MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halomonas elongata DSM 2581 chromosome

Total Repeats: 81984

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_014532	CAG	2	6	613765	613770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307544122
12502	NC_014532	CGG	2	6	613833	613838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544122
12503	NC_014532	TGG	2	6	613863	613868	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307544122
12504	NC_014532	CAG	2	6	613906	613911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307544122
12505	NC_014532	AGC	2	6	613919	613924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307544122
12506	NC_014532	AGC	2	6	613931	613936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307544122
12507	NC_014532	CAC	2	6	613957	613962	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307544122
12508	NC_014532	GGC	2	6	613984	613989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544122
12509	NC_014532	GCGA	2	8	613995	614002	25 %	0 %	50 %	25 %	307544122
12510	NC_014532	CGG	2	6	614028	614033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544122
12511	NC_014532	CAC	2	6	614034	614039	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307544122
12512	NC_014532	CAG	2	6	614062	614067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307544122
12513	NC_014532	CGT	2	6	614068	614073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544122
12514	NC_014532	CG	3	6	614094	614099	0 %	0 %	50 %	50 %	307544122
12515	NC_014532	CAG	3	9	614149	614157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307544122
12516	NC_014532	CGA	2	6	614175	614180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307544122
12517	NC_014532	CTG	2	6	614182	614187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544122
12518	NC_014532	CCG	2	6	614219	614224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307544122
12519	NC_014532	CAGC	2	8	614230	614237	25 %	0 %	25 %	50 %	307544122
12520	NC_014532	GC	3	6	614278	614283	0 %	0 %	50 %	50 %	307544122
12521	NC_014532	CCA	3	9	614322	614330	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307544122
12522	NC_014532	CGG	2	6	614382	614387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544122
12523	NC_014532	GCG	2	6	614396	614401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544122
12524	NC_014532	CGA	2	6	614436	614441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307544123
12525	NC_014532	TAA	2	6	614493	614498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307544123
12526	NC_014532	GCG	3	9	614594	614602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544123
12527	NC_014532	CCAG	2	8	614631	614638	25 %	0 %	25 %	50 %	307544123
12528	NC_014532	GTT	2	6	614674	614679	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307544123
12529	NC_014532	GCC	3	9	614691	614699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307544123
12530	NC_014532	TGC	2	6	614700	614705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544123
12531	NC_014532	GAT	2	6	614725	614730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307544123
12532	NC_014532	GGA	2	6	614740	614745	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307544123
12533	NC_014532	CTG	2	6	614747	614752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544123
12534	NC_014532	ACCT	2	8	614843	614850	25 %	25 %	0 %	50 %	307544123
12535	NC_014532	CGG	2	6	614889	614894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544123
12536	NC_014532	TCA	2	6	614931	614936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307544123
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12538	NC_014532	CGA	3	9	615079	615087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307544123
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12540	NC_014532	GC	3	6	615229	615234	0 %	0 %	50 %	50 %	307544123
12541	NC_014532	TGG	2	6	615297	615302	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307544123
12542	NC_014532	TCG	2	6	615399	615404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544123
12543	NC_014532	GCA	2	6	615510	615515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307544124
12544	NC_014532	TCG	2	6	615525	615530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544124
12545	NC_014532	GCC	2	6	615560	615565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307544124
12546	NC_014532	CTG	2	6	615638	615643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544124
12547	NC_014532	CTT	2	6	615685	615690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307544124
12548	NC_014532	GCT	2	6	615709	615714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544124
12549	NC_014532	GC	3	6	615722	615727	0 %	0 %	50 %	50 %	307544124
12550	NC_014532	TGG	2	6	615789	615794	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307544124
12551	NC_014532	ACC	2	6	615866	615871	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307544124
12552	NC_014532	CATG	2	8	615883	615890	25 %	25 %	25 %	25 %	307544124
12553	NC_014532	GTT	2	6	615898	615903	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307544124
12554	NC_014532	CAT	3	9	615919	615927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307544124
12555	NC_014532	GAC	2	6	615932	615937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307544124
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12559	NC_014532	GCTG	2	8	616038	616045	0 %	25 %	50 %	25 %	307544124
12560	NC_014532	CCGGC	2	10	616136	616145	0 %	0 %	40 %	60 %	307544124
12561	NC_014532	ACA	2	6	616155	616160	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307544124
12562	NC_014532	GCT	2	6	616168	616173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544124
12563	NC_014532	CGGGG	2	10	616183	616192	0 %	0 %	80 %	20 %	307544124
12564	NC_014532	CAC	2	6	616207	616212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307544124
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12566	NC_014532	GTCGC	2	10	616306	616315	0 %	20 %	40 %	40 %	307544124
12567	NC_014532	CTGG	2	8	616408	616415	0 %	25 %	50 %	25 %	307544124
12568	NC_014532	CAGGA	2	10	616426	616435	40 %	0 %	40 %	20 %	307544124
12569	NC_014532	CGA	2	6	616717	616722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307544125
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12571	NC_014532	CGGC	2	8	616758	616765	0 %	0 %	50 %	50 %	307544125
12572	NC_014532	CTG	2	6	616772	616777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544125
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12587	NC_014532	CG	3	6	617418	617423	0 %	0 %	50 %	50 %	307544125
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12590	NC_014532	TGC	2	6	617469	617474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544125
12591	NC_014532	CGG	2	6	617485	617490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544125
12592	NC_014532	GAGC	2	8	617509	617516	25 %	0 %	50 %	25 %	307544125
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12598	NC_014532	GGT	2	6	617702	617707	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307544125
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12602	NC_014532	CGC	2	6	617858	617863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307544125
12603	NC_014532	TCG	2	6	617937	617942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544125
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12605	NC_014532	CGG	2	6	617988	617993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544125
12606	NC_014532	CAT	2	6	618004	618009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307544125
