MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haliscomenobacter hydrossis DSM 1100 chromosome

Total Repeats: 145390

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015510	GTC	2	6	29652	29657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332662028
502	NC_015510	ATA	2	6	29724	29729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332662028
503	NC_015510	T	7	7	29756	29762	0 %	100 %	0 %	0 %	332662028
504	NC_015510	GTTTT	2	10	29776	29785	0 %	80 %	20 %	0 %	332662028
505	NC_015510	TTC	2	6	29796	29801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332662028
506	NC_015510	TTTGAT	2	12	29850	29861	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	332662028
507	NC_015510	A	7	7	30014	30020	100 %	0 %	0 %	0 %	332662028
508	NC_015510	ATT	2	6	30046	30051	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332662028
509	NC_015510	T	7	7	30056	30062	0 %	100 %	0 %	0 %	332662028
510	NC_015510	CAG	2	6	30107	30112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332662029
511	NC_015510	AGA	2	6	30209	30214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332662029
512	NC_015510	TGG	2	6	30250	30255	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332662029
513	NC_015510	TTTTC	2	10	30342	30351	0 %	80 %	0 %	20 %	332662029
514	NC_015510	GGC	2	6	30394	30399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332662029
515	NC_015510	CCG	2	6	30427	30432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332662029
516	NC_015510	ATT	2	6	30596	30601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332662030
517	NC_015510	TTG	2	6	30630	30635	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332662030
518	NC_015510	TGC	2	6	30671	30676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332662030
519	NC_015510	CGT	2	6	30696	30701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332662030
520	NC_015510	TTGA	2	8	30729	30736	25 %	50 %	25 %	0 %	332662030
521	NC_015510	AAGAA	2	10	30790	30799	80 %	0 %	20 %	0 %	332662030
522	NC_015510	TCG	2	6	30928	30933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332662031
523	NC_015510	ACCCTC	2	12	30941	30952	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	332662031
524	NC_015510	TGTA	2	8	30986	30993	25 %	50 %	25 %	0 %	332662031
525	NC_015510	CTGG	2	8	31063	31070	0 %	25 %	50 %	25 %	332662031
526	NC_015510	TTGGTG	2	12	31163	31174	0 %	50 %	50 %	0 %	332662031
527	NC_015510	TGG	2	6	31194	31199	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332662031
528	NC_015510	ACA	2	6	31224	31229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332662031
529	NC_015510	TTTTTC	2	12	31232	31243	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	332662031
530	NC_015510	CAGA	2	8	31303	31310	50 %	0 %	25 %	25 %	332662031
531	NC_015510	CGA	2	6	31543	31548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332662031
532	NC_015510	TTAT	2	8	31589	31596	25 %	75 %	0 %	0 %	332662031
533	NC_015510	GCG	2	6	31682	31687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332662031
534	NC_015510	ATG	2	6	31742	31747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332662031
535	NC_015510	CAT	2	6	31780	31785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332662031
536	NC_015510	TTG	2	6	31832	31837	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332662031
537	NC_015510	CAAAC	2	10	31841	31850	60 %	0 %	0 %	40 %	332662031
538	NC_015510	ATTT	2	8	31922	31929	25 %	75 %	0 %	0 %	332662031
539	NC_015510	GGCCA	2	10	32042	32051	20 %	0 %	40 %	40 %	332662031
540	NC_015510	ACC	2	6	32063	32068	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332662031
541	NC_015510	GTTTTG	2	12	32111	32122	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332662031
542	NC_015510	ATGG	2	8	32196	32203	25 %	25 %	50 %	0 %	332662032
543	NC_015510	AATG	2	8	32218	32225	50 %	25 %	25 %	0 %	332662032
544	NC_015510	GCA	2	6	32252	32257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332662032
545	NC_015510	CCA	2	6	32260	32265	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332662032
546	NC_015510	GTT	2	6	32357	32362	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332662032
547	NC_015510	TGC	2	6	32487	32492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332662032
548	NC_015510	T	6	6	32505	32510	0 %	100 %	0 %	0 %	332662032
549	NC_015510	T	9	9	32532	32540	0 %	100 %	0 %	0 %	332662032
550	NC_015510	ACA	2	6	32567	32572	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332662032
551	NC_015510	TGC	2	6	32578	32583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332662032
552	NC_015510	CAA	2	6	32661	32666	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332662032
553	NC_015510	GAT	2	6	32779	32784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332662033
554	NC_015510	GCG	2	6	32830	32835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332662033
555	NC_015510	TGG	2	6	32838	32843	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332662033
556	NC_015510	TGT	2	6	32848	32853	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332662033
557	NC_015510	TAA	2	6	32904	32909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332662033
558	NC_015510	TTTG	2	8	33013	33020	0 %	75 %	25 %	0 %	332662033
559	NC_015510	GTT	3	9	33043	33051	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332662033
560	NC_015510	GCA	2	6	33058	33063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332662033
561	NC_015510	T	6	6	33227	33232	0 %	100 %	0 %	0 %	332662034
562	NC_015510	T	6	6	33248	33253	0 %	100 %	0 %	0 %	332662034
563	NC_015510	AAC	2	6	33276	33281	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332662034
