MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halopiger xanaduensis SH-6 plasmid pHALXA01

Total Repeats: 9046

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7501	NC_015658	AGC	2	6	347715	347720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252030
7502	NC_015658	GATCG	2	10	347738	347747	20 %	20 %	40 %	20 %	336252030
7503	NC_015658	GAA	2	6	347756	347761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336252030
7504	NC_015658	TCG	2	6	348205	348210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252031
7505	NC_015658	TCG	2	6	348247	348252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252031
7506	NC_015658	CAG	2	6	348309	348314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252031
7507	NC_015658	TCG	2	6	348337	348342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252031
7508	NC_015658	CTC	2	6	348357	348362	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252031
7509	NC_015658	TCG	2	6	348385	348390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252031
7510	NC_015658	GTT	2	6	348461	348466	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336252031
7511	NC_015658	GGA	2	6	348533	348538	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252031
7512	NC_015658	TCG	3	9	348583	348591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252031
7513	NC_015658	TCC	2	6	348619	348624	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252031
7514	NC_015658	CGC	2	6	348670	348675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252031
7515	NC_015658	TTC	2	6	348697	348702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336252031
7516	NC_015658	AAG	2	6	348736	348741	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336252031
7517	NC_015658	CG	3	6	348767	348772	0 %	0 %	50 %	50 %	336252031
7518	NC_015658	CCG	3	9	348785	348793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252031
7519	NC_015658	CGT	2	6	348812	348817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252031
7520	NC_015658	TCG	2	6	349019	349024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252032
7521	NC_015658	GTG	2	6	349042	349047	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336252032
7522	NC_015658	TCG	2	6	349050	349055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252032
7523	NC_015658	CGA	2	6	349068	349073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252032
7524	NC_015658	CCG	2	6	349091	349096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252032
7525	NC_015658	TCA	2	6	349113	349118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336252032
7526	NC_015658	GGTA	2	8	349119	349126	25 %	25 %	50 %	0 %	336252032
7527	NC_015658	CGT	2	6	349150	349155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252032
7528	NC_015658	ACG	2	6	349160	349165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252032
7529	NC_015658	CGTT	2	8	349192	349199	0 %	50 %	25 %	25 %	336252032
7530	NC_015658	CCG	2	6	349284	349289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252032
7531	NC_015658	TCCG	2	8	349313	349320	0 %	25 %	25 %	50 %	336252032
7532	NC_015658	GTC	2	6	349340	349345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252032
7533	NC_015658	CGC	2	6	349347	349352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252032
7534	NC_015658	TCC	2	6	349376	349381	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252032
7535	NC_015658	GCC	2	6	349402	349407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252032
7536	NC_015658	CGG	2	6	349485	349490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252032
7537	NC_015658	TCCC	2	8	349503	349510	0 %	25 %	0 %	75 %	336252032
7538	NC_015658	CGA	2	6	349596	349601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252032
7539	NC_015658	CGT	2	6	349653	349658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252032
7540	NC_015658	GCC	2	6	349666	349671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252032
7541	NC_015658	CGC	2	6	349689	349694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252032
7542	NC_015658	CGG	2	6	349707	349712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252032
7543	NC_015658	GAA	2	6	349717	349722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336252032
7544	NC_015658	CGT	2	6	349794	349799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252032
7545	NC_015658	CGT	2	6	349821	349826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252032
7546	NC_015658	GAT	2	6	349857	349862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336252032
7547	NC_015658	CGGT	2	8	349917	349924	0 %	25 %	50 %	25 %	336252032
7548	NC_015658	CGA	2	6	349938	349943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252032
7549	NC_015658	CGA	2	6	349947	349952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252032
7550	NC_015658	GCC	2	6	349963	349968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252032
7551	NC_015658	TCG	2	6	350042	350047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252032
7552	NC_015658	CG	3	6	350060	350065	0 %	0 %	50 %	50 %	336252032
7553	NC_015658	CTC	2	6	350122	350127	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252032
7554	NC_015658	GAC	2	6	350128	350133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252032
