MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haliscomenobacter hydrossis DSM 1100 plasmid pHALHY01

Total Repeats: 2751

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_015511	TGATC	2	10	148578	148587	20 %	40 %	20 %	20 %	332661879
2502	NC_015511	CTT	2	6	148746	148751	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332661879
2503	NC_015511	T	6	6	148750	148755	0 %	100 %	0 %	0 %	332661879
2504	NC_015511	TCA	2	6	148925	148930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332661879
2505	NC_015511	CAC	3	9	149046	149054	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332661879
2506	NC_015511	AATT	2	8	149065	149072	50 %	50 %	0 %	0 %	332661879
2507	NC_015511	A	6	6	149144	149149	100 %	0 %	0 %	0 %	332661879
2508	NC_015511	CAA	2	6	149230	149235	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332661879
2509	NC_015511	TTCA	2	8	149308	149315	25 %	50 %	0 %	25 %	332661879
2510	NC_015511	TAA	2	6	149400	149405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332661879
2511	NC_015511	TCA	2	6	149549	149554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332661879
2512	NC_015511	TTG	2	6	149599	149604	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332661879
2513	NC_015511	GTC	2	6	149641	149646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332661879
2514	NC_015511	AAT	2	6	149655	149660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332661879
2515	NC_015511	T	6	6	149692	149697	0 %	100 %	0 %	0 %	332661879
2516	NC_015511	TCG	2	6	149834	149839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332661879
2517	NC_015511	CAT	2	6	149950	149955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332661879
2518	NC_015511	TAA	2	6	149969	149974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332661880
2519	NC_015511	TAA	2	6	150014	150019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332661880
2520	NC_015511	T	6	6	150045	150050	0 %	100 %	0 %	0 %	332661880
2521	NC_015511	TCA	2	6	150067	150072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332661880
2522	NC_015511	TC	3	6	150084	150089	0 %	50 %	0 %	50 %	332661880
2523	NC_015511	AGC	2	6	150109	150114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332661880
2524	NC_015511	GCTC	2	8	150185	150192	0 %	25 %	25 %	50 %	332661880
2525	NC_015511	CTG	2	6	150259	150264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332661880
2526	NC_015511	GAT	2	6	150267	150272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332661880
2527	NC_015511	A	6	6	150278	150283	100 %	0 %	0 %	0 %	332661880
2528	NC_015511	TTGTA	2	10	150483	150492	20 %	60 %	20 %	0 %	332661880
2529	NC_015511	GA	3	6	150531	150536	50 %	0 %	50 %	0 %	332661880
2530	NC_015511	CCT	2	6	150553	150558	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332661880
2531	NC_015511	GGC	2	6	150611	150616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332661880
2532	NC_015511	T	6	6	150635	150640	0 %	100 %	0 %	0 %	332661880
2533	NC_015511	TCT	2	6	150910	150915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332661880
2534	NC_015511	AAG	2	6	150947	150952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332661880
2535	NC_015511	CAA	2	6	150964	150969	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332661880
2536	NC_015511	TCA	2	6	150988	150993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332661880
2537	NC_015511	TTC	2	6	151005	151010	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332661880
2538	NC_015511	AATA	2	8	151021	151028	75 %	25 %	0 %	0 %	332661880
2539	NC_015511	T	7	7	151112	151118	0 %	100 %	0 %	0 %	332661880
2540	NC_015511	GATT	2	8	151144	151151	25 %	50 %	25 %	0 %	332661880
2541	NC_015511	GAAC	2	8	151178	151185	50 %	0 %	25 %	25 %	332661880
2542	NC_015511	ATG	2	6	151244	151249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332661880
2543	NC_015511	CGGT	2	8	151324	151331	0 %	25 %	50 %	25 %	332661880
2544	NC_015511	CTT	2	6	151421	151426	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332661880
2545	NC_015511	T	6	6	151533	151538	0 %	100 %	0 %	0 %	332661880
