MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halanaerobium hydrogeniformans chromosome

Total Repeats: 60669

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_014654	TCA	2	6	245710	245715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312142602
5502	NC_014654	TGC	2	6	245737	245742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312142602
5503	NC_014654	GCA	2	6	245751	245756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312142602
5504	NC_014654	AGA	2	6	245786	245791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142602
5505	NC_014654	CTG	2	6	245818	245823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312142602
5506	NC_014654	AAT	2	6	245885	245890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142602
5507	NC_014654	A	6	6	245921	245926	100 %	0 %	0 %	0 %	312142603
5508	NC_014654	AGA	2	6	245939	245944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142603
5509	NC_014654	A	6	6	245949	245954	100 %	0 %	0 %	0 %	312142603
5510	NC_014654	AGTT	2	8	245959	245966	25 %	50 %	25 %	0 %	312142603
5511	NC_014654	GA	3	6	246007	246012	50 %	0 %	50 %	0 %	312142603
5512	NC_014654	A	6	6	246065	246070	100 %	0 %	0 %	0 %	312142603
5513	NC_014654	T	6	6	246088	246093	0 %	100 %	0 %	0 %	312142603
5514	NC_014654	TAA	2	6	246245	246250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142604
5515	NC_014654	AGC	3	9	246291	246299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312142604
5516	NC_014654	TGA	2	6	246324	246329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142604
5517	NC_014654	GGT	2	6	246343	246348	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312142604
5518	NC_014654	ATT	2	6	246351	246356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142604
5519	NC_014654	T	6	6	246373	246378	0 %	100 %	0 %	0 %	312142604
5520	NC_014654	ACA	2	6	246387	246392	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312142604
5521	NC_014654	AG	5	10	246400	246409	50 %	0 %	50 %	0 %	312142604
5522	NC_014654	AGA	2	6	246444	246449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142604
5523	NC_014654	ATT	2	6	246539	246544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142604
5524	NC_014654	ATT	2	6	246556	246561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142604
5525	NC_014654	GCA	2	6	246565	246570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312142604
5526	NC_014654	A	6	6	246581	246586	100 %	0 %	0 %	0 %	312142604
5527	NC_014654	CTGG	2	8	246599	246606	0 %	25 %	50 %	25 %	312142604
5528	NC_014654	ATG	2	6	246646	246651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142604
5529	NC_014654	GTA	2	6	246715	246720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142604
5530	NC_014654	GGT	2	6	246759	246764	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312142604
5531	NC_014654	TGG	2	6	246783	246788	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312142604
5532	NC_014654	A	6	6	246871	246876	100 %	0 %	0 %	0 %	312142604
5533	NC_014654	GCA	2	6	246915	246920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312142604
5534	NC_014654	GTCT	2	8	246958	246965	0 %	50 %	25 %	25 %	312142604
5535	NC_014654	CTGT	2	8	247046	247053	0 %	50 %	25 %	25 %	312142604
5536	NC_014654	TGC	2	6	247089	247094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312142604
5537	NC_014654	AGA	2	6	247113	247118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142604
5538	NC_014654	TGC	2	6	247125	247130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312142604
5539	NC_014654	AGC	2	6	247149	247154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312142604
5540	NC_014654	AGA	2	6	247233	247238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142604
5541	NC_014654	GCTT	2	8	247322	247329	0 %	50 %	25 %	25 %	312142604
5542	NC_014654	A	6	6	247330	247335	100 %	0 %	0 %	0 %	312142604
5543	NC_014654	GGT	2	6	247374	247379	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312142604
5544	NC_014654	A	6	6	247385	247390	100 %	0 %	0 %	0 %	312142604
5545	NC_014654	GTA	2	6	247399	247404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142604
5546	NC_014654	TGT	2	6	247407	247412	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312142604
5547	NC_014654	CCAGG	2	10	247558	247567	20 %	0 %	40 %	40 %	312142604
5548	NC_014654	TAGA	2	8	247670	247677	50 %	25 %	25 %	0 %	312142604
5549	NC_014654	AAAT	2	8	247727	247734	75 %	25 %	0 %	0 %	312142604
5550	NC_014654	T	6	6	247792	247797	0 %	100 %	0 %	0 %	312142604
5551	NC_014654	A	6	6	247884	247889	100 %	0 %	0 %	0 %	312142605
5552	NC_014654	A	6	6	247902	247907	100 %	0 %	0 %	0 %	312142605
5553	NC_014654	GAT	2	6	247908	247913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142605
5554	NC_014654	GAT	2	6	247919	247924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142605
5555	NC_014654	GAG	2	6	247938	247943	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312142605
5556	NC_014654	GA	3	6	247954	247959	50 %	0 %	50 %	0 %	312142605
5557	NC_014654	TCA	2	6	247973	247978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312142605
5558	NC_014654	TGA	2	6	247994	247999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142605
5559	NC_014654	GGGAT	2	10	248022	248031	20 %	20 %	60 %	0 %	312142605
5560	NC_014654	TTA	2	6	248059	248064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142605
5561	NC_014654	AGA	2	6	248078	248083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142605
5562	NC_014654	AGC	2	6	248093	248098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312142605
