MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halogeometricum borinquense DSM 11551 plasmid pHBOR04

Total Repeats: 3990

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_014732	ATCT	2	8	22833	22840	25 %	50 %	0 %	25 %	313122387
502	NC_014732	TCG	3	9	22987	22995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122387
503	NC_014732	TGG	3	9	23014	23022	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313122387
504	NC_014732	CTC	2	6	23025	23030	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313122387
505	NC_014732	TCG	2	6	23074	23079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122387
506	NC_014732	TGGA	2	8	23253	23260	25 %	25 %	50 %	0 %	313122388
507	NC_014732	CCG	2	6	23263	23268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122388
508	NC_014732	ACA	2	6	23273	23278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	313122388
509	NC_014732	ACG	2	6	23340	23345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122388
510	NC_014732	CG	3	6	23354	23359	0 %	0 %	50 %	50 %	313122388
511	NC_014732	CAT	2	6	23388	23393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313122388
512	NC_014732	CGA	2	6	23442	23447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122388
513	NC_014732	CGA	2	6	23575	23580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122388
514	NC_014732	GGCG	2	8	23581	23588	0 %	0 %	75 %	25 %	313122388
515	NC_014732	ACG	2	6	23642	23647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122388
516	NC_014732	CG	3	6	23689	23694	0 %	0 %	50 %	50 %	313122388
517	NC_014732	GGC	2	6	23710	23715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313122388
518	NC_014732	CCA	2	6	23761	23766	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313122388
519	NC_014732	CCG	2	6	23777	23782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122388
520	NC_014732	GGAT	2	8	23806	23813	25 %	25 %	50 %	0 %	313122388
521	NC_014732	TCGC	2	8	23880	23887	0 %	25 %	25 %	50 %	313122388
522	NC_014732	CGTTC	2	10	23890	23899	0 %	40 %	20 %	40 %	313122388
523	NC_014732	ATG	2	6	23904	23909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313122388
524	NC_014732	GAC	2	6	23957	23962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122388
525	NC_014732	TCG	2	6	23976	23981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122388
526	NC_014732	GTC	2	6	24017	24022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122388
527	NC_014732	CA	3	6	24066	24071	50 %	0 %	0 %	50 %	313122388
528	NC_014732	GTC	2	6	24074	24079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122388
529	NC_014732	CGA	2	6	24082	24087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122388
530	NC_014732	TCG	2	6	24108	24113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122388
531	NC_014732	CGT	2	6	24148	24153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122388
532	NC_014732	ACGCA	2	10	24257	24266	40 %	0 %	20 %	40 %	313122388
533	NC_014732	GCG	2	6	24267	24272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313122388
534	NC_014732	GAC	2	6	24311	24316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122388
535	NC_014732	ACC	2	6	24372	24377	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313122388
536	NC_014732	GAG	2	6	24443	24448	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313122388
537	NC_014732	GAA	2	6	24527	24532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313122388
538	NC_014732	CGA	2	6	24544	24549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122388
539	NC_014732	TGA	2	6	24659	24664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313122389
540	NC_014732	CTC	2	6	24697	24702	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313122389
541	NC_014732	CGAA	2	8	24732	24739	50 %	0 %	25 %	25 %	313122389
542	NC_014732	CGG	2	6	24758	24763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313122389
543	NC_014732	TTCG	2	8	24807	24814	0 %	50 %	25 %	25 %	313122389
544	NC_014732	GGT	2	6	24843	24848	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313122389
545	NC_014732	GGC	2	6	24915	24920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313122389
546	NC_014732	CG	3	6	24923	24928	0 %	0 %	50 %	50 %	313122389
547	NC_014732	CGG	2	6	24943	24948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313122389
548	NC_014732	GGA	2	6	25016	25021	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313122389
549	NC_014732	TCG	2	6	25061	25066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122389
550	NC_014732	GGTG	2	8	25077	25084	0 %	25 %	75 %	0 %	313122389
551	NC_014732	TTCGTC	2	12	25144	25155	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	313122389
552	NC_014732	GACA	2	8	25170	25177	50 %	0 %	25 %	25 %	313122389
553	NC_014732	CCGG	2	8	25230	25237	0 %	0 %	50 %	50 %	313122389
554	NC_014732	TCG	2	6	25323	25328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122390
555	NC_014732	CGT	2	6	25330	25335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122390
556	NC_014732	CGC	2	6	25336	25341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122390
557	NC_014732	CGT	2	6	25342	25347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122390
558	NC_014732	CGTC	2	8	25357	25364	0 %	25 %	25 %	50 %	313122390
559	NC_014732	TCG	2	6	25462	25467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122390