7555	NC_015658	CGT	2	6	350140	350145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252032
7556	NC_015658	CG	3	6	350185	350190	0 %	0 %	50 %	50 %	336252032
7557	NC_015658	CGG	2	6	350446	350451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252033
7558	NC_015658	GGTC	2	8	350505	350512	0 %	25 %	50 %	25 %	336252033
7559	NC_015658	GAC	2	6	350530	350535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252033
7560	NC_015658	CGC	2	6	350550	350555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252033
7561	NC_015658	TCG	2	6	350561	350566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252033
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7563	NC_015658	GCG	2	6	350573	350578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252033
7564	NC_015658	GGC	2	6	350783	350788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252034
7565	NC_015658	CGA	3	9	350824	350832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252034
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7567	NC_015658	GGC	2	6	350902	350907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252034
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7569	NC_015658	CTG	2	6	350945	350950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252034
7570	NC_015658	CGA	2	6	350959	350964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252034
7571	NC_015658	CCGG	2	8	350974	350981	0 %	0 %	50 %	50 %	336252034
7572	NC_015658	CGA	2	6	350992	350997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252034
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7574	NC_015658	TGTA	2	8	351126	351133	25 %	50 %	25 %	0 %	336252034
7575	NC_015658	GC	3	6	351153	351158	0 %	0 %	50 %	50 %	336252034
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7581	NC_015658	CAC	2	6	351318	351323	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336252034
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7585	NC_015658	GGC	2	6	351420	351425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252034
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7589	NC_015658	CGA	2	6	351502	351507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252034
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7593	NC_015658	GTC	2	6	351660	351665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252034
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7599	NC_015658	TCGG	2	8	351846	351853	0 %	25 %	50 %	25 %	336252034
7600	NC_015658	CTC	2	6	352004	352009	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252034
7601	NC_015658	GCT	2	6	352046	352051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252034
7602	NC_015658	TCC	2	6	352059	352064	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252034
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7605	NC_015658	TCG	2	6	352137	352142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252034
7606	NC_015658	CGG	2	6	352145	352150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252034
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7615	NC_015658	GCGA	2	8	352815	352822	25 %	0 %	50 %	25 %	336252035
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7617	NC_015658	CGA	2	6	352847	352852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252035
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7743	NC_015658	CGA	2	6	357948	357953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252039
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7979	NC_015658	CCT	2	6	371919	371924	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252053
7980	NC_015658	TCGAT	2	10	371939	371948	20 %	40 %	20 %	20 %	336252053
7981	NC_015658	CGA	2	6	371952	371957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252053
7982	NC_015658	CGTC	2	8	371982	371989	0 %	25 %	25 %	50 %	336252053
7983	NC_015658	GTT	2	6	372118	372123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336252053
7984	NC_015658	GGCC	2	8	372135	372142	0 %	0 %	50 %	50 %	336252053
7985	NC_015658	CGA	2	6	372156	372161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252053
7986	NC_015658	GC	3	6	372164	372169	0 %	0 %	50 %	50 %	336252053
7987	NC_015658	CTCGTC	2	12	372196	372207	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	336252053
7988	NC_015658	CGG	2	6	372253	372258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252053
7989	NC_015658	CGT	2	6	372280	372285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252053
7990	NC_015658	TC	3	6	372305	372310	0 %	50 %	0 %	50 %	336252053
7991	NC_015658	TAA	2	6	372329	372334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336252053
7992	NC_015658	ATA	2	6	372344	372349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336252053
7993	NC_015658	GCT	3	9	372625	372633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252054
7994	NC_015658	CCT	2	6	372646	372651	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252054
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7998	NC_015658	TCGCGT	2	12	372831	372842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252054
7999	NC_015658	CGG	3	9	372844	372852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252054
8000	NC_015658	CGA	2	6	372864	372869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252054

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