MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haliscomenobacter hydrossis DSM 1100 plasmid pHALHY01

Total Repeats: 2751

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015511	TCC	2	6	31180	31185	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332661785
502	NC_015511	GGT	2	6	31216	31221	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332661785
503	NC_015511	TCCTTT	2	12	31231	31242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332661785
504	NC_015511	ATC	2	6	31266	31271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332661785
505	NC_015511	GCA	2	6	31310	31315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332661785
506	NC_015511	AAAC	2	8	31413	31420	75 %	0 %	0 %	25 %	332661785
507	NC_015511	AATAG	2	10	31485	31494	60 %	20 %	20 %	0 %	332661785
508	NC_015511	TGCG	2	8	31498	31505	0 %	25 %	50 %	25 %	332661785
509	NC_015511	ATT	2	6	31519	31524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332661786
510	NC_015511	CAG	2	6	31529	31534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332661786
511	NC_015511	TTA	2	6	31620	31625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332661786
512	NC_015511	AGT	2	6	31683	31688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332661786
513	NC_015511	T	6	6	31790	31795	0 %	100 %	0 %	0 %	332661786
514	NC_015511	TTGG	2	8	31821	31828	0 %	50 %	50 %	0 %	332661786
515	NC_015511	ACC	2	6	31848	31853	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332661786
516	NC_015511	T	7	7	31878	31884	0 %	100 %	0 %	0 %	332661786
517	NC_015511	TGACAA	2	12	31897	31908	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	332661786
518	NC_015511	TCG	2	6	32025	32030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332661786
519	NC_015511	TGGCC	2	10	32062	32071	0 %	20 %	40 %	40 %	332661786
520	NC_015511	TGCTG	2	10	32128	32137	0 %	40 %	40 %	20 %	332661786
521	NC_015511	CAG	2	6	32215	32220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332661786
522	NC_015511	CAG	2	6	32291	32296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332661786
523	NC_015511	GC	3	6	32334	32339	0 %	0 %	50 %	50 %	332661786
524	NC_015511	GAG	2	6	32404	32409	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332661786
525	NC_015511	TGT	2	6	32419	32424	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332661786
526	NC_015511	T	6	6	32451	32456	0 %	100 %	0 %	0 %	332661787
527	NC_015511	GGC	2	6	32463	32468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332661787
528	NC_015511	ATC	2	6	32521	32526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332661787
529	NC_015511	T	8	8	32552	32559	0 %	100 %	0 %	0 %	332661787
530	NC_015511	AAAG	2	8	32726	32733	75 %	0 %	25 %	0 %	332661787
531	NC_015511	ATGG	2	8	32746	32753	25 %	25 %	50 %	0 %	332661787
532	NC_015511	A	7	7	32774	32780	100 %	0 %	0 %	0 %	332661787
533	NC_015511	TAG	2	6	32805	32810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332661787
534	NC_015511	A	6	6	32872	32877	100 %	0 %	0 %	0 %	332661787
535	NC_015511	CAG	2	6	32886	32891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332661787
536	NC_015511	CAA	2	6	33012	33017	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332661787
537	NC_015511	TCT	2	6	33076	33081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332661787
538	NC_015511	CAAGA	2	10	33158	33167	60 %	0 %	20 %	20 %	332661787
539	NC_015511	GGT	2	6	33201	33206	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332661787
540	NC_015511	GAG	2	6	33217	33222	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332661787
541	NC_015511	TGCG	2	8	33227	33234	0 %	25 %	50 %	25 %	332661787
542	NC_015511	AGG	2	6	33262	33267	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332661787
543	NC_015511	TTTG	2	8	33270	33277	0 %	75 %	25 %	0 %	332661787
544	NC_015511	TCA	2	6	33308	33313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332661787
545	NC_015511	GTT	2	6	33352	33357	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332661787
546	NC_015511	TCCAG	2	10	33468	33477	20 %	20 %	20 %	40 %	332661787
547	NC_015511	TCA	2	6	33482	33487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332661787
548	NC_015511	C	6	6	33543	33548	0 %	0 %	0 %	100 %	332661787
549	NC_015511	CTT	2	6	33621	33626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332661787
550	NC_015511	AGT	2	6	33703	33708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332661787
551	NC_015511	GCC	2	6	33746	33751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332661787
552	NC_015511	GCAAG	2	10	33801	33810	40 %	0 %	40 %	20 %	332661787
553	NC_015511	CGT	2	6	33843	33848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332661787
554	NC_015511	CCA	2	6	33878	33883	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332661787
555	NC_015511	GAG	2	6	33895	33900	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332661787
556	NC_015511	TGAG	2	8	33914	33921	25 %	25 %	50 %	0 %	332661787
557	NC_015511	AGGGG	2	10	33975	33984	20 %	0 %	80 %	0 %	332661787
558	NC_015511	G	6	6	33981	33986	0 %	0 %	100 %	0 %	332661787
559	NC_015511	CTG	2	6	33994	33999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332661787
560	NC_015511	TC	3	6	34420	34425	0 %	50 %	0 %	50 %	332661788
561	NC_015511	CTGT	2	8	34447	34454	0 %	50 %	25 %	25 %	332661788
562	NC_015511	CAT	2	6	34500	34505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332661788
563	NC_015511	TAT	2	6	34554	34559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332661788
564	NC_015511	G	6	6	34581	34586	0 %	0 %	100 %	0 %	332661788
