MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halogeometricum borinquense DSM 11551 chromosome

Total Repeats: 62950

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_014729	ACCG	2	8	196918	196925	25 %	0 %	25 %	50 %	313125001
4502	NC_014729	TC	3	6	196940	196945	0 %	50 %	0 %	50 %	313125001
4503	NC_014729	CCGAG	2	10	197027	197036	20 %	0 %	40 %	40 %	313125001
4504	NC_014729	GAC	2	6	197070	197075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313125001
4505	NC_014729	CTC	2	6	197084	197089	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313125001
4506	NC_014729	GAC	2	6	197103	197108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313125001
4507	NC_014729	ACG	2	6	197206	197211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313125001
4508	NC_014729	CGTC	2	8	197227	197234	0 %	25 %	25 %	50 %	313125001
4509	NC_014729	GAC	2	6	197253	197258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313125001
4510	NC_014729	GAG	2	6	197262	197267	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313125001
4511	NC_014729	CGT	2	6	197364	197369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313125002
4512	NC_014729	CCG	2	6	197375	197380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313125002
4513	NC_014729	TCTCGT	2	12	197452	197463	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	313125002
4514	NC_014729	CGA	2	6	197470	197475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313125002
4515	NC_014729	GAA	2	6	197480	197485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313125002
4516	NC_014729	CTCG	2	8	197513	197520	0 %	25 %	25 %	50 %	313125002
4517	NC_014729	ACG	2	6	197595	197600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313125002
4518	NC_014729	TCCA	2	8	197700	197707	25 %	25 %	0 %	50 %	313125002
4519	NC_014729	GTT	2	6	197741	197746	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313125002
4520	NC_014729	CTG	2	6	197789	197794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313125002
4521	NC_014729	GGC	2	6	198096	198101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313125003
4522	NC_014729	CGT	2	6	198297	198302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313125003
4523	NC_014729	CGT	2	6	198333	198338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313125003
4524	NC_014729	CGT	2	6	198366	198371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313125003
4525	NC_014729	AAC	2	6	198376	198381	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	313125003
4526	NC_014729	CCAA	2	8	198413	198420	50 %	0 %	0 %	50 %	313125003
4527	NC_014729	ACG	2	6	198458	198463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313125003
4528	NC_014729	TCG	2	6	198518	198523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313125003
4529	NC_014729	AAG	2	6	198524	198529	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313125003
4530	NC_014729	GTC	2	6	198550	198555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313125003
4531	NC_014729	CAA	2	6	198570	198575	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	313125003
4532	NC_014729	CGACG	2	10	198642	198651	20 %	0 %	40 %	40 %	313125003
4533	NC_014729	AAG	2	6	198787	198792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313125003
4534	NC_014729	CGC	2	6	198819	198824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313125003
4535	NC_014729	GGT	2	6	198895	198900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313125003
4536	NC_014729	GGC	2	6	198918	198923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313125003
4537	NC_014729	ACC	2	6	198954	198959	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313125003
4538	NC_014729	GTC	2	6	198998	199003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313125003
4539	NC_014729	ACCG	2	8	199035	199042	25 %	0 %	25 %	50 %	313125003
4540	NC_014729	TTC	2	6	199076	199081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313125003
4541	NC_014729	GGC	2	6	199141	199146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313125003
4542	NC_014729	ACCG	2	8	199186	199193	25 %	0 %	25 %	50 %	313125003
4543	NC_014729	GCC	2	6	199267	199272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313125003
4544	NC_014729	TCG	2	6	199313	199318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313125003
4545	NC_014729	TCG	2	6	199381	199386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313125003
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4547	NC_014729	GAG	2	6	199455	199460	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313125004
4548	NC_014729	GAG	2	6	199474	199479	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313125004
4549	NC_014729	TTC	2	6	199540	199545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313125004
4550	NC_014729	GA	3	6	199621	199626	50 %	0 %	50 %	0 %	313125004
