MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halopiger xanaduensis SH-6 plasmid pHALXA01

Total Repeats: 9046

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_015658	GTCTC	2	10	372873	372882	0 %	40 %	20 %	40 %	336252054
8002	NC_015658	GAC	2	6	372905	372910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252054
8003	NC_015658	GC	3	6	372936	372941	0 %	0 %	50 %	50 %	336252054
8004	NC_015658	TCG	3	9	372945	372953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252054
8005	NC_015658	TCG	2	6	373011	373016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252054
8006	NC_015658	CGTC	2	8	373029	373036	0 %	25 %	25 %	50 %	336252054
8007	NC_015658	CGT	2	6	373060	373065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252054
8008	NC_015658	CGTTC	2	10	373075	373084	0 %	40 %	20 %	40 %	336252054
8009	NC_015658	TCG	2	6	373116	373121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252054
8010	NC_015658	GAC	2	6	373127	373132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252054
8011	NC_015658	GAT	2	6	373144	373149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336252054
8012	NC_015658	GCGG	2	8	373157	373164	0 %	0 %	75 %	25 %	336252054
8013	NC_015658	GTC	2	6	373169	373174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252054
8014	NC_015658	CGT	2	6	373177	373182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252054
8015	NC_015658	TGC	2	6	373194	373199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252054
8016	NC_015658	CGT	2	6	373219	373224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252054
8017	NC_015658	CGGCG	2	10	373225	373234	0 %	0 %	60 %	40 %	336252054
8018	NC_015658	CGTACT	2	12	373255	373266	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	336252054
8019	NC_015658	GGC	2	6	373267	373272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252054
8020	NC_015658	TC	3	6	373336	373341	0 %	50 %	0 %	50 %	336252054
8021	NC_015658	ACG	2	6	373352	373357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252054
8022	NC_015658	CGCGC	2	10	373421	373430	0 %	0 %	40 %	60 %	336252054
8023	NC_015658	TCG	2	6	373449	373454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252054
8024	NC_015658	CGT	2	6	373471	373476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252054
8025	NC_015658	CGC	2	6	373477	373482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252054
8026	NC_015658	CGT	2	6	373486	373491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252054
8027	NC_015658	CGC	2	6	373496	373501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252054
8028	NC_015658	CCT	2	6	373545	373550	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252054
8029	NC_015658	CGA	2	6	373582	373587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252054
8030	NC_015658	CCG	2	6	373632	373637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252054
8031	NC_015658	CGGC	2	8	373684	373691	0 %	0 %	50 %	50 %	336252054
8032	NC_015658	TCG	2	6	373695	373700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252054
8033	NC_015658	ACG	2	6	373727	373732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252054
8034	NC_015658	TCG	3	9	373737	373745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252054
8035	NC_015658	GCGTCA	2	12	373749	373760	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	336252054
8036	NC_015658	GCG	3	9	373776	373784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252054
8037	NC_015658	CG	3	6	373799	373804	0 %	0 %	50 %	50 %	336252054
8038	NC_015658	GCG	2	6	373806	373811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252054
8039	NC_015658	CTG	2	6	373838	373843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252054
8040	NC_015658	CGC	2	6	373870	373875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252054
8041	NC_015658	CGC	2	6	373920	373925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252054
8042	NC_015658	CCG	2	6	373974	373979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252054
8043	NC_015658	CTA	2	6	373987	373992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336252054
8044	NC_015658	CAC	2	6	373999	374004	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336252054
8045	NC_015658	GTC	2	6	374018	374023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252054
8046	NC_015658	ACCG	2	8	374034	374041	25 %	0 %	25 %	50 %	336252054
8047	NC_015658	GTC	2	6	374044	374049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252054
8048	NC_015658	ACTGA	2	10	374058	374067	40 %	20 %	20 %	20 %	336252054
8049	NC_015658	CGA	2	6	374557	374562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252055
8050	NC_015658	TGC	2	6	374593	374598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252055
8051	NC_015658	TGAT	2	8	374643	374650	25 %	50 %	25 %	0 %	336252055
8052	NC_015658	CGA	2	6	374674	374679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252055
8053	NC_015658	ATG	2	6	374721	374726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336252055
8054	NC_015658	TCCGAC	2	12	375466	375477	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	336252056
8055	NC_015658	GTTC	2	8	375483	375490	0 %	50 %	25 %	25 %	336252056
8056	NC_015658	CAA	2	6	375510	375515	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336252056
8057	NC_015658	CTC	2	6	375520	375525	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252056
8058	NC_015658	TCG	2	6	375557	375562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252056
8059	NC_015658	CGA	3	9	375567	375575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252056
8060	NC_015658	TG	3	6	375671	375676	0 %	50 %	50 %	0 %	336252056
8061	NC_015658	TCG	2	6	375698	375703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252056
8062	NC_015658	CCG	2	6	375707	375712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252056
8063	NC_015658	AGG	2	6	375713	375718	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252056
8064	NC_015658	ACGT	2	8	375733	375740	25 %	25 %	25 %	25 %	336252056
8065	NC_015658	GC	3	6	375752	375757	0 %	0 %	50 %	50 %	336252056
8066	NC_015658	TAC	2	6	375859	375864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336252056
8067	NC_015658	CGA	2	6	375885	375890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252056
8068	NC_015658	ACG	2	6	375896	375901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252056
8069	NC_015658	CGA	2	6	375918	375923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252056
8070	NC_015658	CGT	2	6	376008	376013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252056
8071	NC_015658	ACGA	2	8	376052	376059	50 %	0 %	25 %	25 %	336252056
8072	NC_015658	CAACG	2	10	376104	376113	40 %	0 %	20 %	40 %	336252056
8073	NC_015658	GGC	2	6	376131	376136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252056
8074	NC_015658	GAG	2	6	376168	376173	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252056
8075	NC_015658	CGC	2	6	376200	376205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252056
8076	NC_015658	CG	3	6	376221	376226	0 %	0 %	50 %	50 %	336252056
