MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halogeometricum borinquense DSM 11551 chromosome

Total Repeats: 62950

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2502	NC_014729	CGA	2	6	108068	108073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313124911
2503	NC_014729	AGG	2	6	108151	108156	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313124911
2504	NC_014729	GAC	2	6	108165	108170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313124911
2505	NC_014729	GCT	2	6	108173	108178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313124911
2506	NC_014729	CTC	2	6	108210	108215	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313124911
2507	NC_014729	GCG	2	6	108290	108295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313124911
2508	NC_014729	CG	3	6	108318	108323	0 %	0 %	50 %	50 %	313124911
2509	NC_014729	CGTT	2	8	108325	108332	0 %	50 %	25 %	25 %	313124911
2510	NC_014729	GACG	2	8	108362	108369	25 %	0 %	50 %	25 %	313124911
2511	NC_014729	GC	3	6	108378	108383	0 %	0 %	50 %	50 %	313124911
2512	NC_014729	GCC	2	6	108435	108440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313124911
2513	NC_014729	GTT	2	6	108465	108470	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313124911
2514	NC_014729	CGA	2	6	108473	108478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313124911
2515	NC_014729	CGG	2	6	108481	108486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313124911
2516	NC_014729	GTCG	2	8	108513	108520	0 %	25 %	50 %	25 %	313124911
2517	NC_014729	GAC	2	6	108570	108575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313124911
2518	NC_014729	TCG	2	6	108721	108726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313124912
2519	NC_014729	GTC	2	6	108730	108735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313124912
2520	NC_014729	GAC	2	6	108753	108758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313124912
2521	NC_014729	TCG	2	6	108862	108867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313124912
2522	NC_014729	CGG	2	6	108887	108892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313124912
2523	NC_014729	CGA	2	6	108914	108919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313124912
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2526	NC_014729	CGAG	2	8	109037	109044	25 %	0 %	50 %	25 %	313124912
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2528	NC_014729	CGC	2	6	109114	109119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313124912
2529	NC_014729	GAC	2	6	109175	109180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313124912
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2532	NC_014729	CGC	2	6	109267	109272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313124912
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2534	NC_014729	GTG	2	6	109314	109319	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313124912
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2544	NC_014729	TCG	2	6	109816	109821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313124913
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2555	NC_014729	CCG	2	6	110169	110174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313124913
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2595	NC_014729	CGA	2	6	111627	111632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313124915
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2601	NC_014729	TGGTC	2	10	111929	111938	0 %	40 %	40 %	20 %	313124916
2602	NC_014729	TTC	2	6	111957	111962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313124916
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2604	NC_014729	TCG	2	6	111997	112002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313124916
2605	NC_014729	CA	3	6	112220	112225	50 %	0 %	0 %	50 %	313124917
2606	NC_014729	GAT	2	6	112366	112371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313124917
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2609	NC_014729	GGAA	2	8	112485	112492	50 %	0 %	50 %	0 %	313124917
2610	NC_014729	ACG	2	6	112650	112655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313124917
2611	NC_014729	AG	3	6	112712	112717	50 %	0 %	50 %	0 %	313124917
2612	NC_014729	CGT	2	6	112726	112731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313124917
2613	NC_014729	ATCCCG	2	12	112755	112766	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	313124917
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2617	NC_014729	GCG	2	6	112835	112840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313124917
2618	NC_014729	AGA	2	6	112843	112848	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313124917
2619	NC_014729	CGC	3	9	112870	112878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313124917
2620	NC_014729	CGG	2	6	112897	112902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313124917
2621	NC_014729	CGC	2	6	112957	112962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313124917
2622	NC_014729	CGC	2	6	112966	112971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313124917
2623	NC_014729	GC	3	6	112970	112975	0 %	0 %	50 %	50 %	313124917
2624	NC_014729	ACT	2	6	113066	113071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313124918
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2626	NC_014729	CGC	2	6	113082	113087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313124918
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2649	NC_014729	CGT	2	6	114487	114492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313124921
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2654	NC_014729	TCG	2	6	114588	114593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313124921
