MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halanaerobium hydrogeniformans chromosome

Total Repeats: 60669

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10002	NC_014654	TAGA	2	8	450763	450770	50 %	25 %	25 %	0 %	312142771
10003	NC_014654	AGCC	2	8	450865	450872	25 %	0 %	25 %	50 %	312142771
10004	NC_014654	TAA	2	6	450889	450894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142771
10005	NC_014654	GCCG	2	8	450902	450909	0 %	0 %	50 %	50 %	312142771
10006	NC_014654	ATG	2	6	450913	450918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142771
10007	NC_014654	TAAA	2	8	451095	451102	75 %	25 %	0 %	0 %	312142772
10008	NC_014654	CAG	2	6	451132	451137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312142772
10009	NC_014654	ATT	2	6	451150	451155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142772
10010	NC_014654	A	7	7	451156	451162	100 %	0 %	0 %	0 %	312142772
10011	NC_014654	AAG	2	6	451206	451211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142772
10012	NC_014654	AGA	2	6	451225	451230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142772
10013	NC_014654	GAA	2	6	451235	451240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142772
10014	NC_014654	GAT	2	6	451256	451261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142772
10015	NC_014654	AGA	2	6	451294	451299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142772
10016	NC_014654	AGA	3	9	451324	451332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142772
10017	NC_014654	TGA	2	6	451354	451359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142772
10018	NC_014654	ATG	2	6	451365	451370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142772
10019	NC_014654	TGG	2	6	451405	451410	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312142772
10020	NC_014654	AGC	2	6	451417	451422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312142772
10021	NC_014654	TGA	2	6	451491	451496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142772
10022	NC_014654	GTGG	2	8	451514	451521	0 %	25 %	75 %	0 %	312142772
10023	NC_014654	ATC	2	6	451532	451537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312142772
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10025	NC_014654	AGA	2	6	451675	451680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142772
10026	NC_014654	TAAAGC	2	12	451843	451854	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	312142772
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10028	NC_014654	AG	3	6	451891	451896	50 %	0 %	50 %	0 %	312142772
10029	NC_014654	GAG	2	6	452081	452086	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312142772
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10033	NC_014654	A	6	6	452344	452349	100 %	0 %	0 %	0 %	312142773
10034	NC_014654	CCAGA	2	10	452396	452405	40 %	0 %	20 %	40 %	312142773
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10039	NC_014654	A	6	6	452592	452597	100 %	0 %	0 %	0 %	312142773
10040	NC_014654	GAA	2	6	452608	452613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142773
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10043	NC_014654	TCC	2	6	452694	452699	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312142773
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10045	NC_014654	AAG	2	6	452797	452802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142773
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10050	NC_014654	AAT	2	6	453017	453022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142774
10051	NC_014654	GAT	2	6	453023	453028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142774
10052	NC_014654	GCT	2	6	453044	453049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312142774
10053	NC_014654	GCT	2	6	453107	453112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312142774
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10055	NC_014654	A	6	6	453390	453395	100 %	0 %	0 %	0 %	312142774
10056	NC_014654	TGGTC	2	10	453397	453406	0 %	40 %	40 %	20 %	312142774
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10062	NC_014654	C	6	6	453699	453704	0 %	0 %	0 %	100 %	312142774
10063	NC_014654	TA	3	6	453714	453719	50 %	50 %	0 %	0 %	312142774
10064	NC_014654	A	7	7	453733	453739	100 %	0 %	0 %	0 %	312142774
10065	NC_014654	A	9	9	453765	453773	100 %	0 %	0 %	0 %	312142774
10066	NC_014654	AGAA	2	8	453810	453817	75 %	0 %	25 %	0 %	312142774
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10072	NC_014654	GAA	2	6	453935	453940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142774
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10086	NC_014654	TTAAA	2	10	454477	454486	60 %	40 %	0 %	0 %	312142775
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10093	NC_014654	ATTAA	2	10	455095	455104	60 %	40 %	0 %	0 %	312142776
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10103	NC_014654	TTG	2	6	455613	455618	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312142777
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10106	NC_014654	ATC	2	6	455735	455740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312142777
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10108	NC_014654	GCA	2	6	455777	455782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312142777
10109	NC_014654	AAT	2	6	455791	455796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142777
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10111	NC_014654	ATA	2	6	455957	455962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142777
10112	NC_014654	TGCT	2	8	456024	456031	0 %	50 %	25 %	25 %	312142777
10113	NC_014654	CTG	2	6	456131	456136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312142777
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10115	NC_014654	ATC	2	6	456272	456277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312142777
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10117	NC_014654	TC	3	6	456332	456337	0 %	50 %	0 %	50 %	312142777
10118	NC_014654	AGCC	2	8	456344	456351	25 %	0 %	25 %	50 %	312142777
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10120	NC_014654	AGGT	2	8	456511	456518	25 %	25 %	50 %	0 %	312142778
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10484	NC_014654	GAA	3	9	472610	472618	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142796
10485	NC_014654	GCA	2	6	472643	472648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312142796
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10487	NC_014654	TAGAT	2	10	472735	472744	40 %	40 %	20 %	0 %	312142796
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