MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halanaerobium hydrogeniformans chromosome

Total Repeats: 60669

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3002	NC_014654	A	7	7	137556	137562	100 %	0 %	0 %	0 %	312142519
3003	NC_014654	GGAT	2	8	137602	137609	25 %	25 %	50 %	0 %	312142519
3004	NC_014654	AGC	2	6	137618	137623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312142519
3005	NC_014654	ATA	2	6	137653	137658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142519
3006	NC_014654	CAG	2	6	137719	137724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312142519
3007	NC_014654	AAG	2	6	137725	137730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142519
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3009	NC_014654	CAA	2	6	137865	137870	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312142520
3010	NC_014654	A	8	8	137869	137876	100 %	0 %	0 %	0 %	312142520
3011	NC_014654	TTTA	2	8	137921	137928	25 %	75 %	0 %	0 %	312142520
3012	NC_014654	T	7	7	137930	137936	0 %	100 %	0 %	0 %	312142520
3013	NC_014654	ATT	2	6	137947	137952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142520
3014	NC_014654	TA	3	6	138022	138027	50 %	50 %	0 %	0 %	312142520
3015	NC_014654	CTA	2	6	138098	138103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312142520
3016	NC_014654	ATT	2	6	138159	138164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142520
3017	NC_014654	T	7	7	138177	138183	0 %	100 %	0 %	0 %	312142520
3018	NC_014654	AAT	2	6	138219	138224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142520
3019	NC_014654	TATT	2	8	138229	138236	25 %	75 %	0 %	0 %	312142520
3020	NC_014654	TTA	2	6	138254	138259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142520
3021	NC_014654	AGA	2	6	138270	138275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142520
3022	NC_014654	TGG	2	6	138355	138360	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312142520
3023	NC_014654	GCA	2	6	138391	138396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312142520
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3029	NC_014654	AGA	2	6	138715	138720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142520
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3031	NC_014654	AT	3	6	138776	138781	50 %	50 %	0 %	0 %	312142521
3032	NC_014654	ATC	2	6	138819	138824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312142521
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3036	NC_014654	TTG	2	6	138967	138972	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312142521
3037	NC_014654	ATT	2	6	138998	139003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142521
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3040	NC_014654	GTA	2	6	139107	139112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142521
3041	NC_014654	TTG	2	6	139126	139131	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312142521
3042	NC_014654	ATT	2	6	139200	139205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142521
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3044	NC_014654	GATG	2	8	139260	139267	25 %	25 %	50 %	0 %	312142521
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3047	NC_014654	ATTTTT	2	12	139508	139519	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	312142521
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3052	NC_014654	AAAG	2	8	139706	139713	75 %	0 %	25 %	0 %	312142522
3053	NC_014654	AGC	2	6	139876	139881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312142522
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3057	NC_014654	A	6	6	140057	140062	100 %	0 %	0 %	0 %	312142522
3058	NC_014654	T	6	6	140068	140073	0 %	100 %	0 %	0 %	312142522
3059	NC_014654	CTAG	2	8	140126	140133	25 %	25 %	25 %	25 %	312142522
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3066	NC_014654	GATT	2	8	140386	140393	25 %	50 %	25 %	0 %	312142522
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3071	NC_014654	A	6	6	140628	140633	100 %	0 %	0 %	0 %	312142522
3072	NC_014654	AGA	2	6	140635	140640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142522
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3089	NC_014654	AATA	2	8	141356	141363	75 %	25 %	0 %	0 %	312142522
3090	NC_014654	TTA	2	6	141612	141617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142523
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3093	NC_014654	CTC	2	6	141658	141663	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312142523
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3099	NC_014654	CAGC	2	8	141777	141784	25 %	0 %	25 %	50 %	312142523
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3102	NC_014654	T	6	6	141860	141865	0 %	100 %	0 %	0 %	312142523
3103	NC_014654	TA	3	6	141882	141887	50 %	50 %	0 %	0 %	312142523
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3106	NC_014654	AAG	2	6	141963	141968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142523
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3109	NC_014654	TAA	2	6	142031	142036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142523
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3112	NC_014654	ATA	2	6	142093	142098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142523
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3122	NC_014654	A	6	6	142439	142444	100 %	0 %	0 %	0 %	312142523
3123	NC_014654	ACT	2	6	142481	142486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312142523
3124	NC_014654	GAA	2	6	142527	142532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142523
3125	NC_014654	ATT	2	6	142533	142538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142523
3126	NC_014654	GAG	2	6	142549	142554	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312142523
3127	NC_014654	ATC	2	6	142563	142568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312142523
3128	NC_014654	GCT	3	9	142590	142598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312142523
3129	NC_014654	AG	3	6	142610	142615	50 %	0 %	50 %	0 %	312142523
3130	NC_014654	AAT	2	6	142616	142621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142523
