MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halanaerobium hydrogeniformans chromosome

Total Repeats: 60669

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_014654	TAT	2	6	158099	158104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142537
3502	NC_014654	AGA	2	6	158111	158116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142537
3503	NC_014654	ATAAA	2	10	158125	158134	80 %	20 %	0 %	0 %	312142537
3504	NC_014654	TTA	2	6	158200	158205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142537
3505	NC_014654	TAA	2	6	158225	158230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142537
3506	NC_014654	TACT	2	8	158293	158300	25 %	50 %	0 %	25 %	312142537
3507	NC_014654	A	6	6	158385	158390	100 %	0 %	0 %	0 %	312142537
3508	NC_014654	AGAA	2	8	158393	158400	75 %	0 %	25 %	0 %	312142537
3509	NC_014654	AT	3	6	158435	158440	50 %	50 %	0 %	0 %	312142537
3510	NC_014654	AAG	2	6	158833	158838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142538
3511	NC_014654	TGA	2	6	158872	158877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142538
3512	NC_014654	CTT	2	6	158887	158892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312142538
3513	NC_014654	TAAAAG	2	12	158905	158916	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	312142538
3514	NC_014654	GAA	2	6	158931	158936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142538
3515	NC_014654	A	7	7	158945	158951	100 %	0 %	0 %	0 %	312142538
3516	NC_014654	A	6	6	158954	158959	100 %	0 %	0 %	0 %	312142538
3517	NC_014654	TTAA	2	8	158961	158968	50 %	50 %	0 %	0 %	312142538
3518	NC_014654	AAT	2	6	158977	158982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142538
3519	NC_014654	TGG	2	6	159059	159064	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312142539
3520	NC_014654	A	6	6	159065	159070	100 %	0 %	0 %	0 %	312142539
3521	NC_014654	GCT	2	6	159079	159084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312142539
3522	NC_014654	AG	3	6	159091	159096	50 %	0 %	50 %	0 %	312142539
3523	NC_014654	TAAT	2	8	159107	159114	50 %	50 %	0 %	0 %	312142539
3524	NC_014654	GAA	2	6	159148	159153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142539
3525	NC_014654	ATG	2	6	159155	159160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142539
3526	NC_014654	TTA	2	6	159166	159171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142539
3527	NC_014654	AAATA	2	10	159179	159188	80 %	20 %	0 %	0 %	312142539
3528	NC_014654	TGT	2	6	159240	159245	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312142539
3529	NC_014654	AAT	2	6	159314	159319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142539
3530	NC_014654	AT	3	6	159318	159323	50 %	50 %	0 %	0 %	312142539
3531	NC_014654	AAT	2	6	159364	159369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142540
3532	NC_014654	TAA	2	6	159373	159378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142540
3533	NC_014654	T	6	6	159388	159393	0 %	100 %	0 %	0 %	312142540
3534	NC_014654	AGA	2	6	159394	159399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142540
3535	NC_014654	TTA	2	6	159486	159491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142540
3536	NC_014654	GTAG	2	8	159560	159567	25 %	25 %	50 %	0 %	312142540
3537	NC_014654	TGA	2	6	159573	159578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142540
3538	NC_014654	TGC	2	6	159613	159618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312142540
3539	NC_014654	ATATG	2	10	159649	159658	40 %	40 %	20 %	0 %	312142540
3540	NC_014654	CAG	2	6	159672	159677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312142540
3541	NC_014654	GCA	2	6	159689	159694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312142540
3542	NC_014654	ATT	2	6	159731	159736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142540
3543	NC_014654	ATT	2	6	159760	159765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142540
3544	NC_014654	TAT	2	6	159772	159777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142540
3545	NC_014654	A	6	6	159818	159823	100 %	0 %	0 %	0 %	312142540
3546	NC_014654	TTA	2	6	159831	159836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142540
3547	NC_014654	ACC	2	6	159853	159858	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312142540
3548	NC_014654	TAT	2	6	159898	159903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142540
3549	NC_014654	ATT	2	6	159904	159909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142540
3550	NC_014654	CT	4	8	159910	159917	0 %	50 %	0 %	50 %	312142540
3551	NC_014654	CTA	2	6	159951	159956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312142540
3552	NC_014654	TAA	2	6	159969	159974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142540
3553	NC_014654	TTA	2	6	159981	159986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142540
3554	NC_014654	TTG	2	6	160062	160067	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312142540
3555	NC_014654	CTG	2	6	160098	160103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312142540
3556	NC_014654	ATT	2	6	160120	160125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142540
3557	NC_014654	GCT	2	6	160148	160153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312142540
3558	NC_014654	AT	3	6	160197	160202	50 %	50 %	0 %	0 %	312142540
3559	NC_014654	TAT	2	6	160245	160250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142540
3560	NC_014654	TGC	2	6	160258	160263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312142540
3561	NC_014654	GTT	2	6	160312	160317	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312142540
3562	NC_014654	CCA	2	6	160407	160412	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312142540
3563	NC_014654	ACA	2	6	160472	160477	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312142540
3564	NC_014654	TTA	2	6	160564	160569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142540
3565	NC_014654	ATA	2	6	160590	160595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142540
3566	NC_014654	AGA	2	6	160624	160629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142540
