MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Helicobacter felis ATCC 49179 chromosome

Total Repeats: 29432

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014810	AGCA	2	8	1434	1441	50 %	0 %	25 %	25 %	332309248
2	NC_014810	AGG	2	6	1494	1499	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332309248
3	NC_014810	AGAGG	2	10	1505	1514	40 %	0 %	60 %	0 %	332309248
4	NC_014810	A	6	6	1583	1588	100 %	0 %	0 %	0 %	332309248
5	NC_014810	ACT	2	6	1596	1601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332309248
6	NC_014810	GA	3	6	1614	1619	50 %	0 %	50 %	0 %	332309248
7	NC_014810	TTGC	2	8	1701	1708	0 %	50 %	25 %	25 %	332309248
8	NC_014810	AAC	2	6	1808	1813	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332309248
9	NC_014810	AAG	2	6	1851	1856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332309248
10	NC_014810	A	6	6	1869	1874	100 %	0 %	0 %	0 %	332309248
11	NC_014810	GTC	2	6	1888	1893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332309248
12	NC_014810	ACA	2	6	1937	1942	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332309248
13	NC_014810	CTA	2	6	1948	1953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332309248
14	NC_014810	TGC	2	6	1957	1962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332309248
15	NC_014810	A	6	6	1991	1996	100 %	0 %	0 %	0 %	332309248
16	NC_014810	GATT	2	8	2079	2086	25 %	50 %	25 %	0 %	332309248
17	NC_014810	AGC	2	6	2099	2104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332309248
18	NC_014810	GGC	3	9	2164	2172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332309248
19	NC_014810	GCCTAC	2	12	2183	2194	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	332309248
20	NC_014810	ATTT	2	8	2384	2391	25 %	75 %	0 %	0 %	332309248
21	NC_014810	GCA	2	6	2459	2464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332309248
22	NC_014810	TAC	2	6	2468	2473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332309248
23	NC_014810	TATC	2	8	2507	2514	25 %	50 %	0 %	25 %	332309248
24	NC_014810	AGCA	2	8	2518	2525	50 %	0 %	25 %	25 %	332309248
25	NC_014810	A	6	6	2561	2566	100 %	0 %	0 %	0 %	332309248
26	NC_014810	GC	4	8	2567	2574	0 %	0 %	50 %	50 %	332309248
27	NC_014810	GGGA	2	8	2588	2595	25 %	0 %	75 %	0 %	332309248
28	NC_014810	TG	4	8	2601	2608	0 %	50 %	50 %	0 %	332309248
29	NC_014810	GAT	2	6	2621	2626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332309248
30	NC_014810	TGAG	2	8	2632	2639	25 %	25 %	50 %	0 %	332309248
31	NC_014810	GGA	2	6	2641	2646	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332309249
32	NC_014810	AG	3	6	2688	2693	50 %	0 %	50 %	0 %	332309249
33	NC_014810	TG	3	6	2738	2743	0 %	50 %	50 %	0 %	332309249
34	NC_014810	CAA	2	6	2805	2810	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332309249
35	NC_014810	TGT	2	6	2820	2825	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332309249
36	NC_014810	TC	3	6	2868	2873	0 %	50 %	0 %	50 %	332309249
37	NC_014810	TCC	2	6	2879	2884	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332309249
38	NC_014810	CT	3	6	3014	3019	0 %	50 %	0 %	50 %	332309249
39	NC_014810	CTC	2	6	3025	3030	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332309249
40	NC_014810	GCT	2	6	3056	3061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332309249
41	NC_014810	GAT	2	6	3159	3164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332309249
42	NC_014810	TGG	2	6	3916	3921	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	315452432
43	NC_014810	GC	3	6	3939	3944	0 %	0 %	50 %	50 %	315452432
44	NC_014810	A	6	6	3955	3960	100 %	0 %	0 %	0 %	315452432
45	NC_014810	AAC	2	6	4057	4062	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315452432
46	NC_014810	ACA	2	6	4067	4072	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315452432
47	NC_014810	ATTTA	2	10	4088	4097	40 %	60 %	0 %	0 %	315452432
48	NC_014810	AAG	2	6	4108	4113	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315452432
49	NC_014810	GCA	2	6	4129	4134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315452432
50	NC_014810	G	6	6	4137	4142	0 %	0 %	100 %	0 %	315452432
51	NC_014810	CAT	2	6	4143	4148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315452432