2546	NC_015511	T	7	7	151577	151583	0 %	100 %	0 %	0 %	332661880
2547	NC_015511	GGC	2	6	151584	151589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332661880
2548	NC_015511	A	6	6	151655	151660	100 %	0 %	0 %	0 %	332661880
2549	NC_015511	ATC	2	6	151675	151680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332661880
2550	NC_015511	ACA	2	6	151724	151729	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332661880
2551	NC_015511	CAA	2	6	151766	151771	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332661880
2552	NC_015511	GAA	2	6	151859	151864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332661881
2553	NC_015511	T	8	8	151880	151887	0 %	100 %	0 %	0 %	332661881
2554	NC_015511	CCA	2	6	152009	152014	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332661881
2555	NC_015511	GGT	2	6	152045	152050	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332661881
2556	NC_015511	A	6	6	152399	152404	100 %	0 %	0 %	0 %	332661881
2557	NC_015511	CCT	2	6	152410	152415	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332661881
2558	NC_015511	TCCT	2	8	152438	152445	0 %	50 %	0 %	50 %	332661881
2559	NC_015511	ATC	2	6	152504	152509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332661881
2560	NC_015511	GTC	2	6	152519	152524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332661881
2561	NC_015511	A	6	6	152580	152585	100 %	0 %	0 %	0 %	332661881
2562	NC_015511	TGA	2	6	152611	152616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332661881
2563	NC_015511	ATAG	2	8	152642	152649	50 %	25 %	25 %	0 %	332661881
2564	NC_015511	TCT	2	6	152681	152686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332661881
2565	NC_015511	CT	4	8	152715	152722	0 %	50 %	0 %	50 %	332661881
2566	NC_015511	GGTGTC	2	12	152723	152734	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	332661881
2567	NC_015511	T	8	8	152819	152826	0 %	100 %	0 %	0 %	332661881
2568	NC_015511	GTT	2	6	152830	152835	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332661881
2569	NC_015511	GAT	2	6	152867	152872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332661881
2570	NC_015511	A	6	6	152873	152878	100 %	0 %	0 %	0 %	332661881
2571	NC_015511	AT	3	6	153032	153037	50 %	50 %	0 %	0 %	332661881
2572	NC_015511	GAG	2	6	153554	153559	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332661882
2573	NC_015511	GAA	2	6	153595	153600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332661882
2574	NC_015511	A	7	7	153616	153622	100 %	0 %	0 %	0 %	332661882
2575	NC_015511	A	6	6	153638	153643	100 %	0 %	0 %	0 %	332661882
2576	NC_015511	TCA	2	6	153756	153761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332661882
2577	NC_015511	A	6	6	153776	153781	100 %	0 %	0 %	0 %	332661882
2578	NC_015511	GATT	2	8	153819	153826	25 %	50 %	25 %	0 %	332661882
2579	NC_015511	TAA	2	6	153880	153885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332661882
2580	NC_015511	TCT	2	6	153946	153951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332661882
2581	NC_015511	A	6	6	153966	153971	100 %	0 %	0 %	0 %	332661882
2582	NC_015511	A	6	6	153996	154001	100 %	0 %	0 %	0 %	332661882
2583	NC_015511	TCC	2	6	154095	154100	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332661882
2584	NC_015511	TTC	2	6	154184	154189	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332661882
2585	NC_015511	GTT	2	6	154208	154213	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332661882
2586	NC_015511	GTC	2	6	154226	154231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332661882
2587	NC_015511	ATGCT	2	10	154249	154258	20 %	40 %	20 %	20 %	332661882
2588	NC_015511	GCA	2	6	154329	154334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332661882
2589	NC_015511	TGA	2	6	154337	154342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332661882
2590	NC_015511	A	6	6	154374	154379	100 %	0 %	0 %	0 %	332661882
2591	NC_015511	A	6	6	154386	154391	100 %	0 %	0 %	0 %	332661882
2592	NC_015511	T	6	6	154409	154414	0 %	100 %	0 %	0 %	332661882
2593	NC_015511	CAAC	2	8	154430	154437	50 %	0 %	0 %	50 %	332661882
