MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halomonas elongata DSM 2581 chromosome

Total Repeats: 81984

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014532	TCGC	2	8	231	238	0 %	25 %	25 %	50 %	307543590
2	NC_014532	CAG	2	6	285	290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543590
3	NC_014532	AGG	2	6	325	330	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307543590
4	NC_014532	CTG	2	6	351	356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543590
5	NC_014532	GCC	2	6	443	448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543590
6	NC_014532	GGT	2	6	452	457	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307543590
7	NC_014532	GCTCCC	2	12	483	494	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	307543590
8	NC_014532	CGCC	2	8	538	545	0 %	0 %	25 %	75 %	307543590
9	NC_014532	CGC	3	9	553	561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543590
10	NC_014532	AGGCG	2	10	608	617	20 %	0 %	60 %	20 %	307543590
11	NC_014532	CAG	2	6	618	623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543590
12	NC_014532	CGT	2	6	624	629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543590
13	NC_014532	CCAGGT	2	12	644	655	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	307543590
14	NC_014532	TCG	2	6	712	717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543590
15	NC_014532	CCAA	2	8	727	734	50 %	0 %	0 %	50 %	307543590
16	NC_014532	GGC	2	6	804	809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543590
17	NC_014532	ATGC	2	8	834	841	25 %	25 %	25 %	25 %	307543590
18	NC_014532	CGC	2	6	864	869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543590
19	NC_014532	GTG	2	6	882	887	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307543590
20	NC_014532	TCG	2	6	907	912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543590
21	NC_014532	CGA	2	6	992	997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543590
22	NC_014532	TTC	2	6	1005	1010	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307543590
23	NC_014532	TTC	2	6	1038	1043	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307543590
24	NC_014532	CAG	2	6	1074	1079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543590
25	NC_014532	GCC	2	6	1175	1180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543590
26	NC_014532	TGA	2	6	1207	1212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307543590
27	NC_014532	ATG	2	6	1246	1251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307543590
28	NC_014532	CTT	2	6	1256	1261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307543590
29	NC_014532	AGA	2	6	1270	1275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307543590
30	NC_014532	GAA	2	6	1310	1315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307543590
31	NC_014532	CTG	2	6	1386	1391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543590
32	NC_014532	TAC	2	6	1446	1451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307543590
33	NC_014532	TGT	2	6	1471	1476	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307543590
34	NC_014532	CGG	2	6	1577	1582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543590
35	NC_014532	CAC	2	6	1592	1597	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307543590
36	NC_014532	TGCA	2	8	1603	1610	25 %	25 %	25 %	25 %	307543590
37	NC_014532	CTG	2	6	1680	1685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543590
38	NC_014532	GCT	2	6	1792	1797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543591
39	NC_014532	GTG	2	6	1823	1828	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307543591
40	NC_014532	GCG	2	6	1831	1836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543591
41	NC_014532	GCCA	2	8	1940	1947	25 %	0 %	25 %	50 %	307543591
42	NC_014532	GGA	2	6	2041	2046	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307543591
43	NC_014532	AGC	2	6	2135	2140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543591
44	NC_014532	CG	3	6	2157	2162	0 %	0 %	50 %	50 %	307543591
45	NC_014532	CCT	2	6	2190	2195	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307543591
46	NC_014532	GCA	2	6	2206	2211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543591
47	NC_014532	TGC	2	6	2238	2243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543591
48	NC_014532	CTG	2	6	2313	2318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543591
49	NC_014532	TCGT	2	8	2376	2383	0 %	50 %	25 %	25 %	307543591
50	NC_014532	CTTCAC	2	12	2455	2466	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	307543591
51	NC_014532	TGG	2	6	2475	2480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307543591
52	NC_014532	CAA	2	6	2650	2655	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307543591
53	NC_014532	AGG	3	9	2664	2672	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307543591
54	NC_014532	GAG	2	6	2675	2680	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307543591
55	NC_014532	GGCC	2	8	2703	2710	0 %	0 %	50 %	50 %	307543591
56	NC_014532	CAG	2	6	2800	2805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543591
57	NC_014532	GAG	2	6	2816	2821	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307543591
58	NC_014532	GTC	2	6	2846	2851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543591
59	NC_014532	GAA	2	6	3128	3133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307543592
60	NC_014532	GCC	2	6	3169	3174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543592