52	NC_014810	TAC	2	6	4161	4166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315452432
53	NC_014810	TAT	2	6	4170	4175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315452432
54	NC_014810	TTAGAA	2	12	4176	4187	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	315452432
55	NC_014810	GC	3	6	4210	4215	0 %	0 %	50 %	50 %	315452432
56	NC_014810	A	6	6	4283	4288	100 %	0 %	0 %	0 %	315452432
57	NC_014810	ATG	2	6	4386	4391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315452432
58	NC_014810	GC	3	6	4431	4436	0 %	0 %	50 %	50 %	315452432
59	NC_014810	AATT	2	8	4486	4493	50 %	50 %	0 %	0 %	315452432
60	NC_014810	ACTCCA	2	12	4495	4506	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	315452432
61	NC_014810	GC	3	6	4597	4602	0 %	0 %	50 %	50 %	315452432
62	NC_014810	GCGTG	2	10	4639	4648	0 %	20 %	60 %	20 %	315452432
63	NC_014810	GCC	2	6	4663	4668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	315452432
64	NC_014810	T	6	6	4689	4694	0 %	100 %	0 %	0 %	315452432
65	NC_014810	ATG	2	6	4741	4746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315452432
66	NC_014810	A	6	6	4759	4764	100 %	0 %	0 %	0 %	315452432
67	NC_014810	A	6	6	4785	4790	100 %	0 %	0 %	0 %	315452432
68	NC_014810	CAT	2	6	4859	4864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315452432
69	NC_014810	AAC	2	6	4890	4895	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315452432
70	NC_014810	TGA	2	6	4928	4933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315452432
71	NC_014810	GC	3	6	4982	4987	0 %	0 %	50 %	50 %	315452432
72	NC_014810	AAC	2	6	5004	5009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315452432
73	NC_014810	GC	3	6	5023	5028	0 %	0 %	50 %	50 %	315452432
74	NC_014810	GTGGTT	2	12	5061	5072	0 %	50 %	50 %	0 %	315452432
75	NC_014810	TGA	2	6	5081	5086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315452432
76	NC_014810	TAA	2	6	5114	5119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315452432
77	NC_014810	ATT	2	6	5200	5205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315452432
78	NC_014810	GC	3	6	5263	5268	0 %	0 %	50 %	50 %	315452432
79	NC_014810	AGAA	2	8	5271	5278	75 %	0 %	25 %	0 %	315452432
80	NC_014810	GGTG	2	8	5282	5289	0 %	25 %	75 %	0 %	315452432
81	NC_014810	A	6	6	5316	5321	100 %	0 %	0 %	0 %	315452432
82	NC_014810	A	6	6	5350	5355	100 %	0 %	0 %	0 %	315452432
83	NC_014810	CAAA	2	8	5357	5364	75 %	0 %	0 %	25 %	315452432
84	NC_014810	GGC	2	6	5384	5389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	315452432
85	NC_014810	CT	3	6	5641	5646	0 %	50 %	0 %	50 %	315452433
86	NC_014810	GC	3	6	5659	5664	0 %	0 %	50 %	50 %	315452433
87	NC_014810	CAA	2	6	5670	5675	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315452433
88	NC_014810	CAGC	2	8	5730	5737	25 %	0 %	25 %	50 %	315452433
89	NC_014810	A	6	6	5741	5746	100 %	0 %	0 %	0 %	315452433
90	NC_014810	CA	3	6	5784	5789	50 %	0 %	0 %	50 %	315452433
91	NC_014810	ATT	2	6	5851	5856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315452433
92	NC_014810	GGT	2	6	5865	5870	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	315452433
93	NC_014810	CCTG	2	8	5882	5889	0 %	25 %	25 %	50 %	315452433
94	NC_014810	TTG	2	6	5962	5967	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315452433
95	NC_014810	GCC	2	6	6152	6157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	315452433
96	NC_014810	TC	3	6	6262	6267	0 %	50 %	0 %	50 %	315452433
97	NC_014810	GC	3	6	6281	6286	0 %	0 %	50 %	50 %	315452433
98	NC_014810	GC	3	6	6326	6331	0 %	0 %	50 %	50 %	315452433
99	NC_014810	CAA	2	6	6348	6353	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315452433
100	NC_014810	CGTG	2	8	6361	6368	0 %	25 %	50 %	25 %	315452433
101	NC_014810	GCAA	2	8	6563	6570	50 %	0 %	25 %	25 %	315452434
102	NC_014810	TATT	2	8	6583	6590	25 %	75 %	0 %	0 %	315452434
103	NC_014810	G	6	6	6634	6639	0 %	0 %	100 %	0 %	315452434
104	NC_014810	CGC	2	6	6645	6650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	315452434
105	NC_014810	TTAC	2	8	6684	6691	25 %	50 %	0 %	25 %	315452434
106	NC_014810	T	7	7	6861	6867	0 %	100 %	0 %	0 %	315452435
107	NC_014810	GC	3	6	6871	6876	0 %	0 %	50 %	50 %	315452435
