MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halogeometricum borinquense DSM 11551 chromosome

Total Repeats: 62950

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_014729	TGA	2	6	579820	579825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313125396
13002	NC_014729	GCG	2	6	579871	579876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313125396
13003	NC_014729	GC	4	8	579901	579908	0 %	0 %	50 %	50 %	313125396
13004	NC_014729	TCG	2	6	579973	579978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313125396
13005	NC_014729	CGT	2	6	580004	580009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313125396
13006	NC_014729	TCG	2	6	580018	580023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313125396
13007	NC_014729	CGGG	2	8	580038	580045	0 %	0 %	75 %	25 %	313125396
13008	NC_014729	GCT	2	6	580085	580090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313125396
13009	NC_014729	TCG	3	9	580120	580128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313125396
13010	NC_014729	CGT	2	6	580130	580135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313125396
13011	NC_014729	CCG	2	6	580154	580159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313125396
13012	NC_014729	CGA	2	6	580168	580173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313125396
13013	NC_014729	CCA	2	6	580292	580297	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313125397
13014	NC_014729	CGC	2	6	580304	580309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313125397
13015	NC_014729	TGGC	2	8	580362	580369	0 %	25 %	50 %	25 %	313125397
13016	NC_014729	CAT	2	6	580453	580458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313125397
13017	NC_014729	TCG	3	9	580485	580493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313125397
13018	NC_014729	CCG	2	6	580503	580508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313125397
13019	NC_014729	TCA	2	6	580512	580517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313125397
13020	NC_014729	GAT	3	9	580525	580533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313125397
13021	NC_014729	CGC	2	6	580551	580556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313125397
13022	NC_014729	TCG	2	6	580592	580597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313125397
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13024	NC_014729	GCG	2	6	580681	580686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313125397
13025	NC_014729	ACT	2	6	580689	580694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313125397
13026	NC_014729	CGT	2	6	580710	580715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313125397
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13028	NC_014729	CTC	2	6	580820	580825	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313125397
13029	NC_014729	TCG	2	6	580854	580859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313125397
13030	NC_014729	CGG	3	9	580870	580878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313125397
13031	NC_014729	CGTCGC	2	12	580879	580890	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	313125397
13032	NC_014729	GTC	3	9	580898	580906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313125397
13033	NC_014729	GGC	2	6	580910	580915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313125397
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13035	NC_014729	GC	3	6	580953	580958	0 %	0 %	50 %	50 %	313125397
13036	NC_014729	CGC	3	9	580981	580989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313125397
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13041	NC_014729	CG	3	6	581110	581115	0 %	0 %	50 %	50 %	313125398
13042	NC_014729	CGC	2	6	581199	581204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313125398
13043	NC_014729	TCG	2	6	581207	581212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313125398
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13045	NC_014729	AACG	2	8	581296	581303	50 %	0 %	25 %	25 %	313125398
13046	NC_014729	TCG	2	6	581318	581323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313125398
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13051	NC_014729	TCG	2	6	581402	581407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313125398
13052	NC_014729	GTC	2	6	581483	581488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313125399
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13054	NC_014729	TCG	2	6	581562	581567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313125399
13055	NC_014729	GAC	2	6	581570	581575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313125399
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13057	NC_014729	CGC	2	6	581592	581597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313125399
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13060	NC_014729	TCG	2	6	581619	581624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313125399
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13068	NC_014729	TGT	2	6	582097	582102	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313125399
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13072	NC_014729	TCC	2	6	582183	582188	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313125399
13073	NC_014729	CAT	2	6	582197	582202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313125399
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13089	NC_014729	GCG	2	6	583159	583164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313125399
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13091	NC_014729	CG	3	6	583323	583328	0 %	0 %	50 %	50 %	313125399
13092	NC_014729	TCG	3	9	583332	583340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313125399
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13099	NC_014729	CGG	2	6	583857	583862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313125400
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13102	NC_014729	CGA	2	6	584019	584024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313125400
