MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halomonas elongata DSM 2581 chromosome

Total Repeats: 81984

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16002	NC_014532	TGG	2	6	792418	792423	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307544270
16003	NC_014532	AGG	2	6	792493	792498	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307544270
16004	NC_014532	GAT	2	6	792543	792548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307544270
16005	NC_014532	GCC	2	6	792556	792561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307544270
16006	NC_014532	CGA	2	6	792569	792574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307544270
16007	NC_014532	AGGGC	2	10	792575	792584	20 %	0 %	60 %	20 %	307544270
16008	NC_014532	TAT	2	6	792642	792647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307544270
16009	NC_014532	CGC	2	6	792679	792684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307544270
16010	NC_014532	GAG	2	6	792699	792704	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307544270
16011	NC_014532	GCT	2	6	792722	792727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544270
16012	NC_014532	AAGG	2	8	792774	792781	50 %	0 %	50 %	0 %	307544270
16013	NC_014532	CGC	3	9	792792	792800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307544270
16014	NC_014532	CTG	2	6	792801	792806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544270
16015	NC_014532	CAC	2	6	792870	792875	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307544271
16016	NC_014532	AGG	2	6	792877	792882	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307544271
16017	NC_014532	GC	3	6	792900	792905	0 %	0 %	50 %	50 %	307544271
16018	NC_014532	ATC	2	6	792956	792961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307544271
16019	NC_014532	CAG	2	6	792968	792973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307544271
16020	NC_014532	TCG	2	6	792984	792989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544271
16021	NC_014532	GGGCTC	2	12	793013	793024	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	307544271
16022	NC_014532	CCA	2	6	793111	793116	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307544271
16023	NC_014532	GGC	3	9	793169	793177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544271
16024	NC_014532	CAGGGT	2	12	793214	793225	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	307544271
16025	NC_014532	CTC	2	6	793229	793234	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307544271
16026	NC_014532	CAG	2	6	793259	793264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307544271
16027	NC_014532	CGA	2	6	793288	793293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307544271
16028	NC_014532	TCA	2	6	793294	793299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307544271
16029	NC_014532	CCG	2	6	793305	793310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307544271
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16031	NC_014532	TGC	2	6	793408	793413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544271
16032	NC_014532	CGT	2	6	793483	793488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544272
16033	NC_014532	ATC	2	6	793518	793523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307544272
16034	NC_014532	GAG	2	6	793549	793554	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307544272
16035	NC_014532	CTG	2	6	793588	793593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544272
16036	NC_014532	CTG	2	6	793609	793614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544272
16037	NC_014532	CGA	2	6	793683	793688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307544272
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16039	NC_014532	CG	4	8	793708	793715	0 %	0 %	50 %	50 %	307544272
16040	NC_014532	CAT	2	6	793716	793721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307544272
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16043	NC_014532	AGG	2	6	793991	793996	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307544272
16044	NC_014532	CGA	2	6	794061	794066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307544272
16045	NC_014532	CTG	2	6	794113	794118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544272
16046	NC_014532	TCG	2	6	794168	794173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544272
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16052	NC_014532	GCG	2	6	794437	794442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544273
16053	NC_014532	GC	3	6	794497	794502	0 %	0 %	50 %	50 %	307544273
16054	NC_014532	AGG	2	6	794505	794510	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307544273
16055	NC_014532	GCG	2	6	794575	794580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544273
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16057	NC_014532	GTC	2	6	794783	794788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544274
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16059	NC_014532	GCT	2	6	794863	794868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544274
16060	NC_014532	GCC	2	6	794870	794875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307544274
16061	NC_014532	CTG	2	6	794882	794887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544274
16062	NC_014532	GGT	2	6	794975	794980	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307544274
16063	NC_014532	GAT	3	9	795026	795034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307544274
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16065	NC_014532	CTGG	2	8	795193	795200	0 %	25 %	50 %	25 %	307544274
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16107	NC_014532	GGGCG	2	10	797157	797166	0 %	0 %	80 %	20 %	307544275
16108	NC_014532	CAC	2	6	797181	797186	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307544275
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16354	NC_014532	CGG	2	6	809603	809608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544284
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16470	NC_014532	GTCG	2	8	814933	814940	0 %	25 %	50 %	25 %	307544288
16471	NC_014532	ATGG	2	8	814973	814980	25 %	25 %	50 %	0 %	307544288
16472	NC_014532	GTG	3	9	815042	815050	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307544288
16473	NC_014532	GAC	2	6	815108	815113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307544288
16474	NC_014532	CTG	2	6	815144	815149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544288
16475	NC_014532	TGGCT	2	10	815221	815230	0 %	40 %	40 %	20 %	307544289
16476	NC_014532	CGG	2	6	815280	815285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544289
16477	NC_014532	G	6	6	815284	815289	0 %	0 %	100 %	0 %	307544289
16478	NC_014532	ATC	2	6	815293	815298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307544289
16479	NC_014532	GCAT	2	8	815351	815358	25 %	25 %	25 %	25 %	307544289
16480	NC_014532	CT	3	6	815373	815378	0 %	50 %	0 %	50 %	307544289
16481	NC_014532	GTG	2	6	815389	815394	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307544289
16482	NC_014532	CCT	2	6	815402	815407	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307544289
16483	NC_014532	CGG	2	6	815425	815430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544289
16484	NC_014532	TTG	2	6	815461	815466	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307544289
16485	NC_014532	TGT	2	6	815537	815542	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307544289
16486	NC_014532	TGC	2	6	815555	815560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544289
16487	NC_014532	TGG	2	6	815561	815566	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307544289
16488	NC_014532	TGC	2	6	815576	815581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544289
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16490	NC_014532	CGG	2	6	815640	815645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544289
16491	NC_014532	CGG	2	6	815679	815684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544289
16492	NC_014532	CGA	2	6	815723	815728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307544289
16493	NC_014532	CTGT	2	8	815753	815760	0 %	50 %	25 %	25 %	307544289
16494	NC_014532	TCG	2	6	815798	815803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544289
16495	NC_014532	GC	3	6	815894	815899	0 %	0 %	50 %	50 %	307544289
16496	NC_014532	CTGG	2	8	815910	815917	0 %	25 %	50 %	25 %	307544289
16497	NC_014532	GCCC	2	8	815928	815935	0 %	0 %	25 %	75 %	307544289
16498	NC_014532	GCT	2	6	815937	815942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544289
16499	NC_014532	TGG	2	6	816211	816216	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307544290
16500	NC_014532	GC	3	6	816228	816233	0 %	0 %	50 %	50 %	307544290

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