MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halomonas elongata DSM 2581 chromosome

Total Repeats: 81984

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16501	NC_014532	TGT	2	6	816272	816277	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307544290
16502	NC_014532	GC	3	6	816284	816289	0 %	0 %	50 %	50 %	307544290
16503	NC_014532	GTG	2	6	816295	816300	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307544290
16504	NC_014532	TCT	2	6	816326	816331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307544290
16505	NC_014532	TGGC	2	8	816346	816353	0 %	25 %	50 %	25 %	307544290
16506	NC_014532	GGC	2	6	816385	816390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544290
16507	NC_014532	TGC	2	6	816419	816424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544290
16508	NC_014532	TCG	2	6	816444	816449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544290
16509	NC_014532	CTT	2	6	816462	816467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307544290
16510	NC_014532	TCG	2	6	816482	816487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544290
16511	NC_014532	TCA	2	6	816533	816538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307544290
16512	NC_014532	TCG	2	6	816619	816624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544290
16513	NC_014532	GCT	2	6	816636	816641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544290
16514	NC_014532	TCG	2	6	816659	816664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544290
16515	NC_014532	TGG	2	6	816670	816675	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307544290
16516	NC_014532	GCG	2	6	816762	816767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544290
16517	NC_014532	TGC	2	6	816818	816823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544290
16518	NC_014532	GAT	2	6	816834	816839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307544290
16519	NC_014532	CTG	3	9	816850	816858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544290
16520	NC_014532	GTCGC	2	10	816867	816876	0 %	20 %	40 %	40 %	307544290
16521	NC_014532	CTG	2	6	817186	817191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544291
16522	NC_014532	CGA	2	6	817192	817197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307544291
16523	NC_014532	CTCC	2	8	817217	817224	0 %	25 %	0 %	75 %	307544291
16524	NC_014532	TGA	2	6	817282	817287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307544291
16525	NC_014532	CGCT	2	8	817307	817314	0 %	25 %	25 %	50 %	307544291
16526	NC_014532	TC	3	6	817339	817344	0 %	50 %	0 %	50 %	307544291
16527	NC_014532	CAC	2	6	817363	817368	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307544291
16528	NC_014532	AAG	2	6	817370	817375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307544291
16529	NC_014532	TCAT	2	8	817392	817399	25 %	50 %	0 %	25 %	307544291
16530	NC_014532	GTT	2	6	817402	817407	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307544291
16531	NC_014532	CGA	2	6	817480	817485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307544291
16532	NC_014532	GGC	2	6	817544	817549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544291
16533	NC_014532	AGC	2	6	817578	817583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307544291
16534	NC_014532	GCG	2	6	817585	817590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544291
16535	NC_014532	CGG	2	6	817604	817609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544291
16536	NC_014532	CAGCG	2	10	817721	817730	20 %	0 %	40 %	40 %	307544291
16537	NC_014532	GCT	2	6	817774	817779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544291
16538	NC_014532	GAT	2	6	817786	817791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307544291
16539	NC_014532	TGGC	2	8	817800	817807	0 %	25 %	50 %	25 %	307544291
16540	NC_014532	ATC	2	6	817860	817865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307544291
16541	NC_014532	CGC	2	6	817908	817913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307544291
16542	NC_014532	GAT	2	6	818049	818054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307544292
16543	NC_014532	CGC	2	6	818055	818060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307544292
16544	NC_014532	TTC	2	6	818128	818133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307544292
16545	NC_014532	ATCG	2	8	818184	818191	25 %	25 %	25 %	25 %	307544292
16546	NC_014532	GCCG	2	8	818192	818199	0 %	0 %	50 %	50 %	307544292
16547	NC_014532	CGGC	2	8	818205	818212	0 %	0 %	50 %	50 %	307544292
16548	NC_014532	CAG	2	6	818302	818307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307544292
16549	NC_014532	CGA	2	6	818325	818330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307544292
16550	NC_014532	GGA	2	6	818460	818465	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307544292
16551	NC_014532	AGAC	2	8	818546	818553	50 %	0 %	25 %	25 %	307544292
16552	NC_014532	GC	3	6	818583	818588	0 %	0 %	50 %	50 %	307544293
16553	NC_014532	GGA	2	6	818627	818632	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307544293
16554	NC_014532	TGG	2	6	818668	818673	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307544293
16555	NC_014532	GC	3	6	818684	818689	0 %	0 %	50 %	50 %	307544293
16556	NC_014532	CGA	2	6	818753	818758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307544293
16557	NC_014532	GC	3	6	818787	818792	0 %	0 %	50 %	50 %	307544293
16558	NC_014532	GGC	2	6	818804	818809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544293
