MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halomonas elongata DSM 2581 chromosome

Total Repeats: 81984

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_014532	GAT	2	6	543810	543815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307544068
11002	NC_014532	GCG	2	6	543834	543839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544068
11003	NC_014532	CAC	2	6	543852	543857	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307544068
11004	NC_014532	TCA	2	6	543905	543910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307544068
11005	NC_014532	GCC	2	6	543922	543927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307544068
11006	NC_014532	CGTG	2	8	543939	543946	0 %	25 %	50 %	25 %	307544068
11007	NC_014532	GCT	2	6	543948	543953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544068
11008	NC_014532	GTG	2	6	543961	543966	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307544068
11009	NC_014532	CAT	2	6	544008	544013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307544068
11010	NC_014532	CG	3	6	544034	544039	0 %	0 %	50 %	50 %	307544068
11011	NC_014532	TGA	2	6	544115	544120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307544068
11012	NC_014532	GCT	2	6	544128	544133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544068
11013	NC_014532	CCGA	2	8	544150	544157	25 %	0 %	25 %	50 %	307544068
11014	NC_014532	CGT	2	6	544185	544190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544068
11015	NC_014532	TTC	2	6	544231	544236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307544068
11016	NC_014532	CCG	2	6	544238	544243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307544068
11017	NC_014532	CCG	2	6	544292	544297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307544068
11018	NC_014532	GTT	2	6	544353	544358	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307544068
11019	NC_014532	CGAC	2	8	544367	544374	25 %	0 %	25 %	50 %	307544068
11020	NC_014532	CTG	2	6	544384	544389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544068
11021	NC_014532	TGC	3	9	544403	544411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544068
11022	NC_014532	TGG	2	6	544412	544417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307544068
11023	NC_014532	CGC	2	6	544440	544445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307544068
11024	NC_014532	ATC	2	6	544453	544458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307544068
11025	NC_014532	TGA	2	6	544481	544486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307544068
11026	NC_014532	TGA	2	6	544535	544540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307544068
11027	NC_014532	CGC	2	6	544553	544558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307544068
11028	NC_014532	ATC	2	6	544588	544593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307544068
11029	NC_014532	CGTG	2	8	544617	544624	0 %	25 %	50 %	25 %	307544068
11030	NC_014532	GCC	2	6	544787	544792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307544069
11031	NC_014532	GGC	2	6	544871	544876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544069
11032	NC_014532	TTCA	2	8	544922	544929	25 %	50 %	0 %	25 %	307544069
11033	NC_014532	ATG	2	6	544953	544958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307544069
11034	NC_014532	GCGG	2	8	544984	544991	0 %	0 %	75 %	25 %	307544069
11035	NC_014532	GAT	2	6	545194	545199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307544069
11036	NC_014532	GCG	2	6	545323	545328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544070
11037	NC_014532	ATG	2	6	545329	545334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307544070
11038	NC_014532	CGTG	2	8	545361	545368	0 %	25 %	50 %	25 %	307544070
11039	NC_014532	CGA	2	6	545382	545387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307544070
11040	NC_014532	TGC	2	6	545562	545567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544070
11041	NC_014532	GTG	2	6	545569	545574	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307544070
11042	NC_014532	CG	4	8	545647	545654	0 %	0 %	50 %	50 %	307544070
11043	NC_014532	ATC	2	6	545731	545736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307544070
11044	NC_014532	CGG	2	6	545759	545764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544070
11045	NC_014532	CG	3	6	545769	545774	0 %	0 %	50 %	50 %	307544070
11046	NC_014532	TCG	2	6	545828	545833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544070
11047	NC_014532	GC	3	6	545846	545851	0 %	0 %	50 %	50 %	307544070
11048	NC_014532	TGA	2	6	545876	545881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307544070
11049	NC_014532	GGT	2	6	545883	545888	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307544070
11050	NC_014532	ATC	2	6	545894	545899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307544070
11051	NC_014532	AGG	2	6	545915	545920	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307544070
11052	NC_014532	TGA	2	6	545943	545948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307544070
11053	NC_014532	CGATG	2	10	545952	545961	20 %	20 %	40 %	20 %	307544070
11054	NC_014532	G	6	6	545991	545996	0 %	0 %	100 %	0 %	307544070
11055	NC_014532	GCA	2	6	546054	546059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307544070
11056	NC_014532	CGGC	2	8	546105	546112	0 %	0 %	50 %	50 %	307544070
11057	NC_014532	ATC	2	6	546173	546178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307544070
11058	NC_014532	CG	3	6	546237	546242	0 %	0 %	50 %	50 %	307544070
11059	NC_014532	CGC	2	6	546254	546259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307544070
11060	NC_014532	CACG	2	8	546331	546338	25 %	0 %	25 %	50 %	307544070
11061	NC_014532	CGG	2	6	546342	546347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544070