5563	NC_014654	TGA	2	6	248099	248104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142605
5564	NC_014654	ATG	2	6	248164	248169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142605
5565	NC_014654	TAA	2	6	248174	248179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142605
5566	NC_014654	A	6	6	248188	248193	100 %	0 %	0 %	0 %	312142605
5567	NC_014654	A	6	6	248225	248230	100 %	0 %	0 %	0 %	312142606
5568	NC_014654	ATG	2	6	248232	248237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142606
5569	NC_014654	TAA	2	6	248238	248243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142606
5570	NC_014654	A	7	7	248292	248298	100 %	0 %	0 %	0 %	312142606
5571	NC_014654	AGTTTT	2	12	248305	248316	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	312142606
5572	NC_014654	AGA	2	6	248323	248328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142606
5573	NC_014654	GGT	2	6	248339	248344	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312142606
5574	NC_014654	GGGGT	2	10	248358	248367	0 %	20 %	80 %	0 %	312142606
5575	NC_014654	AGA	2	6	248389	248394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142606
5576	NC_014654	TATG	2	8	248407	248414	25 %	50 %	25 %	0 %	312142606
5577	NC_014654	ATA	2	6	248421	248426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142606
5578	NC_014654	ATC	2	6	248469	248474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312142606
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5581	NC_014654	A	6	6	248546	248551	100 %	0 %	0 %	0 %	312142606
5582	NC_014654	A	7	7	248591	248597	100 %	0 %	0 %	0 %	312142606
5583	NC_014654	AT	3	6	248605	248610	50 %	50 %	0 %	0 %	312142606
5584	NC_014654	TGA	2	6	248614	248619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142606
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5587	NC_014654	TTA	2	6	248718	248723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142606
5588	NC_014654	GAA	2	6	248729	248734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142606
5589	NC_014654	TTA	2	6	248794	248799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142606
5590	NC_014654	AGC	2	6	248801	248806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312142606
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5592	NC_014654	GAT	2	6	248932	248937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142606
5593	NC_014654	TGG	2	6	248995	249000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312142606
5594	NC_014654	A	6	6	249033	249038	100 %	0 %	0 %	0 %	312142606
5595	NC_014654	AGAA	2	8	249052	249059	75 %	0 %	25 %	0 %	312142606
5596	NC_014654	ATT	2	6	249090	249095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142606
5597	NC_014654	AAGTA	2	10	249175	249184	60 %	20 %	20 %	0 %	312142606
5598	NC_014654	TTTA	2	8	249201	249208	25 %	75 %	0 %	0 %	312142606
5599	NC_014654	GAA	3	9	249281	249289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142606
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5602	NC_014654	GGTT	2	8	249419	249426	0 %	50 %	50 %	0 %	312142607
5603	NC_014654	CAG	2	6	249428	249433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312142607
5604	NC_014654	GGT	2	6	249434	249439	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312142607
5605	NC_014654	TGG	2	6	249464	249469	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312142607
5606	NC_014654	AAC	2	6	249470	249475	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312142607
5607	NC_014654	GAT	2	6	249510	249515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142607
5608	NC_014654	ATTT	2	8	249533	249540	25 %	75 %	0 %	0 %	312142607
5609	NC_014654	A	6	6	249544	249549	100 %	0 %	0 %	0 %	312142607
5610	NC_014654	AGA	2	6	249551	249556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142607
5611	NC_014654	TAAA	2	8	249562	249569	75 %	25 %	0 %	0 %	312142607
5612	NC_014654	TTC	2	6	249660	249665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312142607
5613	NC_014654	GCT	2	6	249725	249730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312142607
5614	NC_014654	TTA	2	6	249751	249756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142607
5615	NC_014654	A	6	6	250002	250007	100 %	0 %	0 %	0 %	312142608
5616	NC_014654	T	6	6	250036	250041	0 %	100 %	0 %	0 %	312142608
5617	NC_014654	CAG	2	6	250048	250053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312142608
5618	NC_014654	TGG	2	6	250097	250102	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312142608
5619	NC_014654	GAT	2	6	250146	250151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142608
5620	NC_014654	CTGATT	2	12	250192	250203	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	312142608
5621	NC_014654	GAT	2	6	250221	250226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142608
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5623	NC_014654	TCT	2	6	250263	250268	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312142608
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5996	NC_014654	AAT	2	6	268597	268602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142618
5997	NC_014654	TTG	2	6	268750	268755	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312142618
5998	NC_014654	TTC	2	6	268787	268792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312142618
5999	NC_014654	T	6	6	268798	268803	0 %	100 %	0 %	0 %	312142618
6000	NC_014654	ACC	2	6	268820	268825	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312142618

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