MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halogeometricum borinquense DSM 11551 plasmid pHBOR03

Total Repeats: 3727

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_014736	TCG	2	6	138905	138910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122674
2502	NC_014736	CGAA	2	8	138923	138930	50 %	0 %	25 %	25 %	313122674
2503	NC_014736	CGA	2	6	138936	138941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122674
2504	NC_014736	ACCCAG	2	12	138960	138971	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	313122674
2505	NC_014736	TCT	2	6	139007	139012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313122674
2506	NC_014736	CAC	2	6	139069	139074	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313122674
2507	NC_014736	CGC	2	6	139091	139096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122674
2508	NC_014736	GTT	2	6	139367	139372	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313122675
2509	NC_014736	CGT	2	6	139383	139388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122675
2510	NC_014736	GTC	2	6	139426	139431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122675
2511	NC_014736	T	6	6	139463	139468	0 %	100 %	0 %	0 %	313122675
2512	NC_014736	CGT	2	6	139565	139570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122675
2513	NC_014736	TCC	2	6	139573	139578	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313122675
2514	NC_014736	G	6	6	139583	139588	0 %	0 %	100 %	0 %	313122675
2515	NC_014736	CGA	2	6	139712	139717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122675
2516	NC_014736	CCA	2	6	139795	139800	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313122675
2517	NC_014736	GGA	2	6	139839	139844	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313122675
2518	NC_014736	GTTC	2	8	139871	139878	0 %	50 %	25 %	25 %	313122675
2519	NC_014736	CTTC	2	8	139880	139887	0 %	50 %	0 %	50 %	313122675
2520	NC_014736	CG	3	6	139960	139965	0 %	0 %	50 %	50 %	313122675
2521	NC_014736	CGTA	2	8	139988	139995	25 %	25 %	25 %	25 %	313122675
2522	NC_014736	GAG	2	6	140001	140006	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313122675
2523	NC_014736	TCC	2	6	140014	140019	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313122675
2524	NC_014736	CGA	2	6	140030	140035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122675
2525	NC_014736	GCA	2	6	140047	140052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122675
2526	NC_014736	CCG	2	6	140152	140157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122675
2527	NC_014736	CGC	2	6	140172	140177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122675
2528	NC_014736	CGT	2	6	140206	140211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122675
2529	NC_014736	GA	3	6	140226	140231	50 %	0 %	50 %	0 %	313122675
2530	NC_014736	GTC	2	6	140235	140240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122675
2531	NC_014736	GC	3	6	140268	140273	0 %	0 %	50 %	50 %	313122675
2532	NC_014736	TCG	2	6	140279	140284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122675
2533	NC_014736	TGAT	2	8	140308	140315	25 %	50 %	25 %	0 %	313122675
2534	NC_014736	AGT	2	6	140329	140334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313122675
2535	NC_014736	CTC	2	6	140454	140459	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313122675
2536	NC_014736	TGG	2	6	140620	140625	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313122676
2537	NC_014736	CAT	2	6	140638	140643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313122676
2538	NC_014736	TGA	2	6	140751	140756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313122676
2539	NC_014736	GAG	2	6	140910	140915	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313122677
2540	NC_014736	GAC	2	6	140958	140963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122677
2541	NC_014736	GAG	2	6	141036	141041	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313122677
2542	NC_014736	GTAC	2	8	141089	141096	25 %	25 %	25 %	25 %	313122677
2543	NC_014736	CGAA	2	8	141203	141210	50 %	0 %	25 %	25 %	313122677
2544	NC_014736	A	6	6	141234	141239	100 %	0 %	0 %	0 %	313122677
2545	NC_014736	GAG	2	6	141273	141278	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313122677
2546	NC_014736	AAAAG	2	10	141322	141331	80 %	0 %	20 %	0 %	313122677
2547	NC_014736	GAGT	2	8	141490	141497	25 %	25 %	50 %	0 %	313122677
2548	NC_014736	AGG	2	6	141511	141516	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313122677
2549	NC_014736	ACTG	2	8	141522	141529	25 %	25 %	25 %	25 %	313122677
2550	NC_014736	AAT	2	6	141560	141565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	313122677
2551	NC_014736	GCA	2	6	141595	141600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122677
2552	NC_014736	CGG	2	6	141653	141658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313122677
2553	NC_014736	A	6	6	141661	141666	100 %	0 %	0 %	0 %	313122677
2554	NC_014736	TCC	2	6	141745	141750	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313122677
2555	NC_014736	TGC	2	6	141786	141791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122677
2556	NC_014736	ACG	2	6	142035	142040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122678
2557	NC_014736	AGCT	2	8	142055	142062	25 %	25 %	25 %	25 %	313122678
2558	NC_014736	TGCCG	2	10	142177	142186	0 %	20 %	40 %	40 %	313122678
2559	NC_014736	AC	3	6	142242	142247	50 %	0 %	0 %	50 %	313122678
2560	NC_014736	AG	3	6	142333	142338	50 %	0 %	50 %	0 %	313122678
2561	NC_014736	CTC	2	6	142358	142363	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313122678
2562	NC_014736	GCC	2	6	142386	142391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122678
2563	NC_014736	CCGT	2	8	142410	142417	0 %	25 %	25 %	50 %	313122678
2564	NC_014736	CGG	2	6	142657	142662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313122679
2565	NC_014736	TCG	2	6	142755	142760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122679
2566	NC_014736	ACG	2	6	142837	142842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122679
2567	NC_014736	CTAC	2	8	142890	142897	25 %	25 %	0 %	50 %	313122679
2568	NC_014736	GTC	2	6	142961	142966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122679
2569	NC_014736	CACCG	2	10	143050	143059	20 %	0 %	20 %	60 %	313122679
2570	NC_014736	CAG	2	6	143089	143094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122679
2571	NC_014736	CGT	2	6	143205	143210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122680
2572	NC_014736	ACG	2	6	143213	143218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122680
2573	NC_014736	ACC	2	6	143220	143225	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313122680
2574	NC_014736	GTT	2	6	143330	143335	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313122680
