MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Helicobacter pylori PeCan4 chromosome

Total Repeats: 30050

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014555	GAGC	2	8	28	35	25 %	0 %	50 %	25 %	308182189
2	NC_014555	CATT	2	8	114	121	25 %	50 %	0 %	25 %	308182189
3	NC_014555	GAT	3	9	122	130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308182189
4	NC_014555	TG	3	6	138	143	0 %	50 %	50 %	0 %	308182189
5	NC_014555	TTCT	2	8	259	266	0 %	75 %	0 %	25 %	308182189
6	NC_014555	GTT	2	6	305	310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308182189
7	NC_014555	T	7	7	318	324	0 %	100 %	0 %	0 %	308182189
8	NC_014555	T	7	7	346	352	0 %	100 %	0 %	0 %	308182189
9	NC_014555	TTC	2	6	356	361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308182189
10	NC_014555	ACA	2	6	382	387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308182189
11	NC_014555	C	6	6	400	405	0 %	0 %	0 %	100 %	308182189
12	NC_014555	AAT	2	6	457	462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308182190
13	NC_014555	C	6	6	642	647	0 %	0 %	0 %	100 %	308182190
14	NC_014555	CT	3	6	691	696	0 %	50 %	0 %	50 %	308182190
15	NC_014555	CTT	2	6	800	805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308182190
16	NC_014555	TCTG	2	8	810	817	0 %	50 %	25 %	25 %	308182190
17	NC_014555	TGA	2	6	818	823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308182190
18	NC_014555	AAAT	2	8	912	919	75 %	25 %	0 %	0 %	308182191
19	NC_014555	GCC	2	6	1048	1053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308182191
20	NC_014555	ACT	2	6	1189	1194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308182191
21	NC_014555	GCT	2	6	1212	1217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308182191
22	NC_014555	CA	3	6	1226	1231	50 %	0 %	0 %	50 %	308182191
23	NC_014555	TC	3	6	1285	1290	0 %	50 %	0 %	50 %	308182191
24	NC_014555	T	6	6	1347	1352	0 %	100 %	0 %	0 %	308182191
25	NC_014555	GGC	2	6	1403	1408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308182191
26	NC_014555	GCTT	2	8	1455	1462	0 %	50 %	25 %	25 %	308182191
27	NC_014555	CT	3	6	1561	1566	0 %	50 %	0 %	50 %	308182191
28	NC_014555	TAAAA	2	10	1601	1610	80 %	20 %	0 %	0 %	308182191
29	NC_014555	GTT	2	6	1623	1628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308182191
30	NC_014555	CTT	2	6	1657	1662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308182191
31	NC_014555	T	6	6	1717	1722	0 %	100 %	0 %	0 %	308182191
32	NC_014555	TTC	2	6	1762	1767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308182192
33	NC_014555	A	7	7	1777	1783	100 %	0 %	0 %	0 %	308182192
34	NC_014555	ATTATA	2	12	1795	1806	50 %	50 %	0 %	0 %	308182192
35	NC_014555	CCTG	2	8	1810	1817	0 %	25 %	25 %	50 %	308182192
36	NC_014555	CCAA	2	8	1834	1841	50 %	0 %	0 %	50 %	308182192
37	NC_014555	CAC	2	6	1861	1866	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308182192
38	NC_014555	TCTT	2	8	1867	1874	0 %	75 %	0 %	25 %	308182192
39	NC_014555	GTT	2	6	1897	1902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308182192
40	NC_014555	T	6	6	1976	1981	0 %	100 %	0 %	0 %	308182192
41	NC_014555	CTT	2	6	1986	1991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308182192
42	NC_014555	TGG	2	6	2043	2048	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308182192
43	NC_014555	TCA	2	6	2051	2056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308182192
44	NC_014555	TTAA	2	8	2057	2064	50 %	50 %	0 %	0 %	308182192
45	NC_014555	AAT	2	6	2104	2109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308182192
46	NC_014555	TAG	2	6	2157	2162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308182192
47	NC_014555	G	6	6	2189	2194	0 %	0 %	100 %	0 %	308182192
48	NC_014555	ATTC	2	8	2349	2356	25 %	50 %	0 %	25 %	308182192
49	NC_014555	A	8	8	2540	2547	100 %	0 %	0 %	0 %	308182193
