MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halogeometricum borinquense DSM 11551 chromosome

Total Repeats: 62950

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_014729	GCC	2	6	220410	220415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313125025
5002	NC_014729	GAG	2	6	220446	220451	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313125025
5003	NC_014729	G	7	7	220451	220457	0 %	0 %	100 %	0 %	313125025
5004	NC_014729	CGA	3	9	220591	220599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313125025
5005	NC_014729	CTC	2	6	220608	220613	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313125025
5006	NC_014729	TTCG	2	8	220617	220624	0 %	50 %	25 %	25 %	313125025
5007	NC_014729	CGC	2	6	220760	220765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313125025
5008	NC_014729	GCG	2	6	220794	220799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313125025
5009	NC_014729	ACG	2	6	220800	220805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313125025
5010	NC_014729	GCC	3	9	220887	220895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313125025
5011	NC_014729	AGG	2	6	220910	220915	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313125025
5012	NC_014729	TCG	3	9	221041	221049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313125025
5013	NC_014729	ACG	2	6	221067	221072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313125025
5014	NC_014729	TTC	2	6	221076	221081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313125025
5015	NC_014729	TCG	2	6	221149	221154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313125025
5016	NC_014729	GAC	2	6	221231	221236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313125025
5017	NC_014729	GAC	2	6	221298	221303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313125025
5018	NC_014729	CG	3	6	221392	221397	0 %	0 %	50 %	50 %	313125025
5019	NC_014729	AGG	2	6	221488	221493	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313125025
5020	NC_014729	CGA	2	6	221533	221538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313125026
5021	NC_014729	TCGC	2	8	221545	221552	0 %	25 %	25 %	50 %	313125026
5022	NC_014729	TCT	2	6	221574	221579	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313125026
5023	NC_014729	TCG	2	6	221589	221594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313125026
5024	NC_014729	GCA	2	6	221600	221605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313125026
5025	NC_014729	CTG	2	6	221606	221611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313125026
5026	NC_014729	TATC	2	8	221623	221630	25 %	50 %	0 %	25 %	313125026
5027	NC_014729	TTC	2	6	221666	221671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313125026
5028	NC_014729	TC	3	6	221692	221697	0 %	50 %	0 %	50 %	313125026
5029	NC_014729	CT	3	6	221738	221743	0 %	50 %	0 %	50 %	313125026
5030	NC_014729	TCG	2	6	221829	221834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313125026
5031	NC_014729	CTC	2	6	221840	221845	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313125026
5032	NC_014729	CGT	2	6	221857	221862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313125026
5033	NC_014729	TCG	2	6	221898	221903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313125026
5034	NC_014729	TCGT	2	8	221939	221946	0 %	50 %	25 %	25 %	313125026
5035	NC_014729	GAT	2	6	221950	221955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313125026
5036	NC_014729	CCG	2	6	222009	222014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313125026
5037	NC_014729	TAC	2	6	222236	222241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313125026
5038	NC_014729	ACG	2	6	222272	222277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313125026
5039	NC_014729	TC	3	6	222328	222333	0 %	50 %	0 %	50 %	313125026
5040	NC_014729	ATG	2	6	222344	222349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313125026
5041	NC_014729	TCC	2	6	222354	222359	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313125026
5042	NC_014729	CGT	3	9	222379	222387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313125026
5043	NC_014729	CTA	2	6	222391	222396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313125026
5044	NC_014729	CAGC	2	8	222480	222487	25 %	0 %	25 %	50 %	313125027
5045	NC_014729	CGT	2	6	222522	222527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313125027
5046	NC_014729	CGC	2	6	222529	222534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313125027
5047	NC_014729	TCG	2	6	222539	222544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313125027
5048	NC_014729	CG	3	6	222651	222656	0 %	0 %	50 %	50 %	313125027
5049	NC_014729	TCG	2	6	222701	222706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313125027
5050	NC_014729	CCGC	2	8	222707	222714	0 %	0 %	25 %	75 %	313125027
5051	NC_014729	GAA	2	6	222787	222792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313125027
5052	NC_014729	TCT	2	6	222801	222806	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313125027
5053	NC_014729	CGGT	2	8	222813	222820	0 %	25 %	50 %	25 %	313125027
5054	NC_014729	CTC	2	6	222844	222849	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313125027
5055	NC_014729	CG	3	6	222886	222891	0 %	0 %	50 %	50 %	313125027
5056	NC_014729	CCG	2	6	222914	222919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313125027
5057	NC_014729	CGA	2	6	222939	222944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313125027
