MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halanaerobium hydrogeniformans chromosome

Total Repeats: 60669

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_014654	ATA	2	6	564240	564245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142864
12502	NC_014654	AATG	2	8	564293	564300	50 %	25 %	25 %	0 %	312142864
12503	NC_014654	TGA	2	6	564328	564333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142864
12504	NC_014654	AAC	2	6	564352	564357	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312142864
12505	NC_014654	ATA	2	6	564369	564374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142864
12506	NC_014654	TAT	2	6	564425	564430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142864
12507	NC_014654	TGA	2	6	564499	564504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142864
12508	NC_014654	GAT	2	6	564569	564574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142864
12509	NC_014654	ATT	2	6	564591	564596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142864
12510	NC_014654	AGA	2	6	564643	564648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142864
12511	NC_014654	GTT	2	6	564656	564661	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312142864
12512	NC_014654	ATA	2	6	564666	564671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142864
12513	NC_014654	GAA	2	6	564689	564694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142864
12514	NC_014654	CAT	2	6	564699	564704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312142864
12515	NC_014654	AGA	2	6	564790	564795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142864
12516	NC_014654	GTG	2	6	564843	564848	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312142864
12517	NC_014654	GATA	2	8	564895	564902	50 %	25 %	25 %	0 %	312142864
12518	NC_014654	AGA	2	6	564964	564969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142864
12519	NC_014654	AGT	2	6	565039	565044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142864
12520	NC_014654	TAT	2	6	565064	565069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142864
12521	NC_014654	TCC	2	6	565093	565098	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312142864
12522	NC_014654	GAT	2	6	565103	565108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142864
12523	NC_014654	AGA	2	6	565118	565123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142864
12524	NC_014654	CTG	2	6	565166	565171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312142864
12525	NC_014654	AAT	2	6	565198	565203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142864
12526	NC_014654	TTCT	2	8	565216	565223	0 %	75 %	0 %	25 %	312142864
12527	NC_014654	CT	3	6	565242	565247	0 %	50 %	0 %	50 %	312142864
12528	NC_014654	AGA	2	6	565282	565287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142864
12529	NC_014654	TGG	2	6	565298	565303	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312142864
12530	NC_014654	GAT	2	6	565304	565309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142864
12531	NC_014654	AAT	2	6	565463	565468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142865
12532	NC_014654	TAA	3	9	565474	565482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142865
12533	NC_014654	T	7	7	565484	565490	0 %	100 %	0 %	0 %	312142865
12534	NC_014654	ACTAT	2	10	565500	565509	40 %	40 %	0 %	20 %	312142865
12535	NC_014654	T	6	6	565509	565514	0 %	100 %	0 %	0 %	312142865
12536	NC_014654	ATGG	2	8	565557	565564	25 %	25 %	50 %	0 %	312142865
12537	NC_014654	AGA	2	6	565574	565579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142865
12538	NC_014654	TAG	2	6	565621	565626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142865
12539	NC_014654	TATTT	2	10	565632	565641	20 %	80 %	0 %	0 %	312142865
12540	NC_014654	TCATT	2	10	565677	565686	20 %	60 %	0 %	20 %	312142865
12541	NC_014654	TTA	2	6	565794	565799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142865
12542	NC_014654	TAG	2	6	565837	565842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142865
12543	NC_014654	G	6	6	565842	565847	0 %	0 %	100 %	0 %	312142865
12544	NC_014654	TAT	2	6	565892	565897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142865
12545	NC_014654	CTGG	2	8	565910	565917	0 %	25 %	50 %	25 %	312142865
12546	NC_014654	ACCA	2	8	565925	565932	50 %	0 %	0 %	50 %	312142865
12547	NC_014654	AAT	2	6	565979	565984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142865
12548	NC_014654	ATT	2	6	565993	565998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142865
12549	NC_014654	ATCTT	2	10	566005	566014	20 %	60 %	0 %	20 %	312142865
12550	NC_014654	GAC	2	6	566021	566026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312142865
12551	NC_014654	TAT	2	6	566037	566042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142865
12552	NC_014654	TGT	2	6	566180	566185	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312142865
12553	NC_014654	GTA	3	9	566229	566237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142865
12554	NC_014654	GGT	2	6	566240	566245	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312142865
12555	NC_014654	ATG	3	9	566325	566333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142865
12556	NC_014654	GGTCT	2	10	566337	566346	0 %	40 %	40 %	20 %	312142865
12557	NC_014654	CAG	2	6	566359	566364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312142865
12558	NC_014654	G	6	6	566408	566413	0 %	0 %	100 %	0 %	312142865
