MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haemophilus influenzae F3031 chromosome

Total Repeats: 34780

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014920	CGTAT	2	10	44	53	20 %	40 %	20 %	20 %	319896423
2	NC_014920	GCA	2	6	59	64	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319896423
3	NC_014920	TGA	2	6	73	78	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319896423
4	NC_014920	TGA	2	6	307	312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319896423
5	NC_014920	A	7	7	343	349	100 %	0 %	0 %	0 %	319896423
6	NC_014920	GTTC	2	8	388	395	0 %	50 %	25 %	25 %	319896423
7	NC_014920	GTG	2	6	396	401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319896423
8	NC_014920	ACA	2	6	452	457	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319896423
9	NC_014920	GTT	2	6	482	487	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319896423
10	NC_014920	CAA	2	6	534	539	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319896423
11	NC_014920	A	6	6	549	554	100 %	0 %	0 %	0 %	319896423
12	NC_014920	GCG	2	6	585	590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319896423
13	NC_014920	CAT	2	6	610	615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319896423
14	NC_014920	TGT	2	6	718	723	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319896423
15	NC_014920	CTT	2	6	753	758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319896423
16	NC_014920	ATG	2	6	759	764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319896423
17	NC_014920	GTT	2	6	851	856	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319896423
18	NC_014920	CAAA	2	8	972	979	75 %	0 %	0 %	25 %	319896423
19	NC_014920	TAG	2	6	990	995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319896423
20	NC_014920	CTACAA	2	12	1003	1014	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	319896423
21	NC_014920	CAA	3	9	1248	1256	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319896424
22	NC_014920	TCAA	2	8	1345	1352	50 %	25 %	0 %	25 %	319896424
23	NC_014920	TTGC	2	8	1365	1372	0 %	50 %	25 %	25 %	319896424
24	NC_014920	ATA	2	6	1414	1419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319896424
25	NC_014920	AGCA	2	8	1501	1508	50 %	0 %	25 %	25 %	319896424
26	NC_014920	TCG	2	6	1546	1551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319896424
27	NC_014920	TCA	2	6	1589	1594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319896424
28	NC_014920	A	6	6	1609	1614	100 %	0 %	0 %	0 %	319896424
29	NC_014920	CCA	2	6	1630	1635	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319896424
30	NC_014920	ACA	2	6	1643	1648	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319896424
31	NC_014920	TTA	2	6	1678	1683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319896424
32	NC_014920	CAA	2	6	1701	1706	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319896424
33	NC_014920	ATTT	2	8	1747	1754	25 %	75 %	0 %	0 %	319896424
34	NC_014920	ATT	2	6	1758	1763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319896424
35	NC_014920	CTTT	2	8	1878	1885	0 %	75 %	0 %	25 %	319896424
36	NC_014920	T	6	6	1883	1888	0 %	100 %	0 %	0 %	319896424
37	NC_014920	TC	3	6	1894	1899	0 %	50 %	0 %	50 %	319896424
38	NC_014920	GGC	2	6	1919	1924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319896424
39	NC_014920	TTC	2	6	1930	1935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319896424
40	NC_014920	AGA	2	6	1961	1966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319896424
41	NC_014920	TG	3	6	2014	2019	0 %	50 %	50 %	0 %	319896424
42	NC_014920	A	6	6	2038	2043	100 %	0 %	0 %	0 %	319896424
43	NC_014920	GAA	2	6	2174	2179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319896424
44	NC_014920	ATT	2	6	2225	2230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319896424
45	NC_014920	G	6	6	2231	2236	0 %	0 %	100 %	0 %	319896424
46	NC_014920	ATG	2	6	2247	2252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319896424
47	NC_014920	GGA	2	6	2259	2264	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319896424
48	NC_014920	AAC	2	6	2342	2347	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319896424
49	NC_014920	AAT	2	6	2436	2441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319896424
50	NC_014920	GTG	2	6	2455	2460	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319896424
51	NC_014920	TGA	2	6	2467	2472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319896424
52	NC_014920	AGA	2	6	2492	2497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319896424
53	NC_014920	AGA	2	6	2516	2521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319896424
54	NC_014920	ATTT	2	8	2569	2576	25 %	75 %	0 %	0 %	319896424
55	NC_014920	AT	3	6	2621	2626	50 %	50 %	0 %	0 %	319896424
56	NC_014920	CAC	2	6	2629	2634	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319896424
57	NC_014920	AT	3	6	2636	2641	50 %	50 %	0 %	0 %	319896424
58	NC_014920	ATC	2	6	2685	2690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319896424
59	NC_014920	A	6	6	2700	2705	100 %	0 %	0 %	0 %	319896424
60	NC_014920	GAA	2	6	2745	2750	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319896424
