MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halomonas elongata DSM 2581 chromosome

Total Repeats: 81984

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_014532	CAA	2	6	518165	518170	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307544049
10502	NC_014532	CTG	2	6	518190	518195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544049
10503	NC_014532	GAT	2	6	518319	518324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307544049
10504	NC_014532	GCC	2	6	518337	518342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307544049
10505	NC_014532	GCG	2	6	518357	518362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544049
10506	NC_014532	CAGC	2	8	518369	518376	25 %	0 %	25 %	50 %	307544049
10507	NC_014532	GTG	2	6	518380	518385	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307544049
10508	NC_014532	CGC	2	6	518419	518424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307544049
10509	NC_014532	CGAG	2	8	518468	518475	25 %	0 %	50 %	25 %	307544049
10510	NC_014532	TGG	2	6	518714	518719	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307544050
10511	NC_014532	GA	3	6	518788	518793	50 %	0 %	50 %	0 %	307544050
10512	NC_014532	GTC	2	6	518957	518962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544050
10513	NC_014532	GGC	2	6	518974	518979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544050
10514	NC_014532	GC	3	6	518984	518989	0 %	0 %	50 %	50 %	307544050
10515	NC_014532	TTCCTC	2	12	519092	519103	0 %	50 %	0 %	50 %	307544050
10516	NC_014532	GCA	2	6	519223	519228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307544050
10517	NC_014532	CGG	2	6	519303	519308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544050
10518	NC_014532	CCT	2	6	519453	519458	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307544050
10519	NC_014532	CCA	2	6	519463	519468	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307544050
10520	NC_014532	TCG	2	6	519658	519663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544051
10521	NC_014532	CGAG	2	8	519710	519717	25 %	0 %	50 %	25 %	307544051
10522	NC_014532	CGA	2	6	519881	519886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307544051
10523	NC_014532	GGCG	2	8	519926	519933	0 %	0 %	75 %	25 %	307544051
10524	NC_014532	TCG	2	6	519951	519956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544051
10525	NC_014532	CGA	2	6	519967	519972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307544051
10526	NC_014532	TCC	2	6	520048	520053	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307544051
10527	NC_014532	AGCC	2	8	520054	520061	25 %	0 %	25 %	50 %	307544051
10528	NC_014532	T	6	6	520065	520070	0 %	100 %	0 %	0 %	307544051
10529	NC_014532	GACG	2	8	520103	520110	25 %	0 %	50 %	25 %	307544051
10530	NC_014532	CG	3	6	520141	520146	0 %	0 %	50 %	50 %	307544051
10531	NC_014532	CG	3	6	520150	520155	0 %	0 %	50 %	50 %	307544051
10532	NC_014532	GCCCTG	2	12	520185	520196	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	307544051
10533	NC_014532	TG	3	6	520231	520236	0 %	50 %	50 %	0 %	307544051
10534	NC_014532	GA	3	6	520335	520340	50 %	0 %	50 %	0 %	307544051
10535	NC_014532	AGC	2	6	520363	520368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307544051
10536	NC_014532	ACC	2	6	520454	520459	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307544051
10537	NC_014532	CT	3	6	520463	520468	0 %	50 %	0 %	50 %	307544051
10538	NC_014532	TGT	2	6	521063	521068	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307544052
10539	NC_014532	GC	3	6	521099	521104	0 %	0 %	50 %	50 %	307544052
10540	NC_014532	GTCA	2	8	521108	521115	25 %	25 %	25 %	25 %	307544052
10541	NC_014532	GGA	2	6	521133	521138	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307544052
10542	NC_014532	GAA	2	6	521188	521193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307544052
10543	NC_014532	CGG	2	6	521235	521240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544052
10544	NC_014532	CAA	2	6	521256	521261	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307544052
10545	NC_014532	CG	3	6	521303	521308	0 %	0 %	50 %	50 %	307544052
10546	NC_014532	CGAG	2	8	521385	521392	25 %	0 %	50 %	25 %	307544052
10547	NC_014532	GCG	2	6	521464	521469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544052
10548	NC_014532	GGCC	2	8	521475	521482	0 %	0 %	50 %	50 %	307544052
10549	NC_014532	GC	3	6	521532	521537	0 %	0 %	50 %	50 %	307544052
10550	NC_014532	TCC	2	6	521546	521551	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307544052
10551	NC_014532	TCG	2	6	521618	521623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544052
10552	NC_014532	CGG	2	6	521736	521741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544052
10553	NC_014532	ACG	2	6	521923	521928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307544053
10554	NC_014532	CG	3	6	521996	522001	0 %	0 %	50 %	50 %	307544053
10555	NC_014532	CTG	2	6	522114	522119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544053
10556	NC_014532	AGA	2	6	522136	522141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307544053
10557	NC_014532	TGA	2	6	522232	522237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307544053
10558	NC_014532	GAA	2	6	522264	522269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307544053
10559	NC_014532	CT	3	6	522283	522288	0 %	50 %	0 %	50 %	307544053
10560	NC_014532	ACGC	2	8	522301	522308	25 %	0 %	25 %	50 %	307544053
10561	NC_014532	GAA	2	6	522342	522347	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307544053
10562	NC_014532	GCA	3	9	522350	522358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307544053
10563	NC_014532	CGCGG	2	10	522380	522389	0 %	0 %	60 %	40 %	307544053
10564	NC_014532	TGGA	2	8	522405	522412	25 %	25 %	50 %	0 %	307544053
10565	NC_014532	CCG	2	6	522430	522435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307544053
10566	NC_014532	CATG	2	8	522467	522474	25 %	25 %	25 %	25 %	307544053
10567	NC_014532	AAG	2	6	522513	522518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307544053
10568	NC_014532	TC	3	6	522578	522583	0 %	50 %	0 %	50 %	307544053
10569	NC_014532	TGCA	2	8	522624	522631	25 %	25 %	25 %	25 %	307544053
10570	NC_014532	CAA	2	6	522705	522710	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307544053
10571	NC_014532	TGGC	2	8	522723	522730	0 %	25 %	50 %	25 %	307544053
10572	NC_014532	CGA	2	6	522752	522757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307544053
10573	NC_014532	AGA	2	6	522772	522777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307544053
10574	NC_014532	TGGA	2	8	522822	522829	25 %	25 %	50 %	0 %	307544053
