MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halomonas elongata DSM 2581 chromosome

Total Repeats: 81984

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18001	NC_014532	GCC	2	6	894492	894497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307544358
18002	NC_014532	GCC	2	6	894501	894506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307544358
18003	NC_014532	TGG	2	6	894568	894573	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307544358
18004	NC_014532	CAG	2	6	894603	894608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307544358
18005	NC_014532	GGCGA	2	10	894634	894643	20 %	0 %	60 %	20 %	307544358
18006	NC_014532	CAG	2	6	894645	894650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307544358
18007	NC_014532	CGT	2	6	894725	894730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544358
18008	NC_014532	GGTGG	2	10	894765	894774	0 %	20 %	80 %	0 %	307544358
18009	NC_014532	CCG	2	6	894775	894780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307544358
18010	NC_014532	CG	3	6	894808	894813	0 %	0 %	50 %	50 %	307544358
18011	NC_014532	TTG	2	6	894820	894825	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307544358
18012	NC_014532	AGG	2	6	894827	894832	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307544358
18013	NC_014532	AGC	2	6	895202	895207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307544359
18014	NC_014532	CCA	2	6	895215	895220	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307544359
18015	NC_014532	CAT	2	6	895234	895239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307544359
18016	NC_014532	ATC	2	6	895295	895300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307544359
18017	NC_014532	AGT	2	6	895392	895397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307544359
18018	NC_014532	CAG	2	6	895423	895428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307544359
18019	NC_014532	CGA	2	6	895440	895445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307544359
18020	NC_014532	ATG	4	12	895541	895552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307544359
18021	NC_014532	GCG	2	6	895553	895558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544359
18022	NC_014532	GAA	2	6	895585	895590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307544359
18023	NC_014532	TGAA	2	8	895604	895611	50 %	25 %	25 %	0 %	307544359
18024	NC_014532	GGC	2	6	895618	895623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544359
18025	NC_014532	GGC	2	6	895651	895656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544359
18026	NC_014532	ATG	2	6	895718	895723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307544359
18027	NC_014532	CGG	2	6	895743	895748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544359
18028	NC_014532	CGC	2	6	895749	895754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307544359
18029	NC_014532	CGG	2	6	895755	895760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544359
18030	NC_014532	ATG	2	6	895796	895801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307544359
18031	NC_014532	GCC	2	6	895802	895807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307544359
18032	NC_014532	AGC	2	6	895826	895831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307544359
18033	NC_014532	ACG	2	6	895838	895843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307544359
18034	NC_014532	CAG	3	9	895846	895854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307544359
18035	NC_014532	CAC	2	6	895876	895881	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307544359
18036	NC_014532	GCC	2	6	895912	895917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307544359
18037	NC_014532	GAT	2	6	895921	895926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307544359
18038	NC_014532	GACCAG	2	12	895942	895953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307544359
18039	NC_014532	ACC	2	6	895958	895963	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307544359
18040	NC_014532	GGC	2	6	895967	895972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544359
18041	NC_014532	TCC	2	6	895985	895990	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307544359
18042	NC_014532	GAT	2	6	896044	896049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307544359
18043	NC_014532	GCC	2	6	896069	896074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307544359
18044	NC_014532	CAGCCC	2	12	896083	896094	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	307544359
18045	NC_014532	CGGG	2	8	896108	896115	0 %	0 %	75 %	25 %	307544359
18046	NC_014532	CCG	2	6	896117	896122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307544359
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18050	NC_014532	CATCCA	2	12	896209	896220	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	307544359
18051	NC_014532	CCG	2	6	896237	896242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307544359
18052	NC_014532	GGC	2	6	896290	896295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544359
18053	NC_014532	TGG	2	6	896301	896306	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307544359
18054	NC_014532	GCC	2	6	896329	896334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307544359
18055	NC_014532	GCA	2	6	896355	896360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307544359
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18058	NC_014532	CGG	2	6	896475	896480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544359
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18060	NC_014532	CGA	2	6	896798	896803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307544360
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18062	NC_014532	CGG	2	6	896938	896943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544360
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18064	NC_014532	CTG	2	6	897009	897014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544360
18065	NC_014532	GTG	2	6	897030	897035	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307544360
18066	NC_014532	GAACC	2	10	897044	897053	40 %	0 %	20 %	40 %	307544360
18067	NC_014532	GAG	2	6	897063	897068	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307544360
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18069	NC_014532	CG	3	6	897198	897203	0 %	0 %	50 %	50 %	307544360
18070	NC_014532	GCTG	2	8	897269	897276	0 %	25 %	50 %	25 %	307544361
18071	NC_014532	TCT	2	6	897307	897312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307544361
18072	NC_014532	ACG	2	6	897317	897322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307544361