61	NC_014532	GCGT	2	8	3186	3193	0 %	25 %	50 %	25 %	307543592
62	NC_014532	GA	3	6	3236	3241	50 %	0 %	50 %	0 %	307543592
63	NC_014532	TGG	2	6	3261	3266	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307543592
64	NC_014532	CCT	2	6	3307	3312	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307543592
65	NC_014532	CGG	2	6	3324	3329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543592
66	NC_014532	CTC	2	6	3428	3433	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307543592
67	NC_014532	GGGAAC	2	12	3471	3482	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	307543592
68	NC_014532	TTGCC	2	10	3573	3582	0 %	40 %	20 %	40 %	307543592
69	NC_014532	GAGCA	2	10	3644	3653	40 %	0 %	40 %	20 %	307543592
70	NC_014532	GCGG	2	8	3697	3704	0 %	0 %	75 %	25 %	307543592
71	NC_014532	CAG	2	6	3758	3763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543592
72	NC_014532	TGG	2	6	3768	3773	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307543592
73	NC_014532	CTG	2	6	3803	3808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543592
74	NC_014532	GAT	2	6	3845	3850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307543592
75	NC_014532	GCCG	2	8	3853	3860	0 %	0 %	50 %	50 %	307543592
76	NC_014532	TCT	2	6	3885	3890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307543592
77	NC_014532	GGGGCA	2	12	4012	4023	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	307543592
78	NC_014532	GCT	2	6	4024	4029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543592
79	NC_014532	GACA	2	8	4037	4044	50 %	0 %	25 %	25 %	307543592
80	NC_014532	ATG	2	6	4051	4056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307543592
81	NC_014532	TCA	2	6	4087	4092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307543593
82	NC_014532	CAC	2	6	4177	4182	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307543593
83	NC_014532	TGG	2	6	4196	4201	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307543593
84	NC_014532	GTG	2	6	4249	4254	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307543593
85	NC_014532	GCC	2	6	4336	4341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543593
86	NC_014532	CGG	2	6	4368	4373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543593
87	NC_014532	CGA	2	6	4380	4385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543593
88	NC_014532	GGCGTC	2	12	4417	4428	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	307543593
89	NC_014532	GGT	2	6	4431	4436	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307543593
90	NC_014532	GAG	2	6	4450	4455	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307543593
91	NC_014532	GGC	2	6	4472	4477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543593
92	NC_014532	CAC	2	6	4542	4547	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307543593
93	NC_014532	CGTC	2	8	4576	4583	0 %	25 %	25 %	50 %	307543593
94	NC_014532	CGA	2	6	4683	4688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543593
95	NC_014532	GGC	2	6	4723	4728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543593
96	NC_014532	TCG	2	6	4739	4744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543593
97	NC_014532	CAA	2	6	4758	4763	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307543593
98	NC_014532	TCT	2	6	4862	4867	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307543593
99	NC_014532	CAA	2	6	4875	4880	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307543593
100	NC_014532	GAA	2	6	4974	4979	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307543593
101	NC_014532	GAT	2	6	5002	5007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307543593
102	NC_014532	ATC	2	6	5029	5034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307543593
103	NC_014532	TCC	2	6	5089	5094	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307543593
104	NC_014532	CGAA	2	8	5159	5166	50 %	0 %	25 %	25 %	307543593
105	NC_014532	CAA	2	6	5181	5186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307543593
106	NC_014532	GCC	2	6	5197	5202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543593
107	NC_014532	GC	3	6	5227	5232	0 %	0 %	50 %	50 %	307543593
108	NC_014532	GC	3	6	5252	5257	0 %	0 %	50 %	50 %	307543593
109	NC_014532	GGT	2	6	5350	5355	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307543593
110	NC_014532	TCG	2	6	5376	5381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543593
111	NC_014532	GC	3	6	5431	5436	0 %	0 %	50 %	50 %	307543593
112	NC_014532	GTC	2	6	5451	5456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543593
113	NC_014532	TCGG	2	8	5498	5505	0 %	25 %	50 %	25 %	307543593
114	NC_014532	GAA	2	6	5506	5511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307543593
115	NC_014532	ATC	3	9	5542	5550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307543593
116	NC_014532	TGC	2	6	5591	5596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543593
117	NC_014532	CTT	3	9	5601	5609	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307543593
118	NC_014532	CGAG	2	8	5631	5638	25 %	0 %	50 %	25 %	307543593
119	NC_014532	GCC	2	6	5658	5663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543593
120	NC_014532	ACC	2	6	5734	5739	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307543593
121	NC_014532	GCC	2	6	5899	5904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543593
122	NC_014532	GAG	2	6	5917	5922	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307543593
123	NC_014532	GATG	2	8	5976	5983	25 %	25 %	50 %	0 %	307543593
