MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halomonas elongata DSM 2581 chromosome

Total Repeats: 81984

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_014532	TGA	2	6	637490	637495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307544143
13002	NC_014532	CTG	2	6	637537	637542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544143
13003	NC_014532	GGT	2	6	637572	637577	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307544143
13004	NC_014532	GCC	2	6	637594	637599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307544143
13005	NC_014532	CGG	2	6	637682	637687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544143
13006	NC_014532	CCG	2	6	637718	637723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307544143
13007	NC_014532	CG	3	6	637749	637754	0 %	0 %	50 %	50 %	307544143
13008	NC_014532	GGCC	2	8	637793	637800	0 %	0 %	50 %	50 %	307544143
13009	NC_014532	CGA	2	6	637857	637862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307544143
13010	NC_014532	ATC	2	6	637873	637878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307544143
13011	NC_014532	CGG	2	6	637916	637921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544144
13012	NC_014532	TCG	2	6	637948	637953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544144
13013	NC_014532	GCC	2	6	638101	638106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307544144
13014	NC_014532	AGGC	2	8	638107	638114	25 %	0 %	50 %	25 %	307544144
13015	NC_014532	GTC	2	6	638202	638207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544144
13016	NC_014532	GAA	2	6	638352	638357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307544144
13017	NC_014532	GCC	2	6	638364	638369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307544144
13018	NC_014532	CGATAG	2	12	638428	638439	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	307544144
13019	NC_014532	GGC	2	6	638534	638539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544144
13020	NC_014532	ATG	2	6	638541	638546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307544144
13021	NC_014532	CCA	2	6	638558	638563	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307544144
13022	NC_014532	TGT	2	6	638603	638608	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307544144
13023	NC_014532	GAA	2	6	638610	638615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307544144
13024	NC_014532	CGC	2	6	638621	638626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307544144
13025	NC_014532	CGC	2	6	638726	638731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307544144
13026	NC_014532	CTGC	2	8	638758	638765	0 %	25 %	25 %	50 %	307544144
13027	NC_014532	CCG	2	6	638809	638814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307544144
13028	NC_014532	CCT	2	6	638998	639003	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307544145
13029	NC_014532	CGG	2	6	639019	639024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544145
13030	NC_014532	CGGGTG	2	12	639114	639125	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	307544145
13031	NC_014532	CCT	2	6	639154	639159	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307544145
13032	NC_014532	GCT	2	6	639311	639316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544145
13033	NC_014532	TTC	2	6	639329	639334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307544145
13034	NC_014532	GGC	2	6	639386	639391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544145
13035	NC_014532	GCT	2	6	639401	639406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544145
13036	NC_014532	CATC	2	8	639409	639416	25 %	25 %	0 %	50 %	307544145
13037	NC_014532	CTG	2	6	639450	639455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544145
13038	NC_014532	CGG	2	6	639475	639480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544145
13039	NC_014532	CGG	2	6	639496	639501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544145
13040	NC_014532	CGC	2	6	639509	639514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307544145
13041	NC_014532	TCG	2	6	639557	639562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544145
13042	NC_014532	GGT	2	6	639638	639643	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307544145
13043	NC_014532	TGG	2	6	639652	639657	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307544145
13044	NC_014532	GCC	2	6	639660	639665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307544145
13045	NC_014532	CGT	2	6	639695	639700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544145
13046	NC_014532	GGC	2	6	639705	639710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544145
13047	NC_014532	CGC	2	6	639779	639784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307544145
13048	NC_014532	TGC	2	6	639865	639870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544145
13049	NC_014532	GCG	2	6	639914	639919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544145
13050	NC_014532	TCA	2	6	639922	639927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307544145
13051	NC_014532	GGC	2	6	640012	640017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544145
13052	NC_014532	GACG	2	8	640061	640068	25 %	0 %	50 %	25 %	307544145
13053	NC_014532	ATCG	2	8	640119	640126	25 %	25 %	25 %	25 %	307544145
13054	NC_014532	CTGG	2	8	640148	640155	0 %	25 %	50 %	25 %	307544145
13055	NC_014532	CAC	2	6	640164	640169	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307544145
13056	NC_014532	GGC	2	6	640187	640192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544145
13057	NC_014532	CCGC	2	8	640198	640205	0 %	0 %	25 %	75 %	307544145
13058	NC_014532	AGC	2	6	640369	640374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307544146
13059	NC_014532	G	6	6	640379	640384	0 %	0 %	100 %	0 %	307544146
