MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halomonas elongata DSM 2581 chromosome

Total Repeats: 81984

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_014532	CTT	2	6	146430	146435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307543715
3002	NC_014532	TTC	2	6	146452	146457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307543715
3003	NC_014532	CGA	2	6	146463	146468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543715
3004	NC_014532	ACCG	2	8	146536	146543	25 %	0 %	25 %	50 %	307543715
3005	NC_014532	GGC	2	6	146554	146559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543715
3006	NC_014532	CCG	2	6	146605	146610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543715
3007	NC_014532	GCA	2	6	146645	146650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543715
3008	NC_014532	GAA	2	6	146745	146750	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307543715
3009	NC_014532	CGA	2	6	146754	146759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543715
3010	NC_014532	GTG	2	6	146779	146784	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307543715
3011	NC_014532	GGT	2	6	146835	146840	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307543715
3012	NC_014532	CCA	2	6	146868	146873	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307543715
3013	NC_014532	TC	3	6	146925	146930	0 %	50 %	0 %	50 %	307543715
3014	NC_014532	TAC	2	6	146944	146949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307543715
3015	NC_014532	CGG	2	6	146952	146957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543715
3016	NC_014532	GC	3	6	147064	147069	0 %	0 %	50 %	50 %	307543715
3017	NC_014532	ATCC	2	8	147214	147221	25 %	25 %	0 %	50 %	307543715
3018	NC_014532	GCC	2	6	147255	147260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543715
3019	NC_014532	GAA	2	6	147262	147267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307543715
3020	NC_014532	GCG	2	6	147350	147355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543715
3021	NC_014532	CGA	2	6	147363	147368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543715
3022	NC_014532	CGAT	2	8	147371	147378	25 %	25 %	25 %	25 %	307543715
3023	NC_014532	GAC	2	6	147423	147428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543715
3024	NC_014532	TAC	2	6	147451	147456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307543715
3025	NC_014532	GCT	2	6	147458	147463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543715
3026	NC_014532	CAA	2	6	147683	147688	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307543716
3027	NC_014532	CTG	2	6	147697	147702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543716
3028	NC_014532	TGG	2	6	147710	147715	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307543716
3029	NC_014532	GGGC	2	8	147729	147736	0 %	0 %	75 %	25 %	307543716
3030	NC_014532	CAC	2	6	147750	147755	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307543716
3031	NC_014532	CG	3	6	147759	147764	0 %	0 %	50 %	50 %	307543716
3032	NC_014532	TTC	2	6	147775	147780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307543716
3033	NC_014532	CGA	2	6	147783	147788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543716
3034	NC_014532	CG	3	6	147792	147797	0 %	0 %	50 %	50 %	307543716
3035	NC_014532	GGC	2	6	147799	147804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543716
3036	NC_014532	GTG	2	6	147832	147837	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307543716
3037	NC_014532	GCA	2	6	147871	147876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543716
3038	NC_014532	CGC	2	6	147885	147890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543716
3039	NC_014532	CGC	2	6	147930	147935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543716
3040	NC_014532	CGA	2	6	147939	147944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543716
3041	NC_014532	GGTGCG	2	12	147978	147989	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	307543716
3042	NC_014532	CGGC	2	8	148000	148007	0 %	0 %	50 %	50 %	307543716
3043	NC_014532	CTG	2	6	148033	148038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543716
3044	NC_014532	GC	3	6	148066	148071	0 %	0 %	50 %	50 %	307543716
3045	NC_014532	CGC	2	6	148156	148161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543716
3046	NC_014532	GAC	2	6	148243	148248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543716
3047	NC_014532	CAC	2	6	148453	148458	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307543717
3048	NC_014532	CGG	2	6	148506	148511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543717
3049	NC_014532	GCT	2	6	148519	148524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543717
3050	NC_014532	TCGC	2	8	148534	148541	0 %	25 %	25 %	50 %	307543717
3051	NC_014532	GCT	2	6	148597	148602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543717
3052	NC_014532	GC	3	6	148646	148651	0 %	0 %	50 %	50 %	307543717
3053	NC_014532	CGC	2	6	148698	148703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543717
3054	NC_014532	CTG	2	6	148748	148753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543717
3055	NC_014532	GGA	2	6	148765	148770	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307543717
3056	NC_014532	GC	3	6	148808	148813	0 %	0 %	50 %	50 %	307543717
3057	NC_014532	CGG	2	6	148843	148848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543717
3058	NC_014532	ATC	3	9	148916	148924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307543717
