20 %	60 %	336251799
1104	NC_015658	GC	3	6	59968	59973	0 %	0 %	50 %	50 %	336251799
1105	NC_015658	GC	4	8	60000	60007	0 %	0 %	50 %	50 %	336251799
1106	NC_015658	CGC	3	9	60005	60013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336251799
1107	NC_015658	CGA	3	9	60061	60069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251799
1108	NC_015658	GC	3	6	60085	60090	0 %	0 %	50 %	50 %	336251799
1109	NC_015658	GAG	2	6	60108	60113	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336251799
1110	NC_015658	ATCG	2	8	60120	60127	25 %	25 %	25 %	25 %	336251799
1111	NC_015658	GCC	2	6	60129	60134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336251799
1112	NC_015658	CGCT	2	8	60153	60160	0 %	25 %	25 %	50 %	336251799
1113	NC_015658	GGA	2	6	60185	60190	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336251799
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1119	NC_015658	CGT	2	6	60332	60337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251799
1120	NC_015658	GATCG	2	10	60462	60471	20 %	20 %	40 %	20 %	336251799
1121	NC_015658	AG	3	6	60477	60482	50 %	0 %	50 %	0 %	336251799
1122	NC_015658	TCC	2	6	60486	60491	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336251799
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1124	NC_015658	ACG	2	6	60550	60555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251799
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1242	NC_015658	CGG	2	6	65839	65844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336251802
1243	NC_015658	CGA	2	6	65857	65862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251802
1244	NC_015658	CGT	3	9	65912	65920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251802
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1491	NC_015658	GC	3	6	75978	75983	0 %	0 %	50 %	50 %	336251809
1492	NC_015658	TCC	2	6	76004	76009	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336251809
1493	NC_015658	GTC	2	6	76030	76035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251809
1494	NC_015658	CCGT	2	8	76064	76071	0 %	25 %	25 %	50 %	336251809
1495	NC_015658	CGGT	2	8	76072	76079	0 %	25 %	50 %	25 %	336251809
1496	NC_015658	CGA	2	6	76110	76115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251809
1497	NC_015658	CAG	2	6	76123	76128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251809
1498	NC_015658	CCCGGA	2	12	76150	76161	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	336251809
1499	NC_015658	CGA	2	6	76167	76172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251809
1500	NC_015658	GAT	2	6	76177	76182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336251809

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