MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halogeometricum borinquense DSM 11551 plasmid pHBOR03

Total Repeats: 3727

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_014736	AGC	2	6	55464	55469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122596
1002	NC_014736	CGC	2	6	55515	55520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122596
1003	NC_014736	CGC	2	6	55528	55533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122596
1004	NC_014736	CAG	2	6	55597	55602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122596
1005	NC_014736	GCC	2	6	55606	55611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122596
1006	NC_014736	GAG	2	6	55667	55672	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313122596
1007	NC_014736	AGC	2	6	55673	55678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122596
1008	NC_014736	GC	3	6	55728	55733	0 %	0 %	50 %	50 %	313122596
1009	NC_014736	CGG	2	6	55734	55739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313122596
1010	NC_014736	GCGA	2	8	55870	55877	25 %	0 %	50 %	25 %	313122597
1011	NC_014736	CGG	2	6	55885	55890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313122597
1012	NC_014736	CGC	2	6	55949	55954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122597
1013	NC_014736	ACG	2	6	55974	55979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122597
1014	NC_014736	CGA	2	6	55990	55995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122597
1015	NC_014736	GAA	2	6	56033	56038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313122597
1016	NC_014736	GCG	2	6	56069	56074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313122597
1017	NC_014736	GAA	2	6	56099	56104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313122597
1018	NC_014736	ACC	3	9	56109	56117	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313122597
1019	NC_014736	GAC	2	6	56198	56203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122597
1020	NC_014736	CGA	2	6	56212	56217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122597
1021	NC_014736	CGT	2	6	56270	56275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122597
1022	NC_014736	GTCAG	2	10	56509	56518	20 %	20 %	40 %	20 %	313122598
1023	NC_014736	TCG	2	6	56544	56549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122598
1024	NC_014736	GAAC	2	8	56618	56625	50 %	0 %	25 %	25 %	313122598
1025	NC_014736	CGA	2	6	56669	56674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122598
1026	NC_014736	CTG	2	6	56684	56689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122598
1027	NC_014736	TTG	2	6	56702	56707	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313122598
1028	NC_014736	CGA	2	6	56722	56727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122598
1029	NC_014736	CTCC	2	8	56770	56777	0 %	25 %	0 %	75 %	313122598
1030	NC_014736	CGA	2	6	56791	56796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122598
1031	NC_014736	GCGA	2	8	56797	56804	25 %	0 %	50 %	25 %	313122598
1032	NC_014736	GT	3	6	56814	56819	0 %	50 %	50 %	0 %	313122598
1033	NC_014736	GAC	2	6	57005	57010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122598
1034	NC_014736	GACT	2	8	57071	57078	25 %	25 %	25 %	25 %	313122598
1035	NC_014736	CTC	2	6	57277	57282	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313122599
1036	NC_014736	GTC	2	6	57319	57324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122599
1037	NC_014736	GAG	2	6	57349	57354	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313122599
1038	NC_014736	GAAG	2	8	57429	57436	50 %	0 %	50 %	0 %	313122599
1039	NC_014736	CCG	2	6	57472	57477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122599
1040	NC_014736	CGA	2	6	57493	57498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122599
1041	NC_014736	GGC	2	6	57501	57506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313122599
1042	NC_014736	CG	3	6	57616	57621	0 %	0 %	50 %	50 %	313122599
1043	NC_014736	GGC	2	6	57630	57635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313122599
1044	NC_014736	GTCC	2	8	57681	57688	0 %	25 %	25 %	50 %	313122599
1045	NC_014736	ACG	2	6	57725	57730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122599
1046	NC_014736	TGC	2	6	57750	57755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122599
1047	NC_014736	CGAC	2	8	57806	57813	25 %	0 %	25 %	50 %	313122599
1048	NC_014736	ATCC	2	8	57814	57821	25 %	25 %	0 %	50 %	313122599
1049	NC_014736	CCT	2	6	57843	57848	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313122599
1050	NC_014736	ACC	2	6	57875	57880	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313122599
1051	NC_014736	CAGT	2	8	57898	57905	25 %	25 %	25 %	25 %	313122599
1052	NC_014736	CG	4	8	57923	57930	0 %	0 %	50 %	50 %	313122599
1053	NC_014736	ACG	2	6	57982	57987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122599
1054	NC_014736	CGA	2	6	58097	58102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122599
1055	NC_014736	CGGC	2	8	58149	58156	0 %	0 %	50 %	50 %	313122599
1056	NC_014736	GC	3	6	58155	58160	0 %	0 %	50 %	50 %	313122599
1057	NC_014736	CTC	2	6	58165	58170	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313122599
1058	NC_014736	TCGT	2	8	58226	58233	0 %	50 %	25 %	25 %	313122599
1059	NC_014736	CG	3	6	58234	58239	0 %	0 %	50 %	50 %	313122599
1060	NC_014736	CGT	2	6	58317	58322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122600
1061	NC_014736	TCG	2	6	58345	58350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122600
1062	NC_014736	AGG	2	6	58429	58434	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313122600
1063	NC_014736	CAC	2	6	58505	58510	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313122600
1064	NC_014736	AGC	2	6	58537	58542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122600
1065	NC_014736	TCCGC	2	10	58658	58667	0 %	20 %	20 %	60 %	313122600
1066	NC_014736	GAC	2	6	58678	58683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122600
1067	NC_014736	TCT	2	6	58696	58701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313122600
1068	NC_014736	TCG	2	6	58732	58737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122600
1069	NC_014736	TCT	2	6	58739	58744	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313122600
1070	NC_014736	GTCA	2	8	58746	58753	25 %	25 %	25 %	25 %	313122600