108	NC_014810	GC	3	6	6928	6933	0 %	0 %	50 %	50 %	315452435
109	NC_014810	CTA	2	6	6962	6967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315452435
110	NC_014810	GAT	2	6	7063	7068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315452436
111	NC_014810	TCT	2	6	7077	7082	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315452436
112	NC_014810	AGA	2	6	7084	7089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315452436
113	NC_014810	AAG	2	6	7152	7157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315452436
114	NC_014810	AAC	2	6	7300	7305	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315452437
115	NC_014810	A	6	6	7317	7322	100 %	0 %	0 %	0 %	315452437
116	NC_014810	GAA	2	6	7380	7385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315452437
117	NC_014810	A	6	6	7393	7398	100 %	0 %	0 %	0 %	315452437
118	NC_014810	GGA	2	6	7414	7419	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315452437
119	NC_014810	CG	4	8	7430	7437	0 %	0 %	50 %	50 %	315452437
120	NC_014810	A	6	6	7461	7466	100 %	0 %	0 %	0 %	315452437
121	NC_014810	TGC	2	6	7474	7479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315452437
122	NC_014810	AG	3	6	7595	7600	50 %	0 %	50 %	0 %	315452437
123	NC_014810	AGG	2	6	7630	7635	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315452437
124	NC_014810	CAC	2	6	7667	7672	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	315452437
125	NC_014810	CTTT	2	8	7862	7869	0 %	75 %	0 %	25 %	315452438
126	NC_014810	GTGC	2	8	7870	7877	0 %	25 %	50 %	25 %	315452438
127	NC_014810	CG	3	6	7907	7912	0 %	0 %	50 %	50 %	315452438
128	NC_014810	A	6	6	7925	7930	100 %	0 %	0 %	0 %	315452438
129	NC_014810	AG	3	6	8101	8106	50 %	0 %	50 %	0 %	315452439
130	NC_014810	CT	3	6	8107	8112	0 %	50 %	0 %	50 %	315452439
131	NC_014810	AG	3	6	8224	8229	50 %	0 %	50 %	0 %	315452439
132	NC_014810	ACA	2	6	8253	8258	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315452439
133	NC_014810	GC	3	6	8263	8268	0 %	0 %	50 %	50 %	315452439
134	NC_014810	GC	3	6	8277	8282	0 %	0 %	50 %	50 %	315452439
135	NC_014810	CTG	2	6	8337	8342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315452439
136	NC_014810	TG	3	6	8365	8370	0 %	50 %	50 %	0 %	315452439
137	NC_014810	GAA	2	6	8441	8446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315452439
138	NC_014810	GTG	2	6	8534	8539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	315452439
139	NC_014810	GC	3	6	8700	8705	0 %	0 %	50 %	50 %	315452439
140	NC_014810	GGA	2	6	8713	8718	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315452439
141	NC_014810	AC	3	6	8743	8748	50 %	0 %	0 %	50 %	315452439
142	NC_014810	ACTA	2	8	8752	8759	50 %	25 %	0 %	25 %	315452439
143	NC_014810	TCA	2	6	8916	8921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315452439
144	NC_014810	CG	3	6	8954	8959	0 %	0 %	50 %	50 %	315452439
145	NC_014810	ATT	2	6	9105	9110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315452440
146	NC_014810	TCT	2	6	9134	9139	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315452440
147	NC_014810	AAT	2	6	9198	9203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315452440
148	NC_014810	AAG	2	6	9452	9457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315452441
149	NC_014810	AGT	2	6	9466	9471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315452441
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151	NC_014810	AAG	2	6	9518	9523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315452441
152	NC_014810	TTA	2	6	9527	9532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315452441
153	NC_014810	A	6	6	9538	9543	100 %	0 %	0 %	0 %	315452441
154	NC_014810	TGA	2	6	9639	9644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315452441
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156	NC_014810	TAC	2	6	9729	9734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315452441
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158	NC_014810	AAT	2	6	9808	9813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315452441
159	NC_014810	AGAA	2	8	9820	9827	75 %	0 %	25 %	0 %	315452441
160	NC_014810	TCA	2	6	9888	9893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315452441
