MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halomonas elongata DSM 2581 chromosome

Total Repeats: 81984

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_014532	CGCT	2	8	682551	682558	0 %	25 %	25 %	50 %	307544184
14002	NC_014532	CAC	2	6	682592	682597	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307544184
14003	NC_014532	GGC	2	6	682598	682603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544184
14004	NC_014532	GAA	2	6	682699	682704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307544184
14005	NC_014532	GAT	2	6	682727	682732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307544184
14006	NC_014532	CAC	2	6	682751	682756	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307544184
14007	NC_014532	GCC	2	6	682886	682891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307544184
14008	NC_014532	AGC	3	9	682914	682922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307544184
14009	NC_014532	GAT	2	6	682973	682978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307544184
14010	NC_014532	GC	3	6	682980	682985	0 %	0 %	50 %	50 %	307544184
14011	NC_014532	ATC	2	6	683031	683036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307544184
14012	NC_014532	GCTTG	2	10	683063	683072	0 %	40 %	40 %	20 %	307544184
14013	NC_014532	CAC	2	6	683096	683101	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307544184
14014	NC_014532	GCC	2	6	683121	683126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307544184
14015	NC_014532	GCC	2	6	683169	683174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307544184
14016	NC_014532	CGT	2	6	683244	683249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544184
14017	NC_014532	AGT	2	6	683431	683436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307544185
14018	NC_014532	TCA	2	6	683437	683442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307544185
14019	NC_014532	ATA	2	6	683447	683452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307544185
14020	NC_014532	CCG	2	6	683461	683466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307544185
14021	NC_014532	CCA	2	6	683533	683538	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307544185
14022	NC_014532	GCG	2	6	683541	683546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544185
14023	NC_014532	CGC	2	6	683554	683559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307544185
14024	NC_014532	TCG	2	6	683574	683579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544185
14025	NC_014532	GCG	3	9	683603	683611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544185
14026	NC_014532	CCA	3	9	683626	683634	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307544185
14027	NC_014532	GCG	2	6	683694	683699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544185
14028	NC_014532	CAG	2	6	683741	683746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307544185
14029	NC_014532	CGA	2	6	683749	683754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307544185
14030	NC_014532	CATC	2	8	683788	683795	25 %	25 %	0 %	50 %	307544185
14031	NC_014532	CGG	2	6	683807	683812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544185
14032	NC_014532	TTG	2	6	683820	683825	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307544185
14033	NC_014532	TGG	2	6	683833	683838	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307544185
14034	NC_014532	CAG	2	6	683861	683866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307544185
14035	NC_014532	GGT	2	6	683867	683872	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307544185
14036	NC_014532	CAG	2	6	683876	683881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307544185
14037	NC_014532	GCAGG	2	10	683978	683987	20 %	0 %	60 %	20 %	307544185
14038	NC_014532	CAG	2	6	684011	684016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307544185
14039	NC_014532	CAT	2	6	684068	684073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307544185
14040	NC_014532	TCG	2	6	684162	684167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544185
14041	NC_014532	GCA	2	6	684283	684288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307544185
14042	NC_014532	TGA	2	6	684298	684303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307544185
14043	NC_014532	AGA	3	9	684304	684312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307544185
14044	NC_014532	GC	3	6	684408	684413	0 %	0 %	50 %	50 %	307544185
14045	NC_014532	GC	3	6	684455	684460	0 %	0 %	50 %	50 %	307544185
14046	NC_014532	CAGGGC	2	12	684506	684517	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	307544185
14047	NC_014532	AGC	2	6	684532	684537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307544185
14048	NC_014532	CGATGG	2	12	684538	684549	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	307544185
14049	NC_014532	ACG	2	6	684582	684587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307544185
14050	NC_014532	CAG	2	6	684638	684643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307544185
14051	NC_014532	ATG	2	6	684660	684665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307544185
14052	NC_014532	TCT	2	6	684670	684675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307544185
14053	NC_014532	TGCC	2	8	684694	684701	0 %	25 %	25 %	50 %	307544185
14054	NC_014532	GCGG	2	8	684723	684730	0 %	0 %	75 %	25 %	307544185
14055	NC_014532	CGA	2	6	684932	684937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307544186
14056	NC_014532	TGCT	2	8	684970	684977	0 %	50 %	25 %	25 %	307544186
14057	NC_014532	ACC	2	6	685039	685044	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307544186
14058	NC_014532	GCC	2	6	685089	685094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307544186
