MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halanaerobium hydrogeniformans chromosome

Total Repeats: 60669

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11502	NC_014654	GAT	2	6	521498	521503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142832
11503	NC_014654	AGA	2	6	521515	521520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142832
11504	NC_014654	TAT	2	6	521581	521586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142832
11505	NC_014654	A	6	6	521613	521618	100 %	0 %	0 %	0 %	312142832
11506	NC_014654	GAG	2	6	521634	521639	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312142832
11507	NC_014654	TTG	2	6	521669	521674	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312142832
11508	NC_014654	ATG	2	6	521718	521723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142832
11509	NC_014654	TAA	2	6	521728	521733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142832
11510	NC_014654	GAT	2	6	521777	521782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142832
11511	NC_014654	TAG	2	6	521808	521813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142832
11512	NC_014654	GAA	2	6	521822	521827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142832
11513	NC_014654	TTTAAA	2	12	521829	521840	50 %	50 %	0 %	0 %	312142832
11514	NC_014654	T	7	7	521970	521976	0 %	100 %	0 %	0 %	312142833
11515	NC_014654	GTT	2	6	521997	522002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312142833
11516	NC_014654	TAT	2	6	522007	522012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142833
11517	NC_014654	ATCG	2	8	522104	522111	25 %	25 %	25 %	25 %	312142833
11518	NC_014654	ATC	2	6	522148	522153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312142833
11519	NC_014654	T	6	6	522155	522160	0 %	100 %	0 %	0 %	312142833
11520	NC_014654	CAG	2	6	522168	522173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312142833
11521	NC_014654	CTG	2	6	522271	522276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312142833
11522	NC_014654	T	6	6	522282	522287	0 %	100 %	0 %	0 %	312142833
11523	NC_014654	TCT	2	6	522306	522311	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312142833
11524	NC_014654	CTT	2	6	522392	522397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312142833
11525	NC_014654	AGC	2	6	522416	522421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312142833
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11527	NC_014654	T	6	6	522453	522458	0 %	100 %	0 %	0 %	312142833
11528	NC_014654	CTT	2	6	522516	522521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312142833
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11530	NC_014654	AGT	2	6	522561	522566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142833
11531	NC_014654	TCT	2	6	522569	522574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312142833
11532	NC_014654	ACC	2	6	522605	522610	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312142833
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11534	NC_014654	GGC	2	6	522634	522639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312142833
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11539	NC_014654	TTAAA	2	10	522804	522813	60 %	40 %	0 %	0 %	312142833
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11542	NC_014654	CTG	2	6	522911	522916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312142833
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11545	NC_014654	T	6	6	523115	523120	0 %	100 %	0 %	0 %	312142833
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11553	NC_014654	TTGA	2	8	523357	523364	25 %	50 %	25 %	0 %	312142833
11554	NC_014654	GAT	2	6	523365	523370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142833
11555	NC_014654	CTGT	2	8	523415	523422	0 %	50 %	25 %	25 %	312142833
11556	NC_014654	AGG	2	6	523439	523444	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312142833
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11561	NC_014654	A	7	7	523860	523866	100 %	0 %	0 %	0 %	312142834
11562	NC_014654	GCAG	2	8	523916	523923	25 %	0 %	50 %	25 %	312142834
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11591	NC_014654	CT	3	6	525202	525207	0 %	50 %	0 %	50 %	312142834
11592	NC_014654	GAT	2	6	525230	525235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142834
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11599	NC_014654	AAG	2	6	525493	525498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142834
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11608	NC_014654	GTC	2	6	525858	525863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312142834
11609	NC_014654	GTC	2	6	525880	525885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312142834
11610	NC_014654	TAA	2	6	525901	525906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142834
11611	NC_014654	AAATT	2	10	525932	525941	60 %	40 %	0 %	0 %	312142834
11612	NC_014654	A	8	8	526016	526023	100 %	0 %	0 %	0 %	312142835
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11616	NC_014654	ATTT	2	8	526245	526252	25 %	75 %	0 %	0 %	312142835
11617	NC_014654	AGA	3	9	526255	526263	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142835
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11741	NC_014654	ATG	2	6	531726	531731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142841
11742	NC_014654	CTA	2	6	531732	531737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312142841
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11847	NC_014654	AAT	2	6	535909	535914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142844
11848	NC_014654	CTGA	2	8	535949	535956	25 %	25 %	25 %	25 %	312142844
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11853	NC_014654	ATTTT	2	10	536172	536181	20 %	80 %	0 %	0 %	312142844
11854	NC_014654	TAT	2	6	536185	536190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142844
11855	NC_014654	TAT	2	6	536204	536209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142844
11856	NC_014654	CAC	2	6	536256	536261	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312142844
11857	NC_014654	TGCT	2	8	536262	536269	0 %	50 %	25 %	25 %	312142844
11858	NC_014654	TCTT	2	8	536289	536296	0 %	75 %	0 %	25 %	312142844
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