MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halomonas elongata DSM 2581 chromosome

Total Repeats: 81984

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_014532	TGGC	2	8	660538	660545	0 %	25 %	50 %	25 %	307544163
13502	NC_014532	GTG	2	6	660548	660553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307544163
13503	NC_014532	GCT	2	6	660573	660578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544163
13504	NC_014532	TTCC	2	8	660582	660589	0 %	50 %	0 %	50 %	307544163
13505	NC_014532	GTC	2	6	660597	660602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544163
13506	NC_014532	CAT	2	6	660616	660621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307544163
13507	NC_014532	TGA	2	6	660674	660679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307544163
13508	NC_014532	GAG	2	6	660685	660690	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307544163
13509	NC_014532	GGA	2	6	660699	660704	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307544163
13510	NC_014532	GCCT	2	8	660707	660714	0 %	25 %	25 %	50 %	307544163
13511	NC_014532	TCT	2	6	660762	660767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307544163
13512	NC_014532	TGG	3	9	660773	660781	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307544163
13513	NC_014532	GAC	2	6	660831	660836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307544163
13514	NC_014532	CGG	2	6	660899	660904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544163
13515	NC_014532	ACG	2	6	660947	660952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307544163
13516	NC_014532	GCT	2	6	660978	660983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544163
13517	NC_014532	TGC	2	6	660989	660994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544163
13518	NC_014532	GAG	2	6	661138	661143	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307544163
13519	NC_014532	GAA	2	6	661146	661151	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307544163
13520	NC_014532	TGC	2	6	661187	661192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544163
13521	NC_014532	GCCT	2	8	661257	661264	0 %	25 %	25 %	50 %	307544163
13522	NC_014532	ACGCC	2	10	661374	661383	20 %	0 %	20 %	60 %	307544163
13523	NC_014532	TGT	2	6	661400	661405	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307544163
13524	NC_014532	ATCT	2	8	661444	661451	25 %	50 %	0 %	25 %	307544163
13525	NC_014532	GGA	2	6	661479	661484	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307544163
13526	NC_014532	TGG	2	6	661507	661512	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307544163
13527	NC_014532	ATC	2	6	661592	661597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307544163
13528	NC_014532	CTG	2	6	661618	661623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544163
13529	NC_014532	CGG	2	6	661688	661693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544163
13530	NC_014532	CAT	2	6	661777	661782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307544164
13531	NC_014532	TGC	2	6	661866	661871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544164
13532	NC_014532	GGC	2	6	661873	661878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544164
13533	NC_014532	TGG	2	6	661905	661910	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307544164
13534	NC_014532	TAT	2	6	662013	662018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307544164
13535	NC_014532	TGC	2	6	662154	662159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544165
13536	NC_014532	CTGG	2	8	662230	662237	0 %	25 %	50 %	25 %	307544165
13537	NC_014532	ATG	2	6	662271	662276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307544165
13538	NC_014532	CGG	2	6	662283	662288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544165
13539	NC_014532	TACTGA	2	12	662367	662378	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	307544165
13540	NC_014532	TGG	2	6	662419	662424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307544165
13541	NC_014532	GCT	2	6	662464	662469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544165
13542	NC_014532	TCA	2	6	662484	662489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307544165
13543	NC_014532	CGA	2	6	662545	662550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307544165
13544	NC_014532	CTG	3	9	662612	662620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544165
13545	NC_014532	TGA	2	6	662646	662651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307544165
13546	NC_014532	GGA	2	6	662665	662670	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307544165
13547	NC_014532	CTG	2	6	662672	662677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544165
13548	NC_014532	GGA	2	6	662686	662691	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307544165
13549	NC_014532	AAG	2	6	662738	662743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307544165
13550	NC_014532	GTC	2	6	662872	662877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544166
13551	NC_014532	GCC	2	6	662881	662886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307544166
13552	NC_014532	GGCC	2	8	662955	662962	0 %	0 %	50 %	50 %	307544166
13553	NC_014532	CG	3	6	663033	663038	0 %	0 %	50 %	50 %	307544166
13554	NC_014532	ACC	2	6	663095	663100	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307544166
13555	NC_014532	GAA	2	6	663103	663108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307544166
13556	NC_014532	CTG	2	6	663151	663156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544166
13557	NC_014532	GAA	2	6	663199	663204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307544166
13558	NC_014532	TCT	2	6	663248	663253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307544166
13559	NC_014532	CGA	2	6	663261	663266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307544166
13560	NC_014532	TCAT	2	8	663304	663311	25 %	50 %	0 %	25 %	307544166
13561	NC_014532	TGC	2	6	663356	663361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544166