14059	NC_014532	TCG	2	6	685126	685131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544186
14060	NC_014532	GAT	2	6	685152	685157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307544186
14061	NC_014532	GCG	2	6	685168	685173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544186
14062	NC_014532	TCGAGA	2	12	685186	685197	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	307544186
14063	NC_014532	CGG	2	6	685208	685213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544186
14064	NC_014532	CGG	2	6	685222	685227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544186
14065	NC_014532	GAT	2	6	685269	685274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307544186
14066	NC_014532	TTC	2	6	685280	685285	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307544186
14067	NC_014532	GTG	2	6	685291	685296	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307544186
14068	NC_014532	GCC	2	6	685384	685389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307544186
14069	NC_014532	GAT	2	6	685416	685421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307544186
14070	NC_014532	CTT	2	6	685457	685462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307544186
14071	NC_014532	CGGCG	2	10	685554	685563	0 %	0 %	60 %	40 %	307544186
14072	NC_014532	GCG	4	12	685573	685584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544186
14073	NC_014532	TGA	2	6	685619	685624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307544186
14074	NC_014532	CAT	2	6	686232	686237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307544187
14075	NC_014532	GGGC	2	8	686306	686313	0 %	0 %	75 %	25 %	307544187
14076	NC_014532	GGC	2	6	686351	686356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544187
14077	NC_014532	TGC	2	6	686367	686372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544187
14078	NC_014532	ATC	2	6	686408	686413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307544187
14079	NC_014532	CGC	2	6	686712	686717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307544187
14080	NC_014532	CGA	2	6	686767	686772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307544187
14081	NC_014532	ACT	2	6	686796	686801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307544187
14082	NC_014532	CGA	2	6	686806	686811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307544187
14083	NC_014532	CG	3	6	686826	686831	0 %	0 %	50 %	50 %	307544187
14084	NC_014532	TGG	2	6	686865	686870	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307544187
14085	NC_014532	CGC	2	6	686905	686910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307544187
14086	NC_014532	CCG	2	6	686928	686933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307544187
14087	NC_014532	CTT	2	6	686938	686943	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307544187
14088	NC_014532	ACCT	2	8	686945	686952	25 %	25 %	0 %	50 %	307544187
14089	NC_014532	CT	3	6	687005	687010	0 %	50 %	0 %	50 %	307544187
14090	NC_014532	CGG	2	6	687110	687115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544187
14091	NC_014532	GGC	2	6	687293	687298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544188
14092	NC_014532	GAA	3	9	687373	687381	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307544188
14093	NC_014532	CGG	2	6	687492	687497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544188
14094	NC_014532	ATG	2	6	687536	687541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307544188
14095	NC_014532	CAC	2	6	687577	687582	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307544188
14096	NC_014532	CAG	2	6	687625	687630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307544188
14097	NC_014532	CGA	2	6	687645	687650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307544188
14098	NC_014532	GCCCA	2	10	687655	687664	20 %	0 %	20 %	60 %	307544188
14099	NC_014532	CAC	2	6	687700	687705	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307544188
14100	NC_014532	TCG	2	6	687785	687790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544188
14101	NC_014532	CGA	2	6	687813	687818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307544188
14102	NC_014532	ATG	3	9	687827	687835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307544188
14103	NC_014532	GGCC	2	8	687840	687847	0 %	0 %	50 %	50 %	307544188
14104	NC_014532	CAT	2	6	687853	687858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307544188
14105	NC_014532	GAA	2	6	687898	687903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307544188
14106	NC_014532	GCG	2	6	687920	687925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544188
14107	NC_014532	TCG	2	6	687959	687964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544188
14108	NC_014532	GTC	2	6	688033	688038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544188
14109	NC_014532	GC	3	6	688048	688053	0 %	0 %	50 %	50 %	307544188
14110	NC_014532	GAT	2	6	688087	688092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307544188
14111	NC_014532	AG	3	6	688128	688133	50 %	0 %	50 %	0 %	307544188
14112	NC_014532	GTT	2	6	688146	688151	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307544188
14113	NC_014532	GGT	2	6	688186	688191	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307544188
14114	NC_014532	CGG	2	6	688197	688202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544188
14115	NC_014532	CGG	4	12	688221	688232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544188
14116	NC_014532	ATC	2	6	688256	688261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307544188
14117	NC_014532	CCA	2	6	688320	688325	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307544188
14118	NC_014532	GGT	2	6	688333	688338	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307544188
