MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halopiger xanaduensis SH-6 plasmid pHALXA01

Total Repeats: 9046

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_015658	GCG	2	6	324583	324588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252009
7002	NC_015658	CGC	2	6	324727	324732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252009
7003	NC_015658	GTC	2	6	324769	324774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252009
7004	NC_015658	CGA	2	6	324816	324821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252009
7005	NC_015658	CGG	2	6	324852	324857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252009
7006	NC_015658	GAC	2	6	324858	324863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252009
7007	NC_015658	CGGA	2	8	324940	324947	25 %	0 %	50 %	25 %	336252009
7008	NC_015658	CGA	2	6	324975	324980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252009
7009	NC_015658	TCG	2	6	325070	325075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252009
7010	NC_015658	TTC	2	6	325108	325113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336252009
7011	NC_015658	CCGGA	2	10	325142	325151	20 %	0 %	40 %	40 %	336252009
7012	NC_015658	GAG	2	6	325195	325200	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252009
7013	NC_015658	ACT	2	6	325205	325210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336252009
7014	NC_015658	GC	3	6	325275	325280	0 %	0 %	50 %	50 %	336252009
7015	NC_015658	GAT	2	6	325613	325618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336252010
7016	NC_015658	AGAA	2	8	325671	325678	75 %	0 %	25 %	0 %	336252010
7017	NC_015658	AGA	2	6	325876	325881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336252011
7018	NC_015658	GCAAG	2	10	325943	325952	40 %	0 %	40 %	20 %	336252011
7019	NC_015658	TTC	2	6	325986	325991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336252011
7020	NC_015658	TGA	2	6	326107	326112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336252011
7021	NC_015658	TGG	2	6	326113	326118	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336252011
7022	NC_015658	A	6	6	326209	326214	100 %	0 %	0 %	0 %	336252011
7023	NC_015658	GCA	2	6	326222	326227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252011
7024	NC_015658	AATT	2	8	326265	326272	50 %	50 %	0 %	0 %	336252011
7025	NC_015658	TCG	2	6	326326	326331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252011
7026	NC_015658	GCA	2	6	326405	326410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252011
7027	NC_015658	AAG	2	6	326423	326428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336252011
7028	NC_015658	TA	3	6	326492	326497	50 %	50 %	0 %	0 %	336252011
7029	NC_015658	GAT	2	6	326510	326515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336252011
7030	NC_015658	AG	3	6	326532	326537	50 %	0 %	50 %	0 %	336252011
7031	NC_015658	GAA	2	6	326715	326720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336252012
7032	NC_015658	GGAA	2	8	326827	326834	50 %	0 %	50 %	0 %	336252012
7033	NC_015658	AC	3	6	326845	326850	50 %	0 %	0 %	50 %	336252012
7034	NC_015658	TA	3	6	326861	326866	50 %	50 %	0 %	0 %	336252012
7035	NC_015658	CTGTCT	2	12	326867	326878	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	336252012
7036	NC_015658	A	6	6	326951	326956	100 %	0 %	0 %	0 %	336252012
7037	NC_015658	GTG	2	6	327038	327043	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336252012
7038	NC_015658	GTC	2	6	327076	327081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252012
7039	NC_015658	ATT	2	6	327232	327237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336252012
7040	NC_015658	TCAG	2	8	327334	327341	25 %	25 %	25 %	25 %	336252012
7041	NC_015658	GAGG	2	8	327372	327379	25 %	0 %	75 %	0 %	336252012
7042	NC_015658	AC	3	6	327391	327396	50 %	0 %	0 %	50 %	336252013
7043	NC_015658	ATG	2	6	327418	327423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336252013
7044	NC_015658	CTT	2	6	327456	327461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336252013
7045	NC_015658	GAA	2	6	327476	327481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336252013
7046	NC_015658	AT	3	6	327505	327510	50 %	50 %	0 %	0 %	336252013
7047	NC_015658	CT	3	6	327576	327581	0 %	50 %	0 %	50 %	336252013
7048	NC_015658	GAA	2	6	327633	327638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336252013
7049	NC_015658	ACC	2	6	327704	327709	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336252013
7050	NC_015658	ACG	2	6	327748	327753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252013
7051	NC_015658	GTT	2	6	327762	327767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336252013
7052	NC_015658	GGA	2	6	327834	327839	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252013
7053	NC_015658	CA	3	6	327840	327845	50 %	0 %	0 %	50 %	336252013
7054	NC_015658	AT	3	6	327946	327951	50 %	50 %	0 %	0 %	336252013
7055	NC_015658	GA	3	6	328053	328058	50 %	0 %	50 %	0 %	336252013
7056	NC_015658	GGT	2	6	328116	328121	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336252013
7057	NC_015658	GAA	2	6	328181	328186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336252013
7058	NC_015658	GAA	2	6	328248	328253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336252013
7059	NC_015658	AACT	2	8	328326	328333	50 %	25 %	0 %	25 %	336252013
7060	NC_015658	CTG	2	6	328705	328710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252014
7061	NC_015658	CGT	2	6	328716	328721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252014
7062	NC_015658	GTC	2	6	328828	328833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252014
7063	NC_015658	CCG	2	6	328870	328875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252014
7064	NC_015658	TCG	2	6	328901	328906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252014
7065	NC_015658	GACG	2	8	328918	328925	25 %	0 %	50 %	25 %	336252014
7066	NC_015658	TACG	2	8	328944	328951	25 %	25 %	25 %	25 %	336252014
7067	NC_015658	GAC	2	6	329068	329073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252014
7068	NC_015658	AC	3	6	329133	329138	50 %	0 %	0 %	50 %	336252014