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18074	NC_014532	CAG	2	6	897381	897386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307544361
18075	NC_014532	GAG	2	6	897417	897422	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307544361
18076	NC_014532	TGCC	3	12	897669	897680	0 %	25 %	25 %	50 %	307544362
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18081	NC_014532	TGAAGT	2	12	897963	897974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307544362
18082	NC_014532	AAG	2	6	897986	897991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307544362
18083	NC_014532	GGC	2	6	900473	900478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544363
18084	NC_014532	TGC	2	6	900516	900521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544363
18085	NC_014532	GGGCA	2	10	900773	900782	20 %	0 %	60 %	20 %	307544363
18086	NC_014532	AGGCCG	2	12	900823	900834	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	307544363
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18088	NC_014532	TCG	2	6	900970	900975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544363
18089	NC_014532	ACC	2	6	900981	900986	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307544363
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18091	NC_014532	CGGG	2	8	901107	901114	0 %	0 %	75 %	25 %	307544363
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18097	NC_014532	CCGG	2	8	901325	901332	0 %	0 %	50 %	50 %	307544364
18098	NC_014532	CCT	2	6	901351	901356	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307544364
18099	NC_014532	GC	3	6	901409	901414	0 %	0 %	50 %	50 %	307544364
18100	NC_014532	CAT	2	6	901427	901432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307544364
18101	NC_014532	TCG	2	6	901464	901469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544364
18102	NC_014532	GCC	2	6	901530	901535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307544364
18103	NC_014532	CAGA	2	8	901538	901545	50 %	0 %	25 %	25 %	307544364
18104	NC_014532	CCG	2	6	901548	901553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307544364
18105	NC_014532	GTA	2	6	901562	901567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307544364
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18110	NC_014532	CCAG	2	8	901663	901670	25 %	0 %	25 %	50 %	307544364
18111	NC_014532	CTTGGC	2	12	901715	901726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544364
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18116	NC_014532	C	6	6	901932	901937	0 %	0 %	0 %	100 %	307544364
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18118	NC_014532	CGG	2	6	901999	902004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544364
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18234	NC_014532	TGC	2	6	906904	906909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544369
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18353	NC_014532	TCG	2	6	913121	913126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544376
18354	NC_014532	TGC	2	6	913184	913189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544376
18355	NC_014532	GGA	2	6	913206	913211	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307544376
18356	NC_014532	GTC	2	6	913241	913246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544376
18357	NC_014532	GGT	2	6	913308	913313	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307544376
18358	NC_014532	TGC	2	6	913352	913357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544376
18359	NC_014532	TGA	2	6	913388	913393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307544376
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18362	NC_014532	ATC	2	6	913501	913506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307544376
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18372	NC_014532	CTG	2	6	914050	914055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544376
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18459	NC_014532	CG	3	6	918625	918630	0 %	0 %	50 %	50 %	307544382
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18472	NC_014532	CGC	2	6	919107	919112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307544383
18473	NC_014532	GCG	3	9	919124	919132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544383
18474	NC_014532	GTC	2	6	919135	919140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544383
18475	NC_014532	GCT	3	9	919221	919229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544383
18476	NC_014532	CTG	2	6	919297	919302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544383
18477	NC_014532	GCCG	2	8	919343	919350	0 %	0 %	50 %	50 %	307544383
18478	NC_014532	GCA	2	6	919377	919382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307544383
18479	NC_014532	TCA	2	6	919428	919433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307544383
18480	NC_014532	GCT	2	6	919447	919452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544383
18481	NC_014532	CAG	2	6	919495	919500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307544383
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18484	NC_014532	CGG	2	6	919703	919708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544383
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18488	NC_014532	CCG	2	6	920164	920169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307544384
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18490	NC_014532	CGG	2	6	920231	920236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544384
18491	NC_014532	TCG	2	6	920254	920259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544384
18492	NC_014532	CGA	2	6	920309	920314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307544384
18493	NC_014532	ATCACC	2	12	920406	920417	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	307544384
18494	NC_014532	ACG	2	6	920461	920466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307544384
18495	NC_014532	AAG	2	6	920484	920489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307544384
18496	NC_014532	ACC	2	6	920499	920504	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307544384
18497	NC_014532	TGC	2	6	920569	920574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544384
18498	NC_014532	CGA	2	6	920591	920596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307544384
18499	NC_014532	TCA	2	6	920692	920697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307544384
18500	NC_014532	CTG	2	6	920955	920960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544385

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