MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Haliscomenobacter hydrossis DSM 1100 plasmid pHALHY01

Total Repeats: 2751

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_015511	TGC	2	6	88560	88565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332661836
1502	NC_015511	ACC	3	9	88733	88741	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332661836
1503	NC_015511	GCTA	2	8	88975	88982	25 %	25 %	25 %	25 %	332661837
1504	NC_015511	A	6	6	88999	89004	100 %	0 %	0 %	0 %	332661837
1505	NC_015511	GTC	2	6	89087	89092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332661837
1506	NC_015511	AGA	2	6	89187	89192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332661837
1507	NC_015511	TGG	2	6	89202	89207	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332661837
1508	NC_015511	A	7	7	89209	89215	100 %	0 %	0 %	0 %	332661837
1509	NC_015511	GAA	2	6	89257	89262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332661837
1510	NC_015511	ACC	2	6	89383	89388	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332661837
1511	NC_015511	CTT	2	6	89420	89425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332661837
1512	NC_015511	ATTTG	2	10	89429	89438	20 %	60 %	20 %	0 %	332661837
1513	NC_015511	ACT	3	9	89467	89475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332661837
1514	NC_015511	GA	3	6	89482	89487	50 %	0 %	50 %	0 %	332661837
1515	NC_015511	ATT	2	6	89561	89566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332661837
1516	NC_015511	ACTAC	2	10	89567	89576	40 %	20 %	0 %	40 %	332661837
1517	NC_015511	AAGC	2	8	89590	89597	50 %	0 %	25 %	25 %	332661837
1518	NC_015511	ACT	2	6	89599	89604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332661837
1519	NC_015511	CAG	2	6	89612	89617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332661837
1520	NC_015511	A	6	6	89770	89775	100 %	0 %	0 %	0 %	332661837
1521	NC_015511	CAA	2	6	89791	89796	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332661837
1522	NC_015511	T	6	6	89884	89889	0 %	100 %	0 %	0 %	332661838
1523	NC_015511	TGT	2	6	89901	89906	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332661838
1524	NC_015511	T	6	6	89916	89921	0 %	100 %	0 %	0 %	332661838
1525	NC_015511	A	6	6	89927	89932	100 %	0 %	0 %	0 %	332661838
1526	NC_015511	GTG	2	6	89993	89998	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332661838
1527	NC_015511	CAC	2	6	90062	90067	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332661838
1528	NC_015511	TGG	2	6	90136	90141	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332661838
1529	NC_015511	ATC	2	6	90173	90178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332661838
1530	NC_015511	TGGG	2	8	90269	90276	0 %	25 %	75 %	0 %	332661838
1531	NC_015511	GCAAA	2	10	90292	90301	60 %	0 %	20 %	20 %	332661838
1532	NC_015511	GCC	2	6	90404	90409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332661838
1533	NC_015511	ACA	2	6	90420	90425	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332661838
1534	NC_015511	CAT	2	6	90433	90438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332661838
1535	NC_015511	CTG	2	6	90504	90509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332661838
1536	NC_015511	CAC	2	6	90635	90640	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332661838
1537	NC_015511	GTGA	2	8	90653	90660	25 %	25 %	50 %	0 %	332661838
1538	NC_015511	GGT	2	6	90676	90681	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332661838
1539	NC_015511	CAT	2	6	90814	90819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332661838
1540	NC_015511	ATT	3	9	90895	90903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332661838
1541	NC_015511	CTTT	2	8	90999	91006	0 %	75 %	0 %	25 %	332661839
1542	NC_015511	GCT	2	6	91062	91067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332661839
1543	NC_015511	ATACT	2	10	91193	91202	40 %	40 %	0 %	20 %	332661839
1544	NC_015511	ATG	2	6	91248	91253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332661839
1545	NC_015511	CTG	2	6	91288	91293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332661839
1546	NC_015511	A	7	7	91317	91323	100 %	0 %	0 %	0 %	332661839
1547	NC_015511	GTGA	2	8	91338	91345	25 %	25 %	50 %	0 %	332661839
1548	NC_015511	GCG	2	6	91471	91476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332661839
1549	NC_015511	CAA	2	6	91529	91534	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332661839
1550	NC_015511	GCAA	2	8	91583	91590	50 %	0 %	25 %	25 %	332661839
1551	NC_015511	ACT	2	6	91596	91601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332661839
1552	NC_015511	CAA	2	6	91668	91673	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332661839
1553	NC_015511	ACT	2	6	91732	91737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332661839
1554	NC_015511	AC	3	6	91790	91795	50 %	0 %	0 %	50 %	332661839
1555	NC_015511	AC	3	6	91829	91834	50 %	0 %	0 %	50 %	332661839
1556	NC_015511	CAT	2	6	92021	92026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332661840
1557	NC_015511	GCC	2	6	92157	92162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332661840
1558	NC_015511	AGG	2	6	92245	92250	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332661840
1559	NC_015511	GAT	2	6	92304	92309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332661840
1560	NC_015511	TGC	2	6	92334	92339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332661840
1561	NC_015511	TGTT	2	8	92527	92534	0 %	75 %	25 %	0 %	332661841
1562	NC_015511	GCA	2	6	92544	92549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332661841
1563	NC_015511	TGC	2	6	92599	92604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332661841
1564	NC_015511	GTG	2	6	92727	92732	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332661841
1565	NC_015511	CTC	2	6	92741	92746	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332661841
1566	NC_015511	CGCC	2	8	92801	92808	0 %	0 %	25 %	75 %	332661841
1567	NC_015511	TGG	2	6	92812	92817	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332661841
1568	NC_015511	GTTG	2	8	92900	92907	0 %	50 %	50 %	0 %	332661841
1569	NC_015511	CGC	2	6	92991	92996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332661841
1570	NC_015511	T	7	7	93158	93164	0 %	100 %	0 %	0 %	332661841
