MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Hippea maritima DSM 10411 chromosome

Total Repeats: 34616

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_015318	ATTG	2	8	170404	170411	25 %	50 %	25 %	0 %	327398341
3502	NC_015318	TTG	2	6	170457	170462	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327398342
3503	NC_015318	GTT	2	6	170559	170564	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327398342
3504	NC_015318	CCA	2	6	170582	170587	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327398342
3505	NC_015318	GAA	2	6	170605	170610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327398342
3506	NC_015318	CTC	2	6	170611	170616	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327398342
3507	NC_015318	CAT	2	6	170715	170720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327398342
3508	NC_015318	TGG	2	6	170819	170824	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	327398342
3509	NC_015318	ATCAA	2	10	170858	170867	60 %	20 %	0 %	20 %	327398342
3510	NC_015318	AG	3	6	170890	170895	50 %	0 %	50 %	0 %	327398342
3511	NC_015318	A	7	7	170905	170911	100 %	0 %	0 %	0 %	327398342
3512	NC_015318	ACA	2	6	170963	170968	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327398342
3513	NC_015318	ATC	2	6	171002	171007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327398342
3514	NC_015318	TAC	2	6	171050	171055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327398343
3515	NC_015318	TTTGA	2	10	171066	171075	20 %	60 %	20 %	0 %	327398343
3516	NC_015318	TAT	2	6	171152	171157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327398343
3517	NC_015318	T	8	8	171172	171179	0 %	100 %	0 %	0 %	327398343
3518	NC_015318	TAT	2	6	171222	171227	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327398343
3519	NC_015318	CAT	2	6	171281	171286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327398343
3520	NC_015318	ACA	2	6	171313	171318	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327398343
3521	NC_015318	T	6	6	171369	171374	0 %	100 %	0 %	0 %	327398343
3522	NC_015318	ATCT	2	8	171392	171399	25 %	50 %	0 %	25 %	327398343
3523	NC_015318	CCA	2	6	171439	171444	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327398343
3524	NC_015318	ATT	2	6	171453	171458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327398343
3525	NC_015318	CCTT	2	8	171482	171489	0 %	50 %	0 %	50 %	327398343
3526	NC_015318	CAT	2	6	171491	171496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327398343
3527	NC_015318	ATC	2	6	171609	171614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327398343
3528	NC_015318	ATC	2	6	171633	171638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327398343
3529	NC_015318	ATGC	2	8	171653	171660	25 %	25 %	25 %	25 %	327398343
3530	NC_015318	GCA	2	6	171721	171726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327398343
3531	NC_015318	CA	3	6	171725	171730	50 %	0 %	0 %	50 %	327398343
3532	NC_015318	CCG	2	6	171757	171762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327398343
3533	NC_015318	CAAC	2	8	171842	171849	50 %	0 %	0 %	50 %	327398343
3534	NC_015318	GCTTA	2	10	171861	171870	20 %	40 %	20 %	20 %	327398343
3535	NC_015318	TCA	2	6	171872	171877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327398343
3536	NC_015318	CTT	2	6	171952	171957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327398344
3537	NC_015318	CAA	2	6	171969	171974	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327398344
3538	NC_015318	CTC	2	6	171985	171990	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327398344
3539	NC_015318	TCA	2	6	172007	172012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327398344
3540	NC_015318	ATA	2	6	172016	172021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327398344
3541	NC_015318	CCT	2	6	172068	172073	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327398344
3542	NC_015318	TCA	2	6	172083	172088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327398344
3543	NC_015318	ATAG	2	8	172098	172105	50 %	25 %	25 %	0 %	327398345
3544	NC_015318	CAA	2	6	172127	172132	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327398345
3545	NC_015318	CAA	2	6	172145	172150	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327398345
3546	NC_015318	TATC	2	8	172184	172191	25 %	50 %	0 %	25 %	327398345
3547	NC_015318	CAGC	2	8	172217	172224	25 %	0 %	25 %	50 %	327398345
3548	NC_015318	ACT	2	6	172225	172230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327398345
3549	NC_015318	CTT	2	6	172243	172248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327398345
3550	NC_015318	CT	3	6	172254	172259	0 %	50 %	0 %	50 %	327398345
3551	NC_015318	TCT	3	9	172257	172265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327398345
3552	NC_015318	T	6	6	172285	172290	0 %	100 %	0 %	0 %	327398345
3553	NC_015318	CTT	2	6	172292	172297	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327398345
3554	NC_015318	CTC	2	6	172341	172346	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327398345
3555	NC_015318	CTG	2	6	172372	172377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327398345
3556	NC_015318	GCCT	2	8	172514	172521	0 %	25 %	25 %	50 %	327398345
3557	NC_015318	GAT	2	6	172538	172543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327398345
3558	NC_015318	ATA	2	6	172572	172577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327398345
3559	NC_015318	TCC	2	6	172599	172604	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327398345
3560	NC_015318	GCA	2	6	172648	172653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327398345
3561	NC_015318	GTAT	2	8	172665	172672	25 %	50 %	25 %	0 %	327398345
