MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halogeometricum borinquense DSM 11551 plasmid pHBOR03

Total Repeats: 3727

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_014736	CTG	2	6	27620	27625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122574
502	NC_014736	GCG	2	6	27701	27706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313122574
503	NC_014736	CGCC	2	8	27707	27714	0 %	0 %	25 %	75 %	313122574
504	NC_014736	ACG	2	6	27733	27738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122574
505	NC_014736	GAC	2	6	27741	27746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122574
506	NC_014736	CCT	2	6	27770	27775	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313122574
507	NC_014736	GA	3	6	27793	27798	50 %	0 %	50 %	0 %	313122574
508	NC_014736	CGG	2	6	27809	27814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313122574
509	NC_014736	CGG	2	6	27836	27841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313122574
510	NC_014736	GAT	2	6	27894	27899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313122574
511	NC_014736	GTCT	2	8	27951	27958	0 %	50 %	25 %	25 %	313122574
512	NC_014736	CGAG	2	8	27982	27989	25 %	0 %	50 %	25 %	313122574
513	NC_014736	CAAC	2	8	28016	28023	50 %	0 %	0 %	50 %	313122574
514	NC_014736	CTT	2	6	28088	28093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313122574
515	NC_014736	TGCC	2	8	28131	28138	0 %	25 %	25 %	50 %	313122574
516	NC_014736	AGT	2	6	28151	28156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313122574
517	NC_014736	TC	3	6	28244	28249	0 %	50 %	0 %	50 %	313122574
518	NC_014736	GCT	2	6	28364	28369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122574
519	NC_014736	CTG	2	6	28388	28393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122574
520	NC_014736	TTGG	2	8	28394	28401	0 %	50 %	50 %	0 %	313122574
521	NC_014736	CAT	2	6	28536	28541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313122575
522	NC_014736	GTC	2	6	28611	28616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122575
523	NC_014736	GTT	2	6	28736	28741	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313122575
524	NC_014736	AGT	2	6	28801	28806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313122575
525	NC_014736	TGC	2	6	28918	28923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122575
526	NC_014736	TCT	2	6	28927	28932	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313122575
527	NC_014736	CAG	2	6	28938	28943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122575
528	NC_014736	TAG	2	6	28960	28965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313122575
529	NC_014736	CGG	2	6	28970	28975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313122575
530	NC_014736	TCG	2	6	29029	29034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122575
531	NC_014736	TCTGTC	2	12	29037	29048	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	313122575
532	NC_014736	GGT	2	6	29082	29087	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313122575
533	NC_014736	GTCG	2	8	29171	29178	0 %	25 %	50 %	25 %	313122575
534	NC_014736	GCT	2	6	29204	29209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122575
535	NC_014736	TG	3	6	29248	29253	0 %	50 %	50 %	0 %	313122575
536	NC_014736	TCT	2	6	29254	29259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313122575
537	NC_014736	AGC	2	6	29287	29292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122575
538	NC_014736	CAG	3	9	29333	29341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122575
539	NC_014736	GTC	2	6	29361	29366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122575
540	NC_014736	CAGC	2	8	29380	29387	25 %	0 %	25 %	50 %	313122575
541	NC_014736	AGC	3	9	29400	29408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122575
542	NC_014736	CGA	2	6	29420	29425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122575
543	NC_014736	CGAC	2	8	29664	29671	25 %	0 %	25 %	50 %	313122576
544	NC_014736	GCT	2	6	29696	29701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122576
545	NC_014736	CAA	2	6	29702	29707	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	313122576
546	NC_014736	TGG	2	6	29814	29819	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313122576
547	NC_014736	AGT	2	6	29862	29867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313122576
548	NC_014736	TCC	2	6	30097	30102	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313122577
549	NC_014736	GTC	2	6	30127	30132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122577
550	NC_014736	CGC	2	6	30152	30157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122577
551	NC_014736	CCG	2	6	30218	30223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122577
552	NC_014736	TCA	2	6	30232	30237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313122577
553	NC_014736	TC	3	6	30409	30414	0 %	50 %	0 %	50 %	313122577
554	NC_014736	ACG	2	6	30529	30534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122577
555	NC_014736	GAG	2	6	30579	30584	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313122577
556	NC_014736	GAC	2	6	30600	30605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122577
557	NC_014736	ACG	2	6	30617	30622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122577
558	NC_014736	CGC	2	6	30690	30695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122577
559	NC_014736	GCG	2	6	30716	30721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313122577
560	NC_014736	GA	3	6	30727	30732	50 %	0 %	50 %	0 %	313122577
561	NC_014736	GC	3	6	30803	30808	0 %	0 %	50 %	50 %	313122577
562	NC_014736	CGT	2	6	30824	30829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122577
563	NC_014736	ATA	2	6	30864	30869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	313122577