3059	NC_014532	TGG	2	6	148950	148955	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307543717
3060	NC_014532	GCT	2	6	149032	149037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543717
3061	NC_014532	ATC	2	6	149063	149068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307543717
3062	NC_014532	TCG	2	6	149097	149102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543717
3063	NC_014532	CGA	2	6	149104	149109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543717
3064	NC_014532	GAT	2	6	149116	149121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307543717
3065	NC_014532	GC	3	6	149141	149146	0 %	0 %	50 %	50 %	307543717
3066	NC_014532	ATC	2	6	149267	149272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307543717
3067	NC_014532	TGGGC	2	10	149350	149359	0 %	20 %	60 %	20 %	307543717
3068	NC_014532	TCC	2	6	149379	149384	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307543717
3069	NC_014532	CTG	2	6	149441	149446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543717
3070	NC_014532	TCG	2	6	149491	149496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543718
3071	NC_014532	GC	3	6	149570	149575	0 %	0 %	50 %	50 %	307543718
3072	NC_014532	TGC	2	6	149584	149589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543718
3073	NC_014532	GCT	2	6	149594	149599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543718
3074	NC_014532	GAG	2	6	149601	149606	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307543718
3075	NC_014532	TGA	2	6	149707	149712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307543718
3076	NC_014532	CCT	2	6	149743	149748	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307543718
3077	NC_014532	TCGACG	2	12	149785	149796	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	307543718
3078	NC_014532	GCGCC	2	10	149813	149822	0 %	0 %	40 %	60 %	307543718
3079	NC_014532	ATC	2	6	149883	149888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307543718
3080	NC_014532	AGG	2	6	149908	149913	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307543718
3081	NC_014532	CGGC	2	8	149927	149934	0 %	0 %	50 %	50 %	307543718
3082	NC_014532	GGC	2	6	150056	150061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543718
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3085	NC_014532	CGA	2	6	150179	150184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543718
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3087	NC_014532	TGC	2	6	150220	150225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543718
3088	NC_014532	CGG	2	6	150257	150262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543718
3089	NC_014532	CAT	2	6	150290	150295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307543718
3090	NC_014532	CGC	2	6	150296	150301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543718
3091	NC_014532	CACC	2	8	150302	150309	25 %	0 %	0 %	75 %	307543718
3092	NC_014532	CGA	2	6	150329	150334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543718
3093	NC_014532	GCC	2	6	150450	150455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543718
3094	NC_014532	GAG	2	6	150498	150503	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307543718
3095	NC_014532	CTGGC	2	10	150516	150525	0 %	20 %	40 %	40 %	307543718
3096	NC_014532	TGG	2	6	150595	150600	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307543718
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3099	NC_014532	GCC	2	6	150693	150698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543718
3100	NC_014532	CTG	2	6	150711	150716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543718
3101	NC_014532	CGG	2	6	150773	150778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543718
3102	NC_014532	GCC	2	6	150792	150797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543718
3103	NC_014532	CTG	2	6	150801	150806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543718
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3105	NC_014532	GAA	2	6	150980	150985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307543719
3106	NC_014532	CGT	2	6	151003	151008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543719
3107	NC_014532	CGT	2	6	151015	151020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543719
3108	NC_014532	CGG	2	6	151045	151050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543719
3109	NC_014532	GCC	2	6	151088	151093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543719
3110	NC_014532	GCA	2	6	151102	151107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543719
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3112	NC_014532	CGG	2	6	151165	151170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543719
3113	NC_014532	CG	3	6	151192	151197	0 %	0 %	50 %	50 %	307543719
3114	NC_014532	GGC	2	6	151268	151273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543719
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3116	NC_014532	CTG	2	6	151340	151345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543719
3117	NC_014532	AGC	2	6	151365	151370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543719
3118	NC_014532	GCA	2	6	151531	151536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543719
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3120	NC_014532	GGC	2	6	151661	151666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543719
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3124	NC_014532	GCG	2	6	151851	151856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543719