13060	NC_014532	TGG	2	6	640420	640425	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307544146
13061	NC_014532	CAT	2	6	640436	640441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307544146
13062	NC_014532	TCA	2	6	640450	640455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307544146
13063	NC_014532	CAT	2	6	640658	640663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307544146
13064	NC_014532	TGA	2	6	640681	640686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307544146
13065	NC_014532	TG	3	6	640702	640707	0 %	50 %	50 %	0 %	307544146
13066	NC_014532	TCA	2	6	640714	640719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307544146
13067	NC_014532	CCT	2	6	640750	640755	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307544146
13068	NC_014532	CGG	2	6	640762	640767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544146
13069	NC_014532	CGGC	2	8	640771	640778	0 %	0 %	50 %	50 %	307544146
13070	NC_014532	TGG	2	6	640825	640830	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307544146
13071	NC_014532	CGGTG	2	10	640832	640841	0 %	20 %	60 %	20 %	307544146
13072	NC_014532	CGC	2	6	640873	640878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307544146
13073	NC_014532	ACC	2	6	640887	640892	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307544146
13074	NC_014532	TGA	2	6	640894	640899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307544146
13075	NC_014532	TGG	2	6	640924	640929	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307544146
13076	NC_014532	CGC	2	6	640976	640981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307544146
13077	NC_014532	CTG	2	6	640983	640988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544146
13078	NC_014532	TGG	3	9	640993	641001	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307544146
13079	NC_014532	TCT	2	6	641005	641010	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307544146
13080	NC_014532	GAC	2	6	641019	641024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307544146
13081	NC_014532	GGCT	2	8	641085	641092	0 %	25 %	50 %	25 %	307544146
13082	NC_014532	GCT	3	9	641090	641098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544146
13083	NC_014532	GCCG	2	8	641099	641106	0 %	0 %	50 %	50 %	307544146
13084	NC_014532	TCG	2	6	641107	641112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544146
13085	NC_014532	CCG	2	6	641129	641134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307544146
13086	NC_014532	CTGG	2	8	641189	641196	0 %	25 %	50 %	25 %	307544146
13087	NC_014532	GCT	2	6	641210	641215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544146
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13089	NC_014532	CATTG	2	10	641318	641327	20 %	40 %	20 %	20 %	307544146
13090	NC_014532	CGG	2	6	641348	641353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544146
13091	NC_014532	TGC	2	6	641374	641379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544146
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13093	NC_014532	CTT	2	6	641465	641470	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307544146
13094	NC_014532	GGC	2	6	641477	641482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544146
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13098	NC_014532	TGC	2	6	641692	641697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544146
13099	NC_014532	CT	3	6	641704	641709	0 %	50 %	0 %	50 %	307544146
13100	NC_014532	AGG	2	6	641755	641760	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307544146
13101	NC_014532	CGG	2	6	642018	642023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544147
13102	NC_014532	TTC	2	6	642095	642100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307544147
13103	NC_014532	ATA	2	6	642126	642131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307544147
13104	NC_014532	GGAA	2	8	642145	642152	50 %	0 %	50 %	0 %	307544147
13105	NC_014532	AAGG	2	8	642218	642225	50 %	0 %	50 %	0 %	307544147
13106	NC_014532	GGC	2	6	642305	642310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544147
13107	NC_014532	GTG	2	6	642348	642353	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307544147
13108	NC_014532	CATT	2	8	642395	642402	25 %	50 %	0 %	25 %	307544147
13109	NC_014532	ATG	2	6	642528	642533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307544147
13110	NC_014532	GCC	2	6	642550	642555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307544147
13111	NC_014532	GCT	2	6	642571	642576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544147
13112	NC_014532	TCA	2	6	642676	642681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307544147
13113	NC_014532	CGA	2	6	642736	642741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307544147
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13115	NC_014532	CTG	2	6	642815	642820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544147
13116	NC_014532	GGA	2	6	642826	642831	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307544147
13117	NC_014532	CCGGG	2	10	642835	642844	0 %	0 %	60 %	40 %	307544147
13118	NC_014532	TCA	2	6	642855	642860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307544147
13119	NC_014532	GAG	2	6	642869	642874	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307544147
13120	NC_014532	TCA	2	6	642876	642881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307544147
13121	NC_014532	GAG	2	6	642926	642931	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307544147
13122	NC_014532	GAG	2	6	642971	642976	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307544147
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13220	NC_014532	CCAC	2	8	647910	647917	25 %	0 %	0 %	75 %	307544152
13221	NC_014532	CG	3	6	647967	647972	0 %	0 %	50 %	50 %	307544152
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13230	NC_014532	AGCA	2	8	648320	648327	50 %	0 %	25 %	25 %	307544152