560	NC_014732	CGT	2	6	25471	25476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122390
561	NC_014732	GCG	3	9	25478	25486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313122390
562	NC_014732	TCC	2	6	25520	25525	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313122390
563	NC_014732	CAG	2	6	25625	25630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122390
564	NC_014732	GA	3	6	25635	25640	50 %	0 %	50 %	0 %	313122390
565	NC_014732	GAAC	2	8	25645	25652	50 %	0 %	25 %	25 %	313122390
566	NC_014732	CT	3	6	25671	25676	0 %	50 %	0 %	50 %	313122390
567	NC_014732	TCG	2	6	25677	25682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122390
568	NC_014732	CGT	2	6	25736	25741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122390
569	NC_014732	CCA	2	6	25780	25785	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313122390
570	NC_014732	AG	3	6	25862	25867	50 %	0 %	50 %	0 %	313122390
571	NC_014732	GTTT	2	8	25888	25895	0 %	75 %	25 %	0 %	313122390
572	NC_014732	CGG	2	6	25935	25940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313122390
573	NC_014732	TCA	2	6	26035	26040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313122390
574	NC_014732	TCG	2	6	26058	26063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122390
575	NC_014732	TAG	2	6	26076	26081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313122390
576	NC_014732	GAC	2	6	26132	26137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122390
577	NC_014732	TGA	2	6	26151	26156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313122390
578	NC_014732	GTC	2	6	26186	26191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122390
579	NC_014732	CGC	2	6	26199	26204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122390
580	NC_014732	GTC	2	6	26231	26236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122390
581	NC_014732	CGT	2	6	26245	26250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122390
582	NC_014732	ACG	2	6	26275	26280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122390
583	NC_014732	CGA	2	6	26302	26307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122390
584	NC_014732	ACG	2	6	26331	26336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122390
585	NC_014732	GA	3	6	26723	26728	50 %	0 %	50 %	0 %	313122391
586	NC_014732	ATC	2	6	26748	26753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313122391
587	NC_014732	CGG	2	6	26776	26781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313122391
588	NC_014732	GAT	2	6	26807	26812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313122391
589	NC_014732	CGC	2	6	26819	26824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122391
590	NC_014732	GAAACG	2	12	26841	26852	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	313122391
591	NC_014732	GAG	2	6	26874	26879	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313122391
592	NC_014732	TCG	2	6	27001	27006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122391
593	NC_014732	GAC	2	6	27033	27038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122391
594	NC_014732	GGA	2	6	27044	27049	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313122391
595	NC_014732	CAG	2	6	27096	27101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122391
596	NC_014732	CGA	2	6	27125	27130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122391
597	NC_014732	CGT	2	6	27176	27181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122391
598	NC_014732	CGG	2	6	27188	27193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313122391
599	NC_014732	GAC	2	6	27267	27272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122391
600	NC_014732	CAG	2	6	27354	27359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122391
601	NC_014732	GGT	2	6	27388	27393	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313122391
602	NC_014732	CGA	2	6	27407	27412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122391
603	NC_014732	GTC	2	6	27417	27422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122391
604	NC_014732	GAT	2	6	27476	27481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313122391
605	NC_014732	CGAG	2	8	27526	27533	25 %	0 %	50 %	25 %	313122391
606	NC_014732	GAG	2	6	27567	27572	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313122391
607	NC_014732	ACTGA	2	10	27581	27590	40 %	20 %	20 %	20 %	313122391
608	NC_014732	CTT	2	6	27650	27655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313122392
609	NC_014732	CGT	2	6	27710	27715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122392
610	NC_014732	CGAC	2	8	27720	27727	25 %	0 %	25 %	50 %	313122392
611	NC_014732	CCT	2	6	27746	27751	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313122392
612	NC_014732	CCA	2	6	27794	27799	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313122392
613	NC_014732	CGT	2	6	27839	27844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122392
614	NC_014732	GTTC	2	8	27857	27864	0 %	50 %	25 %	25 %	313122392
615	NC_014732	CGCGG	2	10	27909	27918	0 %	0 %	60 %	40 %	313122392
616	NC_014732	CCCG	2	8	27948	27955	0 %	0 %	25 %	75 %	313122392
617	NC_014732	GGC	2	6	27987	27992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313122392
618	NC_014732	TCT	2	6	28003	28008	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313122392
619	NC_014732	GCG	2	6	28009	28014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313122392