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12609	NC_014532	GGA	3	9	618061	618069	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307544125
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12611	NC_014532	GA	3	6	618223	618228	50 %	0 %	50 %	0 %	307544126
12612	NC_014532	CGG	2	6	618237	618242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544126
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12617	NC_014532	CTGGG	2	10	618392	618401	0 %	20 %	60 %	20 %	307544126
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12619	NC_014532	CG	3	6	618570	618575	0 %	0 %	50 %	50 %	307544126
12620	NC_014532	TTC	2	6	618647	618652	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307544126
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12728	NC_014532	GCCA	2	8	623923	623930	25 %	0 %	25 %	50 %	307544130
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12732	NC_014532	CAG	2	6	624153	624158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307544131
12733	NC_014532	GTC	3	9	624321	624329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544131
12734	NC_014532	CGG	2	6	624344	624349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544131
12735	NC_014532	GCCG	2	8	624369	624376	0 %	0 %	50 %	50 %	307544131
12736	NC_014532	GAT	2	6	624474	624479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307544131
12737	NC_014532	GCA	2	6	624497	624502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307544131
12738	NC_014532	GCC	2	6	624616	624621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307544131
12739	NC_014532	TGG	2	6	624626	624631	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307544131
12740	NC_014532	CGCT	2	8	624670	624677	0 %	25 %	25 %	50 %	307544131
12741	NC_014532	ACG	2	6	624691	624696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307544131
12742	NC_014532	GCGTC	2	10	624737	624746	0 %	20 %	40 %	40 %	307544131
12743	NC_014532	CGG	2	6	624772	624777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544131
12744	NC_014532	TCGAC	2	10	624802	624811	20 %	20 %	20 %	40 %	307544131
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12757	NC_014532	GT	3	6	625277	625282	0 %	50 %	50 %	0 %	307544131
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12760	NC_014532	CTGG	2	8	625323	625330	0 %	25 %	50 %	25 %	307544131
12761	NC_014532	ATGA	2	8	625350	625357	50 %	25 %	25 %	0 %	307544131
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12767	NC_014532	GCG	2	6	625668	625673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544131
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12769	NC_014532	GGC	2	6	625734	625739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544131
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12774	NC_014532	CCAGGG	2	12	625902	625913	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	307544131
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12819	NC_014532	TGA	2	6	628210	628215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307544134
12820	NC_014532	CTG	2	6	628263	628268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544134
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12842	NC_014532	TGC	2	6	629136	629141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544135
12843	NC_014532	TGA	2	6	629148	629153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307544135
12844	NC_014532	TTC	2	6	629165	629170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307544135
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12847	NC_014532	GAAGA	2	10	629222	629231	60 %	0 %	40 %	0 %	307544135
12848	NC_014532	CTG	2	6	629258	629263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544135
12849	NC_014532	TCT	2	6	629289	629294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307544135
12850	NC_014532	GGC	3	9	629338	629346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544135
12851	NC_014532	GAT	2	6	629434	629439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307544135
12852	NC_014532	GGGCTG	2	12	629537	629548	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	307544135
12853	NC_014532	CTG	2	6	629564	629569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544135
12854	NC_014532	CTG	2	6	629588	629593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544135
12855	NC_014532	CTT	2	6	629602	629607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307544135
12856	NC_014532	CTG	3	9	629621	629629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544135
12857	NC_014532	GCT	2	6	629704	629709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544135
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12959	NC_014532	GCA	2	6	635339	635344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307544141
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12965	NC_014532	CCAG	2	8	635555	635562	25 %	0 %	25 %	50 %	307544141
12966	NC_014532	CAGC	2	8	635564	635571	25 %	0 %	25 %	50 %	307544141
12967	NC_014532	TCA	2	6	635840	635845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307544142
12968	NC_014532	TCC	2	6	635860	635865	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307544142
12969	NC_014532	CGC	2	6	635960	635965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307544142
12970	NC_014532	CCCA	2	8	635974	635981	25 %	0 %	0 %	75 %	307544142
12971	NC_014532	CGT	2	6	636011	636016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544142
12972	NC_014532	CGA	2	6	636035	636040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307544142
12973	NC_014532	GTT	2	6	636051	636056	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307544142
12974	NC_014532	TGG	2	6	636095	636100	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307544142
12975	NC_014532	TGG	2	6	636115	636120	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307544142
12976	NC_014532	GGT	2	6	636195	636200	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307544142
12977	NC_014532	AGT	2	6	636233	636238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307544142
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12979	NC_014532	CGA	2	6	636338	636343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307544142
12980	NC_014532	TGC	2	6	636398	636403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544142
12981	NC_014532	ACG	2	6	636421	636426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307544142
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12989	NC_014532	GCG	2	6	636751	636756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544142
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12991	NC_014532	TGG	2	6	636999	637004	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307544143
12992	NC_014532	GTG	2	6	637100	637105	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307544143
12993	NC_014532	GCGCC	2	10	637125	637134	0 %	0 %	40 %	60 %	307544143
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12995	NC_014532	CGG	2	6	637290	637295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544143
12996	NC_014532	AGCC	2	8	637296	637303	25 %	0 %	25 %	50 %	307544143
12997	NC_014532	GGCT	2	8	637375	637382	0 %	25 %	50 %	25 %	307544143
12998	NC_014532	CTG	2	6	637419	637424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544143
12999	NC_014532	TG	3	6	637459	637464	0 %	50 %	50 %	0 %	307544143
13000	NC_014532	GTC	2	6	637468	637473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544143

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