MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halogeometricum borinquense DSM 11551 plasmid pHBOR04

Total Repeats: 3990

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_014732	TGA	2	6	120917	120922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313122476
2502	NC_014732	CCG	2	6	120931	120936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122476
2503	NC_014732	ACG	2	6	120997	121002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122476
2504	NC_014732	GTC	2	6	121026	121031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122476
2505	NC_014732	ACG	2	6	121034	121039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122476
2506	NC_014732	ACG	2	6	121046	121051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122476
2507	NC_014732	GTT	2	6	121059	121064	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313122476
2508	NC_014732	CTC	2	6	121089	121094	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313122476
2509	NC_014732	CGGT	2	8	121129	121136	0 %	25 %	50 %	25 %	313122476
2510	NC_014732	CGCC	2	8	121162	121169	0 %	0 %	25 %	75 %	313122476
2511	NC_014732	ACC	2	6	121228	121233	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313122476
2512	NC_014732	CCG	2	6	121247	121252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122476
2513	NC_014732	CTGT	2	8	121307	121314	0 %	50 %	25 %	25 %	313122476
2514	NC_014732	CCG	2	6	121334	121339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122476
2515	NC_014732	AGA	2	6	121525	121530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313122477
2516	NC_014732	AGG	2	6	121560	121565	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313122477
2517	NC_014732	GCT	2	6	121612	121617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122477
2518	NC_014732	CGA	3	9	121639	121647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122477
2519	NC_014732	GCGAT	2	10	121662	121671	20 %	20 %	40 %	20 %	313122477
2520	NC_014732	CGA	2	6	121717	121722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122477
2521	NC_014732	TCG	2	6	121736	121741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122478
2522	NC_014732	GGA	2	6	121806	121811	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313122478
2523	NC_014732	TCG	2	6	121834	121839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122478
2524	NC_014732	CGA	2	6	121887	121892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122478
2525	NC_014732	TGA	2	6	121955	121960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313122478
2526	NC_014732	GCC	2	6	121970	121975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122478
2527	NC_014732	CGGT	2	8	121980	121987	0 %	25 %	50 %	25 %	313122478
2528	NC_014732	GACG	2	8	121989	121996	25 %	0 %	50 %	25 %	313122478
2529	NC_014732	GCC	2	6	122000	122005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122478
2530	NC_014732	TTAGC	2	10	122121	122130	20 %	40 %	20 %	20 %	313122478
2531	NC_014732	CGCGT	2	10	122180	122189	0 %	20 %	40 %	40 %	313122479
2532	NC_014732	GCC	2	6	122291	122296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122479
2533	NC_014732	GTC	2	6	122312	122317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122479
2534	NC_014732	GAC	2	6	122330	122335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122479
2535	NC_014732	CGG	2	6	122401	122406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313122479
2536	NC_014732	CGA	2	6	122489	122494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122479
2537	NC_014732	GC	3	6	122541	122546	0 %	0 %	50 %	50 %	313122479
2538	NC_014732	TTC	2	6	122625	122630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313122479
2539	NC_014732	CAG	2	6	122636	122641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122479
2540	NC_014732	CGC	2	6	122704	122709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122479
2541	NC_014732	CGTCGG	2	12	122743	122754	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	313122479
2542	NC_014732	GC	3	6	122807	122812	0 %	0 %	50 %	50 %	313122479
2543	NC_014732	CGT	2	6	122846	122851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122479
2544	NC_014732	CCA	2	6	122852	122857	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313122479
2545	NC_014732	GC	3	6	122894	122899	0 %	0 %	50 %	50 %	313122479
2546	NC_014732	ATC	2	6	122910	122915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313122479
2547	NC_014732	CGCC	2	8	122974	122981	0 %	0 %	25 %	75 %	313122479
2548	NC_014732	CTC	2	6	122999	123004	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313122479
2549	NC_014732	CGA	2	6	123022	123027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122479
2550	NC_014732	TCG	2	6	123051	123056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122479
2551	NC_014732	GAG	2	6	123086	123091	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313122479
2552	NC_014732	CCT	2	6	123103	123108	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313122479
2553	NC_014732	GCA	2	6	123118	123123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122479
2554	NC_014732	CCG	2	6	123147	123152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122479
2555	NC_014732	CG	3	6	123190	123195	0 %	0 %	50 %	50 %	313122479
2556	NC_014732	CCT	2	6	123196	123201	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313122479