61	NC_014920	ACT	2	6	2792	2797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319896424
62	NC_014920	A	6	6	2798	2803	100 %	0 %	0 %	0 %	319896424
63	NC_014920	AGC	2	6	2827	2832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319896424
64	NC_014920	A	7	7	2876	2882	100 %	0 %	0 %	0 %	319896424
65	NC_014920	GCAA	2	8	2974	2981	50 %	0 %	25 %	25 %	319896424
66	NC_014920	AAG	2	6	3004	3009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319896424
67	NC_014920	ATT	2	6	3049	3054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319896425
68	NC_014920	TCT	2	6	3066	3071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319896425
69	NC_014920	ATT	2	6	3095	3100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319896425
70	NC_014920	TCA	2	6	3135	3140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319896425
71	NC_014920	AAT	2	6	3241	3246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319896425
72	NC_014920	A	6	6	3252	3257	100 %	0 %	0 %	0 %	319896425
73	NC_014920	CGCAC	2	10	3258	3267	20 %	0 %	20 %	60 %	319896425
74	NC_014920	A	6	6	3300	3305	100 %	0 %	0 %	0 %	319896425
75	NC_014920	T	6	6	3341	3346	0 %	100 %	0 %	0 %	319896425
76	NC_014920	TCT	2	6	3375	3380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319896425
77	NC_014920	AAT	2	6	3389	3394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319896425
78	NC_014920	TCA	2	6	3426	3431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319896425
79	NC_014920	ATTT	2	8	3478	3485	25 %	75 %	0 %	0 %	319896425
80	NC_014920	CG	3	6	3493	3498	0 %	0 %	50 %	50 %	319896425
81	NC_014920	ATT	2	6	3509	3514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319896425
82	NC_014920	TAA	2	6	3519	3524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319896425
83	NC_014920	GC	3	6	3631	3636	0 %	0 %	50 %	50 %	319896425
84	NC_014920	CAA	2	6	3646	3651	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319896425
85	NC_014920	ATT	2	6	3656	3661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319896425
86	NC_014920	TAA	2	6	3794	3799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319896425
87	NC_014920	CAT	2	6	3833	3838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319896425
88	NC_014920	ATT	2	6	3853	3858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319896426
89	NC_014920	ATC	2	6	3875	3880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319896426
90	NC_014920	TTC	2	6	3923	3928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319896426
91	NC_014920	TC	4	8	4032	4039	0 %	50 %	0 %	50 %	319896426
92	NC_014920	GAC	2	6	4048	4053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319896426
93	NC_014920	ATTCT	2	10	4317	4326	20 %	60 %	0 %	20 %	319896426
94	NC_014920	TTTCCT	2	12	4613	4624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319896427
95	NC_014920	T	6	6	4731	4736	0 %	100 %	0 %	0 %	319896427
96	NC_014920	CTCG	2	8	4751	4758	0 %	25 %	25 %	50 %	319896427
97	NC_014920	TAAAA	2	10	4768	4777	80 %	20 %	0 %	0 %	319896427
98	NC_014920	CCAA	2	8	4804	4811	50 %	0 %	0 %	50 %	319896427
99	NC_014920	GGC	2	6	4833	4838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319896427
100	NC_014920	T	7	7	4928	4934	0 %	100 %	0 %	0 %	319896427
101	NC_014920	TA	3	6	5007	5012	50 %	50 %	0 %	0 %	319896427
102	NC_014920	ACG	2	6	5068	5073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319896427
103	NC_014920	ACA	2	6	5144	5149	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319896427
104	NC_014920	TCT	2	6	5165	5170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319896427
105	NC_014920	CAT	2	6	5239	5244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319896427
106	NC_014920	TA	3	6	5265	5270	50 %	50 %	0 %	0 %	319896427
107	NC_014920	TTG	2	6	5311	5316	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319896427
108	NC_014920	T	6	6	5342	5347	0 %	100 %	0 %	0 %	319896427
109	NC_014920	A	6	6	5356	5361	100 %	0 %	0 %	0 %	319896427
110	NC_014920	CCA	2	6	10065	10070	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319896428
111	NC_014920	ATA	2	6	10082	10087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319896428
112	NC_014920	T	6	6	10120	10125	0 %	100 %	0 %	0 %	319896428
113	NC_014920	CT	3	6	10151	10156	0 %	50 %	0 %	50 %	319896428
114	NC_014920	AAT	2	6	10218	10223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319896428
115	NC_014920	ATT	2	6	10322	10327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319896428
116	NC_014920	ATT	2	6	10364	10369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319896428
117	NC_014920	T	6	6	10368	10373	0 %	100 %	0 %	0 %	319896428
118	NC_014920	TGCT	2	8	10403	10410	0 %	50 %	25 %	25 %	319896428
119	NC_014920	ATA	2	6	10458	10463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319896428
120	NC_014920	GCT	2	6	10476	10481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319896429
121	NC_014920	TTG	2	6	10486	10491	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319896429
122	NC_014920	TGA	2	6	10511	10516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319896429
123	NC_014920	TGC	2	6	10529	10534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319896429
