MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halanaerobium hydrogeniformans chromosome

Total Repeats: 60669

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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7003	NC_014654	AGCT	2	8	316204	316211	25 %	25 %	25 %	25 %	312142645
7004	NC_014654	TCT	2	6	316238	316243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312142645
7005	NC_014654	TTA	2	6	316335	316340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142645
7006	NC_014654	ATA	2	6	316377	316382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142645
7007	NC_014654	CTTT	2	8	316464	316471	0 %	75 %	0 %	25 %	312142645
7008	NC_014654	T	6	6	316508	316513	0 %	100 %	0 %	0 %	312142645
7009	NC_014654	CTTTAT	2	12	316529	316540	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	312142645
7010	NC_014654	CTG	2	6	316541	316546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312142645
7011	NC_014654	GATAAG	2	12	316635	316646	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	312142645
7012	NC_014654	ATT	2	6	316689	316694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142645
7013	NC_014654	GA	3	6	316778	316783	50 %	0 %	50 %	0 %	312142645
7014	NC_014654	A	8	8	316786	316793	100 %	0 %	0 %	0 %	312142645
7015	NC_014654	TGT	2	6	316827	316832	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312142645
7016	NC_014654	TAT	2	6	316915	316920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142645
7017	NC_014654	TAT	2	6	316942	316947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142645
7018	NC_014654	ATTA	2	8	316976	316983	50 %	50 %	0 %	0 %	312142645
7019	NC_014654	TAA	2	6	317521	317526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142646
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7021	NC_014654	TGC	2	6	317534	317539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312142646
7022	NC_014654	ATG	2	6	317575	317580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142646
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7025	NC_014654	TTTAG	2	10	317643	317652	20 %	60 %	20 %	0 %	312142646
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7029	NC_014654	T	6	6	317816	317821	0 %	100 %	0 %	0 %	312142646
7030	NC_014654	A	7	7	317852	317858	100 %	0 %	0 %	0 %	312142646
7031	NC_014654	AGCAAA	2	12	317889	317900	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	312142646
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7033	NC_014654	AAT	2	6	317922	317927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142646
7034	NC_014654	T	6	6	318041	318046	0 %	100 %	0 %	0 %	312142646
7035	NC_014654	A	6	6	318053	318058	100 %	0 %	0 %	0 %	312142646
7036	NC_014654	ATAG	2	8	318084	318091	50 %	25 %	25 %	0 %	312142646
7037	NC_014654	TTG	2	6	318100	318105	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312142646
7038	NC_014654	T	6	6	318122	318127	0 %	100 %	0 %	0 %	312142646
7039	NC_014654	AAG	2	6	318145	318150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142646
7040	NC_014654	A	6	6	318168	318173	100 %	0 %	0 %	0 %	312142646
7041	NC_014654	CTG	2	6	318226	318231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312142646
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7044	NC_014654	GTTAGA	2	12	318251	318262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142646
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7046	NC_014654	TGA	2	6	318320	318325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142646
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7051	NC_014654	AT	3	6	318509	318514	50 %	50 %	0 %	0 %	312142647
7052	NC_014654	AAG	2	6	318518	318523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142647
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7054	NC_014654	ATG	2	6	318557	318562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142647
7055	NC_014654	TTA	2	6	318563	318568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142647
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7058	NC_014654	ATAAAA	2	12	318803	318814	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	312142647
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7060	NC_014654	AATT	2	8	318830	318837	50 %	50 %	0 %	0 %	312142647
7061	NC_014654	AAT	2	6	318841	318846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142647
7062	NC_014654	AATT	2	8	318872	318879	50 %	50 %	0 %	0 %	312142647
7063	NC_014654	GAT	2	6	318886	318891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142647
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7065	NC_014654	A	7	7	318957	318963	100 %	0 %	0 %	0 %	312142647
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7372	NC_014654	ATC	2	6	332532	332537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312142659
7373	NC_014654	TGA	2	6	332543	332548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142659
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7375	NC_014654	GCT	2	6	332616	332621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312142659
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7377	NC_014654	CTG	2	6	332827	332832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312142659
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7379	NC_014654	GAT	2	6	332919	332924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142659
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7383	NC_014654	CAT	2	6	333029	333034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312142659
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7403	NC_014654	A	6	6	333891	333896	100 %	0 %	0 %	0 %	312142659
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7407	NC_014654	AGCT	2	8	334102	334109	25 %	25 %	25 %	25 %	312142659
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7411	NC_014654	ATAG	2	8	334275	334282	50 %	25 %	25 %	0 %	312142659
7412	NC_014654	TGA	2	6	334285	334290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142659
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7427	NC_014654	ATG	2	6	334929	334934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142660
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7431	NC_014654	CATGAA	2	12	335009	335020	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	312142660
7432	NC_014654	CATGAA	2	12	335042	335053	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	312142660
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7472	NC_014654	TA	3	6	336462	336467	50 %	50 %	0 %	0 %	312142661
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7478	NC_014654	CTTT	2	8	336634	336641	0 %	75 %	0 %	25 %	312142662
7479	NC_014654	GCT	2	6	336742	336747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312142662
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7482	NC_014654	TGC	2	6	336813	336818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312142662
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7484	NC_014654	AAG	2	6	336858	336863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142662
7485	NC_014654	TATT	2	8	336880	336887	25 %	75 %	0 %	0 %	312142662
7486	NC_014654	TTGG	2	8	336901	336908	0 %	50 %	50 %	0 %	312142662
7487	NC_014654	TAT	2	6	336924	336929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142662
7488	NC_014654	TAA	3	9	336944	336952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142662
7489	NC_014654	ATT	2	6	336958	336963	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142662
7490	NC_014654	TTA	2	6	336972	336977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142662
7491	NC_014654	T	6	6	336981	336986	0 %	100 %	0 %	0 %	312142662
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