MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halogeometricum borinquense DSM 11551 chromosome

Total Repeats: 62950

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_014729	CGA	2	6	22712	22717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313124821
502	NC_014729	GCAA	2	8	22747	22754	50 %	0 %	25 %	25 %	313124821
503	NC_014729	CGT	2	6	22802	22807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313124821
504	NC_014729	CAC	2	6	22808	22813	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313124821
505	NC_014729	CAA	2	6	22815	22820	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	313124821
506	NC_014729	CGA	2	6	22880	22885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313124821
507	NC_014729	GACG	2	8	22911	22918	25 %	0 %	50 %	25 %	313124821
508	NC_014729	CAC	2	6	22934	22939	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313124821
509	NC_014729	GCA	2	6	22948	22953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313124821
510	NC_014729	CGT	2	6	23042	23047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313124821
511	NC_014729	CGA	2	6	23081	23086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313124821
512	NC_014729	T	7	7	23114	23120	0 %	100 %	0 %	0 %	313124821
513	NC_014729	GTG	2	6	23165	23170	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313124821
514	NC_014729	CGC	2	6	23204	23209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313124821
515	NC_014729	TCG	2	6	23296	23301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313124821
516	NC_014729	TCAGTG	2	12	23365	23376	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	313124821
517	NC_014729	CGA	2	6	23387	23392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313124821
518	NC_014729	TCG	2	6	23395	23400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313124821
519	NC_014729	TCG	2	6	23404	23409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313124821
520	NC_014729	CCG	2	6	23449	23454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313124821
521	NC_014729	AGC	2	6	23512	23517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313124821
522	NC_014729	CGG	2	6	23520	23525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313124821
523	NC_014729	CAC	2	6	23613	23618	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313124821
524	NC_014729	AGCAAG	2	12	23670	23681	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	313124821
525	NC_014729	CCG	2	6	23734	23739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313124821
526	NC_014729	AGC	2	6	23821	23826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313124821
527	NC_014729	CCG	2	6	23830	23835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313124821
528	NC_014729	TC	3	6	23849	23854	0 %	50 %	0 %	50 %	313124821
529	NC_014729	TCG	2	6	23932	23937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313124821
530	NC_014729	GTAC	2	8	24005	24012	25 %	25 %	25 %	25 %	313124821
531	NC_014729	GAA	2	6	24026	24031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313124821
532	NC_014729	TCG	3	9	24044	24052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313124821
533	NC_014729	GTC	2	6	24078	24083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313124821
534	NC_014729	CGG	2	6	24100	24105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313124821
535	NC_014729	CGTTC	2	10	24219	24228	0 %	40 %	20 %	40 %	313124821
536	NC_014729	CGTT	2	8	24231	24238	0 %	50 %	25 %	25 %	313124821
537	NC_014729	GAG	2	6	24246	24251	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313124822
538	NC_014729	GAC	2	6	24290	24295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313124822
539	NC_014729	AGA	2	6	24324	24329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313124822
540	NC_014729	AGT	2	6	24336	24341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313124822
541	NC_014729	GAC	2	6	24359	24364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313124822
542	NC_014729	GA	3	6	24379	24384	50 %	0 %	50 %	0 %	313124822
543	NC_014729	GT	3	6	24414	24419	0 %	50 %	50 %	0 %	313124822
544	NC_014729	GAA	2	6	24428	24433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313124822
545	NC_014729	GTCG	2	8	24455	24462	0 %	25 %	50 %	25 %	313124822
546	NC_014729	ATC	2	6	24575	24580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313124822
547	NC_014729	GA	3	6	24620	24625	50 %	0 %	50 %	0 %	313124822
548	NC_014729	TCG	2	6	24642	24647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313124822
549	NC_014729	ATA	2	6	24659	24664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	313124822
550	NC_014729	CGTCGG	2	12	24675	24686	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	313124822
551	NC_014729	ACT	2	6	25464	25469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313124823
552	NC_014729	ACA	2	6	25470	25475	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	313124823
553	NC_014729	AAGCA	2	10	25476	25485	60 %	0 %	20 %	20 %	313124823
554	NC_014729	CGT	2	6	25564	25569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313124823
555	NC_014729	GCC	2	6	25580	25585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313124823
556	NC_014729	CGG	2	6	25588	25593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313124823
557	NC_014729	CGC	2	6	25606	25611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313124823
558	NC_014729	AGA	2	6	25612	25617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313124823
559	NC_014729	GTC	2	6	25637	25642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313124823
560	NC_014729	CGA	2	6	25711	25716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313124823
561	NC_014729	AG	3	6	25726	25731	50 %	0 %	50 %	0 %	313124823
562	NC_014729	GAG	2	6	25751	25756	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313124823