10575	NC_014532	GGC	2	6	523008	523013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544054
10576	NC_014532	ATG	2	6	523084	523089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307544054
10577	NC_014532	CTG	2	6	523170	523175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544054
10578	NC_014532	GTT	2	6	523196	523201	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307544054
10579	NC_014532	TTC	2	6	523260	523265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307544054
10580	NC_014532	CGG	2	6	523346	523351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544054
10581	NC_014532	CGA	2	6	523387	523392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307544054
10582	NC_014532	GCCC	2	8	523517	523524	0 %	0 %	25 %	75 %	307544054
10583	NC_014532	GCTGGT	2	12	523703	523714	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	307544055
10584	NC_014532	GGC	2	6	523724	523729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544055
10585	NC_014532	CGC	2	6	523744	523749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307544055
10586	NC_014532	CCAGT	2	10	523763	523772	20 %	20 %	20 %	40 %	307544055
10587	NC_014532	TGC	2	6	523828	523833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544055
10588	NC_014532	CTG	2	6	523839	523844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544055
10589	NC_014532	AT	3	6	523865	523870	50 %	50 %	0 %	0 %	307544055
10590	NC_014532	CGG	2	6	523875	523880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544055
10591	NC_014532	TGG	2	6	523933	523938	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307544055
10592	NC_014532	CTG	2	6	523956	523961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544055
10593	NC_014532	CG	3	6	523968	523973	0 %	0 %	50 %	50 %	307544055
10594	NC_014532	CCA	2	6	523999	524004	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307544055
10595	NC_014532	GC	3	6	524005	524010	0 %	0 %	50 %	50 %	307544055
10596	NC_014532	GCC	2	6	524016	524021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307544055
10597	NC_014532	ATC	2	6	524022	524027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307544055
10598	NC_014532	ATC	2	6	524035	524040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307544055
10599	NC_014532	TCG	2	6	524074	524079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544055
10600	NC_014532	GC	3	6	524092	524097	0 %	0 %	50 %	50 %	307544055
10601	NC_014532	TGG	2	6	524113	524118	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307544055
10602	NC_014532	TGA	2	6	524155	524160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307544055
10603	NC_014532	CG	3	6	524252	524257	0 %	0 %	50 %	50 %	307544055
10604	NC_014532	CCT	2	6	524311	524316	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307544055
10605	NC_014532	CGG	2	6	524324	524329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544055
10606	NC_014532	CAGG	2	8	524360	524367	25 %	0 %	50 %	25 %	307544055
10607	NC_014532	CGG	2	6	524393	524398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544055
10608	NC_014532	GAT	2	6	524420	524425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307544055
10609	NC_014532	CGT	2	6	524451	524456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544055
10610	NC_014532	AGA	2	6	524458	524463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307544055
10611	NC_014532	CGC	2	6	524466	524471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307544055
10612	NC_014532	CTG	2	6	524475	524480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544055
10613	NC_014532	TGC	2	6	524518	524523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544055
10614	NC_014532	CTG	2	6	524553	524558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544055
10615	NC_014532	GGC	2	6	524592	524597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544055
10616	NC_014532	GC	3	6	524612	524617	0 %	0 %	50 %	50 %	307544055
10617	NC_014532	CAT	2	6	524618	524623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307544055
10618	NC_014532	TGG	2	6	524707	524712	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307544055
10619	NC_014532	TGG	2	6	524797	524802	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307544055
10620	NC_014532	ATG	2	6	525046	525051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307544056
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10622	NC_014532	CGA	2	6	525189	525194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307544056
10623	NC_014532	GGC	2	6	525288	525293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544056
10624	NC_014532	CGT	2	6	525337	525342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544056
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10640	NC_014532	TCG	3	9	526166	526174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544057
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10647	NC_014532	CGT	2	6	526653	526658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544057
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10650	NC_014532	GCCGA	2	10	526736	526745	20 %	0 %	40 %	40 %	307544057
10651	NC_014532	GCA	2	6	526851	526856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307544057
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10656	NC_014532	TCG	2	6	527045	527050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307544057
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10725	NC_014532	GATG	2	8	531096	531103	25 %	25 %	50 %	0 %	307544060
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10730	NC_014532	TGA	2	6	531248	531253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307544060
10731	NC_014532	AAG	2	6	531265	531270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307544060
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10975	NC_014532	CAT	2	6	542633	542638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307544066
10976	NC_014532	GCC	2	6	542640	542645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307544066
10977	NC_014532	CGA	2	6	542687	542692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307544066
10978	NC_014532	GCC	2	6	542715	542720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307544066
10979	NC_014532	CGTG	2	8	542726	542733	0 %	25 %	50 %	25 %	307544066
10980	NC_014532	CAT	2	6	542804	542809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307544066
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10999	NC_014532	GGC	2	6	543709	543714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307544068
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