3562	NC_015318	CAT	2	6	172680	172685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327398345
3563	NC_015318	AGC	2	6	172755	172760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327398345
3564	NC_015318	TGT	4	12	172793	172804	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327398345
3565	NC_015318	TC	3	6	172911	172916	0 %	50 %	0 %	50 %	327398345
3566	NC_015318	CAA	2	6	172928	172933	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327398345
3567	NC_015318	CA	3	6	172980	172985	50 %	0 %	0 %	50 %	327398345
3568	NC_015318	CTC	2	6	172986	172991	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327398345
3569	NC_015318	TGC	2	6	173033	173038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327398345
3570	NC_015318	CTT	2	6	173040	173045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327398345
3571	NC_015318	TCA	2	6	173149	173154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327398345
3572	NC_015318	T	6	6	173188	173193	0 %	100 %	0 %	0 %	327398345
3573	NC_015318	A	6	6	173194	173199	100 %	0 %	0 %	0 %	327398345
3574	NC_015318	CTT	2	6	173235	173240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327398345
3575	NC_015318	CCCTTT	2	12	173252	173263	0 %	50 %	0 %	50 %	327398345
3576	NC_015318	GAT	2	6	173300	173305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327398345
3577	NC_015318	TTC	2	6	173370	173375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327398345
3578	NC_015318	A	6	6	173409	173414	100 %	0 %	0 %	0 %	327398346
3579	NC_015318	CAG	2	6	173417	173422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327398346
3580	NC_015318	ATT	3	9	173425	173433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327398346
3581	NC_015318	TA	3	6	173435	173440	50 %	50 %	0 %	0 %	327398346
3582	NC_015318	AAG	2	6	173509	173514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327398346
3583	NC_015318	ACA	2	6	173518	173523	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327398346
3584	NC_015318	CTT	2	6	173642	173647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327398346
3585	NC_015318	AAT	2	6	173676	173681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327398346
3586	NC_015318	CCA	2	6	173735	173740	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327398346
3587	NC_015318	TTTCTT	2	12	173784	173795	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	327398346
3588	NC_015318	ACC	2	6	173826	173831	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327398346
3589	NC_015318	AG	4	8	173837	173844	50 %	0 %	50 %	0 %	327398346
3590	NC_015318	AAC	2	6	173847	173852	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327398346
3591	NC_015318	A	7	7	173865	173871	100 %	0 %	0 %	0 %	327398346
3592	NC_015318	TAT	2	6	174135	174140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327398346
3593	NC_015318	ATC	2	6	174215	174220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327398347
3594	NC_015318	GTC	2	6	174508	174513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327398347
3595	NC_015318	TC	3	6	174512	174517	0 %	50 %	0 %	50 %	327398347
3596	NC_015318	GCT	2	6	174710	174715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327398347
3597	NC_015318	AC	3	6	174807	174812	50 %	0 %	0 %	50 %	327398347
3598	NC_015318	CAC	2	6	174880	174885	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327398347
3599	NC_015318	CTG	2	6	174984	174989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327398347
3600	NC_015318	ATAA	2	8	174990	174997	75 %	25 %	0 %	0 %	327398347
3601	NC_015318	T	7	7	175002	175008	0 %	100 %	0 %	0 %	327398347
3602	NC_015318	GAT	2	6	175133	175138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327398348
3603	NC_015318	T	7	7	175157	175163	0 %	100 %	0 %	0 %	327398348
3604	NC_015318	TTTGGC	2	12	175209	175220	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	327398348
3605	NC_015318	CTTT	2	8	175289	175296	0 %	75 %	0 %	25 %	327398348
3606	NC_015318	TA	3	6	175306	175311	50 %	50 %	0 %	0 %	327398348
3607	NC_015318	TACA	2	8	175338	175345	50 %	25 %	0 %	25 %	327398348
3608	NC_015318	T	7	7	175413	175419	0 %	100 %	0 %	0 %	327398348
3609	NC_015318	TCT	2	6	175421	175426	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327398348
3610	NC_015318	T	6	6	175468	175473	0 %	100 %	0 %	0 %	327398348
3611	NC_015318	ACAAA	2	10	175498	175507	80 %	0 %	0 %	20 %	327398348
3612	NC_015318	TCTT	2	8	175519	175526	0 %	75 %	0 %	25 %	327398348
3613	NC_015318	TTG	2	6	175565	175570	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327398348
3614	NC_015318	CTT	2	6	175608	175613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327398348
3615	NC_015318	AAG	2	6	175630	175635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327398348
3616	NC_015318	A	6	6	175639	175644	100 %	0 %	0 %	0 %	327398348
3617	NC_015318	GTTT	2	8	175685	175692	0 %	75 %	25 %	0 %	327398348
3618	NC_015318	AGTTT	2	10	175742	175751	20 %	60 %	20 %	0 %	327398348
3619	NC_015318	CA	3	6	175800	175805	50 %	0 %	0 %	50 %	327398348
3620	NC_015318	GTAT	2	8	175830	175837	25 %	50 %	25 %	0 %	327398348
3621	NC_015318	AAT	2	6	175844	175849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327398348
3622	NC_015318	T	6	6	175860	175865	0 %	100 %	0 %	0 %	327398348
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3624	NC_015318	TCA	2	6	175945	175950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327398348
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4000	NC_015318	TCC	2	6	196890	196895	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327398366

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