563	NC_014729	CGCT	2	8	25819	25826	0 %	25 %	25 %	50 %	313124823
564	NC_014729	CTG	2	6	25868	25873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313124823
565	NC_014729	CCG	2	6	25875	25880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313124823
566	NC_014729	TCC	2	6	25997	26002	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313124823
567	NC_014729	CGC	2	6	26044	26049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313124823
568	NC_014729	CGA	2	6	26074	26079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313124823
569	NC_014729	AC	3	6	26121	26126	50 %	0 %	0 %	50 %	313124823
570	NC_014729	TGA	2	6	26152	26157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313124823
571	NC_014729	TC	3	6	26289	26294	0 %	50 %	0 %	50 %	313124824
572	NC_014729	TCG	2	6	26393	26398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313124824
573	NC_014729	CACCG	2	10	26405	26414	20 %	0 %	20 %	60 %	313124824
574	NC_014729	TCG	2	6	26431	26436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313124824
575	NC_014729	ACG	2	6	26443	26448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313124824
576	NC_014729	AACACG	2	12	26500	26511	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	313124824
577	NC_014729	CTT	2	6	26615	26620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313124824
578	NC_014729	TCT	2	6	26695	26700	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313124824
579	NC_014729	CTT	2	6	26707	26712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313124824
580	NC_014729	CA	3	6	26714	26719	50 %	0 %	0 %	50 %	313124824
581	NC_014729	GAAG	2	8	26749	26756	50 %	0 %	50 %	0 %	313124824
582	NC_014729	CGCT	2	8	26795	26802	0 %	25 %	25 %	50 %	313124824
583	NC_014729	CTC	2	6	26834	26839	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313124824
584	NC_014729	AGT	2	6	26848	26853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313124824
585	NC_014729	GTT	2	6	26954	26959	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313124824
586	NC_014729	TCG	2	6	27015	27020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313124824
587	NC_014729	GCAC	2	8	27033	27040	25 %	0 %	25 %	50 %	313124824
588	NC_014729	CTG	2	6	27041	27046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313124824
589	NC_014729	CT	3	6	27108	27113	0 %	50 %	0 %	50 %	313124824
590	NC_014729	GA	3	6	27132	27137	50 %	0 %	50 %	0 %	313124824
591	NC_014729	GTC	2	6	27155	27160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313124824
592	NC_014729	TTC	2	6	27177	27182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313124824
593	NC_014729	GTC	2	6	27206	27211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313124824
594	NC_014729	GTT	2	6	27236	27241	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313124824
595	NC_014729	CGT	2	6	27244	27249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313124824
596	NC_014729	CCAG	2	8	27260	27267	25 %	0 %	25 %	50 %	313124824
597	NC_014729	TTC	2	6	27284	27289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313124824
598	NC_014729	TGACT	2	10	27300	27309	20 %	40 %	20 %	20 %	313124824
599	NC_014729	TCG	2	6	27366	27371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313124824
600	NC_014729	CGT	3	9	27382	27390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313124824
601	NC_014729	GTT	2	6	27397	27402	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313124824
602	NC_014729	GTA	2	6	27407	27412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313124824
603	NC_014729	CGAC	2	8	27414	27421	25 %	0 %	25 %	50 %	313124824
604	NC_014729	GTC	2	6	27461	27466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313124824
605	NC_014729	CTG	2	6	27473	27478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313124824
606	NC_014729	TGCG	2	8	27490	27497	0 %	25 %	50 %	25 %	313124824
607	NC_014729	GGT	2	6	27509	27514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313124824
608	NC_014729	GCC	2	6	27977	27982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313124825
609	NC_014729	CGT	2	6	27996	28001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313124825
610	NC_014729	CGA	2	6	28050	28055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313124825
611	NC_014729	ATG	2	6	28103	28108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313124825
612	NC_014729	AACGC	2	10	28157	28166	40 %	0 %	20 %	40 %	313124825
613	NC_014729	CAA	2	6	28269	28274	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	313124825
614	NC_014729	AAG	2	6	28411	28416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313124825
615	NC_014729	GAC	2	6	28461	28466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313124825
616	NC_014729	GAA	2	6	28498	28503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313124825
617	NC_014729	CGC	2	6	28522	28527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313124825
618	NC_014729	TCG	2	6	28542	28547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313124825
619	NC_014729	CGA	2	6	28551	28556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313124825
620	NC_014729	AGT	2	6	28595	28600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313124825
621	NC_014729	CGT	2	6	28621	28626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313124825
622	NC_014729	ATG	2	6	28634	28639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313124825
623	NC_014729	CG	3	6	28751	28756	0 %	0 %	50 %	50 %	313124826
624	NC_014729	CTT	2	6	28781	28786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313124826
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626	NC_014729	GCC	2	6	29157	29162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313124827
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