MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halomonas elongata DSM 2581 chromosome

Total Repeats: 81984

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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14502	NC_014532	CCA	2	6	706921	706926	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307544206
14503	NC_014532	TCG	2	6	706936	706941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544206
14504	NC_014532	TCG	2	6	706948	706953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544206
14505	NC_014532	CGC	2	6	707032	707037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307544206
14506	NC_014532	TGT	2	6	707062	707067	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307544206
14507	NC_014532	GTCC	2	8	707072	707079	0 %	25 %	25 %	50 %	307544206
14508	NC_014532	GCC	2	6	707115	707120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307544206
14509	NC_014532	ATGT	2	8	707136	707143	25 %	50 %	25 %	0 %	307544206
14510	NC_014532	TCG	2	6	707161	707166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544206
14511	NC_014532	CTG	2	6	707229	707234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544206
14512	NC_014532	CTG	2	6	707244	707249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544206
14513	NC_014532	CTTCGG	2	12	707321	707332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544206
14514	NC_014532	CGT	2	6	707447	707452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544206
14515	NC_014532	GGC	2	6	707460	707465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544206
14516	NC_014532	CGG	2	6	707471	707476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544206
14517	NC_014532	TGG	2	6	707493	707498	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307544206
14518	NC_014532	CGG	2	6	707510	707515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544206
14519	NC_014532	GGC	2	6	707517	707522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544206
14520	NC_014532	TCG	3	9	707524	707532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544206
14521	NC_014532	CGC	2	6	707609	707614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307544206
14522	NC_014532	GCC	2	6	707625	707630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307544206
14523	NC_014532	ACC	2	6	707631	707636	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307544206
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14526	NC_014532	CGGTG	2	10	707690	707699	0 %	20 %	60 %	20 %	307544206
14527	NC_014532	GGC	2	6	707726	707731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544206
14528	NC_014532	CGG	2	6	707785	707790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544206
14529	NC_014532	GCG	2	6	707793	707798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544206
14530	NC_014532	TTC	3	9	707811	707819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307544206
14531	NC_014532	TGG	3	9	708331	708339	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307544207
14532	NC_014532	GCC	2	6	708366	708371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307544207
14533	NC_014532	GGC	2	6	708377	708382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544207
14534	NC_014532	CGC	2	6	708391	708396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307544207
14535	NC_014532	GCC	2	6	708397	708402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307544207
14536	NC_014532	CGA	2	6	708422	708427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307544207
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14538	NC_014532	CG	3	6	708596	708601	0 %	0 %	50 %	50 %	307544207
14539	NC_014532	GCG	2	6	708604	708609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544207
14540	NC_014532	CTG	2	6	708645	708650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544207
14541	NC_014532	TGC	3	9	708667	708675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544207
14542	NC_014532	CAC	2	6	708676	708681	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307544207
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14544	NC_014532	GTGG	2	8	708847	708854	0 %	25 %	75 %	0 %	307544207
14545	NC_014532	CGA	2	6	708857	708862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307544207
14546	NC_014532	GCC	3	9	708909	708917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307544207
14547	NC_014532	TGGCG	2	10	708923	708932	0 %	20 %	60 %	20 %	307544207
14548	NC_014532	CTG	2	6	708942	708947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544207
14549	NC_014532	GCC	2	6	709041	709046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307544207
14550	NC_014532	CGA	2	6	709145	709150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307544207
14551	NC_014532	GTC	2	6	709155	709160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544207
14552	NC_014532	TGC	2	6	709190	709195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544207
14553	NC_014532	CTG	3	9	709281	709289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544207
14554	NC_014532	CGT	2	6	709302	709307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544207
14555	NC_014532	GGACT	2	10	709320	709329	20 %	20 %	40 %	20 %	307544207
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14557	NC_014532	TTC	2	6	709365	709370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307544207
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14559	NC_014532	TGA	2	6	710011	710016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307544208
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14561	NC_014532	TCGA	2	8	710079	710086	25 %	25 %	25 %	25 %	307544208
14562	NC_014532	TCGA	2	8	710105	710112	25 %	25 %	25 %	25 %	307544208
14563	NC_014532	T	9	9	710164	710172	0 %	100 %	0 %	0 %	307544208
14564	NC_014532	CGTG	2	8	710185	710192	0 %	25 %	50 %	25 %	307544208
14565	NC_014532	T	6	6	710273	710278	0 %	100 %	0 %	0 %	307544208