50	NC_014555	T	7	7	2636	2642	0 %	100 %	0 %	0 %	308182193
51	NC_014555	T	7	7	2678	2684	0 %	100 %	0 %	0 %	308182193
52	NC_014555	AGC	2	6	2776	2781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308182193
53	NC_014555	GC	3	6	2789	2794	0 %	0 %	50 %	50 %	308182193
54	NC_014555	A	6	6	2827	2832	100 %	0 %	0 %	0 %	308182193
55	NC_014555	AG	3	6	2946	2951	50 %	0 %	50 %	0 %	308182193
56	NC_014555	GTG	2	6	2965	2970	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308182193
57	NC_014555	T	6	6	3018	3023	0 %	100 %	0 %	0 %	308182193
58	NC_014555	AGA	2	6	3063	3068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308182193
59	NC_014555	CAAA	2	8	3099	3106	75 %	0 %	0 %	25 %	308182193
60	NC_014555	GTG	2	6	3124	3129	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308182193
61	NC_014555	GCC	2	6	3131	3136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308182193
62	NC_014555	GAAA	2	8	3246	3253	75 %	0 %	25 %	0 %	308182194
63	NC_014555	GAAA	2	8	3321	3328	75 %	0 %	25 %	0 %	308182194
64	NC_014555	TG	3	6	3428	3433	0 %	50 %	50 %	0 %	308182194
65	NC_014555	GTT	2	6	3577	3582	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308182194
66	NC_014555	CTA	2	6	3617	3622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308182194
67	NC_014555	A	6	6	3637	3642	100 %	0 %	0 %	0 %	308182194
68	NC_014555	ATC	2	6	3661	3666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308182194
69	NC_014555	GC	3	6	3721	3726	0 %	0 %	50 %	50 %	308182194
70	NC_014555	CAAG	2	8	3822	3829	50 %	0 %	25 %	25 %	308182194
71	NC_014555	A	6	6	3865	3870	100 %	0 %	0 %	0 %	308182194
72	NC_014555	ATT	2	6	3905	3910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308182194
73	NC_014555	GGC	2	6	3978	3983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308182194
74	NC_014555	T	15	15	7147	7161	0 %	100 %	0 %	0 %	308182195
75	NC_014555	T	6	6	7192	7197	0 %	100 %	0 %	0 %	308182195
76	NC_014555	GTTT	2	8	7202	7209	0 %	75 %	25 %	0 %	308182195
77	NC_014555	GGT	2	6	7211	7216	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308182195
78	NC_014555	TTTTA	2	10	7235	7244	20 %	80 %	0 %	0 %	308182195
79	NC_014555	CAT	2	6	7385	7390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308182196
80	NC_014555	GCC	2	6	7391	7396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308182196
81	NC_014555	TCT	2	6	7452	7457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308182196
82	NC_014555	GAAACC	2	12	7500	7511	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	308182196
83	NC_014555	AAT	2	6	7550	7555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308182196
84	NC_014555	CTT	2	6	7558	7563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308182196
85	NC_014555	TTCA	2	8	7628	7635	25 %	50 %	0 %	25 %	308182196
86	NC_014555	CAT	2	6	7648	7653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308182196
87	NC_014555	GC	3	6	7695	7700	0 %	0 %	50 %	50 %	308182196
88	NC_014555	ATG	2	6	7701	7706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308182196
89	NC_014555	TCA	2	6	7725	7730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308182196
90	NC_014555	CCG	2	6	7779	7784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308182196
91	NC_014555	CTT	2	6	7798	7803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308182196
92	NC_014555	CCG	2	6	7807	7812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308182196
93	NC_014555	T	6	6	7847	7852	0 %	100 %	0 %	0 %	308182196
94	NC_014555	AG	3	6	7907	7912	50 %	0 %	50 %	0 %	308182196
95	NC_014555	GTG	2	6	8034	8039	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308182196
96	NC_014555	TTC	2	6	8114	8119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308182196