161	NC_014810	ATT	2	6	9913	9918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315452441
162	NC_014810	GACTT	2	10	9928	9937	20 %	40 %	20 %	20 %	315452441
163	NC_014810	A	6	6	9949	9954	100 %	0 %	0 %	0 %	315452441
164	NC_014810	AGG	2	6	9976	9981	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315452441
165	NC_014810	CAT	2	6	10002	10007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315452441
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167	NC_014810	TTA	2	6	10108	10113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315452441
168	NC_014810	GTG	2	6	10156	10161	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	315452441
169	NC_014810	TGC	2	6	10176	10181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315452441
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171	NC_014810	ATT	2	6	10405	10410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315452442
172	NC_014810	G	6	6	10439	10444	0 %	0 %	100 %	0 %	315452442
173	NC_014810	CAA	2	6	10453	10458	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315452442
174	NC_014810	CTAG	2	8	10540	10547	25 %	25 %	25 %	25 %	315452442
175	NC_014810	T	6	6	10573	10578	0 %	100 %	0 %	0 %	315452442
176	NC_014810	TGCTTG	2	12	10616	10627	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	315452442
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178	NC_014810	TGCGTG	2	12	10655	10666	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	315452442
179	NC_014810	GC	3	6	10690	10695	0 %	0 %	50 %	50 %	315452442
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182	NC_014810	G	6	6	10779	10784	0 %	0 %	100 %	0 %	315452442
183	NC_014810	CCCTC	2	10	10799	10808	0 %	20 %	0 %	80 %	315452442
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204	NC_014810	GC	3	6	11802	11807	0 %	0 %	50 %	50 %	315452444
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242	NC_014810	A	6	6	13988	13993	100 %	0 %	0 %	0 %	332309250
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250	NC_014810	GTG	2	6	14327	14332	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332309250
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256	NC_014810	AC	3	6	14616	14621	50 %	0 %	0 %	50 %	332309250
257	NC_014810	T	7	7	14689	14695	0 %	100 %	0 %	0 %	332309250
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261	NC_014810	T	6	6	14867	14872	0 %	100 %	0 %	0 %	332309250
262	NC_014810	A	6	6	14885	14890	100 %	0 %	0 %	0 %	332309250
263	NC_014810	T	7	7	14914	14920	0 %	100 %	0 %	0 %	332309250
264	NC_014810	A	6	6	14935	14940	100 %	0 %	0 %	0 %	332309250
265	NC_014810	CAC	2	6	14941	14946	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332309250
266	NC_014810	C	6	6	14976	14981	0 %	0 %	0 %	100 %	332309250
267	NC_014810	CT	3	6	14984	14989	0 %	50 %	0 %	50 %	332309250
268	NC_014810	GC	3	6	15057	15062	0 %	0 %	50 %	50 %	332309250
269	NC_014810	GAC	2	6	15065	15070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332309250
270	NC_014810	GC	3	6	15104	15109	0 %	0 %	50 %	50 %	332309250
271	NC_014810	ATG	2	6	15193	15198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332309250
272	NC_014810	C	7	7	16669	16675	0 %	0 %	0 %	100 %	315452449
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276	NC_014810	CG	3	6	16875	16880	0 %	0 %	50 %	50 %	315452449
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279	NC_014810	TG	3	6	16998	17003	0 %	50 %	50 %	0 %	315452449
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293	NC_014810	GCC	2	6	17574	17579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	315452450
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300	NC_014810	CT	3	6	17840	17845	0 %	50 %	0 %	50 %	315452450
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305	NC_014810	AC	3	6	17951	17956	50 %	0 %	0 %	50 %	315452450
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311	NC_014810	CTAT	2	8	18113	18120	25 %	50 %	0 %	25 %	315452450
312	NC_014810	A	6	6	18185	18190	100 %	0 %	0 %	0 %	315452450
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402	NC_014810	TG	3	6	24345	24350	0 %	50 %	50 %	0 %	315452459
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