16559	NC_014532	CCTG	2	8	818896	818903	0 %	25 %	25 %	50 %	307544293
16560	NC_014532	GAG	2	6	818913	818918	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307544293
16561	NC_014532	CGA	2	6	818930	818935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307544293
16562	NC_014532	GCCG	2	8	818990	818997	0 %	0 %	50 %	50 %	307544293
16563	NC_014532	TCT	2	6	819016	819021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307544293
16564	NC_014532	CGCGG	2	10	819022	819031	0 %	0 %	60 %	40 %	307544293
16565	NC_014532	CCG	2	6	819133	819138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307544293
16566	NC_014532	CGG	2	6	819160	819165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544293
16567	NC_014532	GGC	2	6	819175	819180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544293
16568	NC_014532	GCT	2	6	819224	819229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544293
16569	NC_014532	CTT	2	6	819260	819265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307544293
16570	NC_014532	GCG	2	6	819344	819349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544293
16571	NC_014532	GC	3	6	819427	819432	0 %	0 %	50 %	50 %	307544293
16572	NC_014532	TGC	2	6	819455	819460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544293
16573	NC_014532	ACC	2	6	819533	819538	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307544293
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16577	NC_014532	AGG	2	6	819619	819624	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307544293
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16585	NC_014532	CGA	2	6	820369	820374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307544294
16586	NC_014532	CGA	2	6	820384	820389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307544294
16587	NC_014532	GATG	2	8	820483	820490	25 %	25 %	50 %	0 %	307544294
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16589	NC_014532	AGCGGT	2	12	820544	820555	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	307544294
16590	NC_014532	TC	3	6	820608	820613	0 %	50 %	0 %	50 %	307544294
16591	NC_014532	GAA	2	6	820667	820672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307544294
16592	NC_014532	CCG	2	6	820725	820730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307544294
16593	NC_014532	GCC	2	6	820745	820750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307544294
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16598	NC_014532	TCA	2	6	821088	821093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307544294
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16600	NC_014532	ACA	2	6	821106	821111	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307544294
16601	NC_014532	GAC	2	6	821162	821167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307544294
16602	NC_014532	TGC	2	6	821182	821187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544294
16603	NC_014532	CGC	2	6	821576	821581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307544295
16604	NC_014532	TGC	2	6	821584	821589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544295
16605	NC_014532	GGT	2	6	821640	821645	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307544295
16606	NC_014532	CAGA	2	8	821655	821662	50 %	0 %	25 %	25 %	307544295
16607	NC_014532	TGC	2	6	821683	821688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544295
16608	NC_014532	GAT	2	6	821793	821798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307544295
16609	NC_014532	TCG	2	6	821815	821820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544295
16610	NC_014532	CGTG	2	8	821852	821859	0 %	25 %	50 %	25 %	307544295
16611	NC_014532	CGA	2	6	821861	821866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307544295
16612	NC_014532	CGGCG	2	10	821897	821906	0 %	0 %	60 %	40 %	307544295
16613	NC_014532	GCA	2	6	821934	821939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307544295
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16616	NC_014532	CAC	2	6	822113	822118	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307544295
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16738	NC_014532	CCG	2	6	827698	827703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307544300
16739	NC_014532	CG	3	6	827813	827818	0 %	0 %	50 %	50 %	307544300
16740	NC_014532	GGCA	2	8	827851	827858	25 %	0 %	50 %	25 %	307544300
16741	NC_014532	CGA	2	6	827861	827866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307544300
16742	NC_014532	TGC	2	6	827869	827874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544300
16743	NC_014532	GTC	2	6	827875	827880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544300
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16746	NC_014532	GCC	2	6	828010	828015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307544301
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16755	NC_014532	TCG	2	6	828296	828301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544301
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16774	NC_014532	CGAG	2	8	829272	829279	25 %	0 %	50 %	25 %	307544303
16775	NC_014532	CCTGGT	2	12	829301	829312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544303
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16853	NC_014532	GGA	2	6	833007	833012	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307544306
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