565	NC_015511	TAA	2	6	34671	34676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332661788
566	NC_015511	GAAT	2	8	34832	34839	50 %	25 %	25 %	0 %	332661788
567	NC_015511	TA	3	6	34902	34907	50 %	50 %	0 %	0 %	332661788
568	NC_015511	AAT	2	6	34923	34928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332661788
569	NC_015511	AAC	2	6	35257	35262	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332661789
570	NC_015511	AC	3	6	35289	35294	50 %	0 %	0 %	50 %	332661789
571	NC_015511	TCCCC	2	10	35364	35373	0 %	20 %	0 %	80 %	332661789
572	NC_015511	CGA	2	6	35377	35382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332661789
573	NC_015511	AGA	2	6	35389	35394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332661789
574	NC_015511	CTTT	2	8	35439	35446	0 %	75 %	0 %	25 %	332661789
575	NC_015511	CATA	2	8	35692	35699	50 %	25 %	0 %	25 %	332661789
576	NC_015511	TGT	2	6	35709	35714	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332661789
577	NC_015511	AGC	2	6	36517	36522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332661790
578	NC_015511	CCA	2	6	36553	36558	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332661790
579	NC_015511	ACA	2	6	36631	36636	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332661790
580	NC_015511	AAAC	2	8	36915	36922	75 %	0 %	0 %	25 %	332661790
581	NC_015511	GGAA	2	8	36948	36955	50 %	0 %	50 %	0 %	332661790
582	NC_015511	GTT	2	6	36981	36986	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332661790
583	NC_015511	TGC	2	6	37074	37079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332661790
584	NC_015511	GGC	2	6	37178	37183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332661790
585	NC_015511	ATT	2	6	37330	37335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332661790
586	NC_015511	AGC	2	6	37338	37343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332661790
587	NC_015511	A	6	6	37401	37406	100 %	0 %	0 %	0 %	332661790
588	NC_015511	GAA	2	6	37446	37451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332661790
589	NC_015511	TTA	3	9	37476	37484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332661790
590	NC_015511	A	6	6	37525	37530	100 %	0 %	0 %	0 %	332661790
591	NC_015511	TTA	2	6	37533	37538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332661790
592	NC_015511	CAA	2	6	37543	37548	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332661790
593	NC_015511	GGT	2	6	37599	37604	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332661790
594	NC_015511	TCA	2	6	37612	37617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332661790
595	NC_015511	AC	3	6	37618	37623	50 %	0 %	0 %	50 %	332661790
596	NC_015511	GAG	2	6	37860	37865	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332661790
597	NC_015511	GAAC	2	8	37969	37976	50 %	0 %	25 %	25 %	332661790
598	NC_015511	ACC	2	6	38034	38039	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332661790
599	NC_015511	CGG	2	6	38059	38064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332661790
600	NC_015511	GTCGC	2	10	38146	38155	0 %	20 %	40 %	40 %	332661790
601	NC_015511	GCG	2	6	38163	38168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332661790
602	NC_015511	CTAC	2	8	38243	38250	25 %	25 %	0 %	50 %	332661791
603	NC_015511	GGC	2	6	38296	38301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332661791
604	NC_015511	CAA	2	6	38318	38323	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332661791
605	NC_015511	TG	3	6	38331	38336	0 %	50 %	50 %	0 %	332661791
606	NC_015511	GC	3	6	38340	38345	0 %	0 %	50 %	50 %	332661791
607	NC_015511	GCA	2	6	38417	38422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332661791
608	NC_015511	T	6	6	38431	38436	0 %	100 %	0 %	0 %	332661791
609	NC_015511	TGA	2	6	38476	38481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332661791
610	NC_015511	A	6	6	38688	38693	100 %	0 %	0 %	0 %	332661791
611	NC_015511	ACC	2	6	38713	38718	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332661791
612	NC_015511	CAG	2	6	38726	38731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332661791
613	NC_015511	GAG	2	6	38757	38762	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332661791
614	NC_015511	GCC	2	6	38778	38783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332661791
615	NC_015511	GCG	2	6	38789	38794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332661791
616	NC_015511	GTG	2	6	38871	38876	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332661791
617	NC_015511	GCT	2	6	38885	38890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332661791
618	NC_015511	GAT	2	6	38951	38956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332661791
619	NC_015511	GCG	2	6	39047	39052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332661791
620	NC_015511	ACAG	2	8	39062	39069	50 %	0 %	25 %	25 %	332661791
621	NC_015511	CTGGG	2	10	39191	39200	0 %	20 %	60 %	20 %	332661791
622	NC_015511	TTTG	2	8	39296	39303	0 %	75 %	25 %	0 %	332661791
623	NC_015511	GA	3	6	39432	39437	50 %	0 %	50 %	0 %	332661791
624	NC_015511	G	6	6	39463	39468	0 %	0 %	100 %	0 %	332661791
625	NC_015511	TGA	2	6	39472	39477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332661791
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627	NC_015511	A	7	7	39536	39542	100 %	0 %	0 %	0 %	332661792
628	NC_015511	T	6	6	39608	39613	0 %	100 %	0 %	0 %	332661792
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630	NC_015511	TAA	2	6	39734	39739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332661792
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