124	NC_014532	GAG	2	6	6028	6033	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307543593
125	NC_014532	AGCG	2	8	6037	6044	25 %	0 %	50 %	25 %	307543593
126	NC_014532	GCCG	2	8	6057	6064	0 %	0 %	50 %	50 %	307543593
127	NC_014532	TTC	2	6	6115	6120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307543593
128	NC_014532	GAA	2	6	6210	6215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307543593
129	NC_014532	TGA	2	6	6251	6256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307543593
130	NC_014532	TCCA	2	8	6277	6284	25 %	25 %	0 %	50 %	307543593
131	NC_014532	ACC	2	6	6331	6336	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307543593
132	NC_014532	CGC	2	6	6352	6357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543593
133	NC_014532	TGC	2	6	6359	6364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543593
134	NC_014532	GGC	2	6	6387	6392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543593
135	NC_014532	ATG	2	6	6397	6402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307543593
136	NC_014532	CGT	2	6	6436	6441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543593
137	NC_014532	TGG	2	6	6464	6469	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307543593
138	NC_014532	GAGG	2	8	6684	6691	25 %	0 %	75 %	0 %	307543594
139	NC_014532	AGC	2	6	6696	6701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543594
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141	NC_014532	GAC	2	6	6808	6813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543594
142	NC_014532	CGCC	2	8	6826	6833	0 %	0 %	25 %	75 %	307543594
143	NC_014532	GA	3	6	6875	6880	50 %	0 %	50 %	0 %	307543594
144	NC_014532	CGG	2	6	6994	6999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543594
145	NC_014532	GATT	2	8	7074	7081	25 %	50 %	25 %	0 %	307543594
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147	NC_014532	TGA	2	6	7195	7200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307543594
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150	NC_014532	CTT	2	6	7544	7549	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307543595
151	NC_014532	AAC	2	6	7585	7590	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307543595
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153	NC_014532	TCT	2	6	7775	7780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307543595
154	NC_014532	CGA	2	6	7823	7828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543595
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159	NC_014532	CTT	2	6	8028	8033	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307543595
160	NC_014532	GATGG	2	10	8052	8061	20 %	20 %	60 %	0 %	307543595
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165	NC_014532	AGT	2	6	8488	8493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307543595
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168	NC_014532	CGG	2	6	8769	8774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543596
169	NC_014532	GTT	2	6	8905	8910	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307543596
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172	NC_014532	GGC	2	6	8990	8995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543596
173	NC_014532	TTCCTG	2	12	9009	9020	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	307543596
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177	NC_014532	CGA	2	6	9273	9278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543596
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250	NC_014532	GGGCA	2	10	12917	12926	20 %	0 %	60 %	20 %	307543598
251	NC_014532	CGA	2	6	12940	12945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543598
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258	NC_014532	AGGG	2	8	13113	13120	25 %	0 %	75 %	0 %	307543598
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385	NC_014532	CGG	2	6	18871	18876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543604
386	NC_014532	GCAT	2	8	18894	18901	25 %	25 %	25 %	25 %	307543604
387	NC_014532	G	7	7	18923	18929	0 %	0 %	100 %	0 %	307543604
388	NC_014532	AGGCG	2	10	18934	18943	20 %	0 %	60 %	20 %	307543604
389	NC_014532	CTCGT	2	10	18948	18957	0 %	40 %	20 %	40 %	307543604
390	NC_014532	CGG	2	6	19009	19014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543604
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402	NC_014532	GC	3	6	19584	19589	0 %	0 %	50 %	50 %	307543604
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412	NC_014532	GCT	2	6	20230	20235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543605
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455	NC_014532	GCAA	2	8	22836	22843	50 %	0 %	25 %	25 %	307543606
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465	NC_014532	CACT	2	8	23132	23139	25 %	25 %	0 %	50 %	307543607
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495	NC_014532	CGGCT	2	10	24404	24413	0 %	20 %	40 %	40 %	307543608
496	NC_014532	TCG	2	6	24425	24430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543608
497	NC_014532	TCGG	2	8	24464	24471	0 %	25 %	50 %	25 %	307543608
498	NC_014532	GCA	2	6	24523	24528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543608
499	NC_014532	CAC	2	6	24541	24546	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307543608
500	NC_014532	GCC	2	6	24590	24595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543608

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