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2662	NC_014729	GC	3	6	114985	114990	0 %	0 %	50 %	50 %	313124921
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2683	NC_014729	TGA	2	6	115886	115891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313124922
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2716	NC_014729	AAAG	2	8	116987	116994	75 %	0 %	25 %	0 %	313124923
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2723	NC_014729	TCG	2	6	117370	117375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313124924
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2726	NC_014729	TCG	2	6	117475	117480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313124924
2727	NC_014729	CTT	2	6	117534	117539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313124924
2728	NC_014729	CTC	2	6	117591	117596	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313124924
2729	NC_014729	GC	3	6	117609	117614	0 %	0 %	50 %	50 %	313124924
2730	NC_014729	TCG	2	6	117688	117693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313124924
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2733	NC_014729	CAT	2	6	117785	117790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313124924
2734	NC_014729	GA	3	6	117823	117828	50 %	0 %	50 %	0 %	313124924
2735	NC_014729	TCC	2	6	117847	117852	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313124924
2736	NC_014729	CAC	2	6	117875	117880	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313124924
2737	NC_014729	ACG	2	6	117937	117942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313124924
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2739	NC_014729	GAA	3	9	117987	117995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313124924
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2741	NC_014729	CGT	2	6	118010	118015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313124924
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2862	NC_014729	GGC	2	6	123225	123230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313124930
2863	NC_014729	CGC	2	6	123238	123243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313124930
2864	NC_014729	CTCG	2	8	123273	123280	0 %	25 %	25 %	50 %	313124930
2865	NC_014729	CGT	2	6	123293	123298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313124930
2866	NC_014729	CGG	2	6	123335	123340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313124930
2867	NC_014729	GAG	2	6	123342	123347	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313124930
2868	NC_014729	GCA	2	6	123360	123365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313124930
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2870	NC_014729	GGCA	2	8	123425	123432	25 %	0 %	50 %	25 %	313124930
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2874	NC_014729	CGA	2	6	123493	123498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313124930
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2880	NC_014729	TCG	2	6	123637	123642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313124930
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2893	NC_014729	GCTG	2	8	123949	123956	0 %	25 %	50 %	25 %	313124931
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2966	NC_014729	AG	3	6	127183	127188	50 %	0 %	50 %	0 %	313124933
2967	NC_014729	GCA	2	6	127201	127206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313124933
2968	NC_014729	AAAG	2	8	127252	127259	75 %	0 %	25 %	0 %	313124933
2969	NC_014729	CGT	2	6	127382	127387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313124933
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2971	NC_014729	TCCGA	2	10	127495	127504	20 %	20 %	20 %	40 %	313124933
2972	NC_014729	GTGC	2	8	127512	127519	0 %	25 %	50 %	25 %	313124933
2973	NC_014729	TCA	2	6	127567	127572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313124933
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2979	NC_014729	TCGT	2	8	127822	127829	0 %	50 %	25 %	25 %	313124933
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2981	NC_014729	CG	3	6	128007	128012	0 %	0 %	50 %	50 %	313124934
2982	NC_014729	GA	3	6	128055	128060	50 %	0 %	50 %	0 %	313124934
2983	NC_014729	TTTG	2	8	128109	128116	0 %	75 %	25 %	0 %	313124934
2984	NC_014729	GAT	2	6	128154	128159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313124934
2985	NC_014729	GTC	2	6	128166	128171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313124934
2986	NC_014729	TTC	2	6	128208	128213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313124934
2987	NC_014729	ACCG	2	8	128223	128230	25 %	0 %	25 %	50 %	313124934
2988	NC_014729	ACG	2	6	128242	128247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313124934
2989	NC_014729	AGC	2	6	128266	128271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313124934
2990	NC_014729	CCG	2	6	128302	128307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313124934
2991	NC_014729	CG	3	6	128374	128379	0 %	0 %	50 %	50 %	313124934
2992	NC_014729	TGCC	2	8	128540	128547	0 %	25 %	25 %	50 %	313124934
2993	NC_014729	TCA	2	6	128555	128560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313124934
2994	NC_014729	CGT	2	6	128562	128567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313124934
2995	NC_014729	TCA	2	6	128629	128634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313124934
2996	NC_014729	GA	4	8	128640	128647	50 %	0 %	50 %	0 %	313124934
2997	NC_014729	ATCCG	2	10	128667	128676	20 %	20 %	20 %	40 %	313124934
2998	NC_014729	TGCT	2	8	128680	128687	0 %	50 %	25 %	25 %	313124934
2999	NC_014729	GTCC	2	8	128690	128697	0 %	25 %	25 %	50 %	313124934
3000	NC_014729	CGA	2	6	128916	128921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313124935

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