MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halomonas elongata DSM 2581 chromosome

Total Repeats: 81984

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15002	NC_014532	AGA	2	6	735952	735957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307544225
15003	NC_014532	GCG	2	6	736018	736023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544226
15004	NC_014532	GTG	4	12	736040	736051	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307544226
15005	NC_014532	TGG	2	6	736254	736259	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307544226
15006	NC_014532	GCC	2	6	736415	736420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307544226
15007	NC_014532	CGC	2	6	736431	736436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307544226
15008	NC_014532	AGG	2	6	736464	736469	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307544226
15009	NC_014532	AGC	2	6	736476	736481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307544226
15010	NC_014532	ATG	2	6	736493	736498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307544226
15011	NC_014532	TTTG	2	8	736539	736546	0 %	75 %	25 %	0 %	307544226
15012	NC_014532	GTA	2	6	736584	736589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307544226
15013	NC_014532	GC	3	6	736592	736597	0 %	0 %	50 %	50 %	307544226
15014	NC_014532	GCG	2	6	736631	736636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544226
15015	NC_014532	TGG	2	6	736641	736646	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307544226
15016	NC_014532	GTG	2	6	736684	736689	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307544226
15017	NC_014532	CGG	2	6	736749	736754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544226
15018	NC_014532	AGA	2	6	736818	736823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307544226
15019	NC_014532	TGG	2	6	736908	736913	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307544226
15020	NC_014532	TCG	2	6	736949	736954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544226
15021	NC_014532	GGGC	2	8	736968	736975	0 %	0 %	75 %	25 %	307544226
15022	NC_014532	GCCG	2	8	736981	736988	0 %	0 %	50 %	50 %	307544226
15023	NC_014532	G	6	6	737201	737206	0 %	0 %	100 %	0 %	307544227
15024	NC_014532	GTG	2	6	737320	737325	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307544227
15025	NC_014532	CT	3	6	737347	737352	0 %	50 %	0 %	50 %	307544227
15026	NC_014532	AGC	2	6	737353	737358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307544227
15027	NC_014532	GCC	2	6	737383	737388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307544227
15028	NC_014532	ACCC	2	8	737445	737452	25 %	0 %	0 %	75 %	307544227
15029	NC_014532	GCA	2	6	737465	737470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307544227
15030	NC_014532	GCG	2	6	737481	737486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544227
15031	NC_014532	CGG	2	6	737498	737503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544227
15032	NC_014532	GGGT	2	8	737570	737577	0 %	25 %	75 %	0 %	307544227
15033	NC_014532	CGC	3	9	737579	737587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307544227
15034	NC_014532	ACG	2	6	737593	737598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307544227
15035	NC_014532	CA	3	6	737733	737738	50 %	0 %	0 %	50 %	307544227
15036	NC_014532	GGT	2	6	737744	737749	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307544227
15037	NC_014532	GGCC	2	8	737780	737787	0 %	0 %	50 %	50 %	307544227
15038	NC_014532	GC	3	6	737883	737888	0 %	0 %	50 %	50 %	307544228
15039	NC_014532	TTGC	2	8	737921	737928	0 %	50 %	25 %	25 %	307544228
15040	NC_014532	CG	3	6	737968	737973	0 %	0 %	50 %	50 %	307544228
15041	NC_014532	TCGG	2	8	738000	738007	0 %	25 %	50 %	25 %	307544228
15042	NC_014532	GCGT	2	8	738084	738091	0 %	25 %	50 %	25 %	307544229
15043	NC_014532	CGT	2	6	738105	738110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544229
15044	NC_014532	GAG	2	6	738248	738253	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307544229
15045	NC_014532	GCA	2	6	738276	738281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307544229
15046	NC_014532	GCC	2	6	738286	738291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307544229
15047	NC_014532	TGG	2	6	738317	738322	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307544229
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15049	NC_014532	GTC	2	6	738340	738345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544229
15050	NC_014532	GTA	2	6	738379	738384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307544229
15051	NC_014532	GGA	2	6	738408	738413	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307544229
15052	NC_014532	CT	3	6	738436	738441	0 %	50 %	0 %	50 %	307544229
15053	NC_014532	GGT	2	6	738499	738504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307544229
15054	NC_014532	TGCG	2	8	738522	738529	0 %	25 %	50 %	25 %	307544229
15055	NC_014532	CAG	2	6	738541	738546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307544229
15056	NC_014532	TGC	2	6	738560	738565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544229
15057	NC_014532	GTC	2	6	738592	738597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544229
15058	NC_014532	GCTG	2	8	738675	738682	0 %	25 %	50 %	25 %	307544229
15059	NC_014532	CGT	2	6	738696	738701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544229
15060	NC_014532	CCAT	2	8	738702	738709	25 %	25 %	0 %	50 %	307544229
15061	NC_014532	GC	4	8	738817	738824	0 %	0 %	50 %	50 %	307544229
15062	NC_014532	CAC	2	6	738835	738840	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307544229
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15065	NC_014532	CTT	2	6	739104	739109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307544229
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15068	NC_014532	AGGT	2	8	739364	739371	25 %	25 %	50 %	0 %	307544229
15069	NC_014532	CGG	3	9	739605	739613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544229
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15071	NC_014532	GCCC	2	8	739671	739678	0 %	0 %	25 %	75 %	307544229
15072	NC_014532	GTTGGC	2	12	739693	739704	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	307544229
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15075	NC_014532	CAT	2	6	740152	740157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307544230