4551	NC_014729	CGA	2	6	199634	199639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313125004
4552	NC_014729	GGAA	2	8	199723	199730	50 %	0 %	50 %	0 %	313125004
4553	NC_014729	TCG	2	6	199759	199764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313125004
4554	NC_014729	GAA	2	6	199860	199865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313125004
4555	NC_014729	CGA	2	6	199880	199885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313125004
4556	NC_014729	GTC	2	6	199912	199917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313125004
4557	NC_014729	TGCAG	2	10	199934	199943	20 %	20 %	40 %	20 %	313125004
4558	NC_014729	GT	3	6	199962	199967	0 %	50 %	50 %	0 %	313125004
4559	NC_014729	GA	4	8	199991	199998	50 %	0 %	50 %	0 %	313125004
4560	NC_014729	TC	3	6	200024	200029	0 %	50 %	0 %	50 %	313125004
4561	NC_014729	GTC	3	9	200070	200078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313125004
4562	NC_014729	GTTCG	2	10	200140	200149	0 %	40 %	40 %	20 %	313125004
4563	NC_014729	TC	4	8	200167	200174	0 %	50 %	0 %	50 %	313125004
4564	NC_014729	CG	3	6	200194	200199	0 %	0 %	50 %	50 %	313125004
4565	NC_014729	GTT	2	6	200322	200327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313125004
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4583	NC_014729	CACGTC	2	12	201311	201322	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	313125006
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4585	NC_014729	GC	3	6	201381	201386	0 %	0 %	50 %	50 %	313125006
4586	NC_014729	GAC	2	6	201422	201427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313125006
4587	NC_014729	GTC	2	6	201437	201442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313125006
4588	NC_014729	CTC	2	6	201443	201448	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313125006
4589	NC_014729	CGA	2	6	201457	201462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313125006
4590	NC_014729	CGGA	2	8	201482	201489	25 %	0 %	50 %	25 %	313125006
4591	NC_014729	GACG	2	8	201505	201512	25 %	0 %	50 %	25 %	313125006
4592	NC_014729	CAC	2	6	201536	201541	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313125006
4593	NC_014729	GTC	2	6	201566	201571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313125006
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4596	NC_014729	CGA	3	9	201673	201681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313125006
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4599	NC_014729	CGATGA	2	12	201841	201852	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	313125006
4600	NC_014729	CGAC	2	8	201855	201862	25 %	0 %	25 %	50 %	313125006
4601	NC_014729	TACA	2	8	201864	201871	50 %	25 %	0 %	25 %	313125006
4602	NC_014729	CTCG	2	8	202397	202404	0 %	25 %	25 %	50 %	313125007
4603	NC_014729	CAG	2	6	202433	202438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313125007
4604	NC_014729	GTCA	2	8	202449	202456	25 %	25 %	25 %	25 %	313125007
4605	NC_014729	TCG	2	6	202483	202488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313125007
4606	NC_014729	GCC	2	6	202534	202539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313125007
4607	NC_014729	TCG	2	6	202549	202554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313125007
4608	NC_014729	CCG	2	6	202555	202560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313125007
4609	NC_014729	CGA	2	6	202571	202576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313125007
4610	NC_014729	CGT	2	6	202613	202618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313125007
4611	NC_014729	CGC	2	6	202627	202632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313125007
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4615	NC_014729	CG	3	6	202750	202755	0 %	0 %	50 %	50 %	313125007
4616	NC_014729	CGTCT	2	10	202779	202788	0 %	40 %	20 %	40 %	313125007
4617	NC_014729	GTC	2	6	202892	202897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313125008
4618	NC_014729	TTC	2	6	202911	202916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313125008
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4620	NC_014729	CCA	2	6	202944	202949	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313125008
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4862	NC_014729	CGG	2	6	213230	213235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313125017
4863	NC_014729	CGCT	2	8	213294	213301	0 %	25 %	25 %	50 %	313125017
4864	NC_014729	CCT	2	6	213316	213321	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313125017
4865	NC_014729	GAC	2	6	213332	213337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313125017
4866	NC_014729	CGT	2	6	213379	213384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313125017
4867	NC_014729	CGT	2	6	213412	213417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313125017