13231	NC_014532	CG	3	6	648331	648336	0 %	0 %	50 %	50 %	307544152
13232	NC_014532	GC	3	6	648350	648355	0 %	0 %	50 %	50 %	307544152
13233	NC_014532	CGC	2	6	648376	648381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307544152
13234	NC_014532	CTTC	2	8	648396	648403	0 %	50 %	0 %	50 %	307544152
13235	NC_014532	CCG	2	6	648567	648572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307544152
13236	NC_014532	CG	3	6	648675	648680	0 %	0 %	50 %	50 %	307544153
13237	NC_014532	CGGG	2	8	648733	648740	0 %	0 %	75 %	25 %	307544153
13238	NC_014532	GAC	2	6	648747	648752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307544153
13239	NC_014532	CGA	2	6	648845	648850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307544153
13240	NC_014532	GC	3	6	648912	648917	0 %	0 %	50 %	50 %	307544153
13241	NC_014532	CGTG	2	8	648971	648978	0 %	25 %	50 %	25 %	307544153
13242	NC_014532	GCGTCA	2	12	649049	649060	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	307544153
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13343	NC_014532	TGG	3	9	653276	653284	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307544156
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13354	NC_014532	GGGC	2	8	653538	653545	0 %	0 %	75 %	25 %	307544156
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13357	NC_014532	TGC	2	6	653612	653617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544156
13358	NC_014532	TGC	2	6	653633	653638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544156
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13431	NC_014532	CGGA	2	8	656660	656667	25 %	0 %	50 %	25 %	307544159
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13454	NC_014532	CCTT	2	8	658327	658334	0 %	50 %	0 %	50 %	307544161
13455	NC_014532	GCC	2	6	658342	658347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307544161
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13457	NC_014532	TCG	2	6	658442	658447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544161
13458	NC_014532	ACT	2	6	658529	658534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307544161
13459	NC_014532	AGC	2	6	658580	658585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307544161
13460	NC_014532	CCGATG	2	12	658589	658600	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	307544161
13461	NC_014532	CTG	2	6	658880	658885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544162
13462	NC_014532	CGC	2	6	658895	658900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307544162
13463	NC_014532	GAC	2	6	658914	658919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307544162
13464	NC_014532	AAG	2	6	658936	658941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307544162
13465	NC_014532	GCT	2	6	658963	658968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544162
13466	NC_014532	GCG	2	6	658994	658999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544162
13467	NC_014532	CTG	2	6	659033	659038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544162
13468	NC_014532	CG	3	6	659150	659155	0 %	0 %	50 %	50 %	307544162
13469	NC_014532	CTG	2	6	659225	659230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544162
13470	NC_014532	CT	3	6	659290	659295	0 %	50 %	0 %	50 %	307544162
13471	NC_014532	GCG	2	6	659322	659327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544162
13472	NC_014532	CGGC	2	8	659350	659357	0 %	0 %	50 %	50 %	307544162
13473	NC_014532	GGC	2	6	659425	659430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544162
13474	NC_014532	GAGC	2	8	659483	659490	25 %	0 %	50 %	25 %	307544162
13475	NC_014532	GCC	2	6	659492	659497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307544162
13476	NC_014532	TCG	2	6	659544	659549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544162
13477	NC_014532	GGCA	2	8	659586	659593	25 %	0 %	50 %	25 %	307544162
13478	NC_014532	CTG	2	6	659594	659599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544162
13479	NC_014532	TGC	2	6	659634	659639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544162
13480	NC_014532	AGG	2	6	659652	659657	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307544162
13481	NC_014532	GTG	2	6	659702	659707	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307544162
13482	NC_014532	TGC	2	6	659726	659731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544162
13483	NC_014532	GTG	2	6	659813	659818	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307544162
13484	NC_014532	GTT	2	6	659878	659883	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307544162
13485	NC_014532	CGGC	2	8	659885	659892	0 %	0 %	50 %	50 %	307544162
13486	NC_014532	GATG	2	8	659986	659993	25 %	25 %	50 %	0 %	307544162
13487	NC_014532	GGTC	2	8	659998	660005	0 %	25 %	50 %	25 %	307544162
13488	NC_014532	GGGC	2	8	660045	660052	0 %	0 %	75 %	25 %	307544163
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13490	NC_014532	CGC	2	6	660098	660103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307544163
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13492	NC_014532	GC	3	6	660176	660181	0 %	0 %	50 %	50 %	307544163
13493	NC_014532	CTG	3	9	660307	660315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544163
13494	NC_014532	GGC	3	9	660318	660326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544163
13495	NC_014532	TGC	2	6	660386	660391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544163
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13498	NC_014532	CTG	3	9	660445	660453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544163
13499	NC_014532	GGC	2	6	660497	660502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544163
13500	NC_014532	GCT	2	6	660531	660536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544163

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