8077	NC_015658	TTC	2	6	376241	376246	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336252056
8078	NC_015658	GTG	2	6	376303	376308	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336252056
8079	NC_015658	GAGC	2	8	376318	376325	25 %	0 %	50 %	25 %	336252056
8080	NC_015658	CGC	2	6	376364	376369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252056
8081	NC_015658	CTCG	2	8	376404	376411	0 %	25 %	25 %	50 %	336252056
8082	NC_015658	GGAG	2	8	376588	376595	25 %	0 %	75 %	0 %	336252056
8083	NC_015658	GAAG	2	8	376600	376607	50 %	0 %	50 %	0 %	336252056
8084	NC_015658	GGA	2	6	376629	376634	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252056
8085	NC_015658	GATTT	2	10	378059	378068	20 %	60 %	20 %	0 %	336252057
8086	NC_015658	ATCCGT	2	12	378151	378162	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	336252057
8087	NC_015658	CCG	2	6	378246	378251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252057
8088	NC_015658	CCG	2	6	378255	378260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252057
8089	NC_015658	GATC	2	8	378271	378278	25 %	25 %	25 %	25 %	336252057
8090	NC_015658	TCG	2	6	378324	378329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252057
8091	NC_015658	ACC	2	6	378383	378388	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336252057
8092	NC_015658	TGG	2	6	378501	378506	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336252057
8093	NC_015658	CCAT	2	8	378531	378538	25 %	25 %	0 %	50 %	336252057
8094	NC_015658	TAG	2	6	378627	378632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336252057
8095	NC_015658	TGG	2	6	378650	378655	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336252057
8096	NC_015658	GTT	2	6	378670	378675	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336252057
8097	NC_015658	CGA	2	6	378769	378774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252057
8098	NC_015658	GCG	2	6	378891	378896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252057
8099	NC_015658	TCC	2	6	379005	379010	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252057
8100	NC_015658	GAC	2	6	379121	379126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252057
8101	NC_015658	GAG	2	6	379127	379132	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252057
8102	NC_015658	GAC	2	6	379154	379159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252057
8103	NC_015658	CAT	2	6	379165	379170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336252057
8104	NC_015658	CGAT	2	8	379261	379268	25 %	25 %	25 %	25 %	336252057
8105	NC_015658	GTC	2	6	379351	379356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252058
8106	NC_015658	TCA	2	6	379406	379411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336252058
8107	NC_015658	CGT	2	6	379413	379418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252058
8108	NC_015658	GTC	2	6	379507	379512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252058
8109	NC_015658	CTG	2	6	379542	379547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252058
8110	NC_015658	GCCGTA	2	12	379594	379605	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	336252058
8111	NC_015658	ACG	2	6	379761	379766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252058
8112	NC_015658	GATC	2	8	379833	379840	25 %	25 %	25 %	25 %	336252058
8113	NC_015658	TGG	2	6	379856	379861	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336252058
8114	NC_015658	TCG	2	6	379988	379993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252058
8115	NC_015658	CCA	2	6	380041	380046	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336252058
8116	NC_015658	CGTAGG	2	12	380127	380138	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	336252058
8117	NC_015658	TAT	2	6	380184	380189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336252058
8118	NC_015658	CCGT	2	8	380210	380217	0 %	25 %	25 %	50 %	336252058
8119	NC_015658	CGT	2	6	380226	380231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252058
8120	NC_015658	CGA	2	6	380235	380240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252058
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8236	NC_015658	CGACG	2	10	388100	388109	20 %	0 %	40 %	40 %	336252068
8237	NC_015658	CGG	2	6	388136	388141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252068
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8360	NC_015658	GTC	2	6	395956	395961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252072
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8475	NC_015658	GGC	2	6	403085	403090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252075
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8477	NC_015658	GGT	2	6	403213	403218	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336252076
8478	NC_015658	GCG	2	6	403226	403231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252076
8479	NC_015658	GACGCG	2	12	403248	403259	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	336252076
8480	NC_015658	CCT	2	6	403342	403347	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252076
8481	NC_015658	CG	3	6	403366	403371	0 %	0 %	50 %	50 %	336252076
8482	NC_015658	TCG	2	6	403425	403430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252076
8483	NC_015658	CTC	2	6	403499	403504	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252076
8484	NC_015658	CTC	2	6	403526	403531	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252076
8485	NC_015658	AGT	2	6	403584	403589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336252076
8486	NC_015658	CGG	2	6	403601	403606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252076
8487	NC_015658	CGA	2	6	403651	403656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252076
8488	NC_015658	GGTC	2	8	403666	403673	0 %	25 %	50 %	25 %	336252076
8489	NC_015658	GTCGGC	2	12	403679	403690	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	336252076
8490	NC_015658	CGC	2	6	403694	403699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252076
8491	NC_015658	ACTCGA	2	12	403774	403785	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	336252076
8492	NC_015658	GCT	2	6	403828	403833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252076
8493	NC_015658	TGA	2	6	404062	404067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336252077
8494	NC_015658	TGG	2	6	404085	404090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336252077
8495	NC_015658	GAG	2	6	404151	404156	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252077
8496	NC_015658	GAG	2	6	404169	404174	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252077
8497	NC_015658	GGA	2	6	404192	404197	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252077
8498	NC_015658	GAAG	2	8	404201	404208	50 %	0 %	50 %	0 %	336252077
8499	NC_015658	TGA	3	9	404221	404229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336252077
8500	NC_015658	TGG	2	6	404241	404246	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336252077

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