124	NC_014920	GCGA	2	8	10542	10549	25 %	0 %	50 %	25 %	319896429
125	NC_014920	GCT	2	6	10632	10637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319896429
126	NC_014920	T	6	6	10687	10692	0 %	100 %	0 %	0 %	319896429
127	NC_014920	CAA	2	6	10720	10725	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319896429
128	NC_014920	AGA	2	6	10856	10861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319896429
129	NC_014920	T	6	6	11023	11028	0 %	100 %	0 %	0 %	319896430
130	NC_014920	TAT	2	6	11042	11047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319896430
131	NC_014920	TCA	2	6	11098	11103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319896430
132	NC_014920	TAT	2	6	11197	11202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319896430
133	NC_014920	ACAA	2	8	11213	11220	75 %	0 %	0 %	25 %	319896430
134	NC_014920	ATTA	2	8	11277	11284	50 %	50 %	0 %	0 %	319896430
135	NC_014920	GCGT	2	8	11303	11310	0 %	25 %	50 %	25 %	319896430
136	NC_014920	A	6	6	11318	11323	100 %	0 %	0 %	0 %	319896430
137	NC_014920	TCG	2	6	11364	11369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319896430
138	NC_014920	TA	4	8	11466	11473	50 %	50 %	0 %	0 %	319896430
139	NC_014920	GCG	2	6	11494	11499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319896430
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142	NC_014920	ATTTG	2	10	11745	11754	20 %	60 %	20 %	0 %	319896430
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148	NC_014920	AT	3	6	12048	12053	50 %	50 %	0 %	0 %	319896431
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151	NC_014920	T	6	6	12181	12186	0 %	100 %	0 %	0 %	319896431
152	NC_014920	CCGC	2	8	12189	12196	0 %	0 %	25 %	75 %	319896431
153	NC_014920	T	7	7	12208	12214	0 %	100 %	0 %	0 %	319896431
154	NC_014920	ATTT	2	8	12245	12252	25 %	75 %	0 %	0 %	319896431
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172	NC_014920	TTTA	2	8	12860	12867	25 %	75 %	0 %	0 %	319896431
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232	NC_014920	CACGCT	2	12	16332	16343	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	319896434
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251	NC_014920	TAAA	2	8	17389	17396	75 %	25 %	0 %	0 %	319896435
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260	NC_014920	T	7	7	17875	17881	0 %	100 %	0 %	0 %	319896436
261	NC_014920	ATG	2	6	17912	17917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319896436
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264	NC_014920	TGG	2	6	18123	18128	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319896436
265	NC_014920	TAA	2	6	18225	18230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319896437
266	NC_014920	TTA	2	6	18259	18264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319896437
267	NC_014920	GAT	2	6	18308	18313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319896437
268	NC_014920	TGG	2	6	18357	18362	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319896437
269	NC_014920	A	7	7	18381	18387	100 %	0 %	0 %	0 %	319896437
270	NC_014920	AAT	2	6	18428	18433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319896437
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273	NC_014920	T	6	6	18538	18543	0 %	100 %	0 %	0 %	319896437
274	NC_014920	TG	3	6	18566	18571	0 %	50 %	50 %	0 %	319896437
275	NC_014920	TCT	2	6	18717	18722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319896437
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281	NC_014920	AT	3	6	19322	19327	50 %	50 %	0 %	0 %	319896437
282	NC_014920	TGA	2	6	19495	19500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319896437
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287	NC_014920	GA	3	6	19621	19626	50 %	0 %	50 %	0 %	319896437
288	NC_014920	AAT	2	6	19643	19648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319896437
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291	NC_014920	AAGA	2	8	19881	19888	75 %	0 %	25 %	0 %	319896437
292	NC_014920	CCG	2	6	20043	20048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319896437
293	NC_014920	AAT	2	6	20054	20059	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319896437
294	NC_014920	AAT	2	6	20063	20068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319896437
295	NC_014920	TGT	2	6	20179	20184	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319896437
296	NC_014920	ATT	2	6	20237	20242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319896437
297	NC_014920	GTTA	2	8	20266	20273	25 %	50 %	25 %	0 %	319896437
298	NC_014920	ATT	2	6	20301	20306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319896437
299	NC_014920	AATA	2	8	20380	20387	75 %	25 %	0 %	0 %	319896437
300	NC_014920	AAC	2	6	20406	20411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319896437
301	NC_014920	A	7	7	20459	20465	100 %	0 %	0 %	0 %	319896437
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389	NC_014920	AGCA	2	8	25352	25359	50 %	0 %	25 %	25 %	319896442
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391	NC_014920	CAT	2	6	25487	25492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319896442
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