97	NC_014555	CCG	2	6	8133	8138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308182196
98	NC_014555	TTTCT	2	10	8164	8173	0 %	80 %	0 %	20 %	308182196
99	NC_014555	CAC	2	6	8234	8239	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308182196
100	NC_014555	GAT	2	6	8276	8281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308182196
101	NC_014555	T	6	6	8308	8313	0 %	100 %	0 %	0 %	308182196
102	NC_014555	TAG	2	6	8315	8320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308182196
103	NC_014555	GGA	2	6	8323	8328	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	308182196
104	NC_014555	T	7	7	8347	8353	0 %	100 %	0 %	0 %	308182196
105	NC_014555	CGTT	2	8	8404	8411	0 %	50 %	25 %	25 %	308182196
106	NC_014555	GA	3	6	8424	8429	50 %	0 %	50 %	0 %	308182196
107	NC_014555	ACA	2	6	8457	8462	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308182196
108	NC_014555	TCT	2	6	8598	8603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308182196
109	NC_014555	T	6	6	8615	8620	0 %	100 %	0 %	0 %	308182196
110	NC_014555	T	6	6	8627	8632	0 %	100 %	0 %	0 %	308182196
111	NC_014555	CTT	2	6	8719	8724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308182196
112	NC_014555	AAGC	2	8	8737	8744	50 %	0 %	25 %	25 %	308182196
113	NC_014555	GCA	2	6	8772	8777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308182196
114	NC_014555	CTT	2	6	8797	8802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308182196
115	NC_014555	T	6	6	8899	8904	0 %	100 %	0 %	0 %	308182196
116	NC_014555	T	6	6	9053	9058	0 %	100 %	0 %	0 %	308182197
117	NC_014555	CATGTT	2	12	9091	9102	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	308182197
118	NC_014555	TG	3	6	9119	9124	0 %	50 %	50 %	0 %	308182197
119	NC_014555	ACA	2	6	9125	9130	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308182197
120	NC_014555	TCT	2	6	9159	9164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308182197
121	NC_014555	CTT	2	6	9241	9246	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308182197
122	NC_014555	GAT	3	9	9329	9337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308182197
123	NC_014555	TCT	2	6	9357	9362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308182197
124	NC_014555	CTA	2	6	9373	9378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308182197
125	NC_014555	TTG	2	6	9800	9805	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308182198
126	NC_014555	GAA	2	6	9816	9821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308182198
127	NC_014555	TCAA	2	8	9841	9848	50 %	25 %	0 %	25 %	308182198
128	NC_014555	TAT	2	6	9996	10001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308182198
129	NC_014555	AGA	2	6	10010	10015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308182198
130	NC_014555	ACC	2	6	10018	10023	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308182198
131	NC_014555	AAG	2	6	10051	10056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308182198
132	NC_014555	T	8	8	10074	10081	0 %	100 %	0 %	0 %	308182198
133	NC_014555	ATT	2	6	10084	10089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308182198
134	NC_014555	A	6	6	10093	10098	100 %	0 %	0 %	0 %	308182198
135	NC_014555	AG	3	6	10112	10117	50 %	0 %	50 %	0 %	308182198
136	NC_014555	CAT	2	6	10265	10270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308182198
137	NC_014555	GTG	2	6	10299	10304	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308182198
138	NC_014555	A	6	6	10548	10553	100 %	0 %	0 %	0 %	308182198
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271	NC_014555	G	6	6	16971	16976	0 %	0 %	100 %	0 %	308182204
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277	NC_014555	CGG	2	6	17257	17262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308182204
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