5058	NC_014729	ACG	2	6	222948	222953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313125027
5059	NC_014729	TCG	2	6	222969	222974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313125027
5060	NC_014729	TCG	2	6	223037	223042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313125027
5061	NC_014729	CAAC	2	8	223089	223096	50 %	0 %	0 %	50 %	313125027
5062	NC_014729	ACC	2	6	223192	223197	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313125027
5063	NC_014729	CGA	2	6	223290	223295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313125027
5064	NC_014729	CTT	2	6	223296	223301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313125027
5065	NC_014729	TCG	2	6	223343	223348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313125027
5066	NC_014729	CGC	2	6	223413	223418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313125027
5067	NC_014729	CAC	3	9	223477	223485	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313125027
5068	NC_014729	TCG	2	6	223494	223499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313125027
5069	NC_014729	GACC	2	8	223543	223550	25 %	0 %	25 %	50 %	313125027
5070	NC_014729	CGG	2	6	223583	223588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313125027
5071	NC_014729	TGA	2	6	223596	223601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313125027
5072	NC_014729	CG	4	8	223632	223639	0 %	0 %	50 %	50 %	313125027
5073	NC_014729	CGAC	2	8	223683	223690	25 %	0 %	25 %	50 %	313125027
5074	NC_014729	TCGT	2	8	223700	223707	0 %	50 %	25 %	25 %	313125027
5075	NC_014729	CGT	2	6	223779	223784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313125027
5076	NC_014729	AGA	2	6	223785	223790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313125027
5077	NC_014729	CGGT	2	8	223801	223808	0 %	25 %	50 %	25 %	313125027
5078	NC_014729	ACGG	2	8	223817	223824	25 %	0 %	50 %	25 %	313125027
5079	NC_014729	CGG	2	6	223848	223853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313125027
5080	NC_014729	CTC	2	6	223876	223881	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313125027
5081	NC_014729	CG	3	6	223923	223928	0 %	0 %	50 %	50 %	313125027
5082	NC_014729	CGC	2	6	223971	223976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313125027
5083	NC_014729	CGT	2	6	224022	224027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313125027
5084	NC_014729	CGC	2	6	224028	224033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313125027
5085	NC_014729	CG	3	6	224046	224051	0 %	0 %	50 %	50 %	313125027
5086	NC_014729	CG	3	6	224056	224061	0 %	0 %	50 %	50 %	313125027
5087	NC_014729	GAC	2	6	224083	224088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313125027
5088	NC_014729	GA	3	6	224096	224101	50 %	0 %	50 %	0 %	313125027
5089	NC_014729	CGG	2	6	224156	224161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313125027
5090	NC_014729	CACG	2	8	224169	224176	25 %	0 %	25 %	50 %	313125027
5091	NC_014729	AG	3	6	224203	224208	50 %	0 %	50 %	0 %	313125027
5092	NC_014729	CGC	2	6	224253	224258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313125027
5093	NC_014729	CGG	2	6	224264	224269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313125027
5094	NC_014729	GACTC	2	10	224274	224283	20 %	20 %	20 %	40 %	313125027
5095	NC_014729	CGT	2	6	224334	224339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313125027
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5097	NC_014729	GGT	2	6	224382	224387	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313125027
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5100	NC_014729	CGT	2	6	224535	224540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313125027
5101	NC_014729	CGTC	2	8	224734	224741	0 %	25 %	25 %	50 %	313125028
5102	NC_014729	GTC	2	6	224785	224790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313125028
5103	NC_014729	GCC	2	6	224795	224800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313125028
5104	NC_014729	GGA	2	6	224805	224810	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313125028
5105	NC_014729	CG	4	8	224818	224825	0 %	0 %	50 %	50 %	313125028
5106	NC_014729	GGT	2	6	224826	224831	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313125028
5107	NC_014729	GTC	2	6	224835	224840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313125028
5108	NC_014729	CGT	2	6	224874	224879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313125028
5109	NC_014729	GAC	2	6	225003	225008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313125028
5110	NC_014729	GCAC	2	8	225046	225053	25 %	0 %	25 %	50 %	313125028
5111	NC_014729	GCG	2	6	225086	225091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313125028
5112	NC_014729	CCTCGT	2	12	225159	225170	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	313125028
5113	NC_014729	TGGG	2	8	225202	225209	0 %	25 %	75 %	0 %	313125028
5114	NC_014729	ACGG	2	8	225241	225248	25 %	0 %	50 %	25 %	313125028
5115	NC_014729	TCG	2	6	225257	225262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313125028
5116	NC_014729	GC	3	6	225279	225284	0 %	0 %	50 %	50 %	313125028
5117	NC_014729	TCG	2	6	225317	225322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313125028
5118	NC_014729	CGT	2	6	225324	225329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313125028
5119	NC_014729	GGC	2	6	225337	225342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313125028
5120	NC_014729	GCG	2	6	225374	225379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313125028