14119	NC_014532	ATC	2	6	688352	688357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307544188
14120	NC_014532	TCG	2	6	688378	688383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544188
14121	NC_014532	GAT	2	6	688408	688413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307544188
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14227	NC_014532	GCCG	3	12	695049	695060	0 %	0 %	50 %	50 %	307544194
14228	NC_014532	TGG	3	9	695066	695074	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307544194
14229	NC_014532	GCC	2	6	695092	695097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307544194
14230	NC_014532	GGC	3	9	695100	695108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544194
14231	NC_014532	TGG	2	6	695159	695164	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307544194
14232	NC_014532	AGGGC	2	10	695190	695199	20 %	0 %	60 %	20 %	307544194
14233	NC_014532	GCC	2	6	695207	695212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307544194
14234	NC_014532	CGA	2	6	695247	695252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307544194
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14236	NC_014532	GAC	2	6	695308	695313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307544194
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14345	NC_014532	ATGC	2	8	699775	699782	25 %	25 %	25 %	25 %	307544198
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14352	NC_014532	CTA	2	6	700272	700277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307544198
14353	NC_014532	ACCCG	2	10	700510	700519	20 %	0 %	20 %	60 %	307544199
14354	NC_014532	CTG	2	6	700527	700532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544199
14355	NC_014532	CAC	2	6	700613	700618	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307544199
14356	NC_014532	CCG	2	6	700681	700686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307544199
14357	NC_014532	CGC	2	6	700922	700927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307544199
14358	NC_014532	GTC	2	6	701014	701019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544199
14359	NC_014532	GCC	2	6	701097	701102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307544200
14360	NC_014532	CCAG	2	8	701127	701134	25 %	0 %	25 %	50 %	307544200
14361	NC_014532	GCC	2	6	701144	701149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307544200
14362	NC_014532	CAT	2	6	701154	701159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307544200
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14368	NC_014532	CAG	3	9	701395	701403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307544200
14369	NC_014532	TGA	2	6	701412	701417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307544200
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14371	NC_014532	AGC	2	6	701441	701446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307544200
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14375	NC_014532	ATC	2	6	701549	701554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307544200
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14390	NC_014532	CTG	2	6	702444	702449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544201
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14433	NC_014532	CAT	3	9	704175	704183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307544203
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14451	NC_014532	GCAT	2	8	704908	704915	25 %	25 %	25 %	25 %	307544204
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14453	NC_014532	GCCA	2	8	704959	704966	25 %	0 %	25 %	50 %	307544204
14454	NC_014532	TCGC	2	8	704974	704981	0 %	25 %	25 %	50 %	307544204
14455	NC_014532	ATC	2	6	704985	704990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307544204
14456	NC_014532	GGC	2	6	705015	705020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544204
14457	NC_014532	GGTCG	2	10	705039	705048	0 %	20 %	60 %	20 %	307544204
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14461	NC_014532	GCC	2	6	705157	705162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307544204
14462	NC_014532	GGC	2	6	705207	705212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544204
14463	NC_014532	TGCA	2	8	705216	705223	25 %	25 %	25 %	25 %	307544204
14464	NC_014532	CTTG	2	8	705239	705246	0 %	50 %	25 %	25 %	307544204
14465	NC_014532	CGC	2	6	705299	705304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307544204
14466	NC_014532	CCA	2	6	705341	705346	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307544204
14467	NC_014532	G	6	6	705423	705428	0 %	0 %	100 %	0 %	307544204
14468	NC_014532	CCATTC	2	12	705474	705485	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	307544204
14469	NC_014532	GCC	2	6	705501	705506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307544204
14470	NC_014532	GCA	2	6	705536	705541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307544204
14471	NC_014532	GGCGCA	2	12	705557	705568	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	307544204
14472	NC_014532	TGCG	2	8	705575	705582	0 %	25 %	50 %	25 %	307544204
14473	NC_014532	GCG	2	6	705649	705654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544204
14474	NC_014532	GGC	2	6	705665	705670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544204
14475	NC_014532	CTG	2	6	705933	705938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544205
14476	NC_014532	TTC	2	6	705942	705947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307544205
14477	NC_014532	CGA	2	6	706022	706027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307544205
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14479	NC_014532	CTG	2	6	706092	706097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544205
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