MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haliscomenobacter hydrossis DSM 1100 plasmid pHALHY01

Total Repeats: 2751

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_015511	AGC	2	6	59484	59489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332661811
1002	NC_015511	GTA	2	6	59498	59503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332661811
1003	NC_015511	GCC	2	6	59541	59546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332661811
1004	NC_015511	TTG	2	6	59555	59560	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332661811
1005	NC_015511	CCA	2	6	59566	59571	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332661811
1006	NC_015511	TCCGCA	2	12	59751	59762	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	332661811
1007	NC_015511	AGCA	2	8	59862	59869	50 %	0 %	25 %	25 %	332661811
1008	NC_015511	ATG	2	6	59889	59894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332661811
1009	NC_015511	GCA	2	6	59905	59910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332661811
1010	NC_015511	TGC	2	6	59913	59918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332661811
1011	NC_015511	TCA	2	6	59941	59946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332661811
1012	NC_015511	CCA	2	6	59947	59952	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332661811
1013	NC_015511	AGT	2	6	59959	59964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332661811
1014	NC_015511	ATC	2	6	59990	59995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332661811
1015	NC_015511	GATC	2	8	60043	60050	25 %	25 %	25 %	25 %	332661811
1016	NC_015511	GAT	2	6	60098	60103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332661811
1017	NC_015511	ACA	2	6	60163	60168	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332661811
1018	NC_015511	A	6	6	60586	60591	100 %	0 %	0 %	0 %	332661812
1019	NC_015511	TGT	2	6	60597	60602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332661812
1020	NC_015511	CGG	2	6	60630	60635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332661812
1021	NC_015511	A	6	6	60678	60683	100 %	0 %	0 %	0 %	332661812
1022	NC_015511	GCA	3	9	60726	60734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332661812
1023	NC_015511	GCC	2	6	61115	61120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332661813
1024	NC_015511	GCA	2	6	61136	61141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332661813
1025	NC_015511	TTG	2	6	61172	61177	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332661813
1026	NC_015511	TTG	2	6	61202	61207	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332661813
1027	NC_015511	GCG	2	6	61218	61223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332661813
1028	NC_015511	AATC	2	8	61224	61231	50 %	25 %	0 %	25 %	332661813
1029	NC_015511	TCC	2	6	61277	61282	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332661813
1030	NC_015511	ATA	2	6	61390	61395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332661813
1031	NC_015511	GAT	2	6	61452	61457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332661813
1032	NC_015511	AAT	2	6	61480	61485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332661813
1033	NC_015511	TCC	2	6	61646	61651	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332661813
1034	NC_015511	GCC	2	6	61732	61737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332661813
1035	NC_015511	AGG	2	6	61901	61906	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332661813
1036	NC_015511	T	6	6	61914	61919	0 %	100 %	0 %	0 %	332661813
1037	NC_015511	GCAG	2	8	62085	62092	25 %	0 %	50 %	25 %	332661814
1038	NC_015511	GCG	2	6	62133	62138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332661814
1039	NC_015511	GCT	2	6	62186	62191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332661814
1040	NC_015511	GAA	2	6	62291	62296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332661815
1041	NC_015511	CAGG	2	8	62318	62325	25 %	0 %	50 %	25 %	332661815
1042	NC_015511	TGC	2	6	62353	62358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332661815
1043	NC_015511	GCA	2	6	62360	62365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332661815
1044	NC_015511	GCGG	2	8	62400	62407	0 %	0 %	75 %	25 %	332661815
1045	NC_015511	GGT	2	6	62465	62470	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332661815
1046	NC_015511	TCG	2	6	62476	62481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332661815
1047	NC_015511	TTGA	2	8	62556	62563	25 %	50 %	25 %	0 %	332661815
1048	NC_015511	GGA	2	6	62606	62611	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332661815
1049	NC_015511	AAT	2	6	62723	62728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332661815
1050	NC_015511	ACA	2	6	62957	62962	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332661816
1051	NC_015511	ACA	2	6	62967	62972	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332661816
1052	NC_015511	AAC	2	6	63005	63010	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332661816
1053	NC_015511	GAA	2	6	63025	63030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332661816
1054	NC_015511	ACT	2	6	63101	63106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332661817
1055	NC_015511	GCC	2	6	63118	63123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332661817
1056	NC_015511	GGC	2	6	63152	63157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332661817
1057	NC_015511	C	6	6	63175	63180	0 %	0 %	0 %	100 %	332661817
1058	NC_015511	TCC	2	6	63193	63198	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332661817
1059	NC_015511	CGG	2	6	63200	63205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332661817
1060	NC_015511	CCGTGA	2	12	63259	63270	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	332661817
1061	NC_015511	TGG	2	6	63331	63336	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332661817