1071	NC_014736	GGT	2	6	58943	58948	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313122601
1072	NC_014736	TGA	2	6	58962	58967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313122601
1073	NC_014736	TCG	2	6	59015	59020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122601
1074	NC_014736	TCG	2	6	59045	59050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122601
1075	NC_014736	CCG	2	6	59076	59081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122601
1076	NC_014736	AGA	2	6	59082	59087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313122601
1077	NC_014736	ATCA	2	8	59089	59096	50 %	25 %	0 %	25 %	313122601
1078	NC_014736	CGG	2	6	59145	59150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313122601
1079	NC_014736	GCT	2	6	59180	59185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122601
1080	NC_014736	TCT	2	6	59283	59288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313122601
1081	NC_014736	ACGT	2	8	59297	59304	25 %	25 %	25 %	25 %	313122601
1082	NC_014736	GCC	2	6	59378	59383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122601
1083	NC_014736	ATG	2	6	59414	59419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313122601
1084	NC_014736	CGC	2	6	59530	59535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122601
1085	NC_014736	GT	3	6	59556	59561	0 %	50 %	50 %	0 %	313122601
1086	NC_014736	GAATC	2	10	59584	59593	40 %	20 %	20 %	20 %	313122601
1087	NC_014736	CCCA	2	8	59649	59656	25 %	0 %	0 %	75 %	313122601
1088	NC_014736	CTT	2	6	59718	59723	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313122601
1089	NC_014736	CAT	2	6	59830	59835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313122601
1090	NC_014736	TGC	2	6	59836	59841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122601
1091	NC_014736	ATCC	2	8	59869	59876	25 %	25 %	0 %	50 %	313122601
1092	NC_014736	CAG	2	6	59931	59936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122601
1093	NC_014736	CAT	2	6	59949	59954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313122601
1094	NC_014736	TGC	2	6	59974	59979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122601
1095	NC_014736	TGT	2	6	59995	60000	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313122601
1096	NC_014736	CGA	2	6	60025	60030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122601
1097	NC_014736	TCG	2	6	60035	60040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122601
1098	NC_014736	TGC	2	6	60078	60083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122601
1099	NC_014736	GGTGCC	2	12	60458	60469	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	313122602
1100	NC_014736	GTG	2	6	60497	60502	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313122602
1101	NC_014736	TCA	2	6	60519	60524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313122602
1102	NC_014736	ATTCGA	2	12	60626	60637	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	313122602
1103	NC_014736	GTC	2	6	60677	60682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122602
1104	NC_014736	CGA	2	6	60711	60716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122602
1105	NC_014736	AACG	2	8	60782	60789	50 %	0 %	25 %	25 %	313122602
1106	NC_014736	GA	3	6	60804	60809	50 %	0 %	50 %	0 %	313122602
1107	NC_014736	CCG	2	6	60810	60815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122602
1108	NC_014736	TGG	2	6	60901	60906	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313122602
1109	NC_014736	TCA	2	6	60921	60926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313122602
1110	NC_014736	CCG	2	6	60960	60965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122602
1111	NC_014736	CGTC	2	8	60972	60979	0 %	25 %	25 %	50 %	313122602
1112	NC_014736	CGG	2	6	61006	61011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313122602
1113	NC_014736	TCG	2	6	61026	61031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122602
1114	NC_014736	CGC	2	6	61048	61053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122602
1115	NC_014736	TCG	2	6	61080	61085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122602
1116	NC_014736	GAA	2	6	61124	61129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313122602
1117	NC_014736	TCG	2	6	61158	61163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122602
1118	NC_014736	CGG	2	6	61168	61173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313122602
1119	NC_014736	TCC	2	6	61182	61187	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313122602
1120	NC_014736	CAA	2	6	61426	61431	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	313122603
1121	NC_014736	CGA	3	9	61522	61530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122603
1122	NC_014736	ATT	2	6	61570	61575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313122603
1123	NC_014736	GGC	2	6	61630	61635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313122603
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1125	NC_014736	AC	3	6	61702	61707	50 %	0 %	0 %	50 %	313122603
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1487	NC_014736	ACGT	2	8	80243	80250	25 %	25 %	25 %	25 %	313122613
1488	NC_014736	TCGT	2	8	80336	80343	0 %	50 %	25 %	25 %	313122613
1489	NC_014736	CGACGG	2	12	80362	80373	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	313122613
1490	NC_014736	TCGG	2	8	80382	80389	0 %	25 %	50 %	25 %	313122613
1491	NC_014736	CGG	2	6	80473	80478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313122613
1492	NC_014736	GAC	2	6	80479	80484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122613
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1494	NC_014736	ACA	2	6	80561	80566	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	313122613
1495	NC_014736	GAC	2	6	80567	80572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122613
1496	NC_014736	ACG	3	9	80605	80613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122614
1497	NC_014736	GGT	2	6	80665	80670	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313122614
1498	NC_014736	CGA	2	6	80681	80686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122614
1499	NC_014736	GCC	2	6	80734	80739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122614
1500	NC_014736	GTG	2	6	80777	80782	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313122614

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