7069	NC_015658	ACG	2	6	329165	329170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252014
7070	NC_015658	CGA	2	6	329181	329186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252014
7071	NC_015658	ACC	2	6	329242	329247	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336252014
7072	NC_015658	GC	3	6	329268	329273	0 %	0 %	50 %	50 %	336252014
7073	NC_015658	GCG	2	6	329297	329302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252014
7074	NC_015658	ACG	2	6	329330	329335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252014
7075	NC_015658	AGC	2	6	329468	329473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252014
7076	NC_015658	CCCG	3	12	329490	329501	0 %	0 %	25 %	75 %	336252014
7077	NC_015658	CGG	2	6	329502	329507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252014
7078	NC_015658	CGG	2	6	329510	329515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252014
7079	NC_015658	CGT	2	6	329544	329549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252014
7080	NC_015658	CG	3	6	329618	329623	0 %	0 %	50 %	50 %	336252014
7081	NC_015658	CCGA	2	8	329627	329634	25 %	0 %	25 %	50 %	336252014
7082	NC_015658	CGG	2	6	329640	329645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252014
7083	NC_015658	CGA	2	6	329700	329705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252014
7084	NC_015658	CGT	2	6	329706	329711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252014
7085	NC_015658	CGA	2	6	329763	329768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252014
7086	NC_015658	GAG	2	6	329781	329786	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252014
7087	NC_015658	GCC	2	6	329824	329829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252014
7088	NC_015658	TCG	2	6	329867	329872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252014
7089	NC_015658	TCA	2	6	329876	329881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336252014
7090	NC_015658	CCGGC	2	10	329882	329891	0 %	0 %	40 %	60 %	336252014
7091	NC_015658	TGC	2	6	329903	329908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252014
7092	NC_015658	CGGC	2	8	329978	329985	0 %	0 %	50 %	50 %	336252014
7093	NC_015658	CGA	2	6	330016	330021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252014
7094	NC_015658	GAC	2	6	330208	330213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252015
7095	NC_015658	GGT	2	6	330219	330224	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336252015
7096	NC_015658	TCA	2	6	330228	330233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336252015
7097	NC_015658	ATCC	2	8	330273	330280	25 %	25 %	0 %	50 %	336252015
7098	NC_015658	TCG	2	6	330331	330336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252015
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7100	NC_015658	CGTT	2	8	330559	330566	0 %	50 %	25 %	25 %	336252016
7101	NC_015658	CGT	2	6	330638	330643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252016
7102	NC_015658	CGC	2	6	330647	330652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252016
7103	NC_015658	CGC	2	6	330656	330661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252016
7104	NC_015658	GTC	2	6	330702	330707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252016
7105	NC_015658	CATC	2	8	330743	330750	25 %	25 %	0 %	50 %	336252016
7106	NC_015658	AGTA	2	8	330756	330763	50 %	25 %	25 %	0 %	336252016
7107	NC_015658	CGG	2	6	330782	330787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252016
7108	NC_015658	TGC	2	6	330800	330805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252016
7109	NC_015658	CTG	2	6	330810	330815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252016
7110	NC_015658	GGC	2	6	330878	330883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252016
7111	NC_015658	GAA	2	6	330977	330982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336252016
7112	NC_015658	CCG	2	6	330994	330999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252016
7113	NC_015658	CTG	2	6	331014	331019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252016
7114	NC_015658	CTG	2	6	331096	331101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252016
7115	NC_015658	CTC	2	6	331128	331133	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252016
7116	NC_015658	CGA	2	6	331168	331173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252016
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7118	NC_015658	TCT	2	6	331193	331198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336252016
7119	NC_015658	TGC	2	6	331216	331221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252016
7120	NC_015658	CGA	2	6	331559	331564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252017
7121	NC_015658	GC	3	6	331578	331583	0 %	0 %	50 %	50 %	336252017
7122	NC_015658	TCT	2	6	331585	331590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336252017
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7124	NC_015658	TCG	2	6	331615	331620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252017
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7237	NC_015658	CGCC	2	8	336268	336275	0 %	0 %	25 %	75 %	336252023
7238	NC_015658	GCC	2	6	336294	336299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252023
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7360	NC_015658	TCG	2	6	341195	341200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252025
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7369	NC_015658	TCGACA	2	12	341575	341586	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	336252026
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7479	NC_015658	CGT	2	6	346514	346519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252030
7480	NC_015658	GTG	2	6	346640	346645	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336252030
7481	NC_015658	CGA	2	6	346666	346671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252030
7482	NC_015658	CGC	2	6	346691	346696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252030
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