4868	NC_014729	CTC	2	6	213502	213507	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313125017
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4870	NC_014729	GA	3	6	213515	213520	50 %	0 %	50 %	0 %	313125017
4871	NC_014729	GAGG	2	8	213530	213537	25 %	0 %	75 %	0 %	313125017
4872	NC_014729	GTAT	2	8	213799	213806	25 %	50 %	25 %	0 %	313125018
4873	NC_014729	AC	3	6	213884	213889	50 %	0 %	0 %	50 %	313125018
4874	NC_014729	CCGAC	2	10	213930	213939	20 %	0 %	20 %	60 %	313125018
4875	NC_014729	TTC	2	6	213991	213996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313125018
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4880	NC_014729	TCG	2	6	214246	214251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313125019
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4882	NC_014729	GAC	2	6	214494	214499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313125019
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4886	NC_014729	GAC	2	6	214650	214655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313125019
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4889	NC_014729	GAC	2	6	214935	214940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313125019
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4892	NC_014729	ACGCG	2	10	215096	215105	20 %	0 %	40 %	40 %	313125019
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4963	NC_014729	TCCC	2	8	218009	218016	0 %	25 %	0 %	75 %	313125021
4964	NC_014729	GGA	2	6	218157	218162	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313125022
4965	NC_014729	ACGT	2	8	218187	218194	25 %	25 %	25 %	25 %	313125022
4966	NC_014729	ACCG	2	8	218197	218204	25 %	0 %	25 %	50 %	313125022
4967	NC_014729	CGTC	2	8	218247	218254	0 %	25 %	25 %	50 %	313125022
4968	NC_014729	CGA	2	6	218270	218275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313125022
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4970	NC_014729	GAC	2	6	218347	218352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313125022
4971	NC_014729	GAC	2	6	218410	218415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313125022
4972	NC_014729	ACC	2	6	218689	218694	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313125023
4973	NC_014729	CAC	2	6	218702	218707	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313125023
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4975	NC_014729	ATTC	2	8	218747	218754	25 %	50 %	0 %	25 %	313125023
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4977	NC_014729	GAC	2	6	218817	218822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313125023
4978	NC_014729	TCA	2	6	218872	218877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313125023
4979	NC_014729	CCGC	2	8	218896	218903	0 %	0 %	25 %	75 %	313125023
4980	NC_014729	TAC	2	6	219049	219054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313125024
4981	NC_014729	GAG	2	6	219094	219099	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313125024
4982	NC_014729	GTG	2	6	219231	219236	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313125024
4983	NC_014729	GAC	2	6	219238	219243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313125024
4984	NC_014729	CGT	2	6	219276	219281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313125024
4985	NC_014729	GCC	2	6	219360	219365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313125024
4986	NC_014729	AAG	2	6	219415	219420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313125024
4987	NC_014729	CGA	2	6	219489	219494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313125024
4988	NC_014729	AAG	2	6	219520	219525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313125024
4989	NC_014729	GACG	2	8	219531	219538	25 %	0 %	50 %	25 %	313125024
4990	NC_014729	ACC	2	6	219576	219581	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313125024
4991	NC_014729	CGGCG	2	10	219654	219663	0 %	0 %	60 %	40 %	313125024
4992	NC_014729	AAC	2	6	219745	219750	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	313125024
4993	NC_014729	TAC	2	6	219835	219840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313125024
4994	NC_014729	GAT	2	6	219888	219893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313125024
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4996	NC_014729	CGT	2	6	220028	220033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313125024
4997	NC_014729	GCG	2	6	220034	220039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313125024
4998	NC_014729	CGAC	2	8	220043	220050	25 %	0 %	25 %	50 %	313125024
4999	NC_014729	CGT	2	6	220227	220232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313125024
5000	NC_014729	GTAGG	2	10	220284	220293	20 %	20 %	60 %	0 %	313125024

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