MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halogeometricum borinquense DSM 11551 chromosome

Total Repeats: 62950

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_014729	CAT	2	6	44640	44645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313124842
1002	NC_014729	CA	3	6	44659	44664	50 %	0 %	0 %	50 %	313124842
1003	NC_014729	CGA	2	6	44670	44675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313124842
1004	NC_014729	CGA	2	6	44694	44699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313124842
1005	NC_014729	CGC	2	6	44720	44725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313124842
1006	NC_014729	GTC	2	6	44788	44793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313124842
1007	NC_014729	GCC	2	6	44887	44892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313124843
1008	NC_014729	AAC	2	6	44893	44898	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	313124843
1009	NC_014729	CCGG	2	8	44909	44916	0 %	0 %	50 %	50 %	313124843
1010	NC_014729	TCCG	2	8	44990	44997	0 %	25 %	25 %	50 %	313124843
1011	NC_014729	CATCG	2	10	45045	45054	20 %	20 %	20 %	40 %	313124843
1012	NC_014729	TCG	2	6	45070	45075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313124843
1013	NC_014729	AGG	2	6	45079	45084	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313124843
1014	NC_014729	CTT	2	6	45114	45119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313124843
1015	NC_014729	GAA	2	6	45140	45145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313124843
1016	NC_014729	TCG	2	6	45178	45183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313124843
1017	NC_014729	CGG	2	6	45211	45216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313124843
1018	NC_014729	AGT	3	9	45227	45235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313124843
1019	NC_014729	GGA	2	6	45242	45247	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313124843
1020	NC_014729	CGC	2	6	45436	45441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313124844
1021	NC_014729	TGA	2	6	45445	45450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313124844
1022	NC_014729	CG	3	6	45548	45553	0 %	0 %	50 %	50 %	313124844
1023	NC_014729	GTC	3	9	45572	45580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313124844
1024	NC_014729	CGA	2	6	45610	45615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313124844
1025	NC_014729	CGCGGA	2	12	45741	45752	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	313124845
1026	NC_014729	ACCG	2	8	45791	45798	25 %	0 %	25 %	50 %	313124845
1027	NC_014729	CGA	2	6	45807	45812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313124845
1028	NC_014729	TCG	2	6	45833	45838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313124845
1029	NC_014729	GAC	2	6	45865	45870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313124845
1030	NC_014729	CTG	2	6	45880	45885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313124845
1031	NC_014729	ACC	2	6	45913	45918	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313124845
1032	NC_014729	CGA	2	6	45951	45956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313124845
1033	NC_014729	GTG	2	6	46009	46014	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313124845
1034	NC_014729	TCGC	2	8	46034	46041	0 %	25 %	25 %	50 %	313124845
1035	NC_014729	TCG	2	6	46042	46047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313124845
1036	NC_014729	CGG	2	6	46050	46055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313124845
1037	NC_014729	CAT	2	6	46068	46073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313124845
1038	NC_014729	CTT	2	6	46074	46079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313124845
1039	NC_014729	CT	3	6	46092	46097	0 %	50 %	0 %	50 %	313124845
1040	NC_014729	ACT	2	6	46175	46180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313124845
1041	NC_014729	GAC	2	6	46243	46248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313124845
1042	NC_014729	GAG	2	6	46285	46290	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313124845
1043	NC_014729	CGC	2	6	46329	46334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313124845
1044	NC_014729	GGC	3	9	46371	46379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313124845
1045	NC_014729	TCA	2	6	46418	46423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313124845
1046	NC_014729	GCCC	2	8	46432	46439	0 %	0 %	25 %	75 %	313124845
1047	NC_014729	GAG	2	6	46450	46455	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313124845
1048	NC_014729	CG	3	6	46491	46496	0 %	0 %	50 %	50 %	313124845
1049	NC_014729	CGG	2	6	46536	46541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313124845
1050	NC_014729	CAT	2	6	46545	46550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313124845
1051	NC_014729	CGGT	2	8	46564	46571	0 %	25 %	50 %	25 %	313124845
1052	NC_014729	CGAA	2	8	46655	46662	50 %	0 %	25 %	25 %	313124845
1053	NC_014729	CTCGC	2	10	46684	46693	0 %	20 %	20 %	60 %	313124845
1054	NC_014729	GCC	2	6	46699	46704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313124845
1055	NC_014729	CGA	2	6	46707	46712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313124845
1056	NC_014729	ACT	2	6	46747	46752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313124846
1057	NC_014729	ACC	2	6	46807	46812	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313124846
1058	NC_014729	CGT	2	6	46861	46866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313124846
1059	NC_014729	CGG	2	6	46902	46907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313124846
1060	NC_014729	CGT	2	6	46927	46932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313124846
1061	NC_014729	CGT	2	6	46948	46953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313124846
1062	NC_014729	CGT	2	6	46990	46995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313124846
1063	NC_014729	GAG	2	6	47070	47075	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313124846
1064	NC_014729	CCG	2	6	47092	47097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313124846
1065	NC_014729	CGG	2	6	47118	47123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313124846
1066	NC_014729	GTC	2	6	47148	47153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313124846
1067	NC_014729	CGA	2	6	47158	47163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313124846
1068	NC_014729	GTC	2	6	47192	47197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313124846
1069	NC_014729	TCC	2	6	47205	47210	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313124846