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3238	NC_014532	CGAGC	2	10	156292	156301	20 %	0 %	40 %	40 %	307543721
3239	NC_014532	CAG	3	9	156307	156315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543721
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3241	NC_014532	AGCC	2	8	156434	156441	25 %	0 %	25 %	50 %	307543721
3242	NC_014532	AGAT	2	8	156458	156465	50 %	25 %	25 %	0 %	307543721
3243	NC_014532	CGA	2	6	156483	156488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543721
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3245	NC_014532	CGC	2	6	156538	156543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543721
3246	NC_014532	CAG	2	6	156556	156561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543721
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3248	NC_014532	GTA	2	6	156574	156579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307543721
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3250	NC_014532	GAA	2	6	156637	156642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307543721
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3265	NC_014532	CTCG	2	8	157582	157589	0 %	25 %	25 %	50 %	307543722
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3347	NC_014532	GC	3	6	161339	161344	0 %	0 %	50 %	50 %	307543726
3348	NC_014532	ACG	2	6	161370	161375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543726
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3350	NC_014532	TCGGC	2	10	161475	161484	0 %	20 %	40 %	40 %	307543726
3351	NC_014532	CGGG	2	8	161527	161534	0 %	0 %	75 %	25 %	307543726
3352	NC_014532	TGC	2	6	161562	161567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543726
3353	NC_014532	CTCG	2	8	161581	161588	0 %	25 %	25 %	50 %	307543726
3354	NC_014532	TC	3	6	161596	161601	0 %	50 %	0 %	50 %	307543726
3355	NC_014532	TGG	2	6	161621	161626	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307543726
3356	NC_014532	CGTGG	2	10	161660	161669	0 %	20 %	60 %	20 %	307543726
3357	NC_014532	CAA	2	6	161686	161691	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307543726
3358	NC_014532	GCC	3	9	161693	161701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543726
3359	NC_014532	GGC	2	6	161702	161707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543726
3360	NC_014532	CTG	2	6	161762	161767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543726
3361	NC_014532	GCT	2	6	161803	161808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543726
3362	NC_014532	TGG	2	6	161841	161846	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307543726
3363	NC_014532	TGC	2	6	161871	161876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543726
3364	NC_014532	TGG	2	6	161895	161900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307543726
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3366	NC_014532	TCG	2	6	161967	161972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543726
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3471	NC_014532	GGCCG	2	10	166658	166667	0 %	0 %	60 %	40 %	307543731
3472	NC_014532	GCG	2	6	166689	166694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543731
3473	NC_014532	CG	3	6	166693	166698	0 %	0 %	50 %	50 %	307543731
3474	NC_014532	GCG	2	6	166839	166844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543731
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3477	NC_014532	CTG	2	6	166919	166924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543731
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3479	NC_014532	GTG	2	6	166946	166951	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307543731
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3481	NC_014532	ACA	2	6	167007	167012	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307543731
3482	NC_014532	CGA	2	6	167050	167055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543731
3483	NC_014532	GGA	2	6	167119	167124	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307543731
3484	NC_014532	GCC	2	6	167392	167397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543732
3485	NC_014532	GC	3	6	167487	167492	0 %	0 %	50 %	50 %	307543732
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3487	NC_014532	GCCCTT	2	12	167578	167589	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	307543732
3488	NC_014532	GCG	2	6	167605	167610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543732
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3490	NC_014532	GCC	2	6	167654	167659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543732
3491	NC_014532	GTC	2	6	167903	167908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543733
3492	NC_014532	CAG	2	6	167924	167929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543733
3493	NC_014532	GCCG	2	8	167993	168000	0 %	0 %	50 %	50 %	307543733
3494	NC_014532	GC	3	6	168018	168023	0 %	0 %	50 %	50 %	307543733
3495	NC_014532	CCAG	2	8	168025	168032	25 %	0 %	25 %	50 %	307543733
3496	NC_014532	GAC	2	6	168062	168067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543733
3497	NC_014532	CCG	2	6	168077	168082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543733
3498	NC_014532	GCCC	2	8	168116	168123	0 %	0 %	25 %	75 %	307543733
3499	NC_014532	GCA	2	6	168139	168144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543733
3500	NC_014532	CATC	2	8	168145	168152	25 %	25 %	0 %	50 %	307543733

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