3567	NC_014654	TAA	2	6	160643	160648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142540
3568	NC_014654	AAT	2	6	160669	160674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142541
3569	NC_014654	GAA	2	6	160781	160786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142541
3570	NC_014654	AGC	2	6	160795	160800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312142541
3571	NC_014654	TAAA	2	8	160812	160819	75 %	25 %	0 %	0 %	312142541
3572	NC_014654	AAAC	2	8	160829	160836	75 %	0 %	0 %	25 %	312142541
3573	NC_014654	AAG	2	6	160851	160856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142541
3574	NC_014654	ATT	2	6	160882	160887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142541
3575	NC_014654	AATG	2	8	160912	160919	50 %	25 %	25 %	0 %	312142541
3576	NC_014654	TAG	2	6	160938	160943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142541
3577	NC_014654	AGG	2	6	160991	160996	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312142541
3578	NC_014654	A	6	6	161016	161021	100 %	0 %	0 %	0 %	312142542
3579	NC_014654	CAA	2	6	161035	161040	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312142542
3580	NC_014654	TGG	2	6	161042	161047	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312142542
3581	NC_014654	ATG	2	6	161095	161100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142542
3582	NC_014654	GAA	2	6	161136	161141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142542
3583	NC_014654	TTG	2	6	161161	161166	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312142542
3584	NC_014654	AGA	2	6	161189	161194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142542
3585	NC_014654	GATA	2	8	161201	161208	50 %	25 %	25 %	0 %	312142542
3586	NC_014654	AGA	2	6	161232	161237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142542
3587	NC_014654	A	6	6	161311	161316	100 %	0 %	0 %	0 %	312142542
3588	NC_014654	ACA	2	6	161349	161354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312142542
3589	NC_014654	GAA	2	6	161421	161426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142542
3590	NC_014654	TAT	2	6	161471	161476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142542
3591	NC_014654	A	6	6	161545	161550	100 %	0 %	0 %	0 %	312142542
3592	NC_014654	ACC	2	6	161611	161616	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312142542
3593	NC_014654	GCT	2	6	161631	161636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312142542
3594	NC_014654	TTC	2	6	161740	161745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312142542
3595	NC_014654	GAA	2	6	161811	161816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142542
3596	NC_014654	AGC	2	6	161822	161827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312142542
3597	NC_014654	AAGC	2	8	161869	161876	50 %	0 %	25 %	25 %	312142542
3598	NC_014654	AGA	2	6	161918	161923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142542
3599	NC_014654	GAA	2	6	161928	161933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142542
3600	NC_014654	AGG	2	6	161936	161941	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312142542
3601	NC_014654	TGC	2	6	161957	161962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312142542
3602	NC_014654	AAT	2	6	162024	162029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142542
3603	NC_014654	AGAA	2	8	162065	162072	75 %	0 %	25 %	0 %	312142542
3604	NC_014654	CCT	2	6	162123	162128	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312142542
3605	NC_014654	TTA	2	6	162141	162146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142542
3606	NC_014654	TGC	2	6	162206	162211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312142542
3607	NC_014654	CACT	2	8	162220	162227	25 %	25 %	0 %	50 %	312142542
3608	NC_014654	GAT	2	6	162270	162275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142542
3609	NC_014654	ATT	2	6	162276	162281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142542
3610	NC_014654	A	7	7	162283	162289	100 %	0 %	0 %	0 %	312142542
3611	NC_014654	ATTA	2	8	162291	162298	50 %	50 %	0 %	0 %	312142542
3612	NC_014654	TAA	2	6	162311	162316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142542
3613	NC_014654	GCA	2	6	162353	162358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312142543
3614	NC_014654	AGA	2	6	162380	162385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142543
3615	NC_014654	T	6	6	162386	162391	0 %	100 %	0 %	0 %	312142543
3616	NC_014654	AGA	2	6	162533	162538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142543
3617	NC_014654	ATC	2	6	162600	162605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312142543
3618	NC_014654	TGA	2	6	162662	162667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142543
3619	NC_014654	ACT	2	6	162668	162673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312142543
3620	NC_014654	A	6	6	162735	162740	100 %	0 %	0 %	0 %	312142543
3621	NC_014654	GGT	2	6	162741	162746	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312142543
3622	NC_014654	ATA	2	6	162901	162906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142543
3623	NC_014654	ATC	2	6	162931	162936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312142543
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3993	NC_014654	ATG	2	6	180048	180053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142558
3994	NC_014654	ACA	2	6	180094	180099	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312142558
3995	NC_014654	ATA	2	6	180129	180134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142558
3996	NC_014654	A	7	7	180151	180157	100 %	0 %	0 %	0 %	312142558
3997	NC_014654	AAG	2	6	180195	180200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142558
3998	NC_014654	AT	3	6	180211	180216	50 %	50 %	0 %	0 %	312142558
3999	NC_014654	TTA	2	6	180263	180268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142558
4000	NC_014654	CAA	2	6	180281	180286	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312142558

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