MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halanaerobium hydrogeniformans chromosome

Total Repeats: 60669

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_014654	AGA	2	6	498811	498816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142817
11002	NC_014654	AG	3	6	498818	498823	50 %	0 %	50 %	0 %	312142817
11003	NC_014654	TATC	2	8	498838	498845	25 %	50 %	0 %	25 %	312142817
11004	NC_014654	A	7	7	498893	498899	100 %	0 %	0 %	0 %	312142817
11005	NC_014654	GTT	2	6	498935	498940	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312142817
11006	NC_014654	A	6	6	499022	499027	100 %	0 %	0 %	0 %	312142817
11007	NC_014654	AATC	2	8	499053	499060	50 %	25 %	0 %	25 %	312142817
11008	NC_014654	AGA	2	6	499167	499172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142818
11009	NC_014654	ATC	2	6	499197	499202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312142818
11010	NC_014654	AGA	2	6	499208	499213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142818
11011	NC_014654	GAA	2	6	499269	499274	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142818
11012	NC_014654	A	6	6	499318	499323	100 %	0 %	0 %	0 %	312142818
11013	NC_014654	T	6	6	499331	499336	0 %	100 %	0 %	0 %	312142818
11014	NC_014654	TAT	2	6	499394	499399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142818
11015	NC_014654	TCAAG	2	10	499531	499540	40 %	20 %	20 %	20 %	312142819
11016	NC_014654	ATT	2	6	499593	499598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142819
11017	NC_014654	TTA	2	6	499599	499604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142819
11018	NC_014654	ATTT	2	8	499622	499629	25 %	75 %	0 %	0 %	312142819
11019	NC_014654	AGGG	2	8	499632	499639	25 %	0 %	75 %	0 %	312142819
11020	NC_014654	TAA	2	6	499640	499645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142819
11021	NC_014654	TTA	3	9	499658	499666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142819
11022	NC_014654	TAT	2	6	499670	499675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142819
11023	NC_014654	T	7	7	499787	499793	0 %	100 %	0 %	0 %	312142819
11024	NC_014654	TGAT	2	8	499831	499838	25 %	50 %	25 %	0 %	312142819
11025	NC_014654	TAT	2	6	499916	499921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142819
11026	NC_014654	CTTT	2	8	499969	499976	0 %	75 %	0 %	25 %	312142819
11027	NC_014654	TTA	2	6	499977	499982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142819
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11029	NC_014654	T	6	6	500015	500020	0 %	100 %	0 %	0 %	312142819
11030	NC_014654	CTTT	2	8	500148	500155	0 %	75 %	0 %	25 %	312142819
11031	NC_014654	T	7	7	500153	500159	0 %	100 %	0 %	0 %	312142819
11032	NC_014654	ACC	2	6	500181	500186	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312142819
11033	NC_014654	TGC	2	6	500234	500239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312142819
11034	NC_014654	TTA	2	6	500275	500280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142819
11035	NC_014654	T	6	6	500283	500288	0 %	100 %	0 %	0 %	312142819
11036	NC_014654	CTG	2	6	500313	500318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312142819
11037	NC_014654	T	6	6	500328	500333	0 %	100 %	0 %	0 %	312142819
11038	NC_014654	ATA	2	6	500388	500393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142819
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11040	NC_014654	TAC	2	6	500504	500509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312142819
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11042	NC_014654	TAT	2	6	500575	500580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142819
11043	NC_014654	GGA	2	6	500592	500597	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312142819
11044	NC_014654	TGG	2	6	500615	500620	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312142819
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11046	NC_014654	AT	3	6	500679	500684	50 %	50 %	0 %	0 %	312142819
11047	NC_014654	T	6	6	500815	500820	0 %	100 %	0 %	0 %	312142819
11048	NC_014654	CTTT	2	8	500907	500914	0 %	75 %	0 %	25 %	312142819
11049	NC_014654	TAT	2	6	500939	500944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142819
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11051	NC_014654	T	6	6	500989	500994	0 %	100 %	0 %	0 %	312142819
11052	NC_014654	GAA	2	6	501196	501201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142820
11053	NC_014654	GCTTTA	2	12	501236	501247	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	312142820
11054	NC_014654	ATG	2	6	501294	501299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142820
11055	NC_014654	TTG	2	6	501312	501317	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312142820
11056	NC_014654	CTG	2	6	501318	501323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312142820
11057	NC_014654	GTA	2	6	501326	501331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142820
11058	NC_014654	ATA	2	6	501414	501419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142820
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11061	NC_014654	AGA	2	6	501541	501546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142820
11062	NC_014654	TAG	2	6	501624	501629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142820
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11073	NC_014654	AAT	2	6	502031	502036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142820
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11086	NC_014654	GAT	2	6	502754	502759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142820
11087	NC_014654	GCA	2	6	502766	502771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312142820
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11091	NC_014654	TTAA	2	8	503029	503036	50 %	50 %	0 %	0 %	312142820
11092	NC_014654	T	7	7	503157	503163	0 %	100 %	0 %	0 %	312142821
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11096	NC_014654	TGCT	2	8	503237	503244	0 %	50 %	25 %	25 %	312142821
11097	NC_014654	TC	3	6	503270	503275	0 %	50 %	0 %	50 %	312142821
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11101	NC_014654	TA	3	6	503389	503394	50 %	50 %	0 %	0 %	312142821
11102	NC_014654	TCT	2	6	503397	503402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312142821
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11105	NC_014654	T	7	7	503480	503486	0 %	100 %	0 %	0 %	312142821
11106	NC_014654	TTTA	2	8	503501	503508	25 %	75 %	0 %	0 %	312142821
11107	NC_014654	TTC	2	6	503513	503518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312142821
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11109	NC_014654	CTT	2	6	503621	503626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312142821
11110	NC_014654	TAA	2	6	503720	503725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142821
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11113	NC_014654	GCCT	2	8	503780	503787	0 %	25 %	25 %	50 %	312142821
11114	NC_014654	TCT	2	6	503832	503837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312142821
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11116	NC_014654	CTA	2	6	503869	503874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312142821
11117	NC_014654	T	6	6	503875	503880	0 %	100 %	0 %	0 %	312142821
11118	NC_014654	T	6	6	503892	503897	0 %	100 %	0 %	0 %	312142821
11119	NC_014654	TAA	2	6	503906	503911	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142821
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11364	NC_014654	GAA	3	9	515304	515312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142828
11365	NC_014654	GAA	3	9	515421	515429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142828
11366	NC_014654	GGT	2	6	515475	515480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312142828
11367	NC_014654	GAA	2	6	515589	515594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142828
11368	NC_014654	ATT	2	6	515677	515682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142828
11369	NC_014654	GAATT	2	10	515761	515770	40 %	40 %	20 %	0 %	312142828
11370	NC_014654	AAAT	2	8	515771	515778	75 %	25 %	0 %	0 %	312142828
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11473	NC_014654	AAG	2	6	520507	520512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142831
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11475	NC_014654	CCTG	2	8	520563	520570	0 %	25 %	25 %	50 %	312142831
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11481	NC_014654	T	6	6	520758	520763	0 %	100 %	0 %	0 %	312142831
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