620	NC_014732	GGC	2	6	28029	28034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313122392
621	NC_014732	GAC	2	6	28035	28040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122392
622	NC_014732	GT	3	6	28127	28132	0 %	50 %	50 %	0 %	313122392
623	NC_014732	TCG	2	6	28165	28170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122392
624	NC_014732	CGC	2	6	28193	28198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122392
625	NC_014732	TCGCCC	2	12	28213	28224	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	313122392
626	NC_014732	CGT	2	6	28238	28243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122392
627	NC_014732	TTC	2	6	28309	28314	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313122392
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742	NC_014732	CACT	2	8	33359	33366	25 %	25 %	0 %	50 %	313122399
743	NC_014732	CGC	2	6	33388	33393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122399
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746	NC_014732	CGCC	2	8	33420	33427	0 %	0 %	25 %	75 %	313122399
747	NC_014732	TCCA	2	8	33508	33515	25 %	25 %	0 %	50 %	313122399
748	NC_014732	CGC	2	6	33649	33654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122400
749	NC_014732	GC	3	6	33653	33658	0 %	0 %	50 %	50 %	313122400
750	NC_014732	CGA	2	6	33664	33669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122400
751	NC_014732	GTC	2	6	33674	33679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122400
752	NC_014732	CGC	2	6	33718	33723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122400
753	NC_014732	TCG	2	6	33796	33801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122400
754	NC_014732	GCCGC	2	10	33831	33840	0 %	0 %	40 %	60 %	313122400
755	NC_014732	CGC	2	6	33868	33873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122400
756	NC_014732	CTC	2	6	33908	33913	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313122400
757	NC_014732	GTCC	2	8	33940	33947	0 %	25 %	25 %	50 %	313122400
758	NC_014732	GAA	2	6	33998	34003	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313122400
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761	NC_014732	CTC	2	6	34279	34284	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313122401
762	NC_014732	ACG	2	6	34376	34381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122401
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772	NC_014732	GAC	2	6	34945	34950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122401
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774	NC_014732	CCG	2	6	34991	34996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122401
775	NC_014732	ACCGTA	2	12	35005	35016	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	313122401
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779	NC_014732	CGA	2	6	35112	35117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122401
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781	NC_014732	TCC	2	6	35213	35218	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313122401
782	NC_014732	TCG	2	6	35220	35225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122401
783	NC_014732	GTC	2	6	35245	35250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122401
784	NC_014732	CGT	2	6	35262	35267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122401
785	NC_014732	CGCC	2	8	35277	35284	0 %	0 %	25 %	75 %	313122401
786	NC_014732	TC	4	8	35359	35366	0 %	50 %	0 %	50 %	313122401
787	NC_014732	TCCG	2	8	35372	35379	0 %	25 %	25 %	50 %	313122401
788	NC_014732	ACT	2	6	35499	35504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313122402
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790	NC_014732	CGT	2	6	35556	35561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122402
791	NC_014732	GAC	2	6	35578	35583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122402
792	NC_014732	CGG	2	6	35613	35618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313122402
793	NC_014732	CAG	2	6	35650	35655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122402
794	NC_014732	TCG	2	6	35669	35674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122402
795	NC_014732	GCGAT	2	10	35679	35688	20 %	20 %	40 %	20 %	313122402
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810	NC_014732	CGGA	2	8	36200	36207	25 %	0 %	50 %	25 %	313122402
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826	NC_014732	CTC	2	6	36633	36638	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313122403
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834	NC_014732	GAG	2	6	36834	36839	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313122403
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870	NC_014732	AACC	2	8	37852	37859	50 %	0 %	0 %	50 %	313122404
871	NC_014732	TCC	2	6	37916	37921	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313122404
872	NC_014732	GAC	2	6	37987	37992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122404
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874	NC_014732	CGC	3	9	38031	38039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122404
875	NC_014732	CAA	2	6	38050	38055	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	313122404
876	NC_014732	CTC	2	6	38071	38076	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313122404
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