5121	NC_014729	GTC	3	9	225394	225402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313125028
5122	NC_014729	CGG	2	6	225410	225415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313125028
5123	NC_014729	AGG	2	6	225416	225421	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313125028
5124	NC_014729	TCG	2	6	225437	225442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313125028
5125	NC_014729	ACC	2	6	225447	225452	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313125028
5126	NC_014729	CCG	2	6	225456	225461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313125028
5127	NC_014729	ATC	2	6	225493	225498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313125028
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5133	NC_014729	TCG	2	6	225624	225629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313125028
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5144	NC_014729	TCCG	2	8	225907	225914	0 %	25 %	25 %	50 %	313125028
5145	NC_014729	CGCGGC	2	12	225937	225948	0 %	0 %	50 %	50 %	313125028
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5151	NC_014729	AG	3	6	226215	226220	50 %	0 %	50 %	0 %	313125028
5152	NC_014729	CAC	2	6	226359	226364	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313125028
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5154	NC_014729	CG	3	6	226416	226421	0 %	0 %	50 %	50 %	313125028
5155	NC_014729	CGT	2	6	226509	226514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313125028
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5220	NC_014729	CGAC	2	8	229035	229042	25 %	0 %	25 %	50 %	313125030
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5231	NC_014729	TCG	2	6	229275	229280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313125030
5232	NC_014729	CG	3	6	229316	229321	0 %	0 %	50 %	50 %	313125030
5233	NC_014729	GAC	2	6	229325	229330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313125030
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5237	NC_014729	TCG	2	6	229527	229532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313125030
5238	NC_014729	GTCC	2	8	229591	229598	0 %	25 %	25 %	50 %	313125030
5239	NC_014729	CCGT	2	8	229625	229632	0 %	25 %	25 %	50 %	313125030
5240	NC_014729	GTGA	2	8	229675	229682	25 %	25 %	50 %	0 %	313125030
5241	NC_014729	CCG	2	6	229706	229711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313125031
5242	NC_014729	GAC	2	6	229712	229717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313125031
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5244	NC_014729	GTT	2	6	229811	229816	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313125031
5245	NC_014729	CGC	2	6	229909	229914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313125031
5246	NC_014729	TCG	2	6	229980	229985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313125031
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5352	NC_014729	TC	3	6	234348	234353	0 %	50 %	0 %	50 %	313125035
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5360	NC_014729	CCT	2	6	234937	234942	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313125036
5361	NC_014729	TCG	2	6	234945	234950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313125036
5362	NC_014729	TCT	2	6	234966	234971	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313125036
5363	NC_014729	CGG	2	6	234979	234984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313125036
5364	NC_014729	CGG	2	6	234988	234993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313125036
5365	NC_014729	TCA	2	6	235011	235016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313125036
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5369	NC_014729	CGCTCG	2	12	235149	235160	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	313125036
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5371	NC_014729	TCGC	2	8	235232	235239	0 %	25 %	25 %	50 %	313125036
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5391	NC_014729	CGA	2	6	236074	236079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313125037
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5432	NC_014729	GTCG	2	8	237658	237665	0 %	25 %	50 %	25 %	313125040
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5465	NC_014729	GGT	2	6	238720	238725	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313125042
5466	NC_014729	CGG	2	6	238740	238745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313125042
5467	NC_014729	GCG	2	6	238763	238768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313125042
5468	NC_014729	TCG	3	9	238793	238801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313125042
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5470	NC_014729	CGGT	2	8	238865	238872	0 %	25 %	50 %	25 %	313125042
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5477	NC_014729	GTC	2	6	239110	239115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313125042
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5480	NC_014729	CGA	2	6	239163	239168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313125042
5481	NC_014729	CGT	2	6	239211	239216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313125042
5482	NC_014729	GCTT	2	8	239239	239246	0 %	50 %	25 %	25 %	313125042
5483	NC_014729	TGC	2	6	239274	239279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313125042
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