1062	NC_015511	ACT	2	6	63425	63430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332661817
1063	NC_015511	GATG	2	8	63992	63999	25 %	25 %	50 %	0 %	332661818
1064	NC_015511	TTA	2	6	64018	64023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332661818
1065	NC_015511	CCG	2	6	64033	64038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332661818
1066	NC_015511	AAG	2	6	64162	64167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332661818
1067	NC_015511	TTA	2	6	64189	64194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332661818
1068	NC_015511	AAC	2	6	64205	64210	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332661818
1069	NC_015511	GCA	2	6	64285	64290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332661818
1070	NC_015511	AT	3	6	64337	64342	50 %	50 %	0 %	0 %	332661818
1071	NC_015511	GATG	2	8	64358	64365	25 %	25 %	50 %	0 %	332661818
1072	NC_015511	GGC	2	6	64390	64395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332661818
1073	NC_015511	ACT	2	6	64399	64404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332661818
1074	NC_015511	TGA	2	6	64406	64411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332661818
1075	NC_015511	ACT	2	6	64412	64417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332661818
1076	NC_015511	TTTG	2	8	64475	64482	0 %	75 %	25 %	0 %	332661818
1077	NC_015511	AGT	2	6	64488	64493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332661818
1078	NC_015511	T	6	6	64527	64532	0 %	100 %	0 %	0 %	332661818
1079	NC_015511	GCT	2	6	64550	64555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332661818
1080	NC_015511	GCA	2	6	64578	64583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332661818
1081	NC_015511	GGT	2	6	64649	64654	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332661818
1082	NC_015511	TGA	2	6	64694	64699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332661818
1083	NC_015511	ACAA	2	8	64828	64835	75 %	0 %	0 %	25 %	332661818
1084	NC_015511	GTG	2	6	64843	64848	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332661818
1085	NC_015511	GAA	2	6	64875	64880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332661818
1086	NC_015511	CAG	2	6	64971	64976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332661818
1087	NC_015511	AAT	2	6	64996	65001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332661818
1088	NC_015511	ACG	2	6	65059	65064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332661819
1089	NC_015511	C	6	6	65119	65124	0 %	0 %	0 %	100 %	332661819
1090	NC_015511	TGG	2	6	65222	65227	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332661819
1091	NC_015511	GCGG	2	8	65262	65269	0 %	0 %	75 %	25 %	332661819
1092	NC_015511	CTG	2	6	65383	65388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332661819
1093	NC_015511	ACC	2	6	65397	65402	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332661819
1094	NC_015511	GAG	2	6	65538	65543	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332661819
1095	NC_015511	TGTA	2	8	65605	65612	25 %	50 %	25 %	0 %	332661819
1096	NC_015511	CGTG	2	8	65789	65796	0 %	25 %	50 %	25 %	332661819
1097	NC_015511	ACC	2	6	65817	65822	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332661819
1098	NC_015511	TCA	2	6	65846	65851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332661819
1099	NC_015511	CAG	2	6	65952	65957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332661819
1100	NC_015511	GCA	2	6	66004	66009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332661819
1101	NC_015511	TAC	2	6	66198	66203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332661819
1102	NC_015511	ACT	2	6	66323	66328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332661819
1103	NC_015511	GCG	2	6	66394	66399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332661819
1104	NC_015511	G	6	6	66406	66411	0 %	0 %	100 %	0 %	332661819
1105	NC_015511	GCA	2	6	66476	66481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332661819
1106	NC_015511	TGC	2	6	66490	66495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332661819
1107	NC_015511	GGTT	2	8	66588	66595	0 %	50 %	50 %	0 %	332661819
1108	NC_015511	AGG	2	6	66604	66609	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332661819
1109	NC_015511	T	6	6	66614	66619	0 %	100 %	0 %	0 %	332661819
1110	NC_015511	GTG	2	6	66642	66647	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332661819
1111	NC_015511	GAC	2	6	66713	66718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332661819
1112	NC_015511	AAT	2	6	66737	66742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332661819
1113	NC_015511	A	7	7	66770	66776	100 %	0 %	0 %	0 %	332661819
1114	NC_015511	ATT	2	6	66784	66789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332661819
1115	NC_015511	CA	4	8	66798	66805	50 %	0 %	0 %	50 %	332661819
1116	NC_015511	AAAG	2	8	66812	66819	75 %	0 %	25 %	0 %	332661819
1117	NC_015511	AAT	2	6	66834	66839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332661819
1118	NC_015511	CT	3	6	66852	66857	0 %	50 %	0 %	50 %	332661819
1119	NC_015511	TGC	2	6	67004	67009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332661819
1120	NC_015511	AGA	2	6	67019	67024	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332661819
1121	NC_015511	ATTC	2	8	67033	67040	25 %	50 %	0 %	25 %	332661819
1122	NC_015511	A	6	6	67043	67048	100 %	0 %	0 %	0 %	332661819
1123	NC_015511	ATC	2	6	67186	67191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332661819
1124	NC_015511	A	6	6	67377	67382	100 %	0 %	0 %	0 %	332661819
1125	NC_015511	A	6	6	67397	67402	100 %	0 %	0 %	0 %	332661819
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1381	NC_015511	AAG	2	6	82057	82062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332661831
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