13103	NC_014729	CG	4	8	584045	584052	0 %	0 %	50 %	50 %	313125400
13104	NC_014729	TCG	2	6	584087	584092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313125400
13105	NC_014729	TCG	2	6	584111	584116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313125400
13106	NC_014729	ACTTCG	2	12	584222	584233	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	313125400
13107	NC_014729	TGA	2	6	584297	584302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313125400
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13109	NC_014729	TCC	2	6	584347	584352	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313125400
13110	NC_014729	CGA	2	6	584402	584407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313125400
13111	NC_014729	TGG	2	6	584426	584431	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313125400
13112	NC_014729	CGG	2	6	584448	584453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313125400
13113	NC_014729	CCG	2	6	584461	584466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313125400
13114	NC_014729	GTC	2	6	584521	584526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313125400
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13116	NC_014729	GAA	2	6	584686	584691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313125400
13117	NC_014729	CG	3	6	584715	584720	0 %	0 %	50 %	50 %	313125400
13118	NC_014729	TAC	2	6	584953	584958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313125401
13119	NC_014729	CCT	2	6	585120	585125	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313125402
13120	NC_014729	TG	3	6	585155	585160	0 %	50 %	50 %	0 %	313125402
13121	NC_014729	GAA	2	6	585166	585171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313125402
13122	NC_014729	TCG	2	6	585224	585229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313125402
13123	NC_014729	GCG	2	6	585251	585256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313125402
13124	NC_014729	GGT	2	6	585279	585284	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313125402
13125	NC_014729	TCG	2	6	585296	585301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313125402
13126	NC_014729	GTTCG	2	10	585325	585334	0 %	40 %	40 %	20 %	313125402
13127	NC_014729	GTC	2	6	585409	585414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313125402
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13129	NC_014729	CGAG	2	8	585465	585472	25 %	0 %	50 %	25 %	313125402
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13132	NC_014729	CCG	2	6	585537	585542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313125402
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13137	NC_014729	TC	3	6	585813	585818	0 %	50 %	0 %	50 %	313125402
13138	NC_014729	GCC	2	6	585839	585844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313125402
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13142	NC_014729	TGC	2	6	586051	586056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313125403
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13144	NC_014729	TCG	3	9	586113	586121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313125403
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13149	NC_014729	CGTCC	2	10	586457	586466	0 %	20 %	20 %	60 %	313125403
13150	NC_014729	GCT	3	9	586467	586475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313125403
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13223	NC_014729	GTC	2	6	589781	589786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313125407
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13225	NC_014729	CAA	2	6	589861	589866	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	313125407
13226	NC_014729	CGGT	2	8	589871	589878	0 %	25 %	50 %	25 %	313125407
13227	NC_014729	CCGA	2	8	589904	589911	25 %	0 %	25 %	50 %	313125407
13228	NC_014729	CCG	2	6	589946	589951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313125407
13229	NC_014729	G	6	6	590020	590025	0 %	0 %	100 %	0 %	313125407
13230	NC_014729	CGG	2	6	590042	590047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313125407
13231	NC_014729	TCG	3	9	590073	590081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313125407
13232	NC_014729	GTC	2	6	590083	590088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313125407
13233	NC_014729	GAG	2	6	590120	590125	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313125407
13234	NC_014729	ACC	2	6	590178	590183	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313125407
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13236	NC_014729	GTG	2	6	590277	590282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313125407
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13341	NC_014729	CGC	2	6	594942	594947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313125412
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13350	NC_014729	TTC	2	6	595115	595120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313125412
13351	NC_014729	GGC	2	6	595186	595191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313125412
13352	NC_014729	GACC	2	8	595192	595199	25 %	0 %	25 %	50 %	313125412
13353	NC_014729	ACG	2	6	595257	595262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313125412
13354	NC_014729	GC	3	6	595263	595268	0 %	0 %	50 %	50 %	313125412
13355	NC_014729	CGC	2	6	595285	595290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313125412
13356	NC_014729	TCG	2	6	595311	595316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313125412
13357	NC_014729	TCG	2	6	595359	595364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313125412
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13359	NC_014729	GTC	2	6	595445	595450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313125412
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13467	NC_014729	GTC	2	6	600651	600656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313125418
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