MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halomonas elongata DSM 2581 chromosome

Total Repeats: 81984

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_014532	ATG	2	6	48306	48311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307543630
1002	NC_014532	GCA	2	6	48398	48403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543630
1003	NC_014532	CTTG	2	8	48405	48412	0 %	50 %	25 %	25 %	307543630
1004	NC_014532	TCGC	2	8	48434	48441	0 %	25 %	25 %	50 %	307543630
1005	NC_014532	TGCA	2	8	48447	48454	25 %	25 %	25 %	25 %	307543630
1006	NC_014532	CGT	2	6	48474	48479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543630
1007	NC_014532	CAG	2	6	48480	48485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543630
1008	NC_014532	AAC	2	6	48700	48705	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307543631
1009	NC_014532	CAA	2	6	48725	48730	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307543631
1010	NC_014532	CGA	2	6	48818	48823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543631
1011	NC_014532	TGAT	2	8	48889	48896	25 %	50 %	25 %	0 %	307543631
1012	NC_014532	TCA	2	6	48901	48906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307543631
1013	NC_014532	TGG	2	6	48911	48916	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307543631
1014	NC_014532	ACA	2	6	48945	48950	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307543631
1015	NC_014532	CCA	2	6	48952	48957	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307543631
1016	NC_014532	GTC	2	6	49020	49025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543631
1017	NC_014532	CGG	3	9	49031	49039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543631
1018	NC_014532	CAC	2	6	49090	49095	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307543631
1019	NC_014532	TGG	2	6	49156	49161	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307543631
1020	NC_014532	GC	3	6	49199	49204	0 %	0 %	50 %	50 %	307543631
1021	NC_014532	CCTCA	2	10	49251	49260	20 %	20 %	0 %	60 %	307543631
1022	NC_014532	CCTGA	2	10	49284	49293	20 %	20 %	20 %	40 %	307543631
1023	NC_014532	CCG	2	6	49305	49310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543631
1024	NC_014532	CGG	2	6	49387	49392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543631
1025	NC_014532	GTA	2	6	49443	49448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307543631
1026	NC_014532	GAT	3	9	49481	49489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307543631
1027	NC_014532	GGC	2	6	49490	49495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543631
1028	NC_014532	GGT	2	6	49560	49565	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307543631
1029	NC_014532	CAT	2	6	49584	49589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307543631
1030	NC_014532	CGG	2	6	49615	49620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543631
1031	NC_014532	CAA	2	6	50132	50137	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307543632
1032	NC_014532	CTC	2	6	50163	50168	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307543632
1033	NC_014532	GGCTC	2	10	50184	50193	0 %	20 %	40 %	40 %	307543632
1034	NC_014532	CAT	2	6	50222	50227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307543632
1035	NC_014532	AGG	2	6	50243	50248	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307543632
1036	NC_014532	GAG	2	6	50289	50294	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307543632
1037	NC_014532	GTC	2	6	50316	50321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543632
1038	NC_014532	GTG	2	6	50338	50343	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307543632
1039	NC_014532	TTG	2	6	50344	50349	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307543632
1040	NC_014532	ATG	2	6	50418	50423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307543632
1041	NC_014532	GCC	2	6	50712	50717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543632
1042	NC_014532	GGT	2	6	50718	50723	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307543632
1043	NC_014532	ACCG	2	8	50834	50841	25 %	0 %	25 %	50 %	307543632
1044	NC_014532	GGAT	2	8	50905	50912	25 %	25 %	50 %	0 %	307543632
1045	NC_014532	CAG	2	6	50988	50993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543632
1046	NC_014532	GCC	2	6	51018	51023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543632
1047	NC_014532	TCG	2	6	51070	51075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543632
1048	NC_014532	GGTC	2	8	51080	51087	0 %	25 %	50 %	25 %	307543632
1049	NC_014532	G	6	6	51161	51166	0 %	0 %	100 %	0 %	307543633
1050	NC_014532	CCCT	2	8	51234	51241	0 %	25 %	0 %	75 %	307543633
1051	NC_014532	GGC	2	6	51264	51269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543633
1052	NC_014532	TCG	2	6	51337	51342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543633
1053	NC_014532	TCT	2	6	51388	51393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307543633
1054	NC_014532	TGC	2	6	51419	51424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543633
1055	NC_014532	GTG	2	6	51466	51471	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307543633
1056	NC_014532	GCT	2	6	51479	51484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543633
1057	NC_014532	CGG	2	6	51508	51513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543633
1058	NC_014532	CTG	2	6	51543	51548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543633
1059	NC_014532	GTTG	2	8	51641	51648	0 %	50 %	50 %	0 %	307543634
1060	NC_014532	CGC	2	6	51650	51655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543634