1571	NC_015511	A	6	6	93209	93214	100 %	0 %	0 %	0 %	332661841
1572	NC_015511	GGA	2	6	93218	93223	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332661841
1573	NC_015511	CTG	2	6	93267	93272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332661841
1574	NC_015511	TCAA	2	8	93324	93331	50 %	25 %	0 %	25 %	332661841
1575	NC_015511	AAC	2	6	93364	93369	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332661841
1576	NC_015511	GAAC	2	8	93416	93423	50 %	0 %	25 %	25 %	332661841
1577	NC_015511	CAA	2	6	93471	93476	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332661841
1578	NC_015511	A	7	7	93475	93481	100 %	0 %	0 %	0 %	332661841
1579	NC_015511	TTGTTT	2	12	93552	93563	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	332661841
1580	NC_015511	CAT	2	6	93584	93589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332661841
1581	NC_015511	CTTT	2	8	93609	93616	0 %	75 %	0 %	25 %	332661841
1582	NC_015511	TCA	2	6	93619	93624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332661841
1583	NC_015511	GGT	2	6	93675	93680	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332661841
1584	NC_015511	GCCATT	2	12	93684	93695	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	332661841
1585	NC_015511	TGG	2	6	93703	93708	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332661841
1586	NC_015511	ATG	2	6	93709	93714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332661841
1587	NC_015511	A	6	6	93776	93781	100 %	0 %	0 %	0 %	332661841
1588	NC_015511	AGT	2	6	93807	93812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332661841
1589	NC_015511	ATT	2	6	93843	93848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332661841
1590	NC_015511	GTG	2	6	93849	93854	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332661841
1591	NC_015511	TGAA	2	8	94009	94016	50 %	25 %	25 %	0 %	332661841
1592	NC_015511	A	6	6	94047	94052	100 %	0 %	0 %	0 %	332661841
1593	NC_015511	AGC	2	6	94127	94132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332661841
1594	NC_015511	CTT	2	6	94222	94227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332661841
1595	NC_015511	GAA	2	6	94230	94235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332661841
1596	NC_015511	CGC	2	6	94302	94307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332661841
1597	NC_015511	AGT	2	6	94400	94405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332661841
1598	NC_015511	TTG	2	6	94488	94493	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332661841
1599	NC_015511	GGT	2	6	94577	94582	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332661841
1600	NC_015511	CGAC	2	8	94655	94662	25 %	0 %	25 %	50 %	332661841
1601	NC_015511	GGA	2	6	94725	94730	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332661841
1602	NC_015511	CAGC	2	8	94922	94929	25 %	0 %	25 %	50 %	332661841
1603	NC_015511	CAT	2	6	94934	94939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332661841
1604	NC_015511	GA	3	6	94961	94966	50 %	0 %	50 %	0 %	332661841
1605	NC_015511	CAG	2	6	94978	94983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332661841
1606	NC_015511	T	6	6	95033	95038	0 %	100 %	0 %	0 %	332661841
1607	NC_015511	GT	3	6	95098	95103	0 %	50 %	50 %	0 %	332661841
1608	NC_015511	TGG	2	6	95194	95199	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332661841
1609	NC_015511	TGG	2	6	95251	95256	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332661841
1610	NC_015511	ATG	2	6	95298	95303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332661841
1611	NC_015511	ACT	2	6	95311	95316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332661841
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1613	NC_015511	ATC	2	6	95361	95366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332661841
1614	NC_015511	TGA	2	6	95398	95403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332661841
1615	NC_015511	TGC	2	6	95414	95419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332661841
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1618	NC_015511	TGC	2	6	95710	95715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332661842
1619	NC_015511	GCT	2	6	95720	95725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332661842
1620	NC_015511	CAA	2	6	95734	95739	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332661842
1621	NC_015511	A	6	6	95777	95782	100 %	0 %	0 %	0 %	332661842
1622	NC_015511	A	7	7	95790	95796	100 %	0 %	0 %	0 %	332661842
1623	NC_015511	A	7	7	95904	95910	100 %	0 %	0 %	0 %	332661842
1624	NC_015511	AGGT	2	8	95940	95947	25 %	25 %	50 %	0 %	332661842
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1626	NC_015511	A	6	6	96114	96119	100 %	0 %	0 %	0 %	332661842
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1871	NC_015511	ATT	2	6	109715	109720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332661851
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1975	NC_015511	ATTGCG	2	12	115364	115375	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	332661854
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1981	NC_015511	A	6	6	115798	115803	100 %	0 %	0 %	0 %	332661855
1982	NC_015511	GAT	2	6	115875	115880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332661855
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1992	NC_015511	TGA	2	6	116509	116514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332661855
1993	NC_015511	CAA	2	6	116526	116531	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332661855
1994	NC_015511	T	6	6	116547	116552	0 %	100 %	0 %	0 %	332661855
1995	NC_015511	ATT	2	6	116667	116672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332661856
1996	NC_015511	CTT	2	6	116829	116834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332661856
1997	NC_015511	TGA	2	6	116895	116900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332661856
1998	NC_015511	TCT	2	6	116913	116918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332661856
1999	NC_015511	TGG	2	6	116952	116957	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332661856
2000	NC_015511	GCG	2	6	117144	117149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332661857

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