13562	NC_014532	CTG	2	6	663376	663381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544166
13563	NC_014532	GTG	2	6	663452	663457	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307544166
13564	NC_014532	CGAG	2	8	663555	663562	25 %	0 %	50 %	25 %	307544166
13565	NC_014532	CGC	2	6	663565	663570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307544166
13566	NC_014532	CGG	2	6	663575	663580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544166
13567	NC_014532	GCC	2	6	663583	663588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307544166
13568	NC_014532	TC	3	6	663658	663663	0 %	50 %	0 %	50 %	307544166
13569	NC_014532	GGT	2	6	663699	663704	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307544166
13570	NC_014532	CTG	2	6	663712	663717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544166
13571	NC_014532	CAGG	2	8	663747	663754	25 %	0 %	50 %	25 %	307544166
13572	NC_014532	TGG	2	6	663791	663796	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307544166
13573	NC_014532	CAG	2	6	663829	663834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307544166
13574	NC_014532	TGC	2	6	663876	663881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544166
13575	NC_014532	TGCGC	2	10	663918	663927	0 %	20 %	40 %	40 %	307544166
13576	NC_014532	CGA	2	6	664020	664025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307544166
13577	NC_014532	TAC	2	6	664074	664079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307544166
13578	NC_014532	CGA	2	6	664197	664202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307544166
13579	NC_014532	CAG	2	6	664284	664289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307544167
13580	NC_014532	GAA	2	6	664335	664340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307544167
13581	NC_014532	TGGC	2	8	664375	664382	0 %	25 %	50 %	25 %	307544167
13582	NC_014532	GTC	2	6	664389	664394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544167
13583	NC_014532	CGC	2	6	664409	664414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307544167
13584	NC_014532	CGG	2	6	664445	664450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544167
13585	NC_014532	GGTGC	2	10	664455	664464	0 %	20 %	60 %	20 %	307544167
13586	NC_014532	G	6	6	664472	664477	0 %	0 %	100 %	0 %	307544167
13587	NC_014532	GCG	2	6	664493	664498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544167
13588	NC_014532	ACC	2	6	664609	664614	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307544167
13589	NC_014532	GC	3	6	664642	664647	0 %	0 %	50 %	50 %	307544167
13590	NC_014532	TCG	3	9	664648	664656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544167
13591	NC_014532	CATC	2	8	664679	664686	25 %	25 %	0 %	50 %	307544167
13592	NC_014532	CGG	2	6	664696	664701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544167
13593	NC_014532	CAGGAT	2	12	664716	664727	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	307544167
13594	NC_014532	CAG	2	6	664782	664787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307544167
13595	NC_014532	GCC	2	6	664798	664803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307544167
13596	NC_014532	GC	3	6	664812	664817	0 %	0 %	50 %	50 %	307544167
13597	NC_014532	CCA	2	6	664844	664849	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307544167
13598	NC_014532	CGG	2	6	664922	664927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544167
13599	NC_014532	GCG	2	6	664933	664938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544167
13600	NC_014532	AGC	2	6	664939	664944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307544167
13601	NC_014532	GC	3	6	664992	664997	0 %	0 %	50 %	50 %	307544167
13602	NC_014532	GCA	2	6	665033	665038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307544167
13603	NC_014532	TCC	2	6	665051	665056	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307544168
13604	NC_014532	GGC	2	6	665118	665123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544168
13605	NC_014532	CAC	2	6	665158	665163	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307544168
13606	NC_014532	AGGTCG	2	12	665177	665188	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	307544168
13607	NC_014532	ATC	2	6	665198	665203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307544168
13608	NC_014532	GGT	2	6	665215	665220	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307544168
13609	NC_014532	CAC	2	6	665338	665343	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307544168
13610	NC_014532	ATGTCC	2	12	665435	665446	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	307544168
13611	NC_014532	CAG	2	6	665455	665460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307544168
13612	NC_014532	CGT	2	6	665484	665489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544168
13613	NC_014532	CGGC	2	8	665510	665517	0 %	0 %	50 %	50 %	307544168
13614	NC_014532	CGC	2	6	665544	665549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307544168
13615	NC_014532	GGT	2	6	665649	665654	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307544168
13616	NC_014532	ATC	2	6	665672	665677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307544168
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13618	NC_014532	GGC	2	6	665767	665772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544168
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13854	NC_014532	CGC	2	6	676176	676181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307544177
13855	NC_014532	CGC	2	6	676266	676271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307544177
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13957	NC_014532	GTG	2	6	680829	680834	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307544182
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13967	NC_014532	GC	3	6	681568	681573	0 %	0 %	50 %	50 %	307544183
13968	NC_014532	TCG	2	6	681602	681607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544183
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