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15081	NC_014532	GCC	2	6	740615	740620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307544230
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15084	NC_014532	CTGC	2	8	740692	740699	0 %	25 %	25 %	50 %	307544230
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15087	NC_014532	CATGG	2	10	740871	740880	20 %	20 %	40 %	20 %	307544231
15088	NC_014532	CCA	2	6	740883	740888	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307544231
15089	NC_014532	CAG	2	6	740955	740960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307544231
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15092	NC_014532	GAA	2	6	741006	741011	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307544231
15093	NC_014532	CGGC	2	8	741047	741054	0 %	0 %	50 %	50 %	307544231
15094	NC_014532	GTC	2	6	741064	741069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544231
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15099	NC_014532	GCT	2	6	741468	741473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544232
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15101	NC_014532	ATCA	2	8	741532	741539	50 %	25 %	0 %	25 %	307544232
15102	NC_014532	GGCC	2	8	741546	741553	0 %	0 %	50 %	50 %	307544232
15103	NC_014532	TTA	2	6	741585	741590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307544232
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15105	NC_014532	CTG	2	6	741640	741645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544232
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15107	NC_014532	TC	3	6	741711	741716	0 %	50 %	0 %	50 %	307544232
15108	NC_014532	GGT	2	6	741717	741722	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307544232
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15110	NC_014532	CAT	2	6	741780	741785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307544232
15111	NC_014532	GCGA	2	8	741854	741861	25 %	0 %	50 %	25 %	307544232
15112	NC_014532	CGT	2	6	741888	741893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544232
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15118	NC_014532	GCC	2	6	742174	742179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307544232
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15120	NC_014532	CGG	2	6	742274	742279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544232
15121	NC_014532	TGC	2	6	742325	742330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544232
15122	NC_014532	TGA	2	6	742394	742399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307544232
15123	NC_014532	CGA	2	6	742554	742559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307544232
15124	NC_014532	GGT	2	6	742581	742586	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307544232
15125	NC_014532	CCG	2	6	742763	742768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307544233
15126	NC_014532	GCG	2	6	742794	742799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544233
15127	NC_014532	GAG	2	6	742928	742933	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307544233
15128	NC_014532	CTG	2	6	742934	742939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544233
15129	NC_014532	GGCGAT	2	12	742988	742999	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	307544233
15130	NC_014532	TCG	2	6	743016	743021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544233
15131	NC_014532	GAG	2	6	743069	743074	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307544233
15132	NC_014532	GC	3	6	743199	743204	0 %	0 %	50 %	50 %	307544233
15133	NC_014532	G	6	6	743212	743217	0 %	0 %	100 %	0 %	307544233
15134	NC_014532	CGA	2	6	743347	743352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307544233
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15140	NC_014532	CGT	2	6	743945	743950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544234
15141	NC_014532	CCG	2	6	743953	743958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307544234
15142	NC_014532	GTC	2	6	744016	744021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544234
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15144	NC_014532	CGG	2	6	744403	744408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544235
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15149	NC_014532	CGT	2	6	744761	744766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544235
15150	NC_014532	CGGG	2	8	744769	744776	0 %	0 %	75 %	25 %	307544235
15151	NC_014532	GCA	2	6	744806	744811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307544235
15152	NC_014532	GGGCC	2	10	744841	744850	0 %	0 %	60 %	40 %	307544235
15153	NC_014532	GCG	2	6	744851	744856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544235
15154	NC_014532	CCG	2	6	744860	744865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307544235
15155	NC_014532	CGG	2	6	744923	744928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544235
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15220	NC_014532	CAG	2	6	748202	748207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307544238
15221	NC_014532	CTG	2	6	748214	748219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544238
15222	NC_014532	AGC	2	6	748230	748235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307544238
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15224	NC_014532	CGATGT	2	12	748513	748524	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	307544239
15225	NC_014532	TGG	2	6	748546	748551	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307544239
15226	NC_014532	CAT	3	9	748562	748570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307544239
15227	NC_014532	TGG	2	6	748629	748634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307544239
15228	NC_014532	CTG	3	9	748662	748670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544239
15229	NC_014532	CCG	2	6	748675	748680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307544239
15230	NC_014532	CTGG	2	8	748763	748770	0 %	25 %	50 %	25 %	307544239
15231	NC_014532	CGA	2	6	748820	748825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307544239
15232	NC_014532	TGC	2	6	748852	748857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544239
15233	NC_014532	GGTG	2	8	748925	748932	0 %	25 %	75 %	0 %	307544239
15234	NC_014532	GCA	2	6	748934	748939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307544239