564	NC_015510	TCA	2	6	33420	33425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332662034
565	NC_015510	CAT	2	6	33487	33492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332662034
566	NC_015510	TAAAA	2	10	33550	33559	80 %	20 %	0 %	0 %	332662034
567	NC_015510	ACG	2	6	33624	33629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332662034
568	NC_015510	GGT	2	6	33675	33680	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332662034
569	NC_015510	CTA	2	6	33703	33708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332662034
570	NC_015510	GTTG	2	8	33811	33818	0 %	50 %	50 %	0 %	332662034
571	NC_015510	TGC	2	6	33834	33839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332662034
572	NC_015510	A	6	6	33868	33873	100 %	0 %	0 %	0 %	332662034
573	NC_015510	A	6	6	33954	33959	100 %	0 %	0 %	0 %	332662034
574	NC_015510	G	7	7	33961	33967	0 %	0 %	100 %	0 %	332662034
575	NC_015510	CGA	2	6	33997	34002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332662034
576	NC_015510	A	6	6	34008	34013	100 %	0 %	0 %	0 %	332662034
577	NC_015510	GAA	2	6	34055	34060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332662034
578	NC_015510	T	6	6	34090	34095	0 %	100 %	0 %	0 %	332662034
579	NC_015510	GCAA	2	8	34168	34175	50 %	0 %	25 %	25 %	332662034
580	NC_015510	GTG	2	6	34220	34225	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332662034
581	NC_015510	CAA	2	6	34271	34276	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332662034
582	NC_015510	TCA	2	6	34302	34307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332662034
583	NC_015510	CGATC	2	10	34336	34345	20 %	20 %	20 %	40 %	332662034
584	NC_015510	TCG	2	6	34368	34373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332662034
585	NC_015510	GGAAAA	2	12	34420	34431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332662034
586	NC_015510	AAAT	2	8	34454	34461	75 %	25 %	0 %	0 %	332662034
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588	NC_015510	A	6	6	34497	34502	100 %	0 %	0 %	0 %	332662035
589	NC_015510	A	8	8	34536	34543	100 %	0 %	0 %	0 %	332662035
590	NC_015510	T	6	6	34551	34556	0 %	100 %	0 %	0 %	332662035
591	NC_015510	A	6	6	34560	34565	100 %	0 %	0 %	0 %	332662035
592	NC_015510	TAG	2	6	34641	34646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332662035
593	NC_015510	GGT	2	6	34820	34825	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332662036
594	NC_015510	GCA	3	9	34875	34883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332662036
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596	NC_015510	T	6	6	34979	34984	0 %	100 %	0 %	0 %	332662036
597	NC_015510	TGT	2	6	35002	35007	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332662036
598	NC_015510	CAG	2	6	35421	35426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332662037
599	NC_015510	ACC	2	6	35446	35451	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332662037
600	NC_015510	TAA	2	6	35476	35481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332662037
601	NC_015510	CAGCC	2	10	35504	35513	20 %	0 %	20 %	60 %	332662037
602	NC_015510	TTCA	2	8	35556	35563	25 %	50 %	0 %	25 %	332662037
603	NC_015510	A	6	6	35569	35574	100 %	0 %	0 %	0 %	332662037
604	NC_015510	GCC	2	6	35642	35647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332662037
605	NC_015510	CGC	2	6	35662	35667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332662037
606	NC_015510	TTC	2	6	35775	35780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332662037
607	NC_015510	CTG	2	6	35812	35817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332662037
608	NC_015510	TTG	2	6	35862	35867	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332662037
609	NC_015510	CAA	2	6	35907	35912	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332662037
610	NC_015510	GTGC	2	8	35980	35987	0 %	25 %	50 %	25 %	332662037
611	NC_015510	TGG	2	6	35995	36000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332662037
612	NC_015510	ATG	2	6	36112	36117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332662037
613	NC_015510	A	6	6	36183	36188	100 %	0 %	0 %	0 %	332662037
614	NC_015510	ATA	2	6	36269	36274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332662037
615	NC_015510	GTA	2	6	36402	36407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332662037
616	NC_015510	GTT	2	6	36469	36474	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332662037
617	NC_015510	CAT	2	6	36612	36617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332662038
618	NC_015510	ACT	2	6	36660	36665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332662038
619	NC_015510	TG	3	6	36687	36692	0 %	50 %	50 %	0 %	332662038
620	NC_015510	AAC	2	6	36753	36758	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332662038
621	NC_015510	TGG	2	6	36973	36978	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332662038
622	NC_015510	ACCA	2	8	37098	37105	50 %	0 %	0 %	50 %	332662038
623	NC_015510	TGA	2	6	37137	37142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332662038
624	NC_015510	CTT	2	6	37150	37155	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332662038
625	NC_015510	AAG	2	6	37168	37173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332662038
626	NC_015510	A	8	8	37181	37188	100 %	0 %	0 %	0 %	332662038
627	NC_015510	AGT	2	6	37223	37228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332662038
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629	NC_015510	GGA	2	6	37291	37296	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332662038
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