MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halanaerobium hydrogeniformans chromosome

Total Repeats: 60669

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12002	NC_014654	GAA	2	6	541866	541871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142848
12003	NC_014654	A	6	6	541897	541902	100 %	0 %	0 %	0 %	312142848
12004	NC_014654	A	6	6	541921	541926	100 %	0 %	0 %	0 %	312142848
12005	NC_014654	CAC	2	6	541937	541942	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312142848
12006	NC_014654	TGA	2	6	541952	541957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142848
12007	NC_014654	AGG	2	6	542029	542034	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312142848
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12009	NC_014654	AAAG	2	8	542127	542134	75 %	0 %	25 %	0 %	312142848
12010	NC_014654	A	6	6	542163	542168	100 %	0 %	0 %	0 %	312142848
12011	NC_014654	AGA	2	6	542192	542197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142848
12012	NC_014654	ACT	2	6	542374	542379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312142849
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12014	NC_014654	TAA	2	6	542489	542494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142849
12015	NC_014654	GTG	2	6	542495	542500	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312142849
12016	NC_014654	TAT	2	6	542527	542532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142849
12017	NC_014654	GAAC	2	8	542544	542551	50 %	0 %	25 %	25 %	312142849
12018	NC_014654	ATT	2	6	542608	542613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142849
12019	NC_014654	TAT	2	6	542622	542627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142849
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12021	NC_014654	ATT	2	6	542683	542688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142849
12022	NC_014654	AGC	2	6	542712	542717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312142849
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12030	NC_014654	T	6	6	542970	542975	0 %	100 %	0 %	0 %	312142849
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12043	NC_014654	GTTT	2	8	543515	543522	0 %	75 %	25 %	0 %	312142849
12044	NC_014654	TGC	2	6	543633	543638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312142849
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12057	NC_014654	T	6	6	544336	544341	0 %	100 %	0 %	0 %	312142850
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12106	NC_014654	AG	3	6	546474	546479	50 %	0 %	50 %	0 %	312142852
12107	NC_014654	ATG	2	6	546517	546522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142852
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12110	NC_014654	TGT	2	6	546647	546652	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312142852
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12118	NC_014654	GGTCC	2	10	546945	546954	0 %	20 %	40 %	40 %	312142852
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12120	NC_014654	A	6	6	547004	547009	100 %	0 %	0 %	0 %	312142852
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12122	NC_014654	AGA	2	6	547112	547117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142852
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12231	NC_014654	A	6	6	551693	551698	100 %	0 %	0 %	0 %	312142854
12232	NC_014654	TTA	2	6	551730	551735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142854
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12236	NC_014654	A	6	6	551889	551894	100 %	0 %	0 %	0 %	312142854
12237	NC_014654	TGA	2	6	551979	551984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142855
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12239	NC_014654	CAGAG	2	10	552062	552071	40 %	0 %	40 %	20 %	312142855
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12483	NC_014654	CAA	2	6	563213	563218	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312142863
12484	NC_014654	AAG	2	6	563271	563276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142863
12485	NC_014654	ATTT	2	8	563290	563297	25 %	75 %	0 %	0 %	312142863
12486	NC_014654	TGA	2	6	563328	563333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142863
12487	NC_014654	A	7	7	563337	563343	100 %	0 %	0 %	0 %	312142863
12488	NC_014654	AGA	2	6	563370	563375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142863
12489	NC_014654	CTG	2	6	563423	563428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312142863
12490	NC_014654	ATTAT	2	10	563429	563438	40 %	60 %	0 %	0 %	312142863
12491	NC_014654	AAT	2	6	563509	563514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142863
12492	NC_014654	AGGT	2	8	563529	563536	25 %	25 %	50 %	0 %	312142863
12493	NC_014654	CAG	2	6	563802	563807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312142864
12494	NC_014654	T	6	6	563875	563880	0 %	100 %	0 %	0 %	312142864
12495	NC_014654	CAGG	2	8	564000	564007	25 %	0 %	50 %	25 %	312142864
12496	NC_014654	TGG	2	6	564067	564072	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312142864
12497	NC_014654	TAA	2	6	564073	564078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142864
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12499	NC_014654	AAG	2	6	564151	564156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142864
12500	NC_014654	T	6	6	564215	564220	0 %	100 %	0 %	0 %	312142864

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