1061	NC_014532	TGC	2	6	51656	51661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543634
1062	NC_014532	TCG	2	6	51676	51681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543634
1063	NC_014532	GTGCC	2	10	51682	51691	0 %	20 %	40 %	40 %	307543634
1064	NC_014532	CGA	2	6	51703	51708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543634
1065	NC_014532	GCT	2	6	51765	51770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543634
1066	NC_014532	CAC	2	6	51776	51781	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307543634
1067	NC_014532	CGG	2	6	51850	51855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543634
1068	NC_014532	TGCT	2	8	51877	51884	0 %	50 %	25 %	25 %	307543634
1069	NC_014532	TGG	2	6	51938	51943	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307543634
1070	NC_014532	TGGC	2	8	52026	52033	0 %	25 %	50 %	25 %	307543634
1071	NC_014532	AGC	2	6	52047	52052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543634
1072	NC_014532	CTG	2	6	52110	52115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543634
1073	NC_014532	ATG	2	6	52137	52142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307543634
1074	NC_014532	TGA	2	6	52207	52212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307543634
1075	NC_014532	TCG	2	6	52325	52330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543634
1076	NC_014532	GCA	2	6	52354	52359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543634
1077	NC_014532	TGCCC	2	10	52379	52388	0 %	20 %	20 %	60 %	307543634
1078	NC_014532	CAAA	2	8	52445	52452	75 %	0 %	0 %	25 %	307543634
1079	NC_014532	TCG	2	6	52486	52491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543634
1080	NC_014532	GGC	2	6	52641	52646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543634
1081	NC_014532	T	6	6	52706	52711	0 %	100 %	0 %	0 %	307543634
1082	NC_014532	GCT	2	6	52720	52725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543634
1083	NC_014532	ATC	2	6	52767	52772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307543634
1084	NC_014532	TTG	2	6	52786	52791	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307543634
1085	NC_014532	ATC	2	6	52815	52820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307543634
1086	NC_014532	TGC	2	6	52834	52839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543634
1087	NC_014532	TGG	2	6	52849	52854	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307543634
1088	NC_014532	CTG	2	6	52968	52973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543634
1089	NC_014532	GTG	2	6	53063	53068	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307543634
1090	NC_014532	CAT	2	6	53098	53103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307543634
1091	NC_014532	CTG	2	6	53135	53140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543635
1092	NC_014532	TCG	2	6	53151	53156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543635
1093	NC_014532	ACG	2	6	53172	53177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543635
1094	NC_014532	CTG	2	6	53216	53221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543635
1095	NC_014532	TCA	2	6	53224	53229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307543635
1096	NC_014532	GGA	2	6	53288	53293	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307543635
1097	NC_014532	GCA	2	6	53319	53324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543635
1098	NC_014532	ATG	2	6	53343	53348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307543635
1099	NC_014532	CAC	2	6	53450	53455	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307543635
1100	NC_014532	CCTA	2	8	53472	53479	25 %	25 %	0 %	50 %	307543635
1101	NC_014532	TGG	2	6	53487	53492	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307543635
1102	NC_014532	CAA	2	6	53665	53670	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307543635
1103	NC_014532	CGA	2	6	53734	53739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543635
1104	NC_014532	CTT	2	6	53749	53754	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307543635
1105	NC_014532	TGGG	2	8	53784	53791	0 %	25 %	75 %	0 %	307543635
1106	NC_014532	GCG	2	6	53846	53851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543635
1107	NC_014532	GCG	2	6	53894	53899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543635
1108	NC_014532	GTGATG	2	12	53900	53911	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	307543635
1109	NC_014532	AG	3	6	53939	53944	50 %	0 %	50 %	0 %	307543635
1110	NC_014532	TGA	2	6	53953	53958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307543635
1111	NC_014532	GCG	2	6	53974	53979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543635
1112	NC_014532	TTG	2	6	53980	53985	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307543635
1113	NC_014532	CGA	2	6	54052	54057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543635
1114	NC_014532	GCT	2	6	54134	54139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543635
1115	NC_014532	CATG	2	8	54182	54189	25 %	25 %	25 %	25 %	307543636
1116	NC_014532	GGT	2	6	54228	54233	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307543636
1117	NC_014532	GCT	2	6	54240	54245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543636
1118	NC_014532	GCTG	2	8	54258	54265	0 %	25 %	50 %	25 %	307543636
1119	NC_014532	CGG	2	6	54352	54357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543636
1120	NC_014532	TGA	2	6	54472	54477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307543636