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3132	NC_014654	AGA	3	9	142646	142654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142523
3133	NC_014654	ATT	2	6	142719	142724	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142523
3134	NC_014654	AGA	2	6	142733	142738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142523
3135	NC_014654	A	6	6	142819	142824	100 %	0 %	0 %	0 %	312142523
3136	NC_014654	TGA	2	6	142826	142831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142523
3137	NC_014654	AGC	2	6	142833	142838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312142523
3138	NC_014654	GCT	2	6	142926	142931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312142523
3139	NC_014654	ATT	2	6	142956	142961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142523
3140	NC_014654	A	6	6	142966	142971	100 %	0 %	0 %	0 %	312142523
3141	NC_014654	AAT	2	6	143045	143050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142523
3142	NC_014654	ATA	2	6	143146	143151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142523
3143	NC_014654	ATC	2	6	143169	143174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312142523
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3145	NC_014654	TAG	2	6	143293	143298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142523
3146	NC_014654	AAT	2	6	143312	143317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142523
3147	NC_014654	AAT	2	6	143329	143334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142523
3148	NC_014654	TGC	2	6	143539	143544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312142524
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3152	NC_014654	GCT	2	6	143741	143746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312142524
3153	NC_014654	TTG	2	6	143748	143753	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312142524
3154	NC_014654	GCT	2	6	143771	143776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312142524
3155	NC_014654	TAT	2	6	143818	143823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142524
3156	NC_014654	GGT	2	6	143828	143833	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312142524
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3158	NC_014654	CAGCTA	2	12	143862	143873	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	312142524
3159	NC_014654	TGG	2	6	143896	143901	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312142524
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3161	NC_014654	TCA	2	6	144018	144023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312142524
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3163	NC_014654	CTG	2	6	144352	144357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312142525
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3165	NC_014654	TAC	2	6	144496	144501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312142525
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3170	NC_014654	CTG	2	6	144982	144987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312142526
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3198	NC_014654	T	6	6	146027	146032	0 %	100 %	0 %	0 %	312142527
3199	NC_014654	TAA	2	6	146035	146040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142527
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3201	NC_014654	AATT	2	8	146074	146081	50 %	50 %	0 %	0 %	312142527
3202	NC_014654	ATA	2	6	146089	146094	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142527
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3205	NC_014654	CTG	2	6	146181	146186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312142527
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3211	NC_014654	T	6	6	146430	146435	0 %	100 %	0 %	0 %	312142528
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3214	NC_014654	CAT	2	6	146624	146629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312142528
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3220	NC_014654	TCT	2	6	146827	146832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312142528
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3225	NC_014654	T	7	7	147078	147084	0 %	100 %	0 %	0 %	312142528
3226	NC_014654	TATT	2	8	147089	147096	25 %	75 %	0 %	0 %	312142528
3227	NC_014654	T	7	7	147111	147117	0 %	100 %	0 %	0 %	312142528
3228	NC_014654	TTGCTT	2	12	147142	147153	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	312142528
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3230	NC_014654	CCA	2	6	147286	147291	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312142528
3231	NC_014654	CAT	2	6	147326	147331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312142528
3232	NC_014654	TTC	2	6	147351	147356	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312142528
3233	NC_014654	ATG	2	6	147360	147365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142528
3234	NC_014654	CTC	2	6	147395	147400	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312142528
3235	NC_014654	T	6	6	147427	147432	0 %	100 %	0 %	0 %	312142528
3236	NC_014654	TGT	2	6	147474	147479	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312142528
3237	NC_014654	ATT	2	6	147484	147489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142528
3238	NC_014654	ATT	2	6	147516	147521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142528
3239	NC_014654	TAA	2	6	147536	147541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142528
3240	NC_014654	ATA	2	6	147556	147561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142528
3241	NC_014654	CTG	2	6	147592	147597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312142528
3242	NC_014654	T	6	6	147669	147674	0 %	100 %	0 %	0 %	312142528
3243	NC_014654	TACC	2	8	147690	147697	25 %	25 %	0 %	50 %	312142529
3244	NC_014654	A	6	6	147701	147706	100 %	0 %	0 %	0 %	312142529
3245	NC_014654	CTGTT	2	10	147727	147736	0 %	60 %	20 %	20 %	312142529
3246	NC_014654	ATA	2	6	147775	147780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142529
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