11062	NC_014532	CGG	2	6	546449	546454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544070
11063	NC_014532	CG	3	6	546499	546504	0 %	0 %	50 %	50 %	307544070
11064	NC_014532	GAT	2	6	546564	546569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307544071
11065	NC_014532	GC	3	6	546805	546810	0 %	0 %	50 %	50 %	307544071
11066	NC_014532	CCAGC	2	10	546890	546899	20 %	0 %	20 %	60 %	307544071
11067	NC_014532	GCA	2	6	547025	547030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307544071
11068	NC_014532	CGC	2	6	547051	547056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307544071
11069	NC_014532	TCG	2	6	547063	547068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544071
11070	NC_014532	GAT	2	6	547092	547097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307544071
11071	NC_014532	GCCT	2	8	547102	547109	0 %	25 %	25 %	50 %	307544071
11072	NC_014532	GCA	2	6	547120	547125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307544071
11073	NC_014532	ATCG	2	8	547155	547162	25 %	25 %	25 %	25 %	307544071
11074	NC_014532	CAG	2	6	547211	547216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307544071
11075	NC_014532	GTC	2	6	547271	547276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544071
11076	NC_014532	TTG	2	6	547294	547299	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307544071
11077	NC_014532	TCAG	2	8	547311	547318	25 %	25 %	25 %	25 %	307544071
11078	NC_014532	CGGCT	2	10	547369	547378	0 %	20 %	40 %	40 %	307544071
11079	NC_014532	TGA	2	6	547447	547452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307544071
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11081	NC_014532	CAT	2	6	547586	547591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307544071
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11085	NC_014532	TGC	2	6	547883	547888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544072
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11088	NC_014532	CCA	2	6	548013	548018	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307544072
11089	NC_014532	TCG	2	6	548057	548062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544072
11090	NC_014532	GTC	2	6	548203	548208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544072
11091	NC_014532	TG	4	8	548214	548221	0 %	50 %	50 %	0 %	307544072
11092	NC_014532	GCTG	2	8	548250	548257	0 %	25 %	50 %	25 %	307544072
11093	NC_014532	CCA	2	6	548289	548294	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307544072
11094	NC_014532	GC	3	6	548330	548335	0 %	0 %	50 %	50 %	307544072
11095	NC_014532	CGGT	2	8	548375	548382	0 %	25 %	50 %	25 %	307544072
11096	NC_014532	CTC	2	6	548386	548391	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307544072
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11098	NC_014532	GTA	2	6	548404	548409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307544072
11099	NC_014532	GCG	2	6	548437	548442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544072
11100	NC_014532	GCA	2	6	548475	548480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307544072
11101	NC_014532	GCA	2	6	548502	548507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307544072
11102	NC_014532	GCC	2	6	548515	548520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307544072
11103	NC_014532	CGT	2	6	548541	548546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544072
11104	NC_014532	AGA	2	6	548565	548570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307544072
11105	NC_014532	GGT	2	6	548577	548582	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307544072
11106	NC_014532	GCCCA	2	10	548606	548615	20 %	0 %	20 %	60 %	307544072
11107	NC_014532	GCA	2	6	548616	548621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307544072
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11109	NC_014532	GGC	2	6	548725	548730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544072
11110	NC_014532	GCG	2	6	548736	548741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544072
11111	NC_014532	GCA	2	6	548742	548747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307544072
11112	NC_014532	CAG	3	9	548764	548772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307544072
11113	NC_014532	GAT	2	6	548797	548802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307544072
11114	NC_014532	GGGC	2	8	548835	548842	0 %	0 %	75 %	25 %	307544072
11115	NC_014532	TCGCC	2	10	548937	548946	0 %	20 %	20 %	60 %	307544073
11116	NC_014532	TCG	2	6	548975	548980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544073
11117	NC_014532	GTC	2	6	549004	549009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544073
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11119	NC_014532	GCA	2	6	549048	549053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307544073
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11232	NC_014532	TCG	2	6	555429	555434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544076
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11359	NC_014532	GTT	2	6	560164	560169	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307544077
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11363	NC_014532	TCG	2	6	560258	560263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544077
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11477	NC_014532	GGC	2	6	565829	565834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544080
11478	NC_014532	CAT	2	6	565841	565846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307544080
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11481	NC_014532	TGA	2	6	566167	566172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307544080
11482	NC_014532	GTT	2	6	567306	567311	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307544081
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