12559	NC_014654	AAAT	2	8	566414	566421	75 %	25 %	0 %	0 %	312142865
12560	NC_014654	A	6	6	566432	566437	100 %	0 %	0 %	0 %	312142866
12561	NC_014654	TGC	2	6	566472	566477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312142866
12562	NC_014654	ATA	2	6	566501	566506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142866
12563	NC_014654	ATA	2	6	566549	566554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142866
12564	NC_014654	ATGA	2	8	566606	566613	50 %	25 %	25 %	0 %	312142866
12565	NC_014654	TGA	2	6	566641	566646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142866
12566	NC_014654	GTT	2	6	566672	566677	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312142866
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12568	NC_014654	TGG	2	6	566737	566742	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312142866
12569	NC_014654	AT	5	10	566743	566752	50 %	50 %	0 %	0 %	312142866
12570	NC_014654	GAAAT	2	10	566831	566840	60 %	20 %	20 %	0 %	312142866
12571	NC_014654	TACAGA	2	12	566902	566913	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	312142866
12572	NC_014654	GTA	2	6	567093	567098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142866
12573	NC_014654	CTT	2	6	567132	567137	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312142866
12574	NC_014654	GCTG	2	8	567172	567179	0 %	25 %	50 %	25 %	312142866
12575	NC_014654	ATG	2	6	567240	567245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142866
12576	NC_014654	GAT	2	6	567263	567268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142866
12577	NC_014654	CT	3	6	567283	567288	0 %	50 %	0 %	50 %	312142866
12578	NC_014654	ATG	2	6	567357	567362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142866
12579	NC_014654	AAG	2	6	567394	567399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142866
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12581	NC_014654	TATG	2	8	567538	567545	25 %	50 %	25 %	0 %	312142866
12582	NC_014654	TGGT	2	8	567564	567571	0 %	50 %	50 %	0 %	312142866
12583	NC_014654	AGC	2	6	567577	567582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312142866
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12586	NC_014654	T	6	6	567652	567657	0 %	100 %	0 %	0 %	312142866
12587	NC_014654	TTG	2	6	567666	567671	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312142866
12588	NC_014654	AAT	2	6	567706	567711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142866
12589	NC_014654	ATA	2	6	567791	567796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142866
12590	NC_014654	AGC	2	6	567838	567843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312142866
12591	NC_014654	CAG	2	6	567951	567956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312142866
12592	NC_014654	CCA	2	6	567986	567991	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312142866
12593	NC_014654	TTCA	2	8	568017	568024	25 %	50 %	0 %	25 %	312142866
12594	NC_014654	TGG	3	9	568055	568063	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312142866
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12596	NC_014654	TG	3	6	568088	568093	0 %	50 %	50 %	0 %	312142866
12597	NC_014654	GAG	2	6	568155	568160	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312142866
12598	NC_014654	CCTGAA	2	12	568175	568186	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	312142866
12599	NC_014654	AATAA	2	10	568215	568224	80 %	20 %	0 %	0 %	312142866
12600	NC_014654	CAA	2	6	568339	568344	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312142867
12601	NC_014654	TGG	2	6	568346	568351	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312142867
12602	NC_014654	TAG	2	6	568354	568359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142867
12603	NC_014654	AGG	2	6	568540	568545	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312142867
12604	NC_014654	ATTT	2	8	568564	568571	25 %	75 %	0 %	0 %	312142867
12605	NC_014654	GTT	2	6	568644	568649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312142867
12606	NC_014654	GCGATG	2	12	568653	568664	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	312142867
12607	NC_014654	TGT	2	6	568715	568720	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312142867
12608	NC_014654	CAAAA	2	10	568758	568767	80 %	0 %	0 %	20 %	312142867
12609	NC_014654	TTC	2	6	568772	568777	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312142867
12610	NC_014654	AGT	2	6	568805	568810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142867
12611	NC_014654	CAG	2	6	568831	568836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312142867
12612	NC_014654	TATG	2	8	568838	568845	25 %	50 %	25 %	0 %	312142867
12613	NC_014654	CCGG	2	8	568846	568853	0 %	0 %	50 %	50 %	312142867
12614	NC_014654	AG	3	6	568875	568880	50 %	0 %	50 %	0 %	312142867
12615	NC_014654	ATC	2	6	568897	568902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312142867
12616	NC_014654	TTA	2	6	568918	568923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142867
12617	NC_014654	GCG	2	6	568944	568949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312142867
12618	NC_014654	AGA	2	6	568952	568957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142867
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12989	NC_014654	AT	3	6	584605	584610	50 %	50 %	0 %	0 %	312142881
12990	NC_014654	A	6	6	584640	584645	100 %	0 %	0 %	0 %	312142881
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