2575	NC_014736	TCCACT	2	12	143457	143468	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	313122680
2576	NC_014736	CGA	2	6	143505	143510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122680
2577	NC_014736	TTTG	2	8	143722	143729	0 %	75 %	25 %	0 %	313122681
2578	NC_014736	AGAA	2	8	143757	143764	75 %	0 %	25 %	0 %	313122681
2579	NC_014736	CTC	2	6	143787	143792	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313122681
2580	NC_014736	AGC	2	6	143794	143799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122681
2581	NC_014736	GAG	2	6	144048	144053	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313122681
2582	NC_014736	TCT	2	6	144124	144129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313122681
2583	NC_014736	TTG	2	6	144131	144136	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313122681
2584	NC_014736	GGA	2	6	144155	144160	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313122681
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2586	NC_014736	GCGT	2	8	144253	144260	0 %	25 %	50 %	25 %	313122681
2587	NC_014736	GTTC	2	8	144284	144291	0 %	50 %	25 %	25 %	313122681
2588	NC_014736	TCG	2	6	144316	144321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122681
2589	NC_014736	AAT	2	6	144387	144392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	313122681
2590	NC_014736	CGA	2	6	144407	144412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122681
2591	NC_014736	GA	3	6	144434	144439	50 %	0 %	50 %	0 %	313122681
2592	NC_014736	TCG	2	6	144454	144459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122681
2593	NC_014736	ATCT	2	8	144471	144478	25 %	50 %	0 %	25 %	313122681
2594	NC_014736	GAC	2	6	144486	144491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122681
2595	NC_014736	GTA	2	6	144537	144542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313122681
2596	NC_014736	AG	3	6	144552	144557	50 %	0 %	50 %	0 %	313122681
2597	NC_014736	TGA	2	6	144620	144625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313122681
2598	NC_014736	TTG	2	6	144699	144704	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313122681
2599	NC_014736	GGC	2	6	144707	144712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313122681
2600	NC_014736	AG	3	6	144920	144925	50 %	0 %	50 %	0 %	313122681
2601	NC_014736	CCT	2	6	145753	145758	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313122682
2602	NC_014736	GTG	2	6	145924	145929	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313122682
2603	NC_014736	TGC	2	6	145955	145960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122682
2604	NC_014736	GCC	2	6	145986	145991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122682
2605	NC_014736	CGT	2	6	146003	146008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122682
2606	NC_014736	GAC	2	6	146072	146077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122682
2607	NC_014736	TCG	2	6	146100	146105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122682
2608	NC_014736	TGT	2	6	146107	146112	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313122682
2609	NC_014736	CGTTC	2	10	146344	146353	0 %	40 %	20 %	40 %	313122682
2610	NC_014736	ATCCC	2	10	146358	146367	20 %	20 %	0 %	60 %	313122682
2611	NC_014736	TCG	2	6	146370	146375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122682
2612	NC_014736	CGT	2	6	146606	146611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122682
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2614	NC_014736	AT	3	6	146764	146769	50 %	50 %	0 %	0 %	313122682
2615	NC_014736	CCGA	2	8	146874	146881	25 %	0 %	25 %	50 %	313122682
2616	NC_014736	CTCC	2	8	146919	146926	0 %	25 %	0 %	75 %	313122682
2617	NC_014736	TGCCG	2	10	146990	146999	0 %	20 %	40 %	40 %	313122682
2618	NC_014736	TCA	2	6	147009	147014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313122682
2619	NC_014736	TCG	2	6	147082	147087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122682
2620	NC_014736	GGA	2	6	147145	147150	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313122682
2621	NC_014736	CAT	2	6	147185	147190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313122682
2622	NC_014736	GAG	2	6	147198	147203	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313122682
2623	NC_014736	AGG	2	6	147255	147260	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313122682
2624	NC_014736	CGAA	2	8	147264	147271	50 %	0 %	25 %	25 %	313122682
2625	NC_014736	GTC	2	6	147272	147277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122682
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2737	NC_014736	GTGC	2	8	152698	152705	0 %	25 %	50 %	25 %	313122687
2738	NC_014736	GCC	2	6	152821	152826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122687
2739	NC_014736	TCG	2	6	152829	152834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122687
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2741	NC_014736	GTC	2	6	152974	152979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122688
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2983	NC_014736	GCC	2	6	166202	166207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122700
2984	NC_014736	GAC	2	6	166223	166228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122700
2985	NC_014736	CGA	2	6	166246	166251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122700
2986	NC_014736	CGC	2	6	166348	166353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122700
2987	NC_014736	CACGTA	2	12	166387	166398	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	313122700
2988	NC_014736	GTC	2	6	166469	166474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122700
2989	NC_014736	GAT	2	6	166489	166494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313122700
2990	NC_014736	GGT	2	6	166549	166554	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313122700
2991	NC_014736	CCG	2	6	166569	166574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122700
2992	NC_014736	CCG	2	6	166599	166604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122700
2993	NC_014736	CTA	2	6	166633	166638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313122700
2994	NC_014736	CGT	3	9	166714	166722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122700
2995	NC_014736	CGG	2	6	166735	166740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313122700
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2997	NC_014736	ACG	2	6	166803	166808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122700
2998	NC_014736	AC	3	6	166900	166905	50 %	0 %	0 %	50 %	313122700
2999	NC_014736	CGG	2	6	166909	166914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313122700
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