MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halanaerobium hydrogeniformans chromosome

Total Repeats: 60669

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_014654	T	6	6	631275	631280	0 %	100 %	0 %	0 %	312142910
14002	NC_014654	AGA	3	9	631281	631289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142910
14003	NC_014654	GAT	2	6	631386	631391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142910
14004	NC_014654	A	6	6	631446	631451	100 %	0 %	0 %	0 %	312142910
14005	NC_014654	GAA	2	6	631465	631470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142910
14006	NC_014654	AAAG	2	8	631474	631481	75 %	0 %	25 %	0 %	312142910
14007	NC_014654	TA	3	6	631516	631521	50 %	50 %	0 %	0 %	312142910
14008	NC_014654	CAG	2	6	631552	631557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312142910
14009	NC_014654	ATG	2	6	631577	631582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142910
14010	NC_014654	AAGCTG	2	12	631643	631654	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	312142910
14011	NC_014654	A	6	6	631700	631705	100 %	0 %	0 %	0 %	312142910
14012	NC_014654	GAA	2	6	631741	631746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142910
14013	NC_014654	GCA	2	6	631766	631771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312142910
14014	NC_014654	AT	3	6	631796	631801	50 %	50 %	0 %	0 %	312142910
14015	NC_014654	ATT	2	6	631865	631870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142910
14016	NC_014654	ATT	2	6	631884	631889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142910
14017	NC_014654	GTGAT	2	10	631913	631922	20 %	40 %	40 %	0 %	312142910
14018	NC_014654	GAT	2	6	631927	631932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142910
14019	NC_014654	GAT	2	6	631936	631941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142910
14020	NC_014654	AGA	2	6	631978	631983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142910
14021	NC_014654	AGA	2	6	632019	632024	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142910
14022	NC_014654	GAATA	2	10	632108	632117	60 %	20 %	20 %	0 %	312142910
14023	NC_014654	A	6	6	632126	632131	100 %	0 %	0 %	0 %	312142910
14024	NC_014654	A	6	6	632187	632192	100 %	0 %	0 %	0 %	312142910
14025	NC_014654	A	6	6	632229	632234	100 %	0 %	0 %	0 %	312142910
14026	NC_014654	TGA	3	9	632250	632258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142910
14027	NC_014654	ATTTT	2	10	632303	632312	20 %	80 %	0 %	0 %	312142910
14028	NC_014654	TGA	2	6	632388	632393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142910
14029	NC_014654	AGA	2	6	632448	632453	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142910
14030	NC_014654	ATG	2	6	632591	632596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142910
14031	NC_014654	TAA	2	6	632748	632753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142911
14032	NC_014654	T	6	6	632770	632775	0 %	100 %	0 %	0 %	312142911
14033	NC_014654	TAT	2	6	632789	632794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142911
14034	NC_014654	GGT	2	6	632833	632838	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312142911
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14036	NC_014654	T	6	6	632889	632894	0 %	100 %	0 %	0 %	312142911
14037	NC_014654	GTG	3	9	632951	632959	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312142911
14038	NC_014654	CAACTG	2	12	632963	632974	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	312142911
14039	NC_014654	GGT	2	6	632986	632991	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312142911
14040	NC_014654	AT	3	6	632992	632997	50 %	50 %	0 %	0 %	312142911
14041	NC_014654	CCT	2	6	633002	633007	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312142911
14042	NC_014654	TGT	2	6	633087	633092	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312142911
14043	NC_014654	TGG	2	6	633096	633101	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312142911
14044	NC_014654	AAG	2	6	633113	633118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142911
14045	NC_014654	AGTA	2	8	633186	633193	50 %	25 %	25 %	0 %	312142911
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14050	NC_014654	ATG	2	6	633370	633375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142911
14051	NC_014654	AT	3	6	633384	633389	50 %	50 %	0 %	0 %	312142911
14052	NC_014654	GCT	2	6	633493	633498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312142911
14053	NC_014654	ATG	2	6	633500	633505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142911
14054	NC_014654	TGC	2	6	633567	633572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312142911
14055	NC_014654	TAC	2	6	633645	633650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312142911
14056	NC_014654	ATT	2	6	633653	633658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142911
14057	NC_014654	GCAG	2	8	633682	633689	25 %	0 %	50 %	25 %	312142911
14058	NC_014654	CAG	2	6	633749	633754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312142911
14059	NC_014654	GGA	2	6	633769	633774	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312142911
14060	NC_014654	TGT	2	6	633864	633869	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312142911
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14062	NC_014654	TGGAA	2	10	633907	633916	40 %	20 %	40 %	0 %	312142911
14063	NC_014654	GAAG	2	8	633943	633950	50 %	0 %	50 %	0 %	312142911
14064	NC_014654	TTTTC	2	10	633973	633982	0 %	80 %	0 %	20 %	312142911
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14068	NC_014654	CAG	2	6	634202	634207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312142911
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14073	NC_014654	GAT	2	6	634288	634293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142911
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14079	NC_014654	TGA	2	6	634578	634583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142911
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14092	NC_014654	ATAG	2	8	635158	635165	50 %	25 %	25 %	0 %	312142911
14093	NC_014654	CAATT	2	10	635172	635181	40 %	40 %	0 %	20 %	312142911
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14102	NC_014654	AAGT	2	8	635711	635718	50 %	25 %	25 %	0 %	312142911
14103	NC_014654	GAT	2	6	635725	635730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142911
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14107	NC_014654	AATT	2	8	635876	635883	50 %	50 %	0 %	0 %	312142912
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14112	NC_014654	AAT	2	6	636072	636077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142912
14113	NC_014654	TATAG	2	10	636105	636114	40 %	40 %	20 %	0 %	312142912
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14244	NC_014654	AAT	2	6	641681	641686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142914
14245	NC_014654	ATA	2	6	641693	641698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142914
14246	NC_014654	TGA	2	6	641725	641730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142914
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14248	NC_014654	CTG	2	6	641745	641750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312142914
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14263	NC_014654	TAAA	2	8	642219	642226	75 %	25 %	0 %	0 %	312142914
14264	NC_014654	TGA	2	6	642241	642246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142914
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14274	NC_014654	A	6	6	642615	642620	100 %	0 %	0 %	0 %	312142915
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14355	NC_014654	CATT	2	8	648347	648354	25 %	50 %	0 %	25 %	312142920
14356	NC_014654	T	6	6	648353	648358	0 %	100 %	0 %	0 %	312142920
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14365	NC_014654	GA	3	6	649411	649416	50 %	0 %	50 %	0 %	312142921
14366	NC_014654	GCG	2	6	649432	649437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312142921
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14373	NC_014654	ACA	2	6	649749	649754	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312142921
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14486	NC_014654	A	9	9	655591	655599	100 %	0 %	0 %	0 %	312142923
14487	NC_014654	GAA	2	6	655762	655767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142924
14488	NC_014654	AAAAG	2	10	655771	655780	80 %	0 %	20 %	0 %	312142924
14489	NC_014654	TTG	2	6	655781	655786	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312142924
14490	NC_014654	AAT	2	6	655795	655800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142924
14491	NC_014654	TAA	2	6	655875	655880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142924
14492	NC_014654	TTCA	2	8	655887	655894	25 %	50 %	0 %	25 %	312142924
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14494	NC_014654	AAAGAA	2	12	655918	655929	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	312142924
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14498	NC_014654	TAT	2	6	656094	656099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142925
14499	NC_014654	A	6	6	656208	656213	100 %	0 %	0 %	0 %	312142925
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