1070	NC_014729	CTC	2	6	47246	47251	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313124846
1071	NC_014729	CTC	2	6	47336	47341	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313124846
1072	NC_014729	AG	3	6	47404	47409	50 %	0 %	50 %	0 %	313124846
1073	NC_014729	CGG	2	6	47425	47430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313124846
1074	NC_014729	GAC	2	6	47447	47452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313124846
1075	NC_014729	CGG	2	6	47537	47542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313124846
1076	NC_014729	GTC	2	6	47579	47584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313124846
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1081	NC_014729	TCC	2	6	47748	47753	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313124846
1082	NC_014729	CAG	2	6	47792	47797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313124846
1083	NC_014729	TCG	2	6	47820	47825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313124846
1084	NC_014729	CGT	2	6	47920	47925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313124846
1085	NC_014729	CGA	2	6	47944	47949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313124846
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1087	NC_014729	GAC	2	6	48071	48076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313124846
1088	NC_014729	TCG	2	6	48108	48113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313124846
1089	NC_014729	CGACTC	2	12	48198	48209	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	313124846
1090	NC_014729	TC	3	6	48208	48213	0 %	50 %	0 %	50 %	313124846
1091	NC_014729	GAG	2	6	48266	48271	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313124846
1092	NC_014729	GGT	3	9	48280	48288	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313124846
1093	NC_014729	ACCG	2	8	48363	48370	25 %	0 %	25 %	50 %	313124846
1094	NC_014729	TGA	2	6	48418	48423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313124846
1095	NC_014729	TC	3	6	48448	48453	0 %	50 %	0 %	50 %	313124846
1096	NC_014729	GAG	2	6	48455	48460	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313124846
1097	NC_014729	CGT	2	6	48466	48471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313124846
1098	NC_014729	GTC	2	6	48482	48487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313124846
1099	NC_014729	TCG	2	6	48489	48494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313124846
1100	NC_014729	GAG	2	6	48549	48554	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313124846
1101	NC_014729	AAC	2	6	48600	48605	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	313124846
1102	NC_014729	GTC	2	6	48612	48617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313124846
1103	NC_014729	AGCG	2	8	48691	48698	25 %	0 %	50 %	25 %	313124846
1104	NC_014729	AAC	2	6	48848	48853	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	313124846
1105	NC_014729	TCG	2	6	48870	48875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313124846
1106	NC_014729	GAC	2	6	48909	48914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313124846
1107	NC_014729	AGC	2	6	48915	48920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313124846
1108	NC_014729	TCAGT	2	10	49075	49084	20 %	40 %	20 %	20 %	313124847
1109	NC_014729	GCC	2	6	49148	49153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313124847
1110	NC_014729	CGA	2	6	49191	49196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313124847
1111	NC_014729	CGA	2	6	49200	49205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313124847
1112	NC_014729	GAC	2	6	49219	49224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313124847
1113	NC_014729	GAA	2	6	49252	49257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313124847
1114	NC_014729	CGA	2	6	49293	49298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313124847
1115	NC_014729	GTC	2	6	49327	49332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313124847
1116	NC_014729	CGAGA	2	10	49339	49348	40 %	0 %	40 %	20 %	313124847
1117	NC_014729	CGC	2	6	49351	49356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313124847
1118	NC_014729	CGT	2	6	49378	49383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313124847
1119	NC_014729	ACG	2	6	49419	49424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313124847
1120	NC_014729	GAGC	2	8	49428	49435	25 %	0 %	50 %	25 %	313124847
1121	NC_014729	CGG	2	6	49455	49460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313124847
1122	NC_014729	CCG	2	6	49475	49480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313124847
1123	NC_014729	CG	3	6	49549	49554	0 %	0 %	50 %	50 %	313124847
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1132	NC_014729	CGC	3	9	50116	50124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313124848
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1231	NC_014729	CGA	3	9	54054	54062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313124850
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1234	NC_014729	CGG	2	6	54225	54230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313124851
1235	NC_014729	TTCGAC	2	12	54288	54299	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	313124851
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1238	NC_014729	CGG	2	6	54446	54451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313124851
1239	NC_014729	CGA	2	6	54533	54538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313124851
1240	NC_014729	CCG	2	6	54688	54693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313124851
1241	NC_014729	ACG	2	6	54769	54774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313124851
1242	NC_014729	CGCC	2	8	54818	54825	0 %	0 %	25 %	75 %	313124851
1243	NC_014729	TCGG	2	8	54830	54837	0 %	25 %	50 %	25 %	313124851
1244	NC_014729	CCGA	2	8	55140	55147	25 %	0 %	25 %	50 %	313124852
1245	NC_014729	CACG	2	8	55157	55164	25 %	0 %	25 %	50 %	313124852
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1247	NC_014729	CGA	2	6	55235	55240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313124852
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1496	NC_014729	CGC	2	6	65958	65963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313124860
1497	NC_014729	AC	3	6	66064	66069	50 %	0 %	0 %	50 %	313124860
1498	NC_014729	GTC	2	6	66091	66096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313124860
1499	NC_014729	AAC	2	6	66137	66142	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	313124860
1500	NC_014729	CTC	2	6	66199	66204	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313124860

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