14566	NC_014532	CT	3	6	710330	710335	0 %	50 %	0 %	50 %	307544208
14567	NC_014532	TGC	2	6	710371	710376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544208
14568	NC_014532	GGCC	2	8	710399	710406	0 %	0 %	50 %	50 %	307544208
14569	NC_014532	GGA	2	6	710459	710464	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307544208
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14572	NC_014532	CCGC	2	8	710515	710522	0 %	0 %	25 %	75 %	307544208
14573	NC_014532	GGT	2	6	710531	710536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307544208
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14584	NC_014532	TGC	2	6	710872	710877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544208
14585	NC_014532	ATC	2	6	710892	710897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307544208
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14587	NC_014532	CCG	2	6	710980	710985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307544208
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14589	NC_014532	CGA	2	6	711032	711037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307544208
14590	NC_014532	GGA	2	6	711041	711046	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307544208
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14592	NC_014532	GCT	2	6	711122	711127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544208
14593	NC_014532	ACTC	2	8	711149	711156	25 %	25 %	0 %	50 %	307544208
14594	NC_014532	GCA	2	6	711206	711211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307544208
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14598	NC_014532	ATCG	2	8	711381	711388	25 %	25 %	25 %	25 %	307544208
14599	NC_014532	ACC	2	6	711477	711482	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307544208
14600	NC_014532	GCG	2	6	711514	711519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544208
14601	NC_014532	CGA	2	6	711530	711535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307544208
14602	NC_014532	GCC	2	6	711624	711629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307544208
14603	NC_014532	GC	3	6	711634	711639	0 %	0 %	50 %	50 %	307544208
14604	NC_014532	GT	3	6	711684	711689	0 %	50 %	50 %	0 %	307544208
14605	NC_014532	GAAACA	2	12	711723	711734	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	307544208
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14608	NC_014532	AG	3	6	711897	711902	50 %	0 %	50 %	0 %	307544209
14609	NC_014532	CGA	2	6	711930	711935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307544209
14610	NC_014532	GCCT	2	8	711937	711944	0 %	25 %	25 %	50 %	307544209
14611	NC_014532	GGCCT	2	10	711967	711976	0 %	20 %	40 %	40 %	307544209
14612	NC_014532	GCGA	2	8	712013	712020	25 %	0 %	50 %	25 %	307544209
14613	NC_014532	GC	3	6	712042	712047	0 %	0 %	50 %	50 %	307544209
14614	NC_014532	GTG	2	6	712060	712065	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307544209
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14616	NC_014532	CCG	2	6	712135	712140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307544209
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14618	NC_014532	CAA	2	6	712195	712200	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307544209
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14972	NC_014532	TGC	2	6	733714	733719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544223
14973	NC_014532	CCA	2	6	733731	733736	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307544223
14974	NC_014532	ATGGCG	2	12	733756	733767	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	307544223
14975	NC_014532	CCG	2	6	733787	733792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307544223
14976	NC_014532	AGA	2	6	733832	733837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307544223
14977	NC_014532	GAT	2	6	733857	733862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307544223
14978	NC_014532	GCCA	2	8	733876	733883	25 %	0 %	25 %	50 %	307544223
14979	NC_014532	CCG	2	6	734330	734335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307544224
14980	NC_014532	CAT	2	6	734433	734438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307544224
14981	NC_014532	ATC	2	6	734593	734598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307544224
14982	NC_014532	GCG	2	6	734619	734624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544224
14983	NC_014532	GCT	2	6	734751	734756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544224
14984	NC_014532	CTG	2	6	734779	734784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544224
14985	NC_014532	CGC	2	6	734788	734793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307544224
14986	NC_014532	CCG	2	6	734795	734800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307544224
14987	NC_014532	ACG	2	6	734865	734870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307544224
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14989	NC_014532	TCG	2	6	734999	735004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544224
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14992	NC_014532	GGC	2	6	735209	735214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544225
14993	NC_014532	ACC	2	6	735216	735221	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307544225
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14996	NC_014532	CGA	2	6	735455	735460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307544225
14997	NC_014532	CAG	2	6	735533	735538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307544225
14998	NC_014532	CAC	2	6	735788	735793	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307544225
14999	NC_014532	GTC	2	6	735836	735841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544225
15000	NC_014532	CGG	2	6	735855	735860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544225

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