2594	NC_015511	AATTT	2	10	154467	154476	40 %	60 %	0 %	0 %	332661882
2595	NC_015511	CGCT	2	8	154492	154499	0 %	25 %	25 %	50 %	332661882
2596	NC_015511	CTA	2	6	154530	154535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332661882
2597	NC_015511	TAA	2	6	154572	154577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332661882
2598	NC_015511	AT	3	6	154578	154583	50 %	50 %	0 %	0 %	332661882
2599	NC_015511	TAC	2	6	154624	154629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332661882
2600	NC_015511	A	6	6	154637	154642	100 %	0 %	0 %	0 %	332661882
2601	NC_015511	AAT	2	6	154652	154657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332661882
2602	NC_015511	GTG	2	6	154663	154668	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332661882
2603	NC_015511	GTT	2	6	154744	154749	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332661883
2604	NC_015511	A	6	6	154787	154792	100 %	0 %	0 %	0 %	332661883
2605	NC_015511	GTAA	2	8	154793	154800	50 %	25 %	25 %	0 %	332661883
2606	NC_015511	CT	3	6	154808	154813	0 %	50 %	0 %	50 %	332661883
2607	NC_015511	CTC	3	9	154831	154839	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332661883
2608	NC_015511	TCC	2	6	154850	154855	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332661883
2609	NC_015511	TTC	2	6	154903	154908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332661883
2610	NC_015511	AGG	2	6	154920	154925	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332661883
2611	NC_015511	GTT	2	6	155034	155039	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332661883
2612	NC_015511	CGG	2	6	155085	155090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332661883
2613	NC_015511	GCCTGG	2	12	155123	155134	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	332661883
2614	NC_015511	CTG	2	6	155137	155142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332661883
2615	NC_015511	CTC	2	6	155161	155166	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332661883
2616	NC_015511	CTG	2	6	155170	155175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332661883
2617	NC_015511	GCT	2	6	155182	155187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332661883
2618	NC_015511	A	6	6	155344	155349	100 %	0 %	0 %	0 %	332661883
2619	NC_015511	TGCG	2	8	155460	155467	0 %	25 %	50 %	25 %	332661883
2620	NC_015511	GCG	2	6	155495	155500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332661883
2621	NC_015511	TGC	2	6	155592	155597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332661883
2622	NC_015511	CGT	2	6	155667	155672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332661883
2623	NC_015511	GTA	2	6	155737	155742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332661883
2624	NC_015511	GGCGG	2	10	155749	155758	0 %	0 %	80 %	20 %	332661883
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2729	NC_015511	GCTGC	2	10	162734	162743	0 %	20 %	40 %	40 %	332661889
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2740	NC_015511	GC	3	6	163041	163046	0 %	0 %	50 %	50 %	332661889
2741	NC_015511	ATTT	2	8	163053	163060	25 %	75 %	0 %	0 %	332661889
2742	NC_015511	A	6	6	163150	163155	100 %	0 %	0 %	0 %	332661889
2743	NC_015511	CGC	2	6	163179	163184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332661889
2744	NC_015511	TGCAGG	2	12	163190	163201	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	332661889
2745	NC_015511	TGCCA	2	10	163239	163248	20 %	20 %	20 %	40 %	332661889
2746	NC_015511	TGA	2	6	163260	163265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332661889
2747	NC_015511	TTG	2	6	163343	163348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332661889
2748	NC_015511	GTG	2	6	163370	163375	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332661889
2749	NC_015511	TGGA	2	8	163412	163419	25 %	25 %	50 %	0 %	332661889
2750	NC_015511	CAG	2	6	163435	163440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332661889
2751	NC_015511	TGG	2	6	163457	163462	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332661889

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