2557	NC_014732	TCG	2	6	123222	123227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122479
2558	NC_014732	CG	3	6	123310	123315	0 %	0 %	50 %	50 %	313122479
2559	NC_014732	TCG	2	6	123327	123332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122479
2560	NC_014732	CGA	2	6	123420	123425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122480
2561	NC_014732	CGG	2	6	123521	123526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313122480
2562	NC_014732	CGAA	2	8	123533	123540	50 %	0 %	25 %	25 %	313122480
2563	NC_014732	G	6	6	123557	123562	0 %	0 %	100 %	0 %	313122480
2564	NC_014732	ACG	2	6	123617	123622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122480
2565	NC_014732	ACA	2	6	123654	123659	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	313122480
2566	NC_014732	TGCG	2	8	123690	123697	0 %	25 %	50 %	25 %	313122480
2567	NC_014732	ACG	2	6	123704	123709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122480
2568	NC_014732	TGA	2	6	123786	123791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313122480
2569	NC_014732	GTCG	2	8	123861	123868	0 %	25 %	50 %	25 %	313122480
2570	NC_014732	ACT	2	6	123955	123960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313122480
2571	NC_014732	GC	3	6	123966	123971	0 %	0 %	50 %	50 %	313122480
2572	NC_014732	ACC	2	6	124025	124030	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313122480
2573	NC_014732	TCG	2	6	124100	124105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122480
2574	NC_014732	GGAT	2	8	124156	124163	25 %	25 %	50 %	0 %	313122480
2575	NC_014732	GAC	2	6	124218	124223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122480
2576	NC_014732	ACGCG	2	10	124244	124253	20 %	0 %	40 %	40 %	313122480
2577	NC_014732	TCG	2	6	124262	124267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122480
2578	NC_014732	ACGG	2	8	124281	124288	25 %	0 %	50 %	25 %	313122480
2579	NC_014732	ACC	2	6	124304	124309	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313122480
2580	NC_014732	GA	3	6	124352	124357	50 %	0 %	50 %	0 %	313122480
2581	NC_014732	TTC	2	6	124360	124365	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313122480
2582	NC_014732	CGA	2	6	124389	124394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122480
2583	NC_014732	GAA	2	6	124414	124419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313122480
2584	NC_014732	CAT	2	6	124452	124457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313122480
2585	NC_014732	CGA	2	6	124464	124469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122480
2586	NC_014732	TC	3	6	124647	124652	0 %	50 %	0 %	50 %	313122481
2587	NC_014732	ACG	2	6	124714	124719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122481
2588	NC_014732	CGAC	2	8	124744	124751	25 %	0 %	25 %	50 %	313122481
2589	NC_014732	GTG	2	6	124772	124777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313122481
2590	NC_014732	CGTC	2	8	124778	124785	0 %	25 %	25 %	50 %	313122481
2591	NC_014732	TACC	2	8	124819	124826	25 %	25 %	0 %	50 %	313122481
2592	NC_014732	GAG	2	6	124828	124833	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313122481
2593	NC_014732	AAC	2	6	124865	124870	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	313122481
2594	NC_014732	TC	3	6	124896	124901	0 %	50 %	0 %	50 %	313122481
2595	NC_014732	GAC	2	6	124906	124911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122481
2596	NC_014732	TGT	2	6	125043	125048	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313122481
2597	NC_014732	CGA	2	6	125055	125060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122481
2598	NC_014732	GAC	2	6	125125	125130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122481
2599	NC_014732	GAC	2	6	125133	125138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122481
2600	NC_014732	TC	3	6	125145	125150	0 %	50 %	0 %	50 %	313122481
2601	NC_014732	TCC	2	6	125159	125164	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313122481
2602	NC_014732	GTC	2	6	125167	125172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122481
2603	NC_014732	GAG	2	6	125173	125178	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313122481
2604	NC_014732	CGG	2	6	125205	125210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313122481
2605	NC_014732	GGC	2	6	125266	125271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313122481
2606	NC_014732	CCGAC	2	10	125309	125318	20 %	0 %	20 %	60 %	313122481
2607	NC_014732	GAC	2	6	125323	125328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122481
2608	NC_014732	GGT	2	6	125629	125634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313122482
2609	NC_014732	GTT	2	6	125665	125670	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313122482
2610	NC_014732	CAC	2	6	125674	125679	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313122482
2611	NC_014732	CGT	2	6	125695	125700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122482
2612	NC_014732	GTCG	2	8	125794	125801	0 %	25 %	50 %	25 %	313122482
2613	NC_014732	CGT	2	6	125812	125817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122482
2614	NC_014732	GTC	2	6	125828	125833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122482
2615	NC_014732	CTC	2	6	125834	125839	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313122482