15235	NC_014532	CGC	2	6	748946	748951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307544239
15236	NC_014532	TGG	2	6	749066	749071	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307544239
15237	NC_014532	ATG	2	6	749082	749087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307544239
15238	NC_014532	GCC	2	6	749088	749093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307544239
15239	NC_014532	CAC	2	6	749315	749320	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307544240
15240	NC_014532	TCG	2	6	749358	749363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544240
15241	NC_014532	CGG	2	6	749392	749397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544240
15242	NC_014532	CGC	2	6	749422	749427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307544240
15243	NC_014532	CGG	2	6	749494	749499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544240
15244	NC_014532	CTG	2	6	749532	749537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544240
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15331	NC_014532	TGGC	2	8	753852	753859	0 %	25 %	50 %	25 %	307544244
15332	NC_014532	CG	3	6	753904	753909	0 %	0 %	50 %	50 %	307544244
15333	NC_014532	CGG	2	6	753915	753920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544244
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15338	NC_014532	CTG	3	9	754115	754123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544244
15339	NC_014532	CGT	2	6	754199	754204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544244
15340	NC_014532	GCT	2	6	754234	754239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544244
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15342	NC_014532	GAG	2	6	754289	754294	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307544244
15343	NC_014532	GTGCG	2	10	754305	754314	0 %	20 %	60 %	20 %	307544244
15344	NC_014532	GACAGC	2	12	754416	754427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307544244
15345	NC_014532	TGC	2	6	754446	754451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544244
15346	NC_014532	CGA	2	6	754477	754482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307544244
15347	NC_014532	GGC	2	6	754513	754518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544244
15348	NC_014532	TGG	2	6	754608	754613	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307544244
15349	NC_014532	TCG	2	6	754632	754637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544244
15350	NC_014532	CTG	2	6	754658	754663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544244
15351	NC_014532	GGC	2	6	754692	754697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544244
15352	NC_014532	CGA	2	6	754741	754746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307544244
15353	NC_014532	GGA	2	6	754768	754773	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307544244
15354	NC_014532	ATG	2	6	754783	754788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307544244
15355	NC_014532	TCAG	2	8	754838	754845	25 %	25 %	25 %	25 %	307544245
15356	NC_014532	CGT	3	9	754848	754856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544245
15357	NC_014532	GCG	2	6	754859	754864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544245
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15359	NC_014532	ACGG	2	8	754944	754951	25 %	0 %	50 %	25 %	307544245
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15384	NC_014532	CGG	2	6	756402	756407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544247
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15470	NC_014532	TGC	2	6	760905	760910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544250
15471	NC_014532	TCA	2	6	760923	760928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307544250
15472	NC_014532	CTC	2	6	761031	761036	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307544250
15473	NC_014532	ATGG	2	8	761054	761061	25 %	25 %	50 %	0 %	307544250
15474	NC_014532	TGGC	2	8	761082	761089	0 %	25 %	50 %	25 %	307544250
15475	NC_014532	CTT	2	6	761176	761181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307544250
15476	NC_014532	CGG	2	6	761239	761244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544250
15477	NC_014532	CCA	2	6	761343	761348	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307544250
15478	NC_014532	GCCATT	2	12	761366	761377	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	307544250
15479	NC_014532	CGA	2	6	761460	761465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307544250
15480	NC_014532	CGG	2	6	761493	761498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544250
15481	NC_014532	CTG	2	6	761580	761585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544250
15482	NC_014532	CGG	2	6	761704	761709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544250
15483	NC_014532	G	6	6	761734	761739	0 %	0 %	100 %	0 %	307544250
15484	NC_014532	CGGTG	2	10	761791	761800	0 %	20 %	60 %	20 %	307544250
15485	NC_014532	ATG	3	9	761814	761822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307544250
15486	NC_014532	AGGC	2	8	761860	761867	25 %	0 %	50 %	25 %	307544250
15487	NC_014532	GGA	2	6	761932	761937	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307544250
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15489	NC_014532	CCTG	2	8	762058	762065	0 %	25 %	25 %	50 %	307544250
15490	NC_014532	TGG	2	6	762075	762080	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307544250
15491	NC_014532	GAC	2	6	762970	762975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307544251
15492	NC_014532	CGA	2	6	763047	763052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307544251
15493	NC_014532	GA	3	6	763055	763060	50 %	0 %	50 %	0 %	307544251
15494	NC_014532	CGTG	2	8	763101	763108	0 %	25 %	50 %	25 %	307544251
15495	NC_014532	TGGA	2	8	763186	763193	25 %	25 %	50 %	0 %	307544251
15496	NC_014532	TCA	2	6	763220	763225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307544251
15497	NC_014532	GGA	2	6	763281	763286	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307544251
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15499	NC_014532	GAC	2	6	763335	763340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307544251
15500	NC_014532	GCC	2	6	763346	763351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307544251

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