564	NC_014736	TTTG	2	8	30929	30936	0 %	75 %	25 %	0 %	313122577
565	NC_014736	CGA	2	6	30965	30970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122577
566	NC_014736	TCG	2	6	30998	31003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122577
567	NC_014736	GCG	2	6	31034	31039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313122577
568	NC_014736	CAG	2	6	31055	31060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122577
569	NC_014736	GAC	2	6	31068	31073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122577
570	NC_014736	AGC	2	6	31087	31092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122577
571	NC_014736	ACG	2	6	31126	31131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122577
572	NC_014736	CTC	2	6	31212	31217	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313122577
573	NC_014736	CGG	2	6	31229	31234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313122577
574	NC_014736	CGA	2	6	31343	31348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122577
575	NC_014736	AAAG	2	8	31467	31474	75 %	0 %	25 %	0 %	313122577
576	NC_014736	GCG	2	6	31486	31491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313122577
577	NC_014736	GTCG	2	8	31510	31517	0 %	25 %	50 %	25 %	313122577
578	NC_014736	CTG	2	6	31641	31646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122577
579	NC_014736	CGA	2	6	31766	31771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122577
580	NC_014736	CGT	2	6	31817	31822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122577
581	NC_014736	CGC	2	6	31884	31889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122577
582	NC_014736	CGG	2	6	31904	31909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313122577
583	NC_014736	CCG	2	6	31934	31939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122577
584	NC_014736	GACC	2	8	31977	31984	25 %	0 %	25 %	50 %	313122577
585	NC_014736	CTC	2	6	32013	32018	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313122577
586	NC_014736	CGG	2	6	32022	32027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313122577
587	NC_014736	CGC	2	6	32061	32066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122577
588	NC_014736	TCG	2	6	32122	32127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122577
589	NC_014736	GAA	2	6	32277	32282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313122578
590	NC_014736	GTC	2	6	32283	32288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122578
591	NC_014736	AGCA	2	8	32349	32356	50 %	0 %	25 %	25 %	313122578
592	NC_014736	TTC	2	6	32358	32363	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313122578
593	NC_014736	CGA	2	6	32378	32383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122578
594	NC_014736	CGAGGA	2	12	32396	32407	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	313122578
595	NC_014736	GGT	2	6	32454	32459	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313122578
596	NC_014736	CAG	2	6	32465	32470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122578
597	NC_014736	CTCAGT	2	12	32502	32513	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	313122578
598	NC_014736	TCG	2	6	32533	32538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122578
599	NC_014736	GAT	2	6	32544	32549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313122578
600	NC_014736	CGAG	2	8	32572	32579	25 %	0 %	50 %	25 %	313122578
601	NC_014736	GTATC	2	10	32635	32644	20 %	40 %	20 %	20 %	313122578
602	NC_014736	CTGA	2	8	32775	32782	25 %	25 %	25 %	25 %	313122578
603	NC_014736	CGAT	2	8	32789	32796	25 %	25 %	25 %	25 %	313122578
604	NC_014736	CGT	2	6	32828	32833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122578
605	NC_014736	AGC	2	6	32881	32886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122578
606	NC_014736	CGT	2	6	32984	32989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122578
607	NC_014736	CG	3	6	33115	33120	0 %	0 %	50 %	50 %	313122578
608	NC_014736	CAA	2	6	33180	33185	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	313122578
609	NC_014736	ACG	2	6	33193	33198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122578
610	NC_014736	CGC	2	6	33257	33262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122578
611	NC_014736	AACG	2	8	33267	33274	50 %	0 %	25 %	25 %	313122578
612	NC_014736	TG	3	6	33454	33459	0 %	50 %	50 %	0 %	313122578
613	NC_014736	GC	3	6	33478	33483	0 %	0 %	50 %	50 %	313122578
614	NC_014736	CGA	2	6	33503	33508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122578
615	NC_014736	ACC	2	6	33518	33523	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313122578
616	NC_014736	CGA	2	6	33551	33556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122578
617	NC_014736	CGT	2	6	33677	33682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122578
618	NC_014736	ACA	2	6	33779	33784	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	313122578
619	NC_014736	CGT	2	6	33837	33842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122578
620	NC_014736	CGAG	2	8	33845	33852	25 %	0 %	50 %	25 %	313122578
621	NC_014736	CGA	2	6	33857	33862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122578
622	NC_014736	GTC	2	6	33886	33891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122578
623	NC_014736	GCCAC	2	10	33905	33914	20 %	0 %	20 %	60 %	313122578
624	NC_014736	CCGG	2	8	34055	34062	0 %	0 %	50 %	50 %	313122578
625	NC_014736	TGA	2	6	34108	34113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313122578
626	NC_014736	GGC	2	6	34367	34372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313122579
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750	NC_014736	ACTC	2	8	40815	40822	25 %	25 %	0 %	50 %	313122583
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