2616	NC_014732	TGT	2	6	125851	125856	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313122482
2617	NC_014732	TCG	2	6	125910	125915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122482
2618	NC_014732	GT	3	6	125964	125969	0 %	50 %	50 %	0 %	313122482
2619	NC_014732	T	6	6	125969	125974	0 %	100 %	0 %	0 %	313122482
2620	NC_014732	CGC	2	6	126066	126071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122482
2621	NC_014732	CGG	2	6	126133	126138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313122482
2622	NC_014732	TCC	2	6	126141	126146	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313122482
2623	NC_014732	CGA	2	6	126198	126203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122482
2624	NC_014732	TGGAC	2	10	126260	126269	20 %	20 %	40 %	20 %	313122482
2625	NC_014732	CGC	2	6	126323	126328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122482
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2627	NC_014732	CCG	2	6	126355	126360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122482
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2642	NC_014732	CTG	2	6	126849	126854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122482
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2652	NC_014732	CGT	2	6	127307	127312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122483
2653	NC_014732	TCG	2	6	127318	127323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122483
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2671	NC_014732	GTCG	2	8	128035	128042	0 %	25 %	50 %	25 %	313122484
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2723	NC_014732	CGT	2	6	129897	129902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122485
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2732	NC_014732	CCGC	2	8	130168	130175	0 %	0 %	25 %	75 %	313122485
2733	NC_014732	ACTCC	2	10	130311	130320	20 %	20 %	0 %	60 %	313122485
2734	NC_014732	TCG	2	6	130345	130350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122485
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2737	NC_014732	CGC	2	6	130368	130373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122485
2738	NC_014732	CCA	2	6	130757	130762	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313122486
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2740	NC_014732	GGC	2	6	130822	130827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313122486
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2847	NC_014732	CGCT	2	8	136127	136134	0 %	25 %	25 %	50 %	313122490
2848	NC_014732	CG	3	6	136138	136143	0 %	0 %	50 %	50 %	313122490
2849	NC_014732	GGCG	2	8	136152	136159	0 %	0 %	75 %	25 %	313122490
2850	NC_014732	GCG	3	9	136181	136189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313122490
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2852	NC_014732	CGG	2	6	136224	136229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313122490
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2855	NC_014732	GAA	2	6	136276	136281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313122490
2856	NC_014732	CGGCG	2	10	136284	136293	0 %	0 %	60 %	40 %	313122490
2857	NC_014732	GAC	2	6	136351	136356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122490
2858	NC_014732	GAC	2	6	136455	136460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122490
2859	NC_014732	GCC	2	6	136542	136547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122490
2860	NC_014732	ACG	2	6	136556	136561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122490
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2982	NC_014732	CGA	2	6	141837	141842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122498
2983	NC_014732	GGC	2	6	141843	141848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313122498
2984	NC_014732	TCGT	2	8	141850	141857	0 %	50 %	25 %	25 %	313122498
2985	NC_014732	G	6	6	141872	141877	0 %	0 %	100 %	0 %	313122498
2986	NC_014732	CTC	2	6	141955	141960	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313122498
2987	NC_014732	CGA	2	6	142028	142033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122499
2988	NC_014732	TCCC	2	8	142080	142087	0 %	25 %	0 %	75 %	313122499
2989	NC_014732	TCG	2	6	142090	142095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122499
2990	NC_014732	CCT	2	6	142103	142108	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313122499
2991	NC_014732	TCGG	2	8	142144	142151	0 %	25 %	50 %	25 %	313122499
2992	NC_014732	GCG	2	6	142170	142175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313122499
2993	NC_014732	TCT	2	6	142202	142207	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313122499
2994	NC_014732	TCG	2	6	142249	142254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122499
2995	NC_014732	GAG	2	6	142275	142280	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313122499
2996	NC_014732	CGC	2	6	142295	142300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122499
2997	NC_014732	CG	3	6	142415	142420	0 %	0 %	50 %	50 %	313122499
2998	NC_014732	CTT	2	6	142466	142471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313122499
2999	NC_014732	TCG	2	6	142477	142482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122499
3000	NC_014732	CGT	2	6	142538	142543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122499

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