1121	NC_014532	CAGG	2	8	54507	54514	25 %	0 %	50 %	25 %	307543636
1122	NC_014532	GC	3	6	54519	54524	0 %	0 %	50 %	50 %	307543636
1123	NC_014532	CGG	2	6	54560	54565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543636
1124	NC_014532	GTG	2	6	54571	54576	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307543636
1125	NC_014532	TGG	2	6	54601	54606	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307543636
1126	NC_014532	GCT	2	6	54641	54646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543636
1127	NC_014532	TCG	2	6	54721	54726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543636
1128	NC_014532	GTT	2	6	54755	54760	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307543636
1129	NC_014532	CGG	2	6	54773	54778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543636
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1157	NC_014532	CGG	2	6	56451	56456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543638
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1162	NC_014532	GTT	2	6	56641	56646	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307543638
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1239	NC_014532	GCA	2	6	60806	60811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543641
1240	NC_014532	ACT	2	6	60836	60841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307543641
1241	NC_014532	CAT	2	6	60897	60902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307543641
1242	NC_014532	GTC	2	6	60907	60912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543641
1243	NC_014532	AGG	3	9	61069	61077	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307543641
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1245	NC_014532	GGC	2	6	61154	61159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543642
1246	NC_014532	TCT	3	9	61174	61182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307543642
1247	NC_014532	GCT	2	6	61244	61249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543642
1248	NC_014532	TGA	2	6	61282	61287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307543642
1249	NC_014532	TTC	2	6	61386	61391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307543642
1250	NC_014532	GGC	2	6	61392	61397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543642
1251	NC_014532	CGG	2	6	61408	61413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543642
1252	NC_014532	GCA	2	6	61435	61440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543642
1253	NC_014532	TGA	2	6	61441	61446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307543642
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1260	NC_014532	ATC	2	6	61746	61751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307543642
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1272	NC_014532	CTT	2	6	62054	62059	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307543642
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1280	NC_014532	ACGTC	2	10	62339	62348	20 %	20 %	20 %	40 %	307543642
1281	NC_014532	GCGA	2	8	62368	62375	25 %	0 %	50 %	25 %	307543643
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1339	NC_014532	CCA	2	6	65127	65132	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307543645
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1356	NC_014532	GATG	2	8	66325	66332	25 %	25 %	50 %	0 %	307543645
1357	NC_014532	ATGCCG	2	12	66333	66344	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	307543645
1358	NC_014532	CTG	2	6	66359	66364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543645
1359	NC_014532	GCCG	2	8	66383	66390	0 %	0 %	50 %	50 %	307543645
1360	NC_014532	TGGC	2	8	66403	66410	0 %	25 %	50 %	25 %	307543645
1361	NC_014532	CGG	2	6	66445	66450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543645
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1365	NC_014532	CGGC	2	8	66582	66589	0 %	0 %	50 %	50 %	307543645
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1370	NC_014532	GGCC	2	8	66977	66984	0 %	0 %	50 %	50 %	307543646
1371	NC_014532	CGA	2	6	67015	67020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543646
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1480	NC_014532	GGGCG	2	10	72842	72851	0 %	0 %	80 %	20 %	307543652
1481	NC_014532	GCG	2	6	72916	72921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543652
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1488	NC_014532	GGCA	2	8	73694	73701	25 %	0 %	50 %	25 %	307543653
1489	NC_014532	CGGCA	2	10	73770	73779	20 %	0 %	40 %	40 %	307543653
1490	NC_014532	CTG	2	6	73783	73788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543653
1491	NC_014532	GCC	2	6	73789	73794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543653
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1493	NC_014532	GC	3	6	73876	73881	0 %	0 %	50 %	50 %	307543653
1494	NC_014532	CAC	2	6	73884	73889	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307543653
1495	NC_014532	GCC	4	12	73930	73941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543653
1496	NC_014532	CCT	2	6	73991	73996	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307543653
1497	NC_014532	GGT	2	6	74049	74054	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307543653
1498	NC_014532	GCA	2	6	74076	74081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543653
1499	NC_014532	GAAG	2	8	74175	74182	50 %	0 %	50 %	0 %	307